HTML Microdata document

This HTML5 document contains 302 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

Prefix	IRI
dcterms	http://purl.org/dc/terms/
dbo	http://dbpedia.org/ontology/
foaf	http://xmlns.com/foaf/0.1/
dbpedia-gl	http://gl.dbpedia.org/resource/
n4	http://dbpedia.org/resource/File:
n25	https://global.dbpedia.org/id/
dbpedia-ru	http://ru.dbpedia.org/resource/
dbt	http://dbpedia.org/resource/Template:
dbpedia-uk	http://uk.dbpedia.org/resource/
skos	http://www.w3.org/2004/02/skos/core#
rdfs	http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
dbpedia-sv	http://sv.dbpedia.org/resource/
freebase	http://rdf.freebase.com/ns/
dbpedia-pl	http://pl.dbpedia.org/resource/
dbpedia-pt	http://pt.dbpedia.org/resource/
n9	http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/
rdf	http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
dbpedia-ar	http://ar.dbpedia.org/resource/
owl	http://www.w3.org/2002/07/owl#
dbpedia-it	http://it.dbpedia.org/resource/
wikipedia-en	http://en.wikipedia.org/wiki/
n24	http://www.springernature.com/scigraph/things/subjects/
dbpedia-zh	http://zh.dbpedia.org/resource/
dbpedia-fr	http://fr.dbpedia.org/resource/
dbp	http://dbpedia.org/property/
prov	http://www.w3.org/ns/prov#
dbc	http://dbpedia.org/resource/Category:
xsdh	http://www.w3.org/2001/XMLSchema#
gold	http://purl.org/linguistics/gold/
wikidata	http://www.wikidata.org/entity/
dbr	http://dbpedia.org/resource/
dbpedia-ja	http://ja.dbpedia.org/resource/

Statements

Subject Item: dbr:BER
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair
dbo:wikiPageDisambiguates: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Epiblast
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Epigenetics
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Epigenetics_in_learning_and_memory
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Epigenetics_of_physical_exercise
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Neural_stem_cell
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Non-small-cell_lung_carcinoma
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Nucleotide_excision_repair
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:MAG1
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:MUTYH-associated_polyposis
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Animal_embryonic_development
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA-3-methyladenine_glycosylase
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA-deoxyinosine_glycosylase
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA-formamidopyrimidine_glycosylase
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA_base_flipping
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA_damage_(naturally_occurring)
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA_damage_theory_of_aging
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA_demethylation
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA_glycosylase
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA_mismatch_repair
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA_polymerase
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA_polymerase_beta
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA_polymerase_epsilon
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA_polymerase_lambda
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA_repair
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA_repair-deficiency_disorder
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA_synthesis
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Deamination
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Depurination
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Development_of_the_nervous_system
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Developmental_biology
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Nuclease
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Nucleotidyltransferase
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Protein_phosphorylation
