| dbo:abstract
|
- صيغة فاستا صيغة فاستا أو صيغة ملف فاستا وهو مصطلح في علم المعلوماتية الحيوية، وصيغة ملف فاستا FASTA هو صيغة أو تنسيق تستند إلى نص لتمثيل أي تسلسل أو تسلسل النوكليوتيدات، والتي تمثل قاعدة أزواج أو أحماض أمينية باستخدام رموز من أحرف. تسمح الصيغة أيضا بوجود أسماء ألتسلسل وأيضا تعليقات تسبق تعاقب الدنا أو البروين. الصيغة مشتقة من حزمة برامج فاستا، ولكن الصيغة أصبحت الآن معيارا في مجال المعلوماتية الحيوية. (ar)
- En bioinformàtica, el format FASTA és un format de fitxer en text per a la representació de seqüències tant nucleotídiques com peptídiques, en què els nucleòtids i els aminoàcids es representen usant un codi d'una sola lletra. Aquest format també permet que les seqüències estiguin encapçalades pel nom de la seqüència o comentaris. El format FASTA es va originar pel paquet de software FASTA, però avui en dia és un estàndard en el camp de la bioinformàtica. La simplicitat del format FASTA fa que sigui fàcil manipular les seqüències usant eines de processament de text i llenguatges script com ara Python, Ruby o Perl. Una seqüència en format FASTA comença amb una capçalera de descripció d'una sola línia amb el símbol '>' al principi. La paraula que en segueix, que no ha de tenir espais, acostuma a ser l'identificador de la seqüència. Per altra banda, l'NCBI defineix un estàndard d'identificadors únics en aquesta capçalera de descripció, que programes com el makeblastdb del BLAST utilitzen per indexar fitxers amb múltiples seqüències. És habitual que la seqüència biològica que en segueix contingui només vuitanta caràcters per línia. >gi|31563518|ref|NP_852610.1| microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3A isoform b [Homo sapiens]MKMRFFSSPCGKAAVDPADRCKEVQQIRDQHPSKIPVIIERYKGEKQLPVLDKTKFLVPDHVNMSELVKIIRRRLQLNPTQAFFLLVNQHSMVSVSTPIADIYEQEKDEDGFLYMVYASQETFGF L'extensió de fitxer que conté les seqüències acostuma a ser: .fa, .fasta o variacions similars. (ca)
- Das FASTA-Format ist ein textbasiertes Format zur Darstellung und Speicherung der Primärstruktur von Nukleinsäuren (Nukleinsäuresequenz) und Proteinen (Proteinsequenz) in der Bioinformatik. Die Nukleinbasen bzw. Aminosäuren werden durch einen Ein-Buchstaben-Code dargestellt. Es ist dabei möglich den Sequenzen einen Namen und Kommentare voranzustellen. Die Einfachheit des Formates macht es Textverarbeitungswerkzeugen und Skriptsprachen leicht, die Daten einzulesen und zu verarbeiten. (de)
- In bioinformatics and biochemistry, the FASTA format is a text-based format for representing either nucleotide sequences or amino acid (protein) sequences, in which nucleotides or amino acids are represented using single-letter codes. The format also allows for sequence names and comments to precede the sequences. The format originates from the FASTA software package, but has now become a near universal standard in the field of bioinformatics. The simplicity of FASTA format makes it easy to manipulate and parse sequences using text-processing tools and scripting languages like the R programming language, Python, Ruby, Haskell, and Perl. (en)
- En bioinformática, el formato FASTA es un formato de fichero informático basado en texto, utilizado para representar secuencias de ácidos nucleicos, de péptido, y en el que los pares de bases o los aminoácidos se representan usando códigos de una única letra. El formato también permite incluir nombres de secuencias y comentarios que preceden a las secuencias en sí. La simplicidad del formato FASTA hace fácil el manipular y analizar secuencias usando herramientas de procesado de textos y lenguajes de guion como Python y PERL. (es)
- Le format FASTA (ou format Pearson) est un format de fichier texte utilisé pour stocker des séquences biologiques de nature nucléique ou protéique. Ces séquences sont représentées par une suite de lettres codant des acides nucléiques ou des acides aminés selon la nomenclature IUPAC. Chaque séquence peut être précédée par un nom et des commentaires. Ce format est originellement issu de la suite de programmes FASTA mais, de par son utilisation très répandue, est devenu un standard de facto en bioinformatique. La simplicité du format FASTA rend la manipulation et la lecture (ou analyse syntaxique) des séquences aisée par l'utilisation d'outils de traitement de texte et de langages de script tels que Python, R, Ruby ou Perl. Un fichier au format FASTA est conventionnellement signalé par une extension .fasta ou .fa. (fr)
