| dbo:abstract
|
- El ribosome profiling o Ribo-seq (en català, empremta ribosomal) és una tècnica derivada del RNA-seq descrita per primer cop l'any 2009 per . Aquesta tècnica permet estudiar el a una precisió de fins als nucleòtids, sent fins al moment una de les tècniques més potents per estudiar el procés de traducció. El ribosoma és un complex multiproteic encarregat de sintetitzar proteïnes en totes les cèl·lules vives de tots els organismes. Aquesta maquinària utilitza l'ARN missatger com a guia per a sintetitzar proteïnes; durant el procés el ribosoma es mou al llarg de tot l'ARN missatger ocupant prop de 28 nucleòtids. Així doncs, aquesta tècnica es basa en la seqüenciació d'aquests 28 nucleòtids "entreteixits" pel ribosoma. A fi d'obtenir aquesta empremta ribosomal, es requereix una digestió enzimatica (sovint a través de la RNAseA o la nucleasa micrococal) controlada capaç de degradar l'ARN missatger existent entre dos ribosomes i deixant únicament sense degradar l'ARN que hi ha dins del ribosoma. Després d'aquesta digestió, es realitza una selecció de mida en un gel de poliacrilamida en què es talla el gel al voltant de 28 nucleòtids i es purifica la banda d'interès. Finalment, es duu a terme una preparació de la mostra per a sequenciar i es realitza l'anàlisi de dades per a extreure la informació biològica del procés de traducció. (ca)
- برفلة الريبوسوم (بالإنجليزية: Ribosome profiling) أو بصمة الريبوسوم (Ribosome footprinting) هي تقنية تَستخدم السَلسَلة عالية الإنتاج (سَلسَلة الجيل التالي) لتحديد ما هي جزيئات الرنا الرسول التي تتم ترجمتها. وتعطي صورة عن الريبوسومات النشطة في الخلية أثناء لحظة معينة، ويسمى ذلك بالترجموم (en). تسمح هذه التقنية كذلك للباحثين بتحديد مواقع بدء الترجمة، إطارات القراءة المفتوحة في خلية أو نسيج، توزيع الريبوسومات على الرنا الرسول، وسرعة الترجمة. تتطلب برفلة الريبوسوم تحضير مكتبة سَلسَلة ودراسة بيانات مماثلة لتقنية سلسلة الرنا التي تُحدِّد التسلسل الكامل للرنا الرسول المتواجد في عينة، بينما برفلة الريبوسوم لا تستهدف سوى تسلسلات الرنا الرسول المحمية بواسطة الريبوسومات أثناء عملية الترجمة. هذه التقنية مختلفة عن تقنية برفلة عديد الريبوسوم (en). (ar)
- Ribosome profiling, or Ribo-Seq (also named ribosome footprinting), is an adaptation of a technique developed by Joan Steitz and Marilyn Kozak almost 50 years ago that Nicholas Ingolia and Jonathan Weissman adapted to work with next generation sequencing that uses specialized messenger RNA (mRNA) sequencing to determine which mRNAs are being actively translated. A related technique that can also be used to determine which mRNAs are being actively translated is the Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP) methodology, which was developed by Nathaniel Heintz at Rockefeller University (in collaboration with Paul Greengard and Myriam Heiman). TRAP does not involve ribosome footprinting but provides cell type-specific information. (en)
- Рибосомальный профилинг — это метод, основанный на массовом секвенировании фрагментов мРНК, взаимодействующих с рибосомами. Этот метод позволяет наблюдать за трансляцией, конкуренцией рибосом за локализацию вокруг мРНК в определенном месте. Также его используют для нахождения области, кодирующей белки в мРНК, рамок считывания, для определения месторасположения рибосом на мРНК. Рибосомальный профилинг не позволяет прямо описывать кинетику элонгации и остановки рибосом, задействованных в процессе элонгации. До появления этого метода ключевой технологией измерения экспрессии генов была total mrna abundance[уточнить]. (ru)
|
| dbo:thumbnail
| |
| dbo:wikiPageExternalLink
| |
| dbo:wikiPageID
| |
| dbo:wikiPageLength
|
- 11766 (xsd:nonNegativeInteger)
|
| dbo:wikiPageRevisionID
| |
| dbo:wikiPageWikiLink
| |
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| dcterms:subject
| |
| gold:hypernym
| |
| rdf:type
| |
| rdfs:comment
|
- برفلة الريبوسوم (بالإنجليزية: Ribosome profiling) أو بصمة الريبوسوم (Ribosome footprinting) هي تقنية تَستخدم السَلسَلة عالية الإنتاج (سَلسَلة الجيل التالي) لتحديد ما هي جزيئات الرنا الرسول التي تتم ترجمتها. وتعطي صورة عن الريبوسومات النشطة في الخلية أثناء لحظة معينة، ويسمى ذلك بالترجموم (en). تسمح هذه التقنية كذلك للباحثين بتحديد مواقع بدء الترجمة، إطارات القراءة المفتوحة في خلية أو نسيج، توزيع الريبوسومات على الرنا الرسول، وسرعة الترجمة. تتطلب برفلة الريبوسوم تحضير مكتبة سَلسَلة ودراسة بيانات مماثلة لتقنية سلسلة الرنا التي تُحدِّد التسلسل الكامل للرنا الرسول المتواجد في عينة، بينما برفلة الريبوسوم لا تستهدف سوى تسلسلات الرنا الرسول المحمية بواسطة الريبوسومات أثناء عملية الترجمة. هذه التقنية مختلفة عن تقنية برفلة عديد الريبوسوم (en). (ar)
- Ribosome profiling, or Ribo-Seq (also named ribosome footprinting), is an adaptation of a technique developed by Joan Steitz and Marilyn Kozak almost 50 years ago that Nicholas Ingolia and Jonathan Weissman adapted to work with next generation sequencing that uses specialized messenger RNA (mRNA) sequencing to determine which mRNAs are being actively translated. A related technique that can also be used to determine which mRNAs are being actively translated is the Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP) methodology, which was developed by Nathaniel Heintz at Rockefeller University (in collaboration with Paul Greengard and Myriam Heiman). TRAP does not involve ribosome footprinting but provides cell type-specific information. (en)
- El ribosome profiling o Ribo-seq (en català, empremta ribosomal) és una tècnica derivada del RNA-seq descrita per primer cop l'any 2009 per . Aquesta tècnica permet estudiar el a una precisió de fins als nucleòtids, sent fins al moment una de les tècniques més potents per estudiar el procés de traducció. (ca)
- Рибосомальный профилинг — это метод, основанный на массовом секвенировании фрагментов мРНК, взаимодействующих с рибосомами. Этот метод позволяет наблюдать за трансляцией, конкуренцией рибосом за локализацию вокруг мРНК в определенном месте. Также его используют для нахождения области, кодирующей белки в мРНК, рамок считывания, для определения месторасположения рибосом на мРНК. Рибосомальный профилинг не позволяет прямо описывать кинетику элонгации и остановки рибосом, задействованных в процессе элонгации. (ru)
|
| rdfs:label
|
- برفلة الريبوسوم (ar)
- Empremta ribosomal (ca)
- Ribosome profiling (en)
- Рибосомальный профилинг (ru)
|
| owl:sameAs
| |
| prov:wasDerivedFrom
| |
| foaf:depiction
| |
| foaf:isPrimaryTopicOf
| |
| is dbo:knownFor
of | |
| is dbo:wikiPageRedirects
of | |
| is dbo:wikiPageWikiLink
of | |
| is dbp:knownFor
of | |
| is foaf:primaryTopic
of | |
