| dbo:abstract
|
- Eine Gyrase (v. altgr.: γῦρος, gyros = Kreis, Rundung) ist ein Enzym, das die Raumorientierung von geschlossenen DNA-Molekülen verändert. Sie gehört zu den Topoisomerasen Typ II, welche in prokaryotischen Zellen ATP-abhängig einen Doppelstrangbruch in der DNA verursachen. Die Gyrase sorgt für negatives supercoiling – eine „Entwindung“ der DNA im Gegensatz zur Normalstruktur (B-DNA) mit circa zehn Basenpaaren pro Windung. Dies führt sowohl zu einem Platzgewinn, als auch einer partiell besseren Ablesbarkeit der DNA. Da die Gyrase = Topoisomerase II in dieser Form (mit dieser Proteinstruktur) nur in Bakterien vorkommt, werden Gyrasehemmer auch als Antibiotika eingesetzt. Die Affinität der Gyrasehemmer zu der bakteriellen Gyrase ist höher als zu menschlichen Topoisomerasen. Allerdings ist der Wirkmechanismus nicht 100 % selektiv und so haben Gyrasehemmer auch zytostatische Eigenschaften. Die Bindung des ATP an die Gyrase wird durch das Antibiotikum blockiert. Eine Reverse Gyrase führt ein positives DNA-Supercoiling aus, wodurch die Temperaturbeständigkeit des DNA-Doppelstrangs erhöht wird. Ihre Funktionalität entspricht der einer Typ I Topoisomerase, gekoppelt mit einer Helicase. Reverse Gyrasen wurden bei Bakterien und Archaeen gefunden. Im Allgemeinen bestehen sie aus einem einzigen Polypeptid, eine Ausnahme wurde bei gefunden (zwei Teile). (de)
- DNA gyrase, or simply gyrase, is an enzyme within the class of topoisomerase and is a subclass of Type II topoisomerases that reduces topological strain in an ATP dependent manner while double-stranded DNA is being unwound by elongating RNA-polymerase or by helicase in front of the progressing replication fork. The enzyme causes negative supercoiling of the DNA or relaxes positive supercoils. It does so by looping the template so as to form a crossing, then cutting one of the double helices and passing the other through it before releasing the break, changing the linking number by two in each enzymatic step. This process occurs in bacteria, whose single circular DNA is cut by DNA gyrase and the two ends are then twisted around each other to form supercoils. Gyrase is also found in eukaryotic plastids: it has been found in the apicoplast of the malarial parasite Plasmodium falciparum and in chloroplasts of several plants. Bacterial DNA gyrase is the target of many antibiotics, including nalidixic acid, novobiocin, and ciprofloxacin. The unique ability of gyrase to introduce negative supercoils into DNA at the expense of ATP hydrolysis is what allows bacterial DNA to have free negative supercoils. The ability of gyrase to relax positive supercoils comes into play during DNA replication and prokaryotic transcription. The helical nature of the DNA causes positive supercoils to accumulate ahead of a translocating enzyme, in the case of DNA replication, a DNA polymerase. The ability of gyrase (and topoisomerase IV) to relax positive supercoils allows superhelical tension ahead of the polymerase to be released so that replication can continue. (en)
