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- El terme k-mer fa referència a totes les subcadenes possibles de longitud k contingudes en una cadena. En , els k-mers són les subsequències possibles (de longitud k) d'una lectura obtinguda a patir d'un procés de seqüenciació de l'ADN. La quantitat de k-mers possibles donada una cadena de longitud L és , mentre que el nombre de possibles k-mers donades n possibilitats (4 en el cas d'ADN, p. ex. ACTG) és . Els k-mers s'utilitzen normalment en l'assemblatge de seqüències, però també en l'alineament de seqüències. En el context del genoma humà, k-mers de diverses longituds s'han utilitzat per explicar la variabilitat dels índexs de mutació. (ca)
- In bioinformatics, k-mers are substrings of length contained within a biological sequence. Primarily used within the context of computational genomics and sequence analysis, in which k-mers are composed of nucleotides (i.e. A, T, G, and C), k-mers are capitalized upon to assemble DNA sequences, improve heterologous gene expression, identify species in metagenomic samples, and create attenuated vaccines. Usually, the term k-mer refers to all of a sequence's subsequences of length , such that the sequence AGAT would have four monomers (A, G, A, and T), three 2-mers (AG, GA, AT), two 3-mers (AGA and GAT) and one 4-mer (AGAT). More generally, a sequence of length will have k-mers and total possible k-mers, where is number of possible monomers (e.g. four in the case of DNA). (en)
- En bioinformática, los k-meros son subcadenas de la longitud contenidas dentro de una secuencia biológica. Principalmente utilizadas en el contexto de genómica computacional y análisis de secuencias, en el cual los k-meros están compuestos de nucleótidos (es decir, A, T, G, y C). Son utilizados para ensamblar secuencias de ADN, mejorar la expresión génica heteróloga, identificar especies en muestras metagenómicas, y crear vacunas atenuadas. Normalmente, el término k-mero hace referencia a todas las subsecuencias de longitud de una secuencia, tal que la secuencia AGAT tendría cuatro monómeros (A, G, A y T), tres dímeros (AG, GA, AT), dos trímeros (AGA y GAT) y un tetrámero (AGAT). De manera más general, una secuencia de longitud tendrá k-meros y k-meros posibles en total, es el número de monómeros posibles (p. ej. cuatro en el caso del ADN). (es)
- Le terme k-mer fait généralement référence à toutes les sous-chaînes de longueur k qui sont contenues dans une chaîne de caractère. En génomique computationnelle, les k-mers font référence à toutes les sous-séquences (de longueur k) à partir d'une lecture obtenues par séquençage de l'ADN. La quantité de k-mers possible étant donnée une chaîne de caractères de longueur L est tandis que le nombre de k-mers étant données n possibilités (4 dans le cas de l'ADN par exemple ACTG) est . Les k-mers sont généralement utilisés lors de l'assemblage de séquences, mais peuvent également être utilisés dans l'alignement de la séquence. Dans le contexte du génome humain, les k-mers de différentes longueurs ont été utilisés pour expliquer la variabilité dans les taux de mutation. (fr)
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- El terme k-mer fa referència a totes les subcadenes possibles de longitud k contingudes en una cadena. En , els k-mers són les subsequències possibles (de longitud k) d'una lectura obtinguda a patir d'un procés de seqüenciació de l'ADN. La quantitat de k-mers possibles donada una cadena de longitud L és , mentre que el nombre de possibles k-mers donades n possibilitats (4 en el cas d'ADN, p. ex. ACTG) és . Els k-mers s'utilitzen normalment en l'assemblatge de seqüències, però també en l'alineament de seqüències. En el context del genoma humà, k-mers de diverses longituds s'han utilitzat per explicar la variabilitat dels índexs de mutació. (ca)
- In bioinformatics, k-mers are substrings of length contained within a biological sequence. Primarily used within the context of computational genomics and sequence analysis, in which k-mers are composed of nucleotides (i.e. A, T, G, and C), k-mers are capitalized upon to assemble DNA sequences, improve heterologous gene expression, identify species in metagenomic samples, and create attenuated vaccines. Usually, the term k-mer refers to all of a sequence's subsequences of length , such that the sequence AGAT would have four monomers (A, G, A, and T), three 2-mers (AG, GA, AT), two 3-mers (AGA and GAT) and one 4-mer (AGAT). More generally, a sequence of length will have k-mers and total possible k-mers, where is number of possible monomers (e.g. four in the case of DNA). (en)
- Le terme k-mer fait généralement référence à toutes les sous-chaînes de longueur k qui sont contenues dans une chaîne de caractère. En génomique computationnelle, les k-mers font référence à toutes les sous-séquences (de longueur k) à partir d'une lecture obtenues par séquençage de l'ADN. La quantité de k-mers possible étant donnée une chaîne de caractères de longueur L est tandis que le nombre de k-mers étant données n possibilités (4 dans le cas de l'ADN par exemple ACTG) est . Les k-mers sont généralement utilisés lors de l'assemblage de séquences, mais peuvent également être utilisés dans l'alignement de la séquence. Dans le contexte du génome humain, les k-mers de différentes longueurs ont été utilisés pour expliquer la variabilité dans les taux de mutation. (fr)
- En bioinformática, los k-meros son subcadenas de la longitud contenidas dentro de una secuencia biológica. Principalmente utilizadas en el contexto de genómica computacional y análisis de secuencias, en el cual los k-meros están compuestos de nucleótidos (es decir, A, T, G, y C). Son utilizados para ensamblar secuencias de ADN, mejorar la expresión génica heteróloga, identificar especies en muestras metagenómicas, y crear vacunas atenuadas. Normalmente, el término k-mero hace referencia a todas las subsecuencias de longitud de una secuencia, tal que la secuencia AGAT tendría cuatro monómeros (A, G, A y T), tres dímeros (AG, GA, AT), dos trímeros (AGA y GAT) y un tetrámero (AGAT). De manera más general, una secuencia de longitud tendrá k-meros y k-meros posibles en total, es el n (es)
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