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- تسلسل البروتين هو عملية لتحديد تسلسل الحمض الأميني لكل أو جزء من البروتين أو الببتيد. وقد يساعد ذلك على تحديد البروتين أو توصيف تعديلاته بعد الترجمة. عادة، يوفر التسلسل الجزئي للبروتين معلومات كافية (علامة تسلسلية واحدة أو أكثر) لتحديدها بالرجوع إلى قواعد بيانات متواليات البروتين المشتقة من الترجمة النظرية للجينات. طريقتان مباشرتان رئيسيتان لتسلسل البروتين هما قياس الطيف الكتلي وتدهور إدمان باستخدام مرمز بروتين (Sequencer). تعد طرق قياس الطيف الكتلي هي الأكثر استخدامًا على نطاق واسع في تحديد تسلسل البروتين وتحديده، لكن تدهور إدمان يبقى أداة قيّمة لتحديد خصائص N-terminus . (ar)
- Die Proteinsequenzierung bezeichnet biochemische Methoden zur Bestimmung der Aminosäuresequenz von Proteinen oder Peptiden. Sie ist als Proteincharakterisierung von wesentlicher Bedeutung in der Proteomik. (de)
- La secuenciación de proteínas es el proceso práctico de determinar la secuencia de aminoácidos de toda o parte de una proteína o péptido. Esto sirve para identificar a la proteína o caracterizar sus modificaciones postraduccionales. Usualmente, la secuenciación parcial de una proteína provee la información suficiente (uno o más fragmentos) para identificarla con bases de datos de proteínas derivadas de la traducción conceptual de los genes. Los dos métodos directos más importantes para secuenciar proteínas son la espectrometría de masas y la degradación de Edman usando un secuenciador. Los métodos de espectrometría son actualmente los más utilizados para la secuenciación e identificación, sin embargo, la degradación de Edman aún se mantiene como una herramienta valiosa. (es)
- Protein sequencing is the practical process of determining the amino acid sequence of all or part of a protein or peptide. This may serve to identify the protein or characterize its post-translational modifications. Typically, partial sequencing of a protein provides sufficient information (one or more sequence tags) to identify it with reference to databases of protein sequences derived from the conceptual translation of genes. The two major direct methods of protein sequencing are and using a (sequencer). Mass spectrometry methods are now the most widely used for protein sequencing and identification but Edman degradation remains a valuable tool for characterizing a protein's N-terminus. (en)
- Pengurutan protein atau sekuensing protein adalah penentuan urutan asam amino dari suatu protein atau peptida. Metode yang biasa digunakan adalah degradasi Edman dan spektrometri massa. Spektrometri massa lebih sering digunakan untuk sekuensing protein namun metode degradasi Edman juga sering digunakan untuk menentukan ujung-N (N-terminus) protein. (in)
- Le séquençage des protéines est la détermination de la séquence polypeptidique. Elle est destinée à connaître le nombre, la nature chimique et l'ordre de tous les résidus d'acides aminés dans un polypeptide. Pour cela, si la protéine contient plus d'une chaîne polypeptidique, les chaînes doivent être d'abord séparées, puis purifiées. Généralement, toutes les liaisons disulfures seront réduites et les thiols ainsi obtenus alkylés. Après isolement d'une chaîne polypeptidique, la séquence peut être étudiée :
* en faisant appel à des méthodes récurrentes chimiques ou enzymatiques libérant les acides aminés un à un à partir de l'extrémité C ou N terminale;
* ou plus récemment par des méthodes de spectrométrie de masse (séquençage de novo). Le séquençage des protéines est plus difficile que celui de l'ADN. (fr)
- Sequenciação de proteínas é a determinação das sequências de aminoácidos que constituem um péptido; e também a determinação da conformação que adopta e se é complexado com outras moléculas não-péptidas. Descobrir as estruturas e funções de proteínas em organismos vivos é uma ferramenta importante para a compreensão dos processos celulares e permite que sejam mais facilmente desenhados medicamentos que atinjam vias metabólicas específicas. Os dois principais métodos directos de sequenciação de proteínas são espectrometria de massa e a reacção de degradação de Edman. Também é possível gerar uma sequência de aminoácidos a partir de uma sequência de DNA ou mRNA que codifiquem a proteína, se esta for conhecida. Há também uma série de outras reacções que podem ser usadas para ganhar informação mais limitada sobre as sequências das proteínas e que podem ser usadas preliminarmente aos métodos já referidos ou para ultrapassar limitações específicas desse métodos. (pt)