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:NEIL3
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Pyrimidine_dimer
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Complementarity_(molecular_biology)
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Crustacean
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Memory
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Estrogen
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Genome
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Neuron
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Nuclear_DNA
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Salmonella_enterica
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Cnidaria
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Mitochondrion
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Crosslinking_of_DNA
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:LIG1
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:LIG3
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Proliferating_cell_nuclear_antigen
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Aniline
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:M1G
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Cafeteria_roenbergensis_virus
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Sirtuin
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Progeroid_syndromes
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Schizosaccharomyces_pombe
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:SUMO_protein
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Mechanisms_of_schizophrenia
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Mutational_signatures
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Somatic_hypermutation
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Thymine_glycol
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Tom_Brown_(chemist)
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Treatment_of_cancer
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Disposable_soma_theory_of_aging
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:G-quadruplex
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:H2TH_domain
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:HMGA2
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:HSPA1A
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Long-term_memory
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Mutagen
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Topoisomerase_inhibitor
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:5-Formylcytosine
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:5-Hydroxymethylcytosine
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:8-Oxo-2'-deoxyguanosine
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:8-Oxoguanine
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Aladin_(protein)
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:DNA_oxidation
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Familial_adenomatous_polyposis
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Base_excision_repair
rdf:type: dbo:Organisation
rdfs:label: Base excision repair 塩基除去修復 Naprawa przez wycinanie zasady Riparazione per escissione di basi Réparation par excision de base ترميم استئصال القاعدة Ексцизійна репарація основ Excisão de bases Эксцизионная репарация оснований Base excision repair 鹼基切除修復
rdfs:comment: ترميم استئصال القاعدة (بالإنجليزية: Base excision repair)‏ واختصارا (بير، BER) في الكيمياء الحيوية وعلم الوراثة هو آلية خلوية لترميم الدنا خلال دورة الخلية. وهي مسؤولة أساسا على إزالة روابط قواعد غير لولبية صغيرة من الجينوم، مسار ترميم استئصال النوكليوتيد ذات الصلة يقوم بترميم اضطرابات روابط متكتلة مشوِّهة للولب المزدوج. بير مهم لإزالة القواعد المتضررة التي يمكن أن تسبب طفرات في حالة عدم إزالتها عبر التطابق الخاطئ أو التسبب في شروخ في الدنا أثناء التضاعف. تقوم ببدأ عملية بير التي تتعرف على قواعد محددة متضررة أو غير مناسبة، مشكلة . وهي مواقع أزيلت قواعدها بواسطة . السلسلة المنفردة المنشرخة الناتجة يمكن