- FASTA 포맷은 염기서열 혹은 단백질서열을 문자열로 표현한 것이다. 이 포맷은 소프트웨어 패키지가 기원이지만 현재는 생물정보학 분야에서 표준에 가깝게 사용되고 있다. (ko)
- FASTA — текстовый формат для нуклеотидных или полипептидных последовательностей, в котором нуклеотиды или аминокислоты обозначаются при помощи однобуквенных кодов. Из-за его простоты и практичности в настоящее время используется большинством программ работы с биологическими последовательностями. Файлы данного формата могут содержать названия последовательностей, их идентификаторы в базах данных и комментарии. В зависимости от природы содержащихся в нем биологических последовательностей, файл формата FASTA может иметь различные расширения. (ru)
- Format FASTA – format zapisu sekwencji kwasów nukleinowych oraz białek używanym w bioinformatyce. Nukleotydy (dla DNA i RNA) oraz aminokwasy (dla białek) oznaczone są jednoliterowymi skrótami. Format FASTA uwzględnia również możliwość dodawania opisów i komentarzy do sekwencji. (pl)
- Em bioinformática, o formato FASTA é um formato baseado em texto para representar tanto sequencias de nucleótidos quanto sequencias de peptídeos, no qual os nucleotídeos ou aminoácidos são representados usando códigos de uma única letra. O formato também permite sequências de nomes e comentários precedendo as sequências. O formato se origina do FASTA, pacote de software, mas agora se tornou um padrão na área de bioinformática. A simplicidade do formato FASTA torna mais fácil manipular e analisar sequências usando ferramentas de processamento de texto e linguagens de script como Python, Ruby, e Perl. (pt)
- У біоінформатиці, формат FASTA є текстовим файловим форматом для зберігання нуклеотидних послідовностей або пептидних послідовностей, у якому нуклеотиди або амінокислоти передаються за допомогою літер. Цей формат також дозволяє передавати опис цих послідовностей та короткий коментар до них. Назва формату походить від програмного пакету , але цей формат вже став незалежним стандартом у біоінформатиці. Простота формату FASTA полегшує обробку послідовностей з використанням текстових редакторів та скриптових мов програмування на кшталт Perl, Python та Ruby. (uk)
- 在生物信息学中，FASTA格式是一种用于记录核酸序列或肽序列的文本格式，其中的核酸或氨基酸均以单个字母编码呈现。该格式同时还允许在序列之前定义名称和编写注释。这一格式最初由软件包定义，但现今已是生物信息学领域的一项标准。 FASTA简明的格式降低了序列操纵和分析的难度，令序列可被文本处理工具和诸如Python、Ruby和Perl等脚本语言处理。 (zh)
|
| dbo:wikiPageExternalLink
| |
| dbo:wikiPageID
| |
| dbo:wikiPageLength
|
- 23557 (xsd:nonNegativeInteger)
|
| dbo:wikiPageRevisionID
| |
| dbo:wikiPageWikiLink
| |
| dbp:developer
| |
| dbp:extendedFrom
| |
| dbp:extendedTo
| |
| dbp:extensions
|
- .fasta, .fna, .ffn, .faa, .frn, .fa (en)
|
| dbp:genre
| |
| dbp:name
| |
| dbp:released
| |
| dbp:uniformType
| |
| dbp:url
| |
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| dcterms:subject
| |
| gold:hypernym
| |
| rdf:type
| |
| rdfs:comment
|
- صيغة فاستا صيغة فاستا أو صيغة ملف فاستا وهو مصطلح في علم المعلوماتية الحيوية، وصيغة ملف فاستا FASTA هو صيغة أو تنسيق تستند إلى نص لتمثيل أي تسلسل أو تسلسل النوكليوتيدات، والتي تمثل قاعدة أزواج أو أحماض أمينية باستخدام رموز من أحرف. تسمح الصيغة أيضا بوجود أسماء ألتسلسل وأيضا تعليقات تسبق تعاقب الدنا أو البروين. الصيغة مشتقة من حزمة برامج فاستا، ولكن الصيغة أصبحت الآن معيارا في مجال المعلوماتية الحيوية. (ar)
- Das FASTA-Format ist ein textbasiertes Format zur Darstellung und Speicherung der Primärstruktur von Nukleinsäuren (Nukleinsäuresequenz) und Proteinen (Proteinsequenz) in der Bioinformatik. Die Nukleinbasen bzw. Aminosäuren werden durch einen Ein-Buchstaben-Code dargestellt. Es ist dabei möglich den Sequenzen einen Namen und Kommentare voranzustellen. Die Einfachheit des Formates macht es Textverarbeitungswerkzeugen und Skriptsprachen leicht, die Daten einzulesen und zu verarbeiten. (de)
- En bioinformática, el formato FASTA es un formato de fichero informático basado en texto, utilizado para representar secuencias de ácidos nucleicos, de péptido, y en el que los pares de bases o los aminoácidos se representan usando códigos de una única letra. El formato también permite incluir nombres de secuencias y comentarios que preceden a las secuencias en sí. La simplicidad del formato FASTA hace fácil el manipular y analizar secuencias usando herramientas de procesado de textos y lenguajes de guion como Python y PERL. (es)
