| dbo:abstract
|
- Argonaut je označení pro rodinu proteinů přítomných v určité formě u všech forem pozemského života, které tvoří součást RISC komplexu a váží (siRNA, miRNA, ). Vyznačují se přítomností čtyř domén: (kterou sdílejí s Dicerem), (která je pro Ago unikátní) a domény N a Mid. PAZ a Mid doména váží řetězec RNA, PIWI doména je v některých případech schopná RNázové aktivity. (cs)
- The Argonaute protein family, first discovered for its evolutionarily conserved stem cell function, plays a central role in RNA silencing processes as essential components of the RNA-induced silencing complex (RISC). RISC is responsible for the gene silencing phenomenon known as RNA interference (RNAi). Argonaute proteins bind different classes of small non-coding RNAs, including microRNAs (miRNAs), small interfering RNAs (siRNAs) and Piwi-interacting RNAs (piRNAs). Small RNAs guide Argonaute proteins to their specific targets through sequence complementarity (base pairing), which then leads to mRNA cleavage, translation inhibition, and/or the initiation of mRNA decay. The name of this protein family is derived from a mutant phenotype resulting from mutation of AGO1 in Arabidopsis thaliana, which was likened by Bohmert et al. to the appearance of the pelagic octopus Argonauta argo. (en)
- Argonautenproteine (AGO) sind eine Familie von Proteinen, deren Vertreter evolutionär stark konserviert sind. Sie kommen in fast allen Organismen vor, wo sie eine wichtige Rolle in der Aktivierung und Regulation von Genen spielen. Vertreter der AGO-Familie sind an dem posttranskriptionellen Gen-Silencing (PTGS) beteiligt, wozu die RNA-Interferenz (RNAi) und der durch microRNA bedingte mRNA Abbau zählt. (de)
- アルゴノート（英: Argonaute）タンパク質ファミリーは、RNA誘導サイレンシング複合体（RISC）の必須構成要素として、RNAサイレンシングプロセスにおいて中心的な役割を果たしている。RISCは、RNA干渉（RNAi）として知られる遺伝子サイレンシング現象を担っている。アルゴノートタンパク質は、マイクロRNA（miRNA）、低分子干渉RNA（siRNA）、（piRNA）など、さまざまなクラスの低分子非コードRNAと結合する。低分子RNAは、配列相補性（塩基対形成）を通じてアルゴノートタンパク質を特定の標的へ誘導し、次にmRNAを切断または翻訳の抑制を引き起こす。 このタンパク質ファミリーの名前は、Bohmertらによって、シロイヌナズナ（Arabidopsis thaliana）のAGO1の突然変異による表現型が、遠洋性タコのアオイガイ（Argonauta argo）の外観に例えられたことに由来する。 (ja)
- Argonaute est une famille de protéines s'associant avec les petits ARN interférents et conférant le silencing de gènes. Les protéines argonautes sont des composants catalytiques du complexe RISC à l'origine du phénomène de silencing ou interférence par ARN.Elles peuvent se lier à différentes classes de petits ARN non codants, notamment les microARN (miARN), ARN interférents (ARNi) et ARN interagissant avec Piwi (ARNpi).Les petits ARN guident les protéines Argonaute à leur cible spécifique par complémentarité des séquences, permettant typiquement le silencing de la cible.Certaines protéines Argonautes ont une activité endonucléasique dirigée vers les brins d'ARN messagers (ARNm) ayant une bonne complémentarité avec le petit ARN auquel elles sont liées (activité de "slicer").Ces protéines participent également à la sélection du brin guide et à la destruction du brin passager (voir interférence par ARN - section principes). La base structurale de la liaison ARN-Argonaute a été étudiée par cristallographie aux rayons X du domaine liant d'une protéine argonaute liée à son ARN. L'extrémité phosphorylée 5' du brin d'ARN entre dans une poche de surface, conservée et basique, et le contact se fait par un cation divalent comme le magnésium et par « stacking » aromatique (liaison pi-pi non covalente) entre le nucléotide en 5' de l'ARNi et un résidu tyrosine conservé d'Argonaute. On pense que ce site forme un centre de nucléation pour la liaison de l'ARNi à son ARNm cible. Chez les eucaryotes, les