| dbo:abstract
|
- En biologia molecular, el contingut GC (o contingut en guanina-citosina) és el percentatge de bases nitrogenades d'una molècula d'ADN que són o bé guanina, o bé citosina (d'entre quatre possibilitats, incloent-hi adenina i timina). Es pot referir a un fragment específic d'ADN o ARN, o al del genoma sencer. Quan es refereix a un fragment del material genètic, pot representar el contingut GC de part d'un gen (domini), un gen, un grup de gens, o fins i tot una regió no codificant. G (guanina) i C (citosina) tenen un enllaç d'hidrogen específic, mentre que A (adenina) s'uneix específicament amb T (timina). El contingut GC s'empra de vegades per classificar organismes en taxonomia. Per exemple, mentre que Streptomyces coelicolor presenta un GC de 72%, en el llevat Saccharomyces cerevisiae és del 38%. (ca)
- محتوى GC أو محتوى الغوانين والسايتوسين في علم الأحياء الجزيئي هي نسبة القواعد النيتروجينية في الدنا أو الرنا التي هي إما غوانين أو سايتوسين (من احتمالية أربع قواعد، بما فيها الأدنين والثايمين في الدنا والأدينين واليوراسيل في الرنا). وهذه النسبة قد تخص قطعة معينة من الدنا والرنا أو الجينوم بأكمله. حين تتعلق هذه النسبة بقطعة من المادة الجينية، يمكن تدل على محتوى GC في منطقة من جين، جين واحد، مجموعة من الجينات ( تكتل من الجينات) أو حتى منطقة غير مشفرة. يترابط الغوانين والسايتوسين بروابط هيدروجينية محددة، بينما يرتبط الأدنين مع الثايمين بشكل خاص في الدنا، ويرتبط مع اليوراسيل في الرنا. يترابط الزوج القاعدي GC بثلاث روابط هيدروجينية في تترابط الأزواج AT وAU برابطتين هيدروجينيتين، ولتوضيح هذا الاختلاف في عدد الرابط الهيدروجينية، يمكن الرمز لأزواج القواعد بـ: G≡C مقابل A=T وA=U. الدنا الذي له محتوى GC منخفض أقل استقرار من الدنا ذو محتوى GC مرتفع، لكن لا يوجد للروابط الهيدروجينية بحد ذاتها تأثير على الاستقرار وإنما يعود الاستقرار أساس إلى التفاعلات بين القاعد المحزمة على نفس السلسلة المنفردة. رغم الاستقرارية الحرارية المرتفعة الموجودة لدى المادة الوراثية، فقد تمت ملاحظة أنه -على الأقل- تقوم بعض أنواع البكتيريا مرتفعة محتوى GC بالتحلل الذاتي بسهولة أكبر، وهذا يُنقص من طول عمر الخلية بحد ذاتها. بسبب الاستقرارية الحرارية الموجودة لدى الكائنات ذات المواد الجينية مرتفعة محتوى GC، فقد كان يُعتقد بشكل واسع أن محتوى GC لعب دورا ضروريا في التأقلم الحراري، وهي نظرية تم تفنيدها عام 2001، لكن تم توضيح أنه يوجد ارتباط وثيق بين النمو الأمثل لبدائيات النوى في درجات حرارة مرتفعة ومحتوى GC في الرنا المُهيكَل (مثل الرنا الريبوزومي، الرنا الناقل، والعديد من أنواع الرنا غير المشفرة). تم إيعاز سبب كون الأزواج القاعدية AU أقل استقرارا من الأزواج GC إلى احتواء الأزواج GC على ثلاث روابط هيدروجينية وAU على رابطتين فقط وهو ما يجعل بنيات الرنا عاليةِ محتوى GC أكثر مقاومة للتأثيرات الحرارية. حديثا، تم إثبات أن العامل الأكثر تأثيرا في الاستقرار الحراري للأحماض النووية مزدوجة السلاسل - بدل عدد الروابط الهيدروجينية بين القواعد - هو تفاعلات التحزيم بين القواعد المجاورة في سلسلة واحدة. توجد طاقة تحزيم مفضلة أكثر للأزواج G:C لأن الوضعيات النسبية للمجموعات خارج الحلقية فيها مناسبة أكثر منها في الأزواج A:U، بالإضافة إلى ذلك هناك ارتباط بين ترتيب تحزيم القواعد والاستقرار الحراري. في تجارب تفاعل البوليميراز المتسلسل، يستخدم محتوى GC للمشرعات للتنبؤ بدرجة حرارة تلدين سلسلة الدنا القالب. فكلما كان محتوى GC أكبر كانت درجة حرار الذوبان أعلى. (ar)