معالجتها سواء بالتصحيح القصير (أين يتم استبدال نوكليوتيدة واحدة) أو التصحيح الطويل (أين يتم اصطناع من 2-10 نوكليوتيدات جديدة). O reparo por excisão de base (BER em inglês: Base Excision Repair) é um mecanismo celular, estudado nos campos da bioquímica e genética, que repara o DNA danificado ao longo do ciclo celular. É responsável principalmente pela remoção de pequenas lesões básicas que não distorcem a hélice do genoma. A via de reparo de excisão de nucleotídeos relacionada repara lesões volumosas que distorcem a hélice. O BER é importante para a remoção de bases danificadas que, de outra forma, poderiam causar mutações ou levar a quebras no DNA durante a replicação. O BER é iniciado pelas glicosilases de DNA, que reconhecem e removem bases danificadas ou inadequadas específicas, formando AP sites. Estes são então clivados por uma endonuclease AP. A quebra de fita simples resultante pode ser processada por um pa Nell'ambito della biologia cellulare, il sistema di riparazione per escissione di basi (noto anche come "BER", dall'inglese base excision repair) è un sistema di riparazione di danni del DNA occorso a singole basi. Il sistema BER è in grado di riparare errori avvenuti durante il processo replicativo, o più spesso le basi anomale formatesi per tautomerizzazione, deaminazione o alchilazione, processi che avvengono spontaneamente e che possono essere causa di mutazioni alla sequenza nucleotidica se non riparate per tempo.In particolare il sistema di riparazione per escissione di basi si serve di specifiche DNA glicosilasi, enzimi che agiscono solo su substrati riconosciuti. In generale, la BER è in grado di riparare non più di 10 basi contigue. Nei casi di danni maggiormente estesi, interveng La réparation par excision de base (ou BER pour Base excision repair en anglais) est l'un des mécanismes de réparation de l'ADN utilisé par les cellules vivantes pour restaurer l'intégrité de l'ADN. Il est utilisé pour réparer les modifications chimiques survenues au niveau d’une base individuelle. Une telle lésion est réparée par simple élimination de la base, suivi du clivage du désoxyribose, et se termine par une nouvelle synthèse d'ADN intact remplaçant le nucléotide endommagé. Base excision repair (BER) är en reparationsmekanism inom cellen som reparerar skadat DNA. DNA är normalt uppbyggt i en dubbelsträngad spiral, en helix, där de två strängarna hålls samman av komplementära kvävebaser. När DNA:t i cellen kopieras i en process kallad DNA-replikation kan det ibland bli fel, och två DNA-baser som inte är komplementära matchas ihop. Detta kallas för ett basparnings-fel, och Base excision repair är en mekanism för att hitta och reparera sådana fel. 塩基除去修復（えんきじょきょしゅうふく、base excision repair）は、生体に備わっているDNA修復機構の1つで、DNAを構成する塩基の損傷を修復する。省略してBERと呼ばれる。 DNAを構成する塩基は恒常的に活性酸素種やアルキル化剤、また自発的な加水分解などにより損傷を受けており、これらの損傷塩基が修復されずに放置されると突然変異など、細胞にとって有害な影響を及ぼす可能性がある。生体内において、このような1塩基の損傷は塩基除去修復機構によって修復されることが知られている。 BERはDNA中に生じた損傷塩基を認識し、損傷塩基を切断、生じたギャップを鋳型鎖の情報をもとに埋めることで遺伝情報の維持に寄与している。これらの反応にはDNAグリコシラーゼ、、DNAポリメラーゼ、DNAリガーゼといった酵素が関与している。 Эксцизио́нная репара́ция основа́ний (англ. base excision repair (BER)) — система репарации ДНК, удаляющая из повреждённые азотистые основания. BER начинается с распознавания и удаления повреждённого основания . Далее особая эндонуклеаза удаляет фрагмент цепи, содержащий нуклеотид без основания, и ДНК-полимеразы застраивают брешь. Различают BER с точечной заплаткой, при которой удаляется только нуклеотид, лишённый азотистого основания, или BER с короткой заплаткой, при которой удаляется короткий фрагмент, содержащий повреждённый нуклеотид. Ексцизі́йна репара́ція осно́в (англ. base excision repair (BER)) — система репарації ДНК, що видаляє з пошкоджені азотисті основи. BER починається з розпізнавання і видалення пошкодженої основи . Далі особлива ендонуклеаза видаляє уривок ланцюга, що містить нуклеотид без основи, і ДНК-полімерази забудовують пролом. Розрізняють BER з точковою латкою, при якій видаляється тільки нуклеотид, позбавлений азотистої основи, або BER з