| dbo:abstract
|
- RNA-seq (seqüenciació d'RNA), també anomenat Seqüenciació del Transcriptoma Sencer per Clonatge a l'atzar (de l'anglés Whole Transcriptome Shotgun Sequencing), utilitza la (NGS) per revelar la presència i quantitat d'RNA en una mostra biològica a un moment donat. Així, l'RNA-Seq s'usa per analitzar canvis en el transcriptoma. Concretament, l'RNA-Seq facilita l'observació de transcrits resultants de l'empalmament alternatiu, modificacions , , mutacions/SNPs (Polimorfismes de Nucleòtids simples) i canvis d'expressió de gens. Donat que el procés implica l'obtenció d'RNA total, l'RNA-Seq pot ajudar a caracteritzar poblacions diferents d'RNA com miRNA, tRNA, i rRNA. Aquesta tecnologia, a més, també pot servir per determinar les fronteres exó/intró i verificar o esmenar regions 5' i 3'. (ca)
- يستخدم RNA-Seq تسلسل الجيل التالي (NGS) للكشف عن وجود وكمية من الحمض النووي الريبي في عينة بيولوجية في لحظة معينة، وتحليل المتغير الخلوي المستمر. على وجه التحديد، يسهل RNA-Seq القدرة على النظر إلى الجينات البديلة المقسمة، والتعديلات بعد النسخ، والانصهار الجيني، والطفرات / SNPs والتغيرات في التعبير الجيني مع مرور الوقت، أو الاختلافات في التعبير الجيني في مجموعات أو علاجات مختلفة. بالإضافة إلى نسخ mRNA، يمكن أن ينظر RNA-Seq إلى مجموعات مختلفة من الحمض النووي الريبي (RNA) لتشمل إجمالي الحمض النووي الريبي (RNA)، والحمض النووي الريبي (RNA) الصغير، مثل miRNA، الحمض الريبي النووي النقال (tRNA)، وتحديد ملامح الريبوسوم. يمكن أيضًا استخدام RNA-Seq لتحديد حدود exon / intron والتحقق من أو تعديل حدود الجين الموضحة مسبقًا 5 و3. تشمل التطورات الحديثة في RNA-Seq تسلسل خلية وحيدة وتسلسل الأنسجة الثابتة في الموقع. قبل RNA-Seq، أجريت دراسات التعبير الجيني مع المصفوفات الدقيقة القائمة على التهجين. تشمل مشاكل المصفوفات الدقيقة القطع الجينية المتقاطعة، التهميش السيئ للجينات منخفضة الوزن وعالية التعبير، والحاجة إلى معرفة التسلسل المسبق. بسبب هذه المشكلات الفنية، انتقلت النصوص إلى الأساليب القائمة على التسلسل. لقد تطورت هذه من تسلسل Sanger في مكتبات Expressed Sequence Tag، إلى الأساليب القائمة على العلامات الكيميائية (على سبيل المثال، التحليل التسلسلي للتعبير الجيني)، وأخيراً إلى التكنولوجيا الحالية، تسلسل الجيل القادم من cDNA (خاصة RNA-Seq). (ar)
- سَلسَلة الرنا (بفتح السين) (بالإنجليزية: RNA-Seq) وتسمى كذلك السَلسَلة العشوائية لكامل النسخوم (بالإنجليزية: whole transcriptome shotgun sequencing) هي تقنية تستخدم سَلسَلة عالية الإنتاج (سَلسَلة الجيل التالي) للكشف عن تواجد وكمية الرنا في عينة بيولوجية في لحظة معينة. تُستخدم سَلسَلة الرنا في دراسة التغير المستمر للنسخوم الخلوي. وبشكل خاص، تسهِّل سَلسَلة الرنا القدرة على تحديد نُسَخِ الجين المضفرة بالتضفير البديل، تعديلات ما بعد النسخ، ، الطفرات/ تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة والتغيرات في التعبير الجيني مع مرور الوقت، أو الاختلافات في التعبير الجيني في مجموعات أو علاجات مختلفة. فضلا عن نسخ الرنا الرسول، يمكن لسَلسَلة الرنا البحث في مختلف أنواع الرنا بما في ذلك الرنا الصغير مثل الرنا الميكروي والرنا الناقل والرنا الريبوسومي. يمكن كذلك استخدام سَلسَلة الرنا لتحديد الحدود بين الإكسونات والإنترونات والتأكد من وتعديل حدود النهاية 5' والنهاية 3' الموضوعة سابقا للجينات. التقدمات الحديثة في سَلسَلة الرنا تشمل والسَلسَلة الموضعية لنسيج مثبت. قبل تطوير سَلسَلة الرنا، كانت دراسات التعبير الجيني تتم بواسطة التهجين المبني على المصفوفات الدقيقة، ومن مشاكل المصفوفات الدقيقة: أخطاء التهجين التصالبي (cross-hybridization artifacts)، التكميم (تحديد الكمية) الضعيف للجينات المعبر عنها بقلة أو بكثرة، والحاجة إلى معرفة التسلسل مسبقا. وبسبب هذه المشاكل التقنية، انتقلت النسخوميات إلى الطرق المبنية على تحديد التسلسل. وتطورت هذه الأخيرة من لمكتبات تسلسل الوسم المعبر عنه إلى طرق مبنية على وسوم كيميائية (مثل: التحليل التسلسلي للتعبير الجيني) وأخيرا إلى التقانة الحالية: سَلسَلة الجيل التالي أو السَلسَلة عالية الإنتاج للدنا المتمم (وبشكل أخص سَلسَلة الرنا). (ar)