- Obsah GC či množství GC (z anglického GC-content) je podíl guanino-cytosinového komplementárního páru (GC), typicky v rámci určité DNA. Zbylými bázemi jsou adenin (A) a thymin (T), a tak AT pár v daném genomu logicky činí zbytek do sta procent. Podíl GC vazeb však standardně bývá vyšší než podíl AT vazeb. Guanin se váže na cytosin, podobně jako adenin na thymin. Vazba mezi G a C má tři vodíkové vazby (na rozdíl od AT vazby, která má dvě), díky čemuž je GC vazba odolnější vůči vysoké teplotě. Dříve se kvůli tomu mělo za to, že vyšší obsah GC mají termofilní organismy, což však bylo vyvráceno. (cs)
- Der GC-Gehalt ist ein Merkmal von Nukleinsäuremolekülen wie einer DNA oder RNA und gibt den Anteil von Guanin (G) und Cytosin (C) an der Gesamtheit der enthaltenen Nukleinbasen in Prozent an. Bei einem DNA-Molekül bezieht sich das Maß auf die vier DNA-Basen Guanin, Cytosin, Adenin (A) und Thymin (T): Da in einem DNA-Strang gewöhnlich nur diese vier Basen vorkommen, lässt sich aus dem GC-Gehalt der AT-Gehalt berechnen und umgekehrt: Einem GC-Gehalt von beispielsweise 64 % entspricht somit ein AT-Gehalt von 36 %. (de)
- In molecular biology and genetics, GC-content (or guanine-cytosine content) is the percentage of nitrogenous bases in a DNA or RNA molecule that are either guanine (G) or cytosine (C). This measure indicates the proportion of G and C bases out of an implied four total bases, also including adenine and thymine in DNA and adenine and uracil in RNA. GC-content may be given for a certain fragment of DNA or RNA or for an entire genome. When it refers to a fragment, it may denote the GC-content of an individual gene or section of a gene (domain), a group of genes or gene clusters, a non-coding region, or a synthetic oligonucleotide such as a primer. (en)
- En genética, GC, Contenido GC o Porcentaje GC (contenido de guanina y citosina) es una característica del genoma de un organismo o de cualquier pedazo de ADN o ARN. G y C denotan guanina y citosina, respectivamente. Expresado generalmente como porcentaje, representa la cantidad de pares Guanina-Citosina en la molécula de ADN o genoma que está siendo investigado. La fracción restante de cualquier molécula de ADN contendrá bases A (adenina) y T (timina), de forma que el contenido GC da también el contenido AT (por ejemplo, un GC del 58% implica un contenido AT del 42%). Los pares GC en el ADN están conectados por tres enlaces de hidrógeno en vez de dos de los pares AT. Esto hace el enlace GC más fuerte y más resistente a la desnaturalización por efecto de la temperatura por lo que el contenido GC tiende así a ser mayor en los hipertermófilos. El contenido GC se utiliza a veces para clasificar organismos en taxonomía. Por ejemplo, las Actinobacteria se caracterizan por ser “bacterias de GC alto”. En el GC es del 72%, en la levadura Saccharomyces cerevisiae del 38%, mientras que en el organismo modelo Arabidopsis thaliana es del 36%. Debido a la naturaleza del código genético, es virtualmente imposible para que un organismo tenga un genoma con un contenido GC que se acerque al 0% o a 100%. Una especie con un GC extremadamente bajo es Plasmodium falciparum (GC ~20%), y en estos casos es generalmente común referirlos como AT altos en vez de GC bajos. En una sección larga de la secuencia genómica, los genes se caracterizan a menudo por un GC más alto comparado con el genoma