короткою латкою, при якій видаляється короткий уривок, що містить пошкоджений нуклеотид. Base excision repair (BER) is a cellular mechanism, studied in the fields of biochemistry and genetics, that repairs damaged DNA throughout the cell cycle. It is responsible primarily for removing small, non-helix-distorting base lesions from the genome. The related nucleotide excision repair pathway repairs bulky helix-distorting lesions. BER is important for removing damaged bases that could otherwise cause mutations by mispairing or lead to breaks in DNA during replication. BER is initiated by DNA glycosylases, which recognize and remove specific damaged or inappropriate bases, forming AP sites. These are then cleaved by an AP endonuclease. The resulting single-strand break can then be processed by either short-patch (where a single nucleotide is replaced) or long-patch BER (where 2–10 Naprawa przez wycinanie zasady (BER, ang. base excision repair) – mechanizm naprawy DNA w komórkach mający na celu usuwanie uszkodzeń pojedynczych zasad DNA podczas replikacji DNA. Naprawa błędów jest konieczna, aby uniknąć wprowadzania mutacji podczas replikacji. Istnieją glikozylazy monofunkcyjne, oraz glikozylazy dwufunkcyjne – oprócz przecinania wiązań N-glikozydowych mają też właściwości liazowe i usuwają miejsca AP na drodze β-eliminacji, pozostawiając jednonukleotydową lukę w DNA. 鹼基切除修復（Base excision repair，BER）是細胞修復受損DNA的一種機制，主要用來修補大小較小、對DNA雙股螺旋結構影響較小的損傷，包括去胺、被烷基化或氧化的鹼基，如（8-oxoG）、7-甲基鸟苷、黃嘌呤與尿嘧啶等。大小較大、影響DNA結構較大的損傷（如紫外線造成的胸腺嘧啶二聚体）則是由核苷酸切除修复（NER）途徑修補。細菌、古菌與真核生物皆有鹼基切除修復的機制。 BER的過程首先由移除損傷的鹼基，形成AP位點，隨後將此位點的磷酸二酯鍵切除，造成DNA單股斷裂，接著再由DNA聚合酶合成缺失的鹼基（與一般DNA複製的過程一樣有DNA夾參與），可能僅合成單一缺失的鹼基後由DNA連接酶完成修補（短補丁修復；short-patch BER），也可能合成2-10個核苷酸以取代下游的若干的核苷酸，由將舊有的核苷酸切除後，再由DNA連接酶完成修補（長補丁修復；long-patch BER），兩途徑的選擇由DNA損傷種類、細胞週期、細胞分化狀態與物種種類等因素決定。 DNA糖基酶的活性可能隨老化而下降，使BER途徑的效率降低。另外BER途徑的缺失與數種癌症有關。
foaf:depiction: n9:8-oxoG_forming_Hoogsten_base_pair_with_dA.svg n9:Demethylation_of_5-methylcytosine.svg n9:DesaminierungCtoU.png n9:BER_basic_pathway.svg n9:Uracil_base_glycosidase.jpg
dcterms:subject: dbc:DNA_repair
dbo:wikiPageID: 2488636
dbo:wikiPageRevisionID: 1118644628
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:DNA_ligase n4:8-oxoG_forming_Hoogsten_base_pair_with_dA.svg dbr:Colorectal_cancer dbr:Genetics dbr:DNA-3-methyladenine_glycosylase dbr:CpG_site dbr:Adenine dbr:Cancer_epigenetics dbr:Host-cell_reactivation dbr:DNA_oxidation dbr:7-methylguanosine n4:Demethylation_of_5-methylcytosine.svg dbr:PCNA dbr:Oxoguanine_glycosylase dbr:MUTYH dbr:TRAMP_complex dbr:Directionality_(molecular_biology) dbr:Nucleotide_excision_repair dbr:Homologous_recombination dbr:8-oxoguanine dbr:Neurobiological_effects_of_physical_exercise dbr:Exonuclease_III dbr:Transition_(genetics) dbr:DNA_repair dbr:Saccharomyces_cerevisiae dbr:DNA_replication dbr:P53 dbr:Hypoxanthine dbr:FEN1 dbr:Gene_promoter dbr:Cytosine dbr:Biochemistry dbr:Uracil dbr:Deletion_(genetics) dbr:Deamination dbr:Single-nucleotide_polymorphism dbr:Apn1 dbr:Apn2 dbr:Hippocampus dbr:AP_lyase dbr:Cognition dbr:PNKP dbr:Fear_conditioning dbr:Pyrimidine dbr:AP_site dbr:Carcinogenesis dbr:AP_endonuclease dbr:O-6-methylguanine-DNA_methyltransferase dbr:Endonuclease_IV dbr:Epigenetics dbr:MLH1 dbr:5-methylcytosine dbr:NEIL1 dbr:Gene_silencing dbr:Colon_cancer n4:Uracil_base_glycosidase.jpg dbr:DNA_glycosylase dbr:Hydantoin dbr:Memory dbr:Non-homologous_end_joining dbr:Xanthine dbr:Thymine n4:BER_basic_pathway.svg dbr:Thymine_glycol dbc:DNA_repair dbr:DNA_demethylation dbr:8-Oxo-2'-deoxyguanosine dbr:Downregulation_and_upregulation dbr:Thymidine dbr:Messenger_RNA dbr:DNA_base_flipping dbr:APE1 dbr:Intron dbr:APE2 dbr:Uracil-DNA_glycosylase dbr:3-methyladenine dbr:DNA_polymerase_lambda dbr:Mutation dbr:MBD4 dbr:DNA_polymerase_beta dbr:XRCC1 dbr:Okazaki_fragment dbr:Neoplasm dbr:DNA_polymerase dbr:White_blood_cell dbr:Brain-derived_neurotrophic_factor dbr:DNA_mismatch_repair n4:DesaminierungCtoU.png dbr:DNA_methylation dbr:Non-small-cell_lung_carcinoma