- Sekwencjonowanie białka – ustalenie sekwencji aminokwasów w łańcuchu peptydowym białka. Najstarszą, wciąż stosowaną metodą sekwencjonowania białek jest degradacja Edmana. Polega ona na wykorzystaniu specyficzności do wolnej grupy aminowej łańcucha peptydowego. Powstały w tej reakcji , w warunkach kwaśnych, rozpada się na pochodną fenylotiohydantoniową N-terminalnego aminokwasu i polipeptyd pozbawiony końcowego aminokwasu. Reakcję tę można przeprowadzać cyklicznie, za każdym razem analizując produkty reakcji chromatograficznie. W praktyce trudno jest zsekwencjonować w ten sposób więcej niż 10 aminokwasów, ze względu na brak 100% wydajności tej reakcji. Z tego powodu analizuje się sekwencję peptydów będących produktami trawień proteolitycznych badanego białka. Metoda ta jest żmudna, pracochłonna i wymaga dużych ilości oczyszczonego białka. Z powodu tych niedogodności, degradacja Edmana została zastąpiona obecnie analizą jonów peptydowych metodą spektrometrii mas.Do określania sekwencji wykorzystuje się tandemowe spektrometry mas, które pozwalają na wyselekcjonowanie jonów peptydowych, ich fragmentację i pomiar mas molowych powstałych fragmentów. Fragmentacja polipeptydu zachodzi najczęściej przy wiązaniach peptydowych, dzięki czemu dane o masach fragmentów pozwalają na ustalenie sekwencji aminokwasowej peptydów. Podczas sekwencjonowania peptydu w spektrometrze mas nie można odróżnić aminokwasów: leucyny od izoleucyny oraz lizyny od glutaminy. Leucyna i izoleucyna mają identyczne masy molowe, gdyż są swoimi izomerami. Lizyna i glutamina pomimo innego składu pierwiastkowego mają bardzo podobne masy. Metoda sekwencjonowania w spektrometrze mas pozwala na określenie sekwencji aminokwasowej peptydów o długości do około 30 aminokwasów. Polipeptydy występujące w naturze charakteryzują się zwykle większą długością - kilkadziesiąt aminokwasów do kilku tysięcy aminokwasów. Białka są często zbudowane z więcej niż jednego łańcucha polipeptydowego. Problem ich analizy jest rozwiązywany przez trawienie białka proteazą i sekwencjonowanie powstałych w ten sposób krótkich oligopeptydów. (pl)
- Proteinsekvensering innebär att man bestämmer en sekvens av en polypeptid, det vill säga aminosyrornas ordningsföljd. En vanlig metod är Edmannedbrytning, som uppfanns av Pehr Edman. En annan vanlig metod är masspektrometri. (sv)
- 蛋白质测序是指通过实验方法对蛋白质的氨基酸序列以及其高级结构进行测定。虽然根据中心法则蛋白质的序列可以通过核酸序列进行推定，但对蛋白质进行测序可以对转录后修饰（PTM）进行更好的追踪。一般来说，如果是对较常见物种的蛋白质进行测序，只要确定出蛋白质的部分序列，就能通过与蛋白质序列数据库进行比对，就能倒推出相关序列来自哪一种蛋白。 最早的蛋白测序法是由弗雷德里克·桑格（Frederic Sanger）发明的。他于1953年对牛胰岛素进行了测序，是人类历史上第一次蛋白测序。后来，桑格使用的这套办法以他名字得到命名，称为桑格法。目前，最常用的蛋白质测序方法是测序。这种方法中，蛋白质先被分解为较短的肽段，再通过质谱仪获得其电荷与分子质量之比，进而推断出氨基酸序列。不过，基于化学反应的埃德曼降解法也仍占一席之地，尤其是对蛋白质的N端（靠近自由氨基基团的一端）进行测序。 (zh)
- Секвенування білків (від англ. protein sequencing — «визначення послідовності») — набір методів встановлення первинної структури білків. (uk)
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- تسلسل البروتين هو عملية لتحديد تسلسل الحمض الأميني لكل أو جزء من البروتين أو الببتيد. وقد يساعد ذلك على تحديد البروتين أو توصيف تعديلاته بعد الترجمة. عادة، يوفر التسلسل الجزئي للبروتين معلومات كافية (علامة تسلسلية واحدة أو أكثر) لتحديدها بالرجوع إلى قواعد بيانات متواليات البروتين المشتقة من الترجمة النظرية للجينات. طريقتان مباشرتان رئيسيتان لتسلسل البروتين هما قياس الطيف الكتلي وتدهور إدمان باستخدام مرمز بروتين (Sequencer). تعد طرق قياس الطيف الكتلي هي الأكثر استخدامًا على نطاق واسع في تحديد تسلسل البروتين وتحديده، لكن تدهور إدمان يبقى أداة قيّمة لتحديد خصائص N-terminus . (ar)