- La ADN girasa es una de las topoisomerasas de ADN que actúa durante la replicación del ADN para reducir la causada por el superenrollamiento. La ADN girasa produce cortes de doble cadena y después son unidos por las ligasa. Actúa como una molécula altamente peligrosa. La ADN girasa, como topoisomerasa, tiene una función muy importante en la modulación del estado topológico del ADN, pues regula su estructura superhelicoidal. A diferencia de la ADN girasa, la topoisomerasa 1 corta solo una de las dos cadenas de la doble hélice del ADN; y actúa en la transcripción del ADN. Mientras, la ADN girasa (o topoisomerasa 2) corta ambas cadenas del ADN para aliviar el superenrollamiento, y actúa durante la replicación del ADN. Las moléculas de la ADN girasa se desplazan a lo largo del ADN por delante de la horquilla de replicación y eliminan los superenrollamientos positivos. La ADN girasa realiza esta tarea al cortar las dos cadenas del ADN dúplex; un segmento del ADN pasa a través de la rotura de la doble cadena hacia el otro lado y entonces se ligan los cortes de nuevo, un proceso que se lleva a cabo por liberación de energía durante la hidrolisis de ATP (trifosfato de adenosina). (es)
- L'ADN gyrase ou gyrase est une enzyme de la famille des ADN topoisomérases de classe II, qui est capable d'introduire un surenroulement négatif dans l'ADN. L'ADN gyrase est une protéine spécifique des bactéries, qui est essentielle à la réplication de leur chromosome circulaire. La présence du surenroulement négatif créé par la gyrase favorise en particulier le déroulement local de la double hélice nécessaire à la transcription et à la réplication, par les ARN polymérases et ADN polymérases. La gyrase utilise l'énergie libérée par l'hydrolyse de l'ATP pour forcer ce surenroulement négatif. Comme toutes les topoisomérases de classe II, la gyrase catalyse la coupure des deux brins d'un segment d'ADN, pour permettre la traversée par un autre segment d'ADN. En conséquence, le nombre d'enlacement des deux brins d'ADN du duplex varie de deux à chaque étape catalysée par la gyrase. La spécificité remarquable de l'ADN gyrase est sa capacité à forcer l'introduction de supertours négatifs, contre le gradient de tension mécanique de l'ADN, grâce au couplage avec l'énergie chimique libérée par l'hydrolyse de l'ATP. Les autres topoïsomérases de classe II ne sont capables que de relâcher les supertours. Un certain nombre d'antibiotiques ont pour cible la gyrase des procaryotes, en particulier les aminocoumarines, les quinolones et les fluoroquinolones, tels que la novobiocine, l'acide nalidixique et la ciprofloxacine. L'inhibition de l'activité de cette enzyme est létale pour les bactéries. (fr)
- DNAジャイレース (DNA gyrase)、もしくは単にジャイレース、あるいはDNAギラーゼとは細菌が持つDNAトポイソメラーゼII型の1種である (EC 5.99.1.3) 。 II型なのでDNA二本鎖の両鎖を切断することにより鎖を回転させねじれをとる働きをする〈記事DNAトポイソメラーゼに詳しい〉。細菌のDNA複製には欠かせない酵素の1つである。 例をあげると、大腸菌のDNAジャイレースは分子量115,000と95,000の2種のサブユニット2組の四量体を形成している。サブユニットの前者は遺伝子gyrA、後者はgyrBの産物である。 〈ニュー〉キノロン系抗生物質は真核生物のDNAトポイソメラーゼII型は阻害せず、細菌のDNAトポイソメラーゼII型〈すなわちDNAジャイレース〉のみを選択的に阻害し、生体に影響を与えずに細菌の増殖のみを阻害する。 DNAジャイレースの阻害剤は前述のキノロン系抗生物質の他に、 (coumermycin) と (novobiocin) などが知られている。 DNAジャイレースもATP依存性の反応と非依存性の反応との両方を持つが、特にクーママイシンとノボビオシンはATP依存性の反応だけを阻害する点が特徴的である。 遺伝子変異による薬剤耐性の研究より、オキソリン酸 (oxolinic acid) およびナリジクス酸はgyrA産物と、クーママイシン、ノボビオシンはgyrB産物と相互作用することが知られている。 (ja)
- La DNA girasi è un enzima che ha un ruolo molto importante nella replicazione del DNA, nello specifico è una particolare topoisomerasi II che presenta due azioni principali:
* introduce, invece di rimuovere, i superavvolgimenti negativi della molecola di DNA nelle cellule procariote, ed è quindi responsabile del superavvolgimento negativo dei cromosomi dei procarioti;
* a differenza delle topoisomerasi di classe I procariote e delle topoisomerasi di classe II eucariote, che rimuovono i superavvolgimenti rilassando e/o stabilizzando la molecola di DNA, la DNA girasi facilita lo svolgimento (denaturazione) della doppia elica del DNA, necessario per l'attuazione di varie reazioni, come l'apertura della doppia elica ad opera dell'elicasi, all'inizio della replicazione del DNA stesso e della trascrizione. (it)