entero. Particularmente,en los exones son genes con GC alto, mientras que los intrones tienen generalmente AT alto (GC bajo). Más generalmente, muchos estudios han buscado (y encontrado) patrones de la variación de GC a través de una secuencia genómica (abarcando ambas regiones, génicas e intragénicas que las separan). La función y significado de tal variación es confusa. En experimentos con la reacción en cadena de la polimerasa, el GC del partidor se utiliza para determinar los patrones de temperatura. Un GC más alto implica una temperatura de desnaturalización más alta. El contenido GC se puede medir por varios métodos, siendo uno de los más simples la temperatura de desnaturalización de la doble hélice del ADN con un espectrofotómetro. La respuesta del ADN a en la longitud de onda de 260 nm aumenta bastante abrupta cuando la doble hélice se separa en dos las dos hebras cuando se calienta suficientemente. Alternativamente, si la molécula ADN o ARN ha sido secuenciada entonces el GC se puede obtener exactamente contando el número de bases. Este valor es especialmente útil para valorar la calidad de la secuenciación de una hebra de ADN, puesto que este valor es relativamente constante en cada especie (alrededor de un 46% en humanos). Una fluctuación alta de este valor indicaría que nuestra muestra ha sufrido algún daño en su secuencia. (es)
- Le taux de GC (ou pourcentage de GC, ou coefficient de Chargaff) d'une séquence d'ADN est défini comme la proportion de bases nucléiques de cette séquence étant soit une guanine (G), soit une cytosine (C). Il existe deux bases nucléiques supplémentaires, l'adénine (A) et la thymine (T), entrant dans la composition de l'ADN. De plus, la cytosine est toujours liée à la guanine, et l'adénine est toujours liée à la thymine. Ainsi, le taux de GC exprime aussi le pourcentage de liaisons G-C dans la molécule d'ADN. (fr)
- 분자생물학 및 유전학에서 GC 함량(구아닌-사이토신 함량, GC-content)은 DNA 또는 RNA에서의 구아닌과 사이토신의 백분율이다. GC 함량은 DNA의 아데닌과 티민, RNA의 아데닌과 유라실을 포함하여 암시 된 4개의 전체 염기 중 구아닌과 사이토신의 비율을 나타낸다. GC 함량은 DNA 또는 RNA의 특정 단편 또는 전체 게놈에 대해 주어진다. 이것이 단편을 지칭할 때, 이는 개별 유전자 또는 유전자의 도메인, 유전자군, 비암호화 영역, 프라이머와 같은 합성 올리고뉴클레오타이드의 GC 함량을 나타낸다. (ko)
- Het GC-gehalte is een kenmerk van DNA-moleculen en geeft het aandeel van de basen guanine (G) en cytosine (C) in het totaal van de basen (guanine, cytosine, adenine en thymine) in procenten weer. Het wordt als volgt berekend. Het GC-gehalte kan slaan op een bepaald fragment van het DNA of op het hele genoom. Wanneer het slaat op een fragment kan het het CG-gehalte zijn van een deel van een gen (domein), en enkel gen, groep van genen of zelfs van een niet-coderend gedeelte. (nl)
- Per contenuto di GC, s'intende il quantitativo di coppie di basi azotate di guanina e citosina presenti in una molecola di DNA. L'utilizzo di questa coppia di basi a scopi tassonomici è motivato dalla presenza di un triplo legame che le lega, a differenza della coppia adenina - timina, dove il legame è doppio. Questa differenza fa sì che le proprietà fisiche delle molecole di DNA differiscano al variare della composizione percentuale delle coppie di basi azotate presenti, permettendo così l'identificazione dei corredi genomici nelle diverse specie, in quanto ogni specie ha un suo contenuto in GC% caratteristico. Vi è però la possibilità che organismi afferenti a specie differenti abbiano la stessa composizione di GC%, ma diversa sequenza di basi, quindi il dato relativo al GC% dev'essere confrontato con altri elementi di valutazione. (it)