- Als RNA-Seq, auch „Gesamt-Transkriptom-Shotgun-Sequenzierung“ genannt, wird die Bestimmung der Nukleotidabfolge der RNA bezeichnet, die auf Hochdurchsatzmethoden (Next-Generation Sequencing) basiert. Hierfür wird die RNA in cDNA übersetzt, damit die Methode der DNA-Sequenzierung angewendet werden kann. RNA-Seq enthüllt Informationen zur Genexpression, zum Beispiel wie unterschiedliche Allele eines Gens exprimiert werden und ermöglicht das Erkennen von posttranskriptionalen Modifikationen, sowie die Identifizierung von . RNA-Seq ist eine moderne sequenzbasierte Methode und basiert auf Sequenzierung der nächsten Generation (engl. next-generation sequencing). RNA-Seq hat klare Vorteile gegenüber den anderen Methoden. RNA-Seq hilft dabei, komplexe Transkriptome zu erforschen und gibt Aufschluss, welche Exons in der messenger-RNA zusammenfinden. Geringes Hintergrundrauschen, höhere Auflösung und hohe Reproduktionsraten in technischen als auch biologischen Replikaten sind klare Vorteile von RNA-Seq. (de)
- RNA-seq ( «secuenciación de ARN» ), también llamado Secuenciación del Transcriptoma Entero para Clonación al Azar (del inglés Whole Transcriptome Shotgun Sequencing ), utiliza la (NGS) para revelar la presencia y cantidad de ARN, en una muestra biológica en un momento dado. Así, la RNA Seq usa para analizar cambios en el transcriptoma. Concretamente, la RNA-seq facilita la observación de transcritos resultantes del empalme alternativo, modificación postranscripcional, , mutaciones/polimorfismos de nucleótidos únicos y cambios de expresión de genes. Dado que el proceso implica la obtención de RNA total, la RNA Seq puede ayudar a caracterizar poblaciones diferentes de RNA como miRNA, tRNA, y rRNA Esta tecnología, además, también puede servir para determinar las fronteras exón / intrón y verificar o enmendar regiones 5 'y 3'. Los datos obtenidos mediante RNA-seq han sido útiles para la realización de numerosos estudios. En un artículo publicado en 2019 en la revista Nature communications se utilizan datos de ARN-seq para estudiar las firmas transcriptómicas de diferentes miembros del MTBC. Los resultados obtenidos en este estudio muestran que los diferentes clados MTBC tienen su propia firma transcriptómica. (es)
- Le séquençage de l'ARN (RNA-Seq, de l’anglais RNA sequencing), également appelé séquençage aléatoire du transcriptome entier (whole transcriptome shotgun sequencing en anglais), est une technologie qui utilise le séquençage à haut débit (next-generation sequencing en anglais) pour identifier et quantifier l'ARN issu de la transcription du génome à un moment donné. (fr)
- RNA-Seq (named as an abbreviation of RNA sequencing) is a sequencing technique which uses next-generation sequencing (NGS) to reveal the presence and quantity of RNA in a biological sample at a given moment, analyzing the continuously changing cellular transcriptome. Specifically, RNA-Seq facilitates the ability to look at alternative gene spliced transcripts, post-transcriptional modifications, gene fusion, mutations/SNPs and changes in gene expression over time, or differences in gene expression in different groups or treatments. In addition to mRNA transcripts, RNA-Seq can look at different populations of RNA to include total RNA, small RNA, such as miRNA, tRNA, and ribosomal profiling. RNA-Seq can also be used to determine exon/intron boundaries and verify or amend previously annotated 5' and 3' gene boundaries. Recent advances in RNA-Seq include single cell sequencing, in situ sequencing of fixed tissue, and native RNA molecule sequencing with single-molecule real-time sequencing. Other examples of emerging RNA-Seq applications due