- DNA 자이레이스(DNA gyrase) 또는 간단히 자이레이스(gyrase)는 토포아이소머레이즈 부류의 효소이며, 유형 II 토포아이소머레이즈의 하위 부류이다. ATP 의존적 방식으로 토폴로지 균주를 줄이면서 이중 가닥 DNA는 RNA 중합효소를 늘림으로써 풀린다. 또는 진행중인 복제 포크(Replication fork) 앞에 있는 헬리케이스(helicase,나선효소)이다. (ko)
- Gyraza DNA – enzym występujący u Procaryota (szczególnie u bakterii), należący do topoizomeraz typu II. Przy użyciu energii pochodzącej z hydrolizy ATP katalizuje on wprowadzanie ujemnych skrętów w helisie DNA. (pl)
- ДНК-гира́за (или просто гира́за) — фермент бактерии E. coli и других прокариот, относится к группе топоизомераз. Как типичный представитель топоизомераз класса II, ДНК-гираза в процессе каталитического цикла вносит временные двуцепочечные разрывы в ДНК. Уникальной особенностью ДНК-гиразы является способность направленно вносить отрицательные супервитки в молекулы ДНК с затратой энергии гидролиза АТФ. В 2007 году гираза была описана у паразитического простейшего Plasmodium falciparum из типа Apicomplexa. Также гираза обнаружена в хлоропластах и митохондриях некоторых растений. Бактериальная ДНК-гираза необходима для осуществления важнейших клеточных процессов — репликации, деления клеток, транскрипции. Она является мишенью многих антибиотиков, например, налидиксовой кислоты, и ципрофлоксацина. ДНК-гираза была описана в М. Геллертом с соавторами в 1976 году. (ru)
- DNA旋转酶(DNA Gyrase)，经常简称为旋转酶，是一种II类的拓扑异构酶（Type II Topoisomerase）（EC编号5.99.1.3），它的酶作用底物为ccc型环状DNA（Covalently Closed Circular DNA），作用是加入（Negative Supercoil）或松弛（Positive Supercoil）。旋转酶可以让DNA形成一个环状的结构（拓扑学上来说是一个正超螺旋的环环状的结构），通过切开一段DNA并让另一段DNA通过形成一个负超螺旋的环状结构。在这个过程中环绕数（Linking Number）减少了2（从正超螺旋Lk=＋1到负超螺旋Lk=－1,ΔLk=－2）。他的主要功用為紓解解旋酶解開DNA旋轉時所造成的壓力，因為解壓縮旋轉時會造成極大的逆旋轉壓。 (zh)
|
| rdfs:comment
|
- DNA 자이레이스(DNA gyrase) 또는 간단히 자이레이스(gyrase)는 토포아이소머레이즈 부류의 효소이며, 유형 II 토포아이소머레이즈의 하위 부류이다. ATP 의존적 방식으로 토폴로지 균주를 줄이면서 이중 가닥 DNA는 RNA 중합효소를 늘림으로써 풀린다. 또는 진행중인 복제 포크(Replication fork) 앞에 있는 헬리케이스(helicase,나선효소)이다. (ko)
- Gyraza DNA – enzym występujący u Procaryota (szczególnie u bakterii), należący do topoizomeraz typu II. Przy użyciu energii pochodzącej z hydrolizy ATP katalizuje on wprowadzanie ujemnych skrętów w helisie DNA. (pl)
- DNA旋转酶(DNA Gyrase)，经常简称为旋转酶，是一种II类的拓扑异构酶（Type II Topoisomerase）（EC编号5.99.1.3），它的酶作用底物为ccc型环状DNA（Covalently Closed Circular DNA），作用是加入（Negative Supercoil）或松弛（Positive Supercoil）。旋转酶可以让DNA形成一个环状的结构（拓扑学上来说是一个正超螺旋的环环状的结构），通过切开一段DNA并让另一段DNA通过形成一个负超螺旋的环状结构。在这个过程中环绕数（Linking Number）减少了2（从正超螺旋Lk=＋1到负超螺旋Lk=－1,ΔLk=－2）。他的主要功用為紓解解旋酶解開DNA旋轉時所造成的壓力，因為解壓縮旋轉時會造成極大的逆旋轉壓。 (zh)
- DNA gyrase, or simply gyrase, is an enzyme within the class of topoisomerase and is a subclass of Type II topoisomerases that reduces topological strain in an ATP dependent manner while double-stranded DNA is being unwound by elongating RNA-polymerase or by helicase in front of the progressing replication fork. The enzyme causes negative supercoiling of the DNA or relaxes positive supercoils. It does so by looping the template so as to form a crossing, then cutting one of the double helices and passing the other through it before releasing the break, changing the linking number by two in each enzymatic step. This process occurs in bacteria, whose single circular DNA is cut by DNA gyrase and the two ends are then twisted around each other to form supercoils. Gyrase is also found in eukaryot (en)