- GC含量（GCがんりょう、GC-content）は、DNA分子中の窒素塩基のうちグアニンとシトシンの割合である。また、この用語はDNAやRNAの特定の断片や、ゲノム全体に対しても用いられる。 (ja)
- Em biologia molecular e genética, o conteúdo GC (ou conteúdo de guanina-citosina) é a porcentagem de bases nitrogenadas em uma molécula de DNA ou RNA que são guanina ou citosina (dentre quatro bases possíveis, sendo as outras duas adenina e timina no DNA e adenina e uracil no RNA). Isto pode ser feito relativo a um determinado fragmento de DNA ou RNA ou ao genoma completo. G (guanina) e C (citosina) pareiam de forma específica na dupla hélice, da mesma forma que A (adenina) pareia com T (timina no DNA) ou U (uracilo no RNA). O par GC se liga por três ligações de hidrogênio, enquanto o AT e AU se ligam por duas. Para enfatizar essa diferença no número de ligações de hidrogênio, os pareamentos podem ser representados, respectivamente, por G≡C e A=T e ou A=U. Moléculas de DNA com baixo conteúdo GC são menos estáveis do que com conteúdo GC alto. Essa estabilidade se dá, curisoamente, em grande parte não pelo número de ligações, mas por stacking de bases. Em experimentos de PCR, o conteúdo GC de primers é usado para prever a temperatura de anelamento ao molde de DNA. Um maior conteúdo GC indica, relativamente, uma maior temperatura de anelamento. (pt)
- У генетиці, вміст гуаніну і цитозину (часто скорочується як «вміст ГЦ» або «вміст GC», іноді навіть як GC%) — характеристика геному будь-якого даного організма або будь-якого іншого шматка ДНК або РНК. (uk)
- GC-состав (гуанин-цитозиновый состав, ГЦ-состав) — доля гуанина (G) и цитозина (C) среди всех остатков нуклеотидов рассматриваемой нуклеотидной последовательности. GC-состав может быть определён как для фрагмента молекулы ДНК или РНК, так и для всей молекулы или даже всего генома. Пара GC соединена тремя водородными связями, тогда как пара AT (аденин — тимин) — двумя. Поэтому ДНК с высоким содержанием GC более устойчива к денатурации в растворе, чем ДНК с низким. Кроме водородных связей, на стабильность вторичной структуры ДНК и РНК влияют гидрофобные или стэкинг-взаимодействия между соседними нуклеотидами, не зависящие от последовательности оснований нуклеиновых кислот. При проведении ПЦР GC-состав праймера используется для предсказания температуры плавления этого праймера и температуры отжига. Высокий GC-состав праймера позволяет использовать его при высоких температурах отжига. (ru)
- GC含量（GC-content，guanine-cytosine content）是分子生物学和遗传学的术语，指研究对象（例如放线菌）的全基因组（DNA 或 RNA 分子）或其片段中，含氮碱基鸟嘌呤（G）或胞嘧啶（C）任何一个所占的百分比。一种生物的基因組或特定DNA、RNA片段有特定的GC含量。 在DNA链中G和C是以三个氢键相连，而T和A则是两个氢键相连的。氢键的多少体现连接的能量，氢键多的不容易被打断。 在双链DNA中，腺嘌呤与胸腺嘧啶（A/T）之比，以及鸟嘌呤与胞嘧啶（G/C）之比都是1。但是，（A+T）/（G+C）之比则随DNA的种类不同而异。GC含量愈高，DNA的密度也愈高，同时热及碱不易使之变性，因此利用这一特性便可进行DNA的分离或测定。 测定GC含量的方法有：， (zh)
|
| rdfs:comment
|
