| dbo:abstract
|
- ثنائي النوكليوتيد CpG أو موقع CpG (بالإنجليزية: CpG site) هي مناطق في الدنا يكون فيها نوكليوتيد السايتوسين متبوعا بنوكليوتيد الغوانين في تسلسل خطي على طول الاتجاه 5' إلى 3' لسلسلة منفردة. CpG هي اختصار لـ: 5'—C—phosphate—G—3' (5'—سايتوسين—فوسفات—غوانين—3') ومعناه قاعدتا سايتوسين وغوانين مفصولتين بمجموعة فوسفات واحدة، حيث يربط الفوسفات جزيئتي نوكليوسيد في الدنا. يُستخدم الترميز CpG للتمييز بينه وبين الزوج القاعدي CG للسايتوسين والغوانين بين جانبي تسلسل مزدوج السلاسل، ويفسر هذا الترميز على أن السايتوسين في النهاية 5' لقاعدة الغوانين، ولا يجب الخلط بين CpG وGpC فالأخيرة تعني أن الغوانين يكون متبوعا بالسايتوسين في الاتجاه 5' إلى 3' لتسلسل سلسلة واحدة. ثنائي نوكليوتيد CpG يمكن مثيلته لتشكيل 5-ميثيل سايتوسين. لدى الثدييات مثيلة السايتوسين داخل جين يمكن أن يغير ناتج التعبير عنه، وهي جزء من مجال أكبر يدرس التنظيم الجيني ويسمى علم التخلق. تسمى الإنزيمات التي تضيف مجموعة ميثيل ناقلات ميثيل الدنا، تتم مثيلة حوالي 70% إلى 80% من مواقع CpG لدى الثدييات. يمكن تحديد مواقع ثنائيات النوكليوتيد CpG غير الممثيلة بواسطة بروتين مستقبل تنشيط المناعة 9 لدى ، الخلايا الوحيدة، الخلايا الفاتكة الطبيعية، والخلايا البائية لدى البشر. ويستعمل هذا التحديد لمعرفة الإصابات الداخلية للخلايا بالعدوى الفيروسية. لوحظ منذ مدة طويلة أن ثنائيات النوكليوتيد CpG تظهر بتواتر أقل من المتوقع في تسلسلات جينومات الفقاريات وذلك بسبب الحظ العشوائي، على سبيل المثال: في الجينوم البشري الذي لديه نسبة 42% من محتوى GC ، زوج نوكليوتيدات مكون من السايتوسين متبوع بالغوانين يُتوقَّع أن يظهر 0.21 * 0.21 = 4.41% إجماليا. تواتر ثنائي النوكليوتيد CpG في جينوم الإنسان أقل بـ1% من ربع التواتر المتوقع. واقتُرح أن هذا التواتر المنخفض يعود إلى زيادة قابلية قواعد السايتوسين الممثيلة لعمية نزع الأمين التلقائية -فتصبح ثايمين- في الجينومات التي لديها مواقع CpG ممثيلة .العدد الكلي لمواقع CpG في الجينوم البشري يبلغ حوالي 28 مليون. (ar)
- Ein CpG-Dinukleotid ist ein chemischer Zusammenschluss von zwei Nukleotiden, welche die Nukleobasen Cytosin bzw. Guanin aufweisen. Gelegentlich werden andere Bezeichnungen verwendet, wie CG-Stelle, CG-Ort, CpG-Motiv u. ä. Im Englischen sind CpG site und CpG dinucleotide üblich. Im Allgemeinen bezieht sich der Begriff „CpG-Dinukleotid“ auf eine Stelle innerhalb vom Erbgut (DNA), der die Anteile Desoxycytidin – Phosphorsäure – Desoxyguanosin (in 5'–3'-Richtung) enthält. Aufgrund der komplementären Basenpaarung an einer solchen Stelle, die auch CpG-Stelle genannt wird, kommen im DNA-Doppelstrang an jeder Stelle zwei Dinukleotide vor. Die CpG-Stellen spielen in den Genomen mancher Lebewesen (z. B. bei Säugetieren) eine besondere Rolle, weil sie dort Gegenstand der DNA-Methylierung sind und eine spezielle Häufigkeit und Verteilung aufweisen. Die CpG-Stellen bzw. -Dinukleotide sollten nicht mit den CpG-Inseln verwechselt werden. CpG-Inseln sind definierte Bereiche, in denen CpG-Stellen häufiger sind als in anderen Abschnitten des zugrunde liegenden Genoms. (de)