- Die Proteinsequenzierung bezeichnet biochemische Methoden zur Bestimmung der Aminosäuresequenz von Proteinen oder Peptiden. Sie ist als Proteincharakterisierung von wesentlicher Bedeutung in der Proteomik. (de)
- Pengurutan protein atau sekuensing protein adalah penentuan urutan asam amino dari suatu protein atau peptida. Metode yang biasa digunakan adalah degradasi Edman dan spektrometri massa. Spektrometri massa lebih sering digunakan untuk sekuensing protein namun metode degradasi Edman juga sering digunakan untuk menentukan ujung-N (N-terminus) protein. (in)
- Proteinsekvensering innebär att man bestämmer en sekvens av en polypeptid, det vill säga aminosyrornas ordningsföljd. En vanlig metod är Edmannedbrytning, som uppfanns av Pehr Edman. En annan vanlig metod är masspektrometri. (sv)
- 蛋白质测序是指通过实验方法对蛋白质的氨基酸序列以及其高级结构进行测定。虽然根据中心法则蛋白质的序列可以通过核酸序列进行推定，但对蛋白质进行测序可以对转录后修饰（PTM）进行更好的追踪。一般来说，如果是对较常见物种的蛋白质进行测序，只要确定出蛋白质的部分序列，就能通过与蛋白质序列数据库进行比对，就能倒推出相关序列来自哪一种蛋白。 最早的蛋白测序法是由弗雷德里克·桑格（Frederic Sanger）发明的。他于1953年对牛胰岛素进行了测序，是人类历史上第一次蛋白测序。后来，桑格使用的这套办法以他名字得到命名，称为桑格法。目前，最常用的蛋白质测序方法是测序。这种方法中，蛋白质先被分解为较短的肽段，再通过质谱仪获得其电荷与分子质量之比，进而推断出氨基酸序列。不过，基于化学反应的埃德曼降解法也仍占一席之地，尤其是对蛋白质的N端（靠近自由氨基基团的一端）进行测序。 (zh)
- Секвенування білків (від англ. protein sequencing — «визначення послідовності») — набір методів встановлення первинної структури білків. (uk)
- La secuenciación de proteínas es el proceso práctico de determinar la secuencia de aminoácidos de toda o parte de una proteína o péptido. Esto sirve para identificar a la proteína o caracterizar sus modificaciones postraduccionales. Usualmente, la secuenciación parcial de una proteína provee la información suficiente (uno o más fragmentos) para identificarla con bases de datos de proteínas derivadas de la traducción conceptual de los genes. (es)
- Protein sequencing is the practical process of determining the amino acid sequence of all or part of a protein or peptide. This may serve to identify the protein or characterize its post-translational modifications. Typically, partial sequencing of a protein provides sufficient information (one or more sequence tags) to identify it with reference to databases of protein sequences derived from the conceptual translation of genes. (en)
- Le séquençage des protéines est la détermination de la séquence polypeptidique. Elle est destinée à connaître le nombre, la nature chimique et l'ordre de tous les résidus d'acides aminés dans un polypeptide. Pour cela, si la protéine contient plus d'une chaîne polypeptidique, les chaînes doivent être d'abord séparées, puis purifiées. Généralement, toutes les liaisons disulfures seront réduites et les thiols ainsi obtenus alkylés. Après isolement d'une chaîne polypeptidique, la séquence peut être étudiée : Le séquençage des protéines est plus difficile que celui de l'ADN. (fr)
- Sekwencjonowanie białka – ustalenie sekwencji aminokwasów w łańcuchu peptydowym białka. Najstarszą, wciąż stosowaną metodą sekwencjonowania białek jest degradacja Edmana. Polega ona na wykorzystaniu specyficzności do wolnej grupy aminowej łańcucha peptydowego. Powstały w tej reakcji , w warunkach kwaśnych, rozpada się na pochodną fenylotiohydantoniową N-terminalnego aminokwasu i polipeptyd pozbawiony końcowego aminokwasu. Reakcję tę można przeprowadzać cyklicznie, za każdym razem analizując produkty reakcji chromatograficznie. W praktyce trudno jest zsekwencjonować w ten sposób więcej niż 10 aminokwasów, ze względu na brak 100% wydajności tej reakcji. Z tego powodu analizuje się sekwencję peptydów będących produktami trawień proteolitycznych badanego białka. Metoda ta jest żmudna, pracoch (pl)
- Sequenciação de proteínas é a determinação das sequências de aminoácidos que constituem um péptido; e também a determinação da conformação que adopta e se é complexado com outras moléculas não-péptidas. Descobrir as estruturas e funções de proteínas em organismos vivos é uma ferramenta importante para a compreensão dos processos celulares e permite que sejam mais facilmente desenhados medicamentos que atinjam vias metabólicas específicas. (pt)
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