- Obsah GC či množství GC (z anglického GC-content) je podíl guanino-cytosinového komplementárního páru (GC), typicky v rámci určité DNA. Zbylými bázemi jsou adenin (A) a thymin (T), a tak AT pár v daném genomu logicky činí zbytek do sta procent. Podíl GC vazeb však standardně bývá vyšší než podíl AT vazeb. Guanin se váže na cytosin, podobně jako adenin na thymin. Vazba mezi G a C má tři vodíkové vazby (na rozdíl od AT vazby, která má dvě), díky čemuž je GC vazba odolnější vůči vysoké teplotě. Dříve se kvůli tomu mělo za to, že vyšší obsah GC mají termofilní organismy, což však bylo vyvráceno. (cs)
- Der GC-Gehalt ist ein Merkmal von Nukleinsäuremolekülen wie einer DNA oder RNA und gibt den Anteil von Guanin (G) und Cytosin (C) an der Gesamtheit der enthaltenen Nukleinbasen in Prozent an. Bei einem DNA-Molekül bezieht sich das Maß auf die vier DNA-Basen Guanin, Cytosin, Adenin (A) und Thymin (T): Da in einem DNA-Strang gewöhnlich nur diese vier Basen vorkommen, lässt sich aus dem GC-Gehalt der AT-Gehalt berechnen und umgekehrt: Einem GC-Gehalt von beispielsweise 64 % entspricht somit ein AT-Gehalt von 36 %. (de)
- Le taux de GC (ou pourcentage de GC, ou coefficient de Chargaff) d'une séquence d'ADN est défini comme la proportion de bases nucléiques de cette séquence étant soit une guanine (G), soit une cytosine (C). Il existe deux bases nucléiques supplémentaires, l'adénine (A) et la thymine (T), entrant dans la composition de l'ADN. De plus, la cytosine est toujours liée à la guanine, et l'adénine est toujours liée à la thymine. Ainsi, le taux de GC exprime aussi le pourcentage de liaisons G-C dans la molécule d'ADN. (fr)
- 분자생물학 및 유전학에서 GC 함량(구아닌-사이토신 함량, GC-content)은 DNA 또는 RNA에서의 구아닌과 사이토신의 백분율이다. GC 함량은 DNA의 아데닌과 티민, RNA의 아데닌과 유라실을 포함하여 암시 된 4개의 전체 염기 중 구아닌과 사이토신의 비율을 나타낸다. GC 함량은 DNA 또는 RNA의 특정 단편 또는 전체 게놈에 대해 주어진다. 이것이 단편을 지칭할 때, 이는 개별 유전자 또는 유전자의 도메인, 유전자군, 비암호화 영역, 프라이머와 같은 합성 올리고뉴클레오타이드의 GC 함량을 나타낸다. (ko)
- Het GC-gehalte is een kenmerk van DNA-moleculen en geeft het aandeel van de basen guanine (G) en cytosine (C) in het totaal van de basen (guanine, cytosine, adenine en thymine) in procenten weer. Het wordt als volgt berekend. Het GC-gehalte kan slaan op een bepaald fragment van het DNA of op het hele genoom. Wanneer het slaat op een fragment kan het het CG-gehalte zijn van een deel van een gen (domein), en enkel gen, groep van genen of zelfs van een niet-coderend gedeelte. (nl)
- GC含量（GCがんりょう、GC-content）は、DNA分子中の窒素塩基のうちグアニンとシトシンの割合である。また、この用語はDNAやRNAの特定の断片や、ゲノム全体に対しても用いられる。 (ja)
- У генетиці, вміст гуаніну і цитозину (часто скорочується як «вміст ГЦ» або «вміст GC», іноді навіть як GC%) — характеристика геному будь-якого даного організма або будь-якого іншого шматка ДНК або РНК. (uk)
- GC含量（GC-content，guanine-cytosine content）是分子生物学和遗传学的术语，指研究对象（例如放线菌）的全基因组（DNA 或 RNA 分子）或其片段中，含氮碱基鸟嘌呤（G）或胞嘧啶（C）任何一个所占的百分比。一种生物的基因組或特定DNA、RNA片段有特定的GC含量。 在DNA链中G和C是以三个氢键相连，而T和A则是两个氢键相连的。氢键的多少体现连接的能量，氢键多的不容易被打断。 在双链DNA中，腺嘌呤与胸腺嘧啶（A/T）之比，以及鸟嘌呤与胞嘧啶（G/C）之比都是1。但是，（A+T）/（G+C）之比则随DNA的种类不同而异。GC含量愈高，DNA的密度也愈高，同时热及碱不易使之变性，因此利用这一特性便可进行DNA的分离或测定。 测定GC含量的方法有：， (zh)
- محتوى GC أو محتوى الغوانين والسايتوسين في علم الأحياء الجزيئي هي نسبة القواعد النيتروجينية في الدنا أو الرنا التي هي إما غوانين أو سايتوسين (من احتمالية أربع قواعد، بما فيها الأدنين والثايمين في الدنا والأدينين واليوراسيل في الرنا). وهذه النسبة قد تخص قطعة معينة من الدنا والرنا أو الجينوم بأكمله. حين تتعلق هذه النسبة بقطعة من المادة الجينية، يمكن تدل على محتوى GC في منطقة من جين، جين واحد، مجموعة من الجينات ( تكتل من الجينات) أو حتى منطقة غير مشفرة. يترابط الغوانين والسايتوسين بروابط هيدروجينية محددة، بينما يرتبط الأدنين مع الثايمين بشكل خاص في الدنا، ويرتبط مع اليوراسيل في الرنا. (ar)