- The CpG sites or CG sites are regions of DNA where a cytosine nucleotide is followed by a guanine nucleotide in the linear sequence of bases along its 5' → 3' direction. CpG sites occur with high frequency in genomic regions called CpG islands (or CG islands). Cytosines in CpG dinucleotides can be methylated to form 5-methylcytosines. Enzymes that add a methyl group are called DNA methyltransferases. In mammals, 70% to 80% of CpG cytosines are methylated. Methylating the cytosine within a gene can change its expression, a mechanism that is part of a larger field of science studying gene regulation that is called epigenetics. Methylated cytosines often mutate to thymines. In humans, about 70% of promoters located near the transcription start site of a gene (proximal promoters) contain a CpG island. (en)
- Un dinucléotide CpG, parfois appelé site CpG en référence à l'anglais CpG site, est un segment d'ADN de deux nucléotides dont la séquence de bases nucléiques est CG. La notation « CpG » est une abréviation de cytosine–phosphate–guanine destinée à être clairement distinguée de la notation « CG » qui peut également désigner une paire de bases sur deux brins d'ADN distincts et non la séquence d'un brin d'ADN donné. Dans les génomes, les dinucléotides CpG ont une distribution différente de celle d'autres dinucléotides comme GpC, ApT ou TpA, car ils définissent des îlots CpG dans lesquels leur concentration est bien plus élevée et qui jouent un rôle dans la régulation de l'expression génétique. Les résidus de cytosine des dinucléotides CpG peuvent être méthylés en 5-méthylcytosine. Chez les mammifères, la méthylation de la cytosine d'un gène peut inactiver ce dernier dans le cadre d'un mécanisme plus général relevant de l'épigénétique ; les enzymes qui procèdent à la méthylation de l'ADN sont des ADN méthyltransférases. De 70 % à 80 % des résidus de cytosine des dinucléotides CpG sont méthylés chez les mammifères. Les dinucléotides CpG non méthylés peuvent être détectés par les récepteurs de type Toll TLR9 des cellules dendritiques plasmacytoïdes, des monocytes, des lymphocytes NK et des lymphocytes B chez l'homme. Ceci permet de détecter la présence intracellulaire d'ADN d'agents infectieux tels que virus, mycètes ou bactéries. On a observé depuis longtemps que l'occurrence des dinucléotides CpG dans le génome des vertébrés est sensiblement inférieure à celle qu'on s'attendrait statistiquement à trouver. Ainsi, dans un génome ayant un taux de GC de 42 %, la probabilité de la séquence CG sur un brin d'ADN donné vaut (0,42 / 2)2 = 0,0441 = 4,41 %, à comparer la fréquence du dinucléotide CpG dans le génome humain, qui n'est que de 1 %. Une explication de cette anomalie statistique a été proposée en 1967 par la désamination spontanée de la 5-méthylcytosine en thymine sous l'effet de la méthylation de la cytosine des dinucléotides CpG tendant à convertir progressivement ces derniers en dinucléotides TpG. (fr)