to the advancement of bioinformatics algorithms are copy number alteration, microbial contamination, transposable elements, cell type (deconvolution) and the presence of neoantigens. Prior to RNA-Seq, gene expression studies were done with hybridization-based microarrays. Issues with microarrays include cross-hybridization artifacts, poor quantification of lowly and highly expressed genes, and needing to know the sequence a priori. Because of these technical issues, transcriptomics transitioned to sequencing-based methods. These progressed from Sanger sequencing of Expressed sequence tag libraries, to chemical tag-based methods (e.g., serial analysis of gene expression), and finally to the current technology, next-gen sequencing of complementary DNA (cDNA), notably RNA-Seq. (en)
- RNA-sequencing, afgekort tot RNA-seq, is een relatief nieuwe moleculaire laboratoriumtechniek die het mogelijk maakt om de algehele genexpressie en dus de transcriptionele activiteit van cellen in kaart te brengen door middel van next-generation sequencing technologieën. Daar waar standaard DNA-sequencing technieken voornamelijk de nucleotidenvolgorde van het DNA vaststellen, maakt RNA-sequencing het mogelijk om kwantitatief alle RNA-moleculen te analyseren, wat wetenschappers in staat stelt om het cellulaire transcriptoom in kaart te brengen. Heden ten dage is RNA-sequencing een essentiële moleculaire laboratoriumtechniek die veelvuldig toegepast wordt voor kankeronderzoek. (nl)
- Секвени́рование РНК (англ. RNA sequencing, RNA-seq) — метод определения первичной структуры молекул РНК, представляющий собой высокочувствительный и точный инструмент для изучения транскриптома. Под этим может подразумеваться как секвенирование мРНК, так и определение последовательности некодирующих РНК. Современное полногеномное секвенирование основано на прямом секвенировании фрагментов кДНК. В отличие от другого широкомасштабного метода анализа транскриптома — экспрессионных микрочипов, РНК-секвенирование позволяет получать данные об аллель-специфичной экспрессии генов, сплайсинговых вариантах транскриптов, пост- и ко-трансляционном редактировании РНК, однонуклеотидных полиморфизмах, а также химерных генах. Кроме того, РНК-секвенирование позволяет получить абсолютную количественную информацию о представленности различных транскриптов в пробе, в отличие от относительных количественных данных микрочипов. Совершенствование технологий секвенирования РНК наряду с развитием секвенирования РНК одиночных клеток (англ. single-cell RNA-seq) позволяет более детально изучать этиологию и патогенез различных заболеваний. (ru)
- 核糖核酸测序，简称RNA测序（英語：RNA Sequencing，英文简称RNA-Seq，也被称为全转录物组散彈枪法测序 Whole Transcriptome Shotgun Sequencing，简称WTSS）是基于第二代测序技术的转录组学研究方法。RNA测序是使用第二代测序的能力，在给定时刻从一个基因组中，揭示RNA的存在和数量的一个快照的技术。 首先提取生物样品的全部转录的RNA，然后反转录为c-DNA后进行的二代高通量测序，在此基础上进行片段的重叠组装，从而可得到一个个的转录本。进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解（global）。进一步说，若和下一阶段的生物样品的RNA-Seq转录组进行比较，则可以得到全部的（在转录层面）基因表达的上调及下调--这就形成了表达谱，针对关键基因则可以形成你要想要的通路（英語：pathway）的构建。 (zh)
|
| rdfs:comment
|
- Le séquençage de l'ARN (RNA-Seq, de l’anglais RNA sequencing), également appelé séquençage aléatoire du transcriptome entier (whole transcriptome shotgun sequencing en anglais), est une technologie qui utilise le séquençage à haut débit (next-generation sequencing en anglais) pour identifier et quantifier l'ARN issu de la transcription du génome à un moment donné. (fr)