- FASTA 포맷은 염기서열 혹은 단백질서열을 문자열로 표현한 것이다. 이 포맷은 소프트웨어 패키지가 기원이지만 현재는 생물정보학 분야에서 표준에 가깝게 사용되고 있다. (ko)
- FASTA — текстовый формат для нуклеотидных или полипептидных последовательностей, в котором нуклеотиды или аминокислоты обозначаются при помощи однобуквенных кодов. Из-за его простоты и практичности в настоящее время используется большинством программ работы с биологическими последовательностями. Файлы данного формата могут содержать названия последовательностей, их идентификаторы в базах данных и комментарии. В зависимости от природы содержащихся в нем биологических последовательностей, файл формата FASTA может иметь различные расширения. (ru)
- Format FASTA – format zapisu sekwencji kwasów nukleinowych oraz białek używanym w bioinformatyce. Nukleotydy (dla DNA i RNA) oraz aminokwasy (dla białek) oznaczone są jednoliterowymi skrótami. Format FASTA uwzględnia również możliwość dodawania opisów i komentarzy do sekwencji. (pl)
- Em bioinformática, o formato FASTA é um formato baseado em texto para representar tanto sequencias de nucleótidos quanto sequencias de peptídeos, no qual os nucleotídeos ou aminoácidos são representados usando códigos de uma única letra. O formato também permite sequências de nomes e comentários precedendo as sequências. O formato se origina do FASTA, pacote de software, mas agora se tornou um padrão na área de bioinformática. A simplicidade do formato FASTA torna mais fácil manipular e analisar sequências usando ferramentas de processamento de texto e linguagens de script como Python, Ruby, e Perl. (pt)
- У біоінформатиці, формат FASTA є текстовим файловим форматом для зберігання нуклеотидних послідовностей або пептидних послідовностей, у якому нуклеотиди або амінокислоти передаються за допомогою літер. Цей формат також дозволяє передавати опис цих послідовностей та короткий коментар до них. Назва формату походить від програмного пакету , але цей формат вже став незалежним стандартом у біоінформатиці. Простота формату FASTA полегшує обробку послідовностей з використанням текстових редакторів та скриптових мов програмування на кшталт Perl, Python та Ruby. (uk)
- 在生物信息学中，FASTA格式是一种用于记录核酸序列或肽序列的文本格式，其中的核酸或氨基酸均以单个字母编码呈现。该格式同时还允许在序列之前定义名称和编写注释。这一格式最初由软件包定义，但现今已是生物信息学领域的一项标准。 FASTA简明的格式降低了序列操纵和分析的难度，令序列可被文本处理工具和诸如Python、Ruby和Perl等脚本语言处理。 (zh)
- En bioinformàtica, el format FASTA és un format de fitxer en text per a la representació de seqüències tant nucleotídiques com peptídiques, en què els nucleòtids i els aminoàcids es representen usant un codi d'una sola lletra. Aquest format també permet que les seqüències estiguin encapçalades pel nom de la seqüència o comentaris. El format FASTA es va originar pel paquet de software FASTA, però avui en dia és un estàndard en el camp de la bioinformàtica. És habitual que la seqüència biològica que en segueix contingui només vuitanta caràcters per línia. (ca)
- In bioinformatics and biochemistry, the FASTA format is a text-based format for representing either nucleotide sequences or amino acid (protein) sequences, in which nucleotides or amino acids are represented using single-letter codes. The format also allows for sequence names and comments to precede the sequences. The format originates from the FASTA software package, but has now become a near universal standard in the field of bioinformatics. (en)
- Le format FASTA (ou format Pearson) est un format de fichier texte utilisé pour stocker des séquences biologiques de nature nucléique ou protéique. Ces séquences sont représentées par une suite de lettres codant des acides nucléiques ou des acides aminés selon la nomenclature IUPAC. Chaque séquence peut être précédée par un nom et des commentaires. Ce format est originellement issu de la suite de programmes FASTA mais, de par son utilisation très répandue, est devenu un standard de facto en bioinformatique. (fr)
|
| rdfs:label
|
- صيغة فاستا (ar)
- Format FASTA (ca)
- FASTA format (en)
- FASTA-Format (de)
- Formato FASTA (es)
- FASTA (format de fichier) (fr)
- FASTA 포맷 (ko)
- FASTA format (pl)
- Formato FASTA (pt)
- FASTA (ru)
- Формат FASTA (uk)
- FASTA格式 (zh)
|
| owl:sameAs
| |
| prov:wasDerivedFrom
| |
| foaf:isPrimaryTopicOf
| |
| is dbo:wikiPageRedirects
of | |
| is dbo:wikiPageWikiLink
of | |
| is dbp:format
of | |
| is foaf:primaryTopic
of | |