- I siti CpG o CG sono delle regioni del DNA dove una citosina si trova vicino ad una guanina nella sequenza lineare di basi. "CpG" è l'abbreviazione di " --C--phosphate--G-- ", dove i nucleosidi deossicitidina e deossiguanosina sono separati unicamente da un gruppo fosfato, che fa normalmente da ponte tra i nucleotidi nel DNA. La notazione "CpG" viene usata per distinguere questa sequenza lineare dall'appaiamento di basi complementari CG (citosina e guanina) su due diversi filamenti. Le citosine nei dinucleotidi CpG possono essere metilate diventando 5-metilcitosine. Nei mammiferi la metilazione delle citosine all'interno di un gene porta al suo silenziamento. Tale meccanismo è parte di una vasta area di studi scientifici sulla regolazione dell'espressione genica chiamata epigenetica. Gli enzimi che aggiungono gruppi metilici alle basi azotate del DNA sono chiamati DNA metiltransferasi. Nei mammiferi tra il 70% e l'80% delle citosine nei siti CpG sono metilate. Siti CpG non metilati possono essere riconosciuti dal Toll-Like Receptor 9 (TLR9), un recettore intraendosomiale espresso nei mammiferi da numerose cellule del sistema immunitario, tra cui le cellule dendritiche plasmacitoidi, i linfociti B e i linfociti NK. Il TLR 9 viene usato dalla cellula per riconoscere DNA di origine virale, batterica o fungina al suo interno. (it)
- CpG, sekwencje CpG, motywy CpG – niemetylowane CpG to fragmenty DNA bakterii rozpoznawane za pomocą receptora przez komórki układu odpornościowego. Niemetylowane CpG są jednym z PAMP, stąd jest celem dla odpowiedzi odpornościowej nieswoistej. (pl)
- CpG位点（英語：CpG sites，或称为CG位点）是指DNA的某个区域，其上的碱基序列以胞嘧啶接着鸟嘌呤出现。“CpG”是“—C—磷酸—G—”的缩写 ，指磷酸二酯键连接了胞嘧啶和鸟嘌呤，其中C位于5'端而G位于3'端。 在CpG位点中的胞嘧啶可以被甲基化为5-甲基胞嘧啶。在哺乳动物中，基因内CpG位点的甲基化会改变此基因的表达，对这一表达调控的研究是表观遗传学的重要组成部分。涉及添加甲基基团的酶称为。 在哺乳动物中，70%到80%的CpG位点的胞嘧啶是甲基化的。 未甲基化的CpG位点可以被免疫系统的浆细胞样树突状细胞、单核细胞、NK细胞和B细胞上的TLR9（Toll样受体9）识别，来检测体内的微生物感染。 (zh)
- CpG-острівець (англ. CpG island, CGI) — ділянка молекули ДНК, довжиною приблизно в 1 тис. нуклеотидів, яка містять багато послідовностей 5’-CG-3’ на одному ланцюгу ДНК. CpG послідовності у хребетних зустрічаються у вигляді скупчень, власне CpG-острівців, у місцях старту транскрипції, промоторних ділянках та міжгенних проміжках, тоді як решта геному має мало випадків послідовностей CpG. Назва походить від скорочення «Цитозин-фосфатний залишок-Гуанін» і слугує для розмежування послідовності двох нуклеотидів поряд в одному ланцюгу від комплементарної пари C-G, де кожен нуклеотид належить окремому з двох ланцюгів ДНК. Функціонально, CpG-острівці пов'язані з явищем метилювання ДНК по цитозину. Більша частина цитозину, до 80 % геному хребетних, метильована і лежить поза послідовністю нуклеотидів CpG, тоді як CpG-острівці здебільшого неметильовані та містять модифікацію гістонів H3K4me3 — один з маркерів еухроматину (див. табл. у Порівняння еу- та гетерохроматину). У той же час метилювання CpG-острівців в сайтах старту транскрипції призводить до заглушення відповідних генів на довгий час, прикладами можуть бути імпринтні гени та гени на неактивній X-хромосомі. Також характер метилювання CpG-острівців може бути тканинноспецифічним (uk)
|
| rdfs:comment
|
- CpG, sekwencje CpG, motywy CpG – niemetylowane CpG to fragmenty DNA bakterii rozpoznawane za pomocą receptora przez komórki układu odpornościowego. Niemetylowane CpG są jednym z PAMP, stąd jest celem dla odpowiedzi odpornościowej nieswoistej. (pl)
- CpG位点（英語：CpG sites，或称为CG位点）是指DNA的某个区域，其上的碱基序列以胞嘧啶接着鸟嘌呤出现。“CpG”是“—C—磷酸—G—”的缩写 ，指磷酸二酯键连接了胞嘧啶和鸟嘌呤，其中C位于5'端而G位于3'端。 在CpG位点中的胞嘧啶可以被甲基化为5-甲基胞嘧啶。在哺乳动物中，基因内CpG位点的甲基化会改变此基因的表达，对这一表达调控的研究是表观遗传学的重要组成部分。涉及添加甲基基团的酶称为。 在哺乳动物中，70%到80%的CpG位点的胞嘧啶是甲基化的。 未甲基化的CpG位点可以被免疫系统的浆细胞样树突状细胞、单核细胞、NK细胞和B细胞上的TLR9（Toll样受体9）识别，来检测体内的微生物感染。 (zh)