- RNA-sequencing, afgekort tot RNA-seq, is een relatief nieuwe moleculaire laboratoriumtechniek die het mogelijk maakt om de algehele genexpressie en dus de transcriptionele activiteit van cellen in kaart te brengen door middel van next-generation sequencing technologieën. Daar waar standaard DNA-sequencing technieken voornamelijk de nucleotidenvolgorde van het DNA vaststellen, maakt RNA-sequencing het mogelijk om kwantitatief alle RNA-moleculen te analyseren, wat wetenschappers in staat stelt om het cellulaire transcriptoom in kaart te brengen. Heden ten dage is RNA-sequencing een essentiële moleculaire laboratoriumtechniek die veelvuldig toegepast wordt voor kankeronderzoek. (nl)
- 核糖核酸测序，简称RNA测序（英語：RNA Sequencing，英文简称RNA-Seq，也被称为全转录物组散彈枪法测序 Whole Transcriptome Shotgun Sequencing，简称WTSS）是基于第二代测序技术的转录组学研究方法。RNA测序是使用第二代测序的能力，在给定时刻从一个基因组中，揭示RNA的存在和数量的一个快照的技术。 首先提取生物样品的全部转录的RNA，然后反转录为c-DNA后进行的二代高通量测序，在此基础上进行片段的重叠组装，从而可得到一个个的转录本。进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解（global）。进一步说，若和下一阶段的生物样品的RNA-Seq转录组进行比较，则可以得到全部的（在转录层面）基因表达的上调及下调--这就形成了表达谱，针对关键基因则可以形成你要想要的通路（英語：pathway）的构建。 (zh)
- يستخدم RNA-Seq تسلسل الجيل التالي (NGS) للكشف عن وجود وكمية من الحمض النووي الريبي في عينة بيولوجية في لحظة معينة، وتحليل المتغير الخلوي المستمر. على وجه التحديد، يسهل RNA-Seq القدرة على النظر إلى الجينات البديلة المقسمة، والتعديلات بعد النسخ، والانصهار الجيني، والطفرات / SNPs والتغيرات في التعبير الجيني مع مرور الوقت، أو الاختلافات في التعبير الجيني في مجموعات أو علاجات مختلفة. بالإضافة إلى نسخ mRNA، يمكن أن ينظر RNA-Seq إلى مجموعات مختلفة من الحمض النووي الريبي (RNA) لتشمل إجمالي الحمض النووي الريبي (RNA)، والحمض النووي الريبي (RNA) الصغير، مثل miRNA، الحمض الريبي النووي النقال (tRNA)، وتحديد ملامح الريبوسوم. يمكن أيضًا استخدام RNA-Seq لتحديد حدود exon / intron والتحقق من أو تعديل حدود الجين الموضحة مسبقًا 5 و3. تشمل التطورات الحديثة في RNA-Seq تسلسل خلية وحيدة وتسلسل الأنسجة الثابتة في (ar)
- سَلسَلة الرنا (بفتح السين) (بالإنجليزية: RNA-Seq) وتسمى كذلك السَلسَلة العشوائية لكامل النسخوم (بالإنجليزية: whole transcriptome shotgun sequencing) هي تقنية تستخدم سَلسَلة عالية الإنتاج (سَلسَلة الجيل التالي) للكشف عن تواجد وكمية الرنا في عينة بيولوجية في لحظة معينة. (ar)
- RNA-seq (seqüenciació d'RNA), també anomenat Seqüenciació del Transcriptoma Sencer per Clonatge a l'atzar (de l'anglés Whole Transcriptome Shotgun Sequencing), utilitza la (NGS) per revelar la presència i quantitat d'RNA en una mostra biològica a un moment donat. (ca)
- RNA-seq ( «secuenciación de ARN» ), también llamado Secuenciación del Transcriptoma Entero para Clonación al Azar (del inglés Whole Transcriptome Shotgun Sequencing ), utiliza la (NGS) para revelar la presencia y cantidad de ARN, en una muestra biológica en un momento dado. (es)
- Als RNA-Seq, auch „Gesamt-Transkriptom-Shotgun-Sequenzierung“ genannt, wird die Bestimmung der Nukleotidabfolge der RNA bezeichnet, die auf Hochdurchsatzmethoden (Next-Generation Sequencing) basiert. Hierfür wird die RNA in cDNA übersetzt, damit die Methode der DNA-Sequenzierung angewendet werden kann. RNA-Seq enthüllt Informationen zur Genexpression, zum Beispiel wie unterschiedliche Allele eines Gens exprimiert werden und ermöglicht das Erkennen von posttranskriptionalen Modifikationen, sowie die Identifizierung von . (de)
- RNA-Seq (named as an abbreviation of RNA sequencing) is a sequencing technique which uses next-generation sequencing (NGS) to reveal the presence and quantity of RNA in a biological sample at a given moment, analyzing the continuously changing cellular transcriptome. (en)
- Секвени́рование РНК (англ. RNA sequencing, RNA-seq) — метод определения первичной структуры молекул РНК, представляющий собой высокочувствительный и точный инструмент для изучения транскриптома. Под этим может подразумеваться как секвенирование мРНК, так и определение последовательности некодирующих РНК. Современное полногеномное секвенирование основано на прямом секвенировании фрагментов кДНК. (ru)
|
.png){kind=link}
.png){kind=link}