- En biologia molecular, el contingut GC (o contingut en guanina-citosina) és el percentatge de bases nitrogenades d'una molècula d'ADN que són o bé guanina, o bé citosina (d'entre quatre possibilitats, incloent-hi adenina i timina). Es pot referir a un fragment específic d'ADN o ARN, o al del genoma sencer. Quan es refereix a un fragment del material genètic, pot representar el contingut GC de part d'un gen (domini), un gen, un grup de gens, o fins i tot una regió no codificant. G (guanina) i C (citosina) tenen un enllaç d'hidrogen específic, mentre que A (adenina) s'uneix específicament amb T (timina). (ca)
- In molecular biology and genetics, GC-content (or guanine-cytosine content) is the percentage of nitrogenous bases in a DNA or RNA molecule that are either guanine (G) or cytosine (C). This measure indicates the proportion of G and C bases out of an implied four total bases, also including adenine and thymine in DNA and adenine and uracil in RNA. (en)
- En genética, GC, Contenido GC o Porcentaje GC (contenido de guanina y citosina) es una característica del genoma de un organismo o de cualquier pedazo de ADN o ARN. G y C denotan guanina y citosina, respectivamente. Expresado generalmente como porcentaje, representa la cantidad de pares Guanina-Citosina en la molécula de ADN o genoma que está siendo investigado. La fracción restante de cualquier molécula de ADN contendrá bases A (adenina) y T (timina), de forma que el contenido GC da también el contenido AT (por ejemplo, un GC del 58% implica un contenido AT del 42%). Los pares GC en el ADN están conectados por tres enlaces de hidrógeno en vez de dos de los pares AT. Esto hace el enlace GC más fuerte y más resistente a la desnaturalización por efecto de la temperatura por lo que el conten (es)
- Per contenuto di GC, s'intende il quantitativo di coppie di basi azotate di guanina e citosina presenti in una molecola di DNA. L'utilizzo di questa coppia di basi a scopi tassonomici è motivato dalla presenza di un triplo legame che le lega, a differenza della coppia adenina - timina, dove il legame è doppio. (it)
- Em biologia molecular e genética, o conteúdo GC (ou conteúdo de guanina-citosina) é a porcentagem de bases nitrogenadas em uma molécula de DNA ou RNA que são guanina ou citosina (dentre quatro bases possíveis, sendo as outras duas adenina e timina no DNA e adenina e uracil no RNA). Isto pode ser feito relativo a um determinado fragmento de DNA ou RNA ou ao genoma completo. G (guanina) e C (citosina) pareiam de forma específica na dupla hélice, da mesma forma que A (adenina) pareia com T (timina no DNA) ou U (uracilo no RNA). (pt)
- GC-состав (гуанин-цитозиновый состав, ГЦ-состав) — доля гуанина (G) и цитозина (C) среди всех остатков нуклеотидов рассматриваемой нуклеотидной последовательности. GC-состав может быть определён как для фрагмента молекулы ДНК или РНК, так и для всей молекулы или даже всего генома. При проведении ПЦР GC-состав праймера используется для предсказания температуры плавления этого праймера и температуры отжига. Высокий GC-состав праймера позволяет использовать его при высоких температурах отжига. (ru)
|