owl:sameAs: dbpedia-ja:塩基除去修復 dbpedia-uk:Ексцизійна_репарація_основ dbpedia-pt:Excisão_de_bases dbpedia-fr:Réparation_par_excision_de_base dbpedia-pl:Naprawa_przez_wycinanie_zasady dbpedia-ar:ترميم_استئصال_القاعدة freebase:m.07hfm4 dbpedia-gl:Reparación_por_escisión_de_bases dbpedia-it:Riparazione_per_escissione_di_basi n25:2syad dbpedia-sv:Base_excision_repair dbpedia-zh:鹼基切除修復 dbpedia-ru:Эксцизионная_репарация_оснований wikidata:Q3113091
dbp:wikiPageUsesTemplate: dbt:MeshName dbt:Citation_needed dbt:Short_description dbt:DNA_repair dbt:Main dbt:Reflist dbt:Use_American_English
dbo:thumbnail: n9:BER_basic_pathway.svg?width=300
dbo:abstract: Nell'ambito della biologia cellulare, il sistema di riparazione per escissione di basi (noto anche come "BER", dall'inglese base excision repair) è un sistema di riparazione di danni del DNA occorso a singole basi. Il sistema BER è in grado di riparare errori avvenuti durante il processo replicativo, o più spesso le basi anomale formatesi per tautomerizzazione, deaminazione o alchilazione, processi che avvengono spontaneamente e che possono essere causa di mutazioni alla sequenza nucleotidica se non riparate per tempo.In particolare il sistema di riparazione per escissione di basi si serve di specifiche DNA glicosilasi, enzimi che agiscono solo su substrati riconosciuti. In generale, la BER è in grado di riparare non più di 10 basi contigue. Nei casi di danni maggiormente estesi, intervengono meccanismi di riparazione analoghi, come la riparazione per escissione nucleotidica. La réparation par excision de base (ou BER pour Base excision repair en anglais) est l'un des mécanismes de réparation de l'ADN utilisé par les cellules vivantes pour restaurer l'intégrité de l'ADN. Il est utilisé pour réparer les modifications chimiques survenues au niveau d’une base individuelle. Une telle lésion est réparée par simple élimination de la base, suivi du clivage du désoxyribose, et se termine par une nouvelle synthèse d'ADN intact remplaçant le nucléotide endommagé. Le mécanisme se déroule en trois ou quatre étapes suivant la nature de la lésion. Tout d'abord une ADN glycosylase élimine la base endommagée et produit un site abasique (ou site AP). Une endonucléase spécifique, l'AP-endonucléase, clive ensuite le désoxyribose de ce site abasique. Une ADN polymérase remplit à nouveau l’espace libéré en utilisant la base intacte du brin opposé comme matrice. Enfin, une ADN ligase suture le brin réparé. Donc, même si une seule base est endommagée, une série d’enzymes différentes sont nécessaires pour assurer une réparation correcte. La dernière étape de ce processus est également utilisée pour la réparation de simples cassures de la chaîne d’ADN. La réparation par excision de base est limitée à quelques types de bases déterminés et se produit très rapidement. Différentes ADN glycosylases correspondent chacune spécifiquement à l’élimination d’un type de base endommagée. C’est ainsi que l’uracile-ADN glycosylase n’éliminera que les bases d’uracile et certains produits d’oxydation de l’uracile, tandis que d'autres ADN-glycosylases seront spécifiques d'autres types de bases altérées (8-oxoguanine...). La réparation par excision de base est un mécanisme essentiel de maintien de l'intégrité de l'information génétique, conservé dans l'évolution. Elle fonctionne suivant les mêmes principes mécanistiques chez les bactéries et les eucaryotes. La première mise en évidence d'une uracile-ADN glycosylase spécifique a d'ailleurs été faite chez Escherichia coli. Naprawa przez wycinanie zasady (BER, ang. base excision repair) – mechanizm naprawy DNA w komórkach mający na celu usuwanie uszkodzeń pojedynczych zasad DNA podczas replikacji DNA. Naprawa błędów jest konieczna, aby uniknąć wprowadzania mutacji podczas replikacji. Pojedyncze zasady w DNA mogą być modyfikowane chemicznie, np. przez deaminację czy alkilację, co powoduje niewłaściwe parowanie zasad, a w konsekwencji wprowadzenie mutacji w DNA. Naprawa przez wycinanie zasady polega na wycięciu zmutowanej zasady z helisy DNA i jej naprawę. W