| dbo:abstract
|
- La unión de extremos mediada por microhomología (MMEJ), también conocida como unión de extremos no homóloga alternativa (Alt-NHEJ) es una de las vías para reparar roturas de doble hebra en el ADN. La propiedad distintiva más importante de MMEJ es el uso de secuencias microhomólogas durante la alineación de los extremos rotos antes de la unión, lo que da como resultado deleciones que flanquean la rotura original. La MMEJ se asocia con frecuencia con anomalías cromosómicas como deleciones, translocaciones, inversiones y otros reordenamientos complejos. Existen múltiples vías para reparar roturas de doble hebra, principalmente unión de extremos no homólogos (NHEJ), recombinación homóloga (HR) y MMEJ. El NHEJ une directamente ambos extremos de la rotura de la doble hebra y es relativamente preciso, aunque a veces se producen pequeñas inserciones o deleciones (generalmente menos de unos pocos nucleótidos). La frecuencia cardíaca es muy precisa y utiliza la cromátida hermana como plantilla para una reparación precisa del DSB. La MMEJ se distingue de estos otros mecanismos de reparación por el uso de secuencias microhomólogas para alinear las hebras rotas. Esto da como resultado eliminaciones frecuentes y ocasionalmente inserciones que son mucho más grandes que las producidas por NHEJ. MMEJ es completamente independiente del NHEJ clásico y no se basa en factores centrales del NHEJ como la proteína Ku, la DNA-PK o la ligasa IV. En MMEJ, la reparación del DSB se inicia mediante la resección del extremo por la nucleasa MRE, dejando protuberancias monocatenarias. Estos salientes monocatenarios se aparean en microhomologías, que son regiones cortas de complementariedad, a menudo de 5 a 25 pares de bases, entre las dos cadenas. Una forma especializada de MMEJ, llamada unión de extremos mediada por polimerasa teta (TMEJ), es capaz de reparar roturas utilizando ≥1 pb de homología. El dominio helicasa de la ADN polimerasa theta posee actividad de hibridación monocatenaria dependiente de ATP y puede promover la hibridación de microhomologías. Después de la hibridación, las bases colgantes (colgajos) se eliminan mediante nucleasas como Fen1 y los huecos se rellenan con ADN polimerasa teta. Esta capacidad de relleno de huecos de la polimerasa teta ayuda a estabilizar el recocido de los extremos con una complementariedad mínima. Además de las huellas de microhomología, la firma mutacional de la polimerasa theta también consta de inserciones con plantilla (infrecuentes), que se cree que son el resultado de una extensión dependiente de la plantilla abortada, seguida de un reasociamiento en secuencias homólogas secundarias. (es)
- Microhomology-mediated end joining (MMEJ), also known as alternative nonhomologous end-joining (Alt-NHEJ) is one of the pathways for repairing double-strand breaks in DNA. As reviewed by McVey and Lee, the foremost distinguishing property of MMEJ is the use of microhomologous sequences during the alignment of broken ends before joining, thereby resulting in deletions flanking the original break. MMEJ is frequently associated with chromosome abnormalities such as deletions, translocations, inversions and other complex rearrangements. There are multiple pathways for repairing double strand breaks, mainly non-homologous end joining (NHEJ), homologous recombination (HR), and MMEJ. NHEJ directly joins both ends of the double strand break and is relatively accurate, although small (usually less than a few nucleotides) insertions or deletions sometimes occur. HR is highly accurate and uses the sister chromatid as a template for accurate repair of the DSB. MMEJ is distinguished from these other repair mechanisms by its use of microhomologous sequences to align the broken strands. This results in frequent deletions and occasionally insertions which are much larger than those produced by NHEJ. MMEJ is completely independent from classical NHEJ and does not rely on NHEJ core factors such as Ku protein, DNA-PK, or Ligase IV. In MMEJ, repair of the DSB is initiated by end resection by the MRE nuclease, leaving single stranded overhangs. These single stranded overhangs anneal at microhomologies, which are short regions of complementarity, often 5–25 base pairs, between the two strands. A specialized form of MMEJ, called polymerase theta-mediated end-joining (TMEJ), is able to repair breaks using ≥1 bp of homology. The helicase domain of DNA polymerase theta possesses ATP-dependent single-strand annealing activity and may promote annealing of microhomologies. Following annealing, any overhanging bases (flaps) are removed by nucleases such as Fen1 and gaps are filled in by DNA polymerase theta. This gap-filling ability of polymerase theta helps to stabilize the annealing of ends with minimal complementarity. Besides microhomology footprints, polymerase theta's mutational signature also consists of (infrequent) templated inserts, which are thought to be the result of aborted template-dependent extension, followed by re-annealing at secondary homologous sequences. (en)
- Микрогомологичное соединение концов (МСК), также известное как альтернативное негомологичное соединение концов (Альт-НСК), является одним из путей репарации двунитевых разрывов в ДНК-цепи. Как рассмотрено Маквеем и Ли, главным отличительным свойством МСК является использование микрогомологичных последовательностей, состоящих из 5-25 пар оснований (п.о.) МСК часто связано с хромосомными аномалиями, такими как делеции, транслокации, инверсии и другие сложные перестройки. Существует два других вида репарации ДНК: гомологичная рекомбинация (ГР) и негомологичное соединение концов (НСК). Но только МСК в процессе починки использует микрогомологичные последовательности, необходимые для выравнивания участков молекулы по обеим сторонам от места разрыва до их непосредственного соединения. МСК использует Ku-белок и ДНК-ПК-зависимый механизм репарации (ДНК-ПК это ДНК-зависимая протеинкиназа, белок из класса трансфераз), а сама репарация происходит во время S-фазы клеточного цикла, в отличие от G0/G1- и ранней S- фаз во время НСК, и во время поздней S- и G- фаз во время ГР. МСК работает посредством лигирования несовместимых нависающих участков ДНК-цепи, удаления соответствующих нуклеотидов и заполнения потерянных пар оснований. Когда происходит разрыв, гомология вышеупомянутых последовательностей длиной в 5-25 пар оснований используется в качестве базиса для выравнивания цепи по обе стороны от разрыва. После выравнивания любые выступающие участки цепи удаляются, а недостающие нуклеотиды вставляются. Поскольку этот путь репарации не учитывает утерянные пары оснований, а попросту вырезает поврежденные части и соединяет между собой цепи ДНК, он нередко приводит к делеции существенных участков ДНК. Исходя из вышесказанного видно, что МСК - метод, подверженный ошибкам. Делеция участков ДНК может привести к появлению онкогенов и сыграть роль в развитии рака. В большинстве случаев клетка использует МСК только тогда, когда другие два способа репарации по какой-либо причине недоступны или нежелательны. (ru)
|
| rdfs:comment
|
- La unión de extremos mediada por microhomología (MMEJ), también conocida como unión de extremos no homóloga alternativa (Alt-NHEJ) es una de las vías para reparar roturas de doble hebra en el ADN. La propiedad distintiva más importante de MMEJ es el uso de secuencias microhomólogas durante la alineación de los extremos rotos antes de la unión, lo que da como resultado deleciones que flanquean la rotura original. La MMEJ se asocia con frecuencia con anomalías cromosómicas como deleciones, translocaciones, inversiones y otros reordenamientos complejos. (es)
- Microhomology-mediated end joining (MMEJ), also known as alternative nonhomologous end-joining (Alt-NHEJ) is one of the pathways for repairing double-strand breaks in DNA. As reviewed by McVey and Lee, the foremost distinguishing property of MMEJ is the use of microhomologous sequences during the alignment of broken ends before joining, thereby resulting in deletions flanking the original break. MMEJ is frequently associated with chromosome abnormalities such as deletions, translocations, inversions and other complex rearrangements. (en)
- Микрогомологичное соединение концов (МСК), также известное как альтернативное негомологичное соединение концов (Альт-НСК), является одним из путей репарации двунитевых разрывов в ДНК-цепи. Как рассмотрено Маквеем и Ли, главным отличительным свойством МСК является использование микрогомологичных последовательностей, состоящих из 5-25 пар оснований (п.о.) МСК часто связано с хромосомными аномалиями, такими как делеции, транслокации, инверсии и другие сложные перестройки. (ru)
|