- Eine Gyrase (v. altgr.: γῦρος, gyros = Kreis, Rundung) ist ein Enzym, das die Raumorientierung von geschlossenen DNA-Molekülen verändert. Sie gehört zu den Topoisomerasen Typ II, welche in prokaryotischen Zellen ATP-abhängig einen Doppelstrangbruch in der DNA verursachen. Die Gyrase sorgt für negatives supercoiling – eine „Entwindung“ der DNA im Gegensatz zur Normalstruktur (B-DNA) mit circa zehn Basenpaaren pro Windung. Dies führt sowohl zu einem Platzgewinn, als auch einer partiell besseren Ablesbarkeit der DNA. Die Bindung des ATP an die Gyrase wird durch das Antibiotikum blockiert. (de)
- La ADN girasa es una de las topoisomerasas de ADN que actúa durante la replicación del ADN para reducir la causada por el superenrollamiento. La ADN girasa produce cortes de doble cadena y después son unidos por las ligasa. Actúa como una molécula altamente peligrosa. (es)
- L'ADN gyrase ou gyrase est une enzyme de la famille des ADN topoisomérases de classe II, qui est capable d'introduire un surenroulement négatif dans l'ADN. L'ADN gyrase est une protéine spécifique des bactéries, qui est essentielle à la réplication de leur chromosome circulaire. La présence du surenroulement négatif créé par la gyrase favorise en particulier le déroulement local de la double hélice nécessaire à la transcription et à la réplication, par les ARN polymérases et ADN polymérases. La gyrase utilise l'énergie libérée par l'hydrolyse de l'ATP pour forcer ce surenroulement négatif. Comme toutes les topoisomérases de classe II, la gyrase catalyse la coupure des deux brins d'un segment d'ADN, pour permettre la traversée par un autre segment d'ADN. En conséquence, le nombre d'enlaceme (fr)
- La DNA girasi è un enzima che ha un ruolo molto importante nella replicazione del DNA, nello specifico è una particolare topoisomerasi II che presenta due azioni principali:
* introduce, invece di rimuovere, i superavvolgimenti negativi della molecola di DNA nelle cellule procariote, ed è quindi responsabile del superavvolgimento negativo dei cromosomi dei procarioti;
* a differenza delle topoisomerasi di classe I procariote e delle topoisomerasi di classe II eucariote, che rimuovono i superavvolgimenti rilassando e/o stabilizzando la molecola di DNA, la DNA girasi facilita lo svolgimento (denaturazione) della doppia elica del DNA, necessario per l'attuazione di varie reazioni, come l'apertura della doppia elica ad opera dell'elicasi, all'inizio della replicazione del DNA stesso e della (it)
- DNAジャイレース (DNA gyrase)、もしくは単にジャイレース、あるいはDNAギラーゼとは細菌が持つDNAトポイソメラーゼII型の1種である (EC 5.99.1.3) 。 II型なのでDNA二本鎖の両鎖を切断することにより鎖を回転させねじれをとる働きをする〈記事DNAトポイソメラーゼに詳しい〉。細菌のDNA複製には欠かせない酵素の1つである。 例をあげると、大腸菌のDNAジャイレースは分子量115,000と95,000の2種のサブユニット2組の四量体を形成している。サブユニットの前者は遺伝子gyrA、後者はgyrBの産物である。 〈ニュー〉キノロン系抗生物質は真核生物のDNAトポイソメラーゼII型は阻害せず、細菌のDNAトポイソメラーゼII型〈すなわちDNAジャイレース〉のみを選択的に阻害し、生体に影響を与えずに細菌の増殖のみを阻害する。 DNAジャイレースの阻害剤は前述のキノロン系抗生物質の他に、 (coumermycin) と (novobiocin) などが知られている。 DNAジャイレースもATP依存性の反応と非依存性の反応との両方を持つが、特にクーママイシンとノボビオシンはATP依存性の反応だけを阻害する点が特徴的である。 (ja)
- ДНК-гира́за (или просто гира́за) — фермент бактерии E. coli и других прокариот, относится к группе топоизомераз. Как типичный представитель топоизомераз класса II, ДНК-гираза в процессе каталитического цикла вносит временные двуцепочечные разрывы в ДНК. Уникальной особенностью ДНК-гиразы является способность направленно вносить отрицательные супервитки в молекулы ДНК с затратой энергии гидролиза АТФ. В 2007 году гираза была описана у паразитического простейшего Plasmodium falciparum из типа Apicomplexa. Также гираза обнаружена в хлоропластах и митохондриях некоторых растений. (ru)
|