procesie biorą udział dwa typy enzymów, DNA i endonukleazy AP. Glikozylaza DNA przecina wiązanie β-N glikozydowe między uszkodzoną zasadą a cząsteczką deoksyrybozy, tworząc miejsce apurynowe/apirymidynowe. Endonukleaza AP rozpoznaje to miejsce i nacina DNA w kierunku 5' od miejsca AP tworząc wolny koniec 3'-OH. Polimeraza DNA, Pol I, wydłuża nić DNA od wolnego końca 3'-OH wykorzystując aktywność egzonukleazy do zastąpienia nukleotydu z uszkodzoną zasadą oraz kilku następnych. Następnie nowa nić jest łączona ze starą za pomocą ligazy DNA. Istnieją glikozylazy monofunkcyjne, oraz glikozylazy dwufunkcyjne – oprócz przecinania wiązań N-glikozydowych mają też właściwości liazowe i usuwają miejsca AP na drodze β-eliminacji, pozostawiając jednonukleotydową lukę w DNA. 塩基除去修復（えんきじょきょしゅうふく、base excision repair）は、生体に備わっているDNA修復機構の1つで、DNAを構成する塩基の損傷を修復する。省略してBERと呼ばれる。 DNAを構成する塩基は恒常的に活性酸素種やアルキル化剤、また自発的な加水分解などにより損傷を受けており、これらの損傷塩基が修復されずに放置されると突然変異など、細胞にとって有害な影響を及ぼす可能性がある。生体内において、このような1塩基の損傷は塩基除去修復機構によって修復されることが知られている。 BERはDNA中に生じた損傷塩基を認識し、損傷塩基を切断、生じたギャップを鋳型鎖の情報をもとに埋めることで遺伝情報の維持に寄与している。これらの反応にはDNAグリコシラーゼ、、DNAポリメラーゼ、DNAリガーゼといった酵素が関与している。 Base excision repair (BER) är en reparationsmekanism inom cellen som reparerar skadat DNA. DNA är normalt uppbyggt i en dubbelsträngad spiral, en helix, där de två strängarna hålls samman av komplementära kvävebaser. När DNA:t i cellen kopieras i en process kallad DNA-replikation kan det ibland bli fel, och två DNA-baser som inte är komplementära matchas ihop. Detta kallas för ett basparnings-fel, och Base excision repair är en mekanism för att hitta och reparera sådana fel. Att reparera ett basparnings-fel kräver ett antal separata steg. När basparnings-felet uppstår kan det inledningsvis kännas igen av enzymet DNA-glykosylas som också i sådana fall kan avlägsna den felaktigt påbyggda kvävebasen. Den felplacerade kvävebasen avlägsnas genom att bindningen mellan kvävebas och DNA:ts sockerdel, den så kallade glykosidbindningen, bryts av enzymet och det uppkommer en så kallad AP-site. En AP-site är ett område i DNA som borde ha, men som saknar någon sorts kvävebas. Denna tomma site kan i sin tur kännas igen av ett annat enzym, närmare bestämt , vars funktion är att klippa av DNA-strängen i närheten av AP-siten. Den avklippta delen, en , bortforslas i sin tur av enzymet . Genom avlägsnandet av den felaktiga basen, och bortklippandet av sockerfosfat-delen har nu alla förutsättningar skapats för att det DNA-byggande enzymet DNA-polymeras β ska kunna bygga på nya korrekta baser. När byggandet är klart så lagas avslutningsvis brottet i DNA-strängen orsakat av AP-endonukleaset av enzymet DNA-ligas. Эксцизио́нная репара́ция основа́ний (англ. base excision repair (BER)) — система репарации ДНК, удаляющая из повреждённые азотистые основания. BER начинается с распознавания и удаления повреждённого основания . Далее особая эндонуклеаза удаляет фрагмент цепи, содержащий нуклеотид без основания, и ДНК-полимеразы застраивают брешь. Различают BER с точечной заплаткой, при которой удаляется только нуклеотид, лишённый азотистого основания, или BER с короткой заплаткой, при которой удаляется короткий фрагмент, содержащий повреждённый нуклеотид. Base excision repair (BER) is a cellular mechanism, studied in the fields of biochemistry and genetics, that repairs damaged DNA throughout the cell cycle. It is responsible primarily for removing small, non-helix-distorting base lesions from the genome. The related nucleotide excision repair pathway repairs bulky helix-distorting lesions. BER is important for removing damaged bases that could otherwise cause mutations by mispairing or lead to breaks in DNA during replication. BER is initiated by DNA glycosylases, which recognize and remove specific damaged or inappropriate bases, forming AP sites. These are then cleaved by an AP endonuclease. The resulting single-strand break can then be processed by either short-patch (where a single nucleotide is replaced) or long-patch BER (where 2–10 new nucleotides are synthesized). ترميم