- ثنائي النوكليوتيد CpG أو موقع CpG (بالإنجليزية: CpG site) هي مناطق في الدنا يكون فيها نوكليوتيد السايتوسين متبوعا بنوكليوتيد الغوانين في تسلسل خطي على طول الاتجاه 5' إلى 3' لسلسلة منفردة. CpG هي اختصار لـ: 5'—C—phosphate—G—3' (5'—سايتوسين—فوسفات—غوانين—3') ومعناه قاعدتا سايتوسين وغوانين مفصولتين بمجموعة فوسفات واحدة، حيث يربط الفوسفات جزيئتي نوكليوسيد في الدنا. يُستخدم الترميز CpG للتمييز بينه وبين الزوج القاعدي CG للسايتوسين والغوانين بين جانبي تسلسل مزدوج السلاسل، ويفسر هذا الترميز على أن السايتوسين في النهاية 5' لقاعدة الغوانين، ولا يجب الخلط بين CpG وGpC فالأخيرة تعني أن الغوانين يكون متبوعا بالسايتوسين في الاتجاه 5' إلى 3' لتسلسل سلسلة واحدة. (ar)
- Ein CpG-Dinukleotid ist ein chemischer Zusammenschluss von zwei Nukleotiden, welche die Nukleobasen Cytosin bzw. Guanin aufweisen. Gelegentlich werden andere Bezeichnungen verwendet, wie CG-Stelle, CG-Ort, CpG-Motiv u. ä. Im Englischen sind CpG site und CpG dinucleotide üblich. (de)
- The CpG sites or CG sites are regions of DNA where a cytosine nucleotide is followed by a guanine nucleotide in the linear sequence of bases along its 5' → 3' direction. CpG sites occur with high frequency in genomic regions called CpG islands (or CG islands). In humans, about 70% of promoters located near the transcription start site of a gene (proximal promoters) contain a CpG island. (en)
- Un dinucléotide CpG, parfois appelé site CpG en référence à l'anglais CpG site, est un segment d'ADN de deux nucléotides dont la séquence de bases nucléiques est CG. La notation « CpG » est une abréviation de cytosine–phosphate–guanine destinée à être clairement distinguée de la notation « CG » qui peut également désigner une paire de bases sur deux brins d'ADN distincts et non la séquence d'un brin d'ADN donné. Dans les génomes, les dinucléotides CpG ont une distribution différente de celle d'autres dinucléotides comme GpC, ApT ou TpA, car ils définissent des îlots CpG dans lesquels leur concentration est bien plus élevée et qui jouent un rôle dans la régulation de l'expression génétique. (fr)
- I siti CpG o CG sono delle regioni del DNA dove una citosina si trova vicino ad una guanina nella sequenza lineare di basi. "CpG" è l'abbreviazione di " --C--phosphate--G-- ", dove i nucleosidi deossicitidina e deossiguanosina sono separati unicamente da un gruppo fosfato, che fa normalmente da ponte tra i nucleotidi nel DNA. La notazione "CpG" viene usata per distinguere questa sequenza lineare dall'appaiamento di basi complementari CG (citosina e guanina) su due diversi filamenti. Nei mammiferi tra il 70% e l'80% delle citosine nei siti CpG sono metilate. (it)
- CpG-острівець (англ. CpG island, CGI) — ділянка молекули ДНК, довжиною приблизно в 1 тис. нуклеотидів, яка містять багато послідовностей 5’-CG-3’ на одному ланцюгу ДНК. CpG послідовності у хребетних зустрічаються у вигляді скупчень, власне CpG-острівців, у місцях старту транскрипції, промоторних ділянках та міжгенних проміжках, тоді як решта геному має мало випадків послідовностей CpG. (uk)
|