استئصال القاعدة (بالإنجليزية: Base excision repair)‏ واختصارا (بير، BER) في الكيمياء الحيوية وعلم الوراثة هو آلية خلوية لترميم الدنا خلال دورة الخلية. وهي مسؤولة أساسا على إزالة روابط قواعد غير لولبية صغيرة من الجينوم، مسار ترميم استئصال النوكليوتيد ذات الصلة يقوم بترميم اضطرابات روابط متكتلة مشوِّهة للولب المزدوج. بير مهم لإزالة القواعد المتضررة التي يمكن أن تسبب طفرات في حالة عدم إزالتها عبر التطابق الخاطئ أو التسبب في شروخ في الدنا أثناء التضاعف. تقوم ببدأ عملية بير التي تتعرف على قواعد محددة متضررة أو غير مناسبة، مشكلة . وهي مواقع أزيلت قواعدها بواسطة . السلسلة المنفردة المنشرخة الناتجة يمكن معالجتها سواء بالتصحيح القصير (أين يتم استبدال نوكليوتيدة واحدة) أو التصحيح الطويل (أين يتم اصطناع من 2-10 نوكليوتيدات جديدة). 鹼基切除修復（Base excision repair，BER）是細胞修復受損DNA的一種機制，主要用來修補大小較小、對DNA雙股螺旋結構影響較小的損傷，包括去胺、被烷基化或氧化的鹼基，如（8-oxoG）、7-甲基鸟苷、黃嘌呤與尿嘧啶等。大小較大、影響DNA結構較大的損傷（如紫外線造成的胸腺嘧啶二聚体）則是由核苷酸切除修复（NER）途徑修補。細菌、古菌與真核生物皆有鹼基切除修復的機制。 BER的過程首先由移除損傷的鹼基，形成AP位點，隨後將此位點的磷酸二酯鍵切除，造成DNA單股斷裂，接著再由DNA聚合酶合成缺失的鹼基（與一般DNA複製的過程一樣有DNA夾參與），可能僅合成單一缺失的鹼基後由DNA連接酶完成修補（短補丁修復；short-patch BER），也可能合成2-10個核苷酸以取代下游的若干的核苷酸，由將舊有的核苷酸切除後，再由DNA連接酶完成修補（長補丁修復；long-patch BER），兩途徑的選擇由DNA損傷種類、細胞週期、細胞分化狀態與物種種類等因素決定。 DNA糖基酶的活性可能隨老化而下降，使BER途徑的效率降低。另外BER途徑的缺失與數種癌症有關。 Ексцизі́йна репара́ція осно́в (англ. base excision repair (BER)) — система репарації ДНК, що видаляє з пошкоджені азотисті основи. BER починається з розпізнавання і видалення пошкодженої основи . Далі особлива ендонуклеаза видаляє уривок ланцюга, що містить нуклеотид без основи, і ДНК-полімерази забудовують пролом. Розрізняють BER з точковою латкою, при якій видаляється тільки нуклеотид, позбавлений азотистої основи, або BER з короткою латкою, при якій видаляється короткий уривок, що містить пошкоджений нуклеотид. O reparo por excisão de base (BER em inglês: Base Excision Repair) é um mecanismo celular, estudado nos campos da bioquímica e genética, que repara o DNA danificado ao longo do ciclo celular. É responsável principalmente pela remoção de pequenas lesões básicas que não distorcem a hélice do genoma. A via de reparo de excisão de nucleotídeos relacionada repara lesões volumosas que distorcem a hélice. O BER é importante para a remoção de bases danificadas que, de outra forma, poderiam causar mutações ou levar a quebras no DNA durante a replicação. O BER é iniciado pelas glicosilases de DNA, que reconhecem e removem bases danificadas ou inadequadas específicas, formando AP sites. Estes são então clivados por uma endonuclease AP. A quebra de fita simples resultante pode ser processada por um patch curto (onde um único nucleotídeo é substituído) ou um BER de patch longo (onde 2 a 10 novos nucleotídeos são sintetizados). A detecção é dificultada pelo fato de bases estarem posicionadas no interior da molécula de DNA e é efetuada por um mecanismo ainda desconhecido. Em eucariotos, uma maquinaria constituída de muitas enzimas efetua o processo. A quebra da ligação da base com o açúcar pela glicosilase gera sítios apúricos ou apirimídicos (sem as bases). Uma endonuclease remove os nucleotídeos no trecho a ser reparado, o que é preenchido por um DNA polimerase e ligado por uma ligase. Lesões mais complexas em nucleotídeos levam ao bloqueio da forquilha de replicação e são detectadas e corrigidas por um conjunto de enzimas que compõe o sistema de excisão de nucleotídeos.
gold:hypernym: dbr:Mechanism
skos:closeMatch: n24:base-excision-repair
prov:wasDerivedFrom: wikipedia-en:Base_excision_repair?oldid=1118644628&ns=0
dbo:wikiPageLength: 29696
foaf:isPrimaryTopicOf: wikipedia-en:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Caretaker_gene
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Cell_potency
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Ber_(disambiguation)
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair
dbo:wikiPageDisambiguates: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Glycosidic_bond
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Hippocampus
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Histone-modifying_enzymes
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Kinetoplast
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:APEX1
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:CpG_site
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Hydra_(genus)
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:ERCC6
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Flap_structure-specific_endonuclease_1
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:ADP-ribosylation
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:AP_endonuclease
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:AP_site
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Learning
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Blastocyst
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:TET_enzymes
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Mitochondrial_ROS
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:RecQ_helicase
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Trinucleotide_repeat_expansion
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Arsenic_biochemistry
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:CREB-binding_protein
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Free-radical_theory_of_aging
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Cancer_syndrome
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:MSH2
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:MUTYH
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Reactive_oxygen_species
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Rothmund–Thomson_syndrome
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Slipped_strand_mispairing
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:SMUG1
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Uracil-DNA_glycosylase
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Werner_syndrome
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Zygote
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Neurogenesis
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Extrachromosomal_DNA
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:FPG_IleRS_zinc_finger
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Tax_gene_product
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Malignant_transformation
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:NEIL1
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Molecular_lesion
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:POLD1
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Poly_(ADP-ribose)_polymerase
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:MBD4
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Tet_methylcytosine_dioxygenase_2
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Werner_syndrome_helicase
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Ventricular_zone
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:XRCC1
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:RECQL4
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Reprogramming
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Oxoguanine_glycosylase
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:POLG
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:RAD23A
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Sirtuin_6
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Synthetic_lethality
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:NTHL1
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Spatial_memory
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:RNA-directed_DNA_methylation
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Ultraviolet_germicidal_irradiation
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Spinocerebellar_ataxia_type_1
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: dbr:Base-excision_repair
dbo:wikiPageWikiLink: dbr:Base_excision_repair
dbo:wikiPageRedirects: dbr:Base_excision_repair

Subject Item: wikipedia-en:Base_excision_repair
foaf:primaryTopic: dbr:Base_excision_repair