protéines Argonautes ont été trouvées à forte concentration dans des régions du cytoplasme cellulaire appelées « P-bodies » où sont également localisées des enzymes impliquées dans la voie de dégradation des ARNm. La famille des protéines Argonautes n'existe pas seulement chez les eucaryotes mais est partagée par les Archaea et certaines bactéries comme Aquifex aeolicus. Des études basées sur la génomique comparative soutiennent que la famille argonaute aurait évolué à partir de composants du système d'initiation de la traduction, à cause de leur homologie avec le Facteur d'initiation eucaryotique eIF2. Les protéines argonaute sont nommées d'après le phénotype argonaute AGO de mutants d'Arabidopsis thaliana, qui sont eux-mêmes nommés à cause de leur ressemblance avec les argonautes. Le séquençage à haut débit par immunoprécipitation d'Argonaute a été utilisé comme une méthode pour identifier des microARN cibles: les microARN liés à la fois à Argonaute et à leur ARN messager cible pourront précipiter et être séquencés. (fr)
- Le proteine argonaute (l'accezione italiana argonauta è meno usata) sono la componente catalitica dell'RNA-induced silencing complex (comunemente chiamato RISC), il complesso riboproteico responsabile del processo di silenziamento dell'espressione genica noto come RNA interference (o RNAi). Le argonaute sono infatti in grado di legare i frammenti di small interfering RNA (in particolare il filamento detto guida) e di svolgere attività endonucleasica contro gli mRNA complementari allo stesso filamento guida. Le proteine sono anche responsabili della selezione del corretto filamento guida, nonché della degradazione di quello complementare (definito da alcuni passeggero). Le proteine sono state localizzate ad elevate concentrazioni in regioni del citoplasma cellulare note come . Più nel dettaglio, esistono evidenze secondo cui le proteine argonaute siano le uniche ad essere sempre presenti nelle varie forme di complessi RISC. In alcuni casi, come in un RISC individuato in Drosophila melanogaster, la argonaute si è rivelata essere l'unica proteina del complesso. Ciò sembra suggerire che tali proteine possano essere di per sé in grado di avviare la RNA interference. (it)
- Argonaute — белки, которые являются каталитическими компонентами RISC (RNA-induced silencing complex) — белкового комплекса, обеспечивающего сайленсинг генов по механизму РНК-интерференции (RNAi). Белки Argonaute связывают малые интерферирующие РНК (siRNA) и имеют эндонуклеазную активность по отношению к мРНК, комплементарным связанному фрагменту siRNA. Молекулярные механизмы связывания РНК белками Argonaute установлены при помощи РНК-связывающего домена. Фосфорилированный 5'-конец цепи РНК попадает в консервативный основный карман и образует контакты через двухвалентные катионы (например, Mg++) и путём ароматического стэкинга между 5'-нуклеотидом в siRNA и консервативным остатком тирозина. Этот сайт, по-видимому, образует «сайт нуклеации» для связывания siRNA с её мишенью мРНК. У эукариот белки Argonaute идентифицированы в высоких концентрациях в районах цитоплазмы клеток, известных как , в которых разрушаются мРНК. Белки Argonaute также участвуют в образовании и регуляции активности микроРНК. 1.
* Ago2 разрезает пре-микроРНК и образует дополнительный предшественник (ac-pre-miRNA); 2.
* Ago2 также входит в RISC и опосредует связывание микроРНК с 3'НТР, соответствующей мРНК и ингибирует трансляцию (в некоторых случаях - вызывает деаденилирование и деградацию мРНК). Ago2 взаимодействует с TRBP и Dicer (который процессирует пре-миРНК в миРНК) и образует вместе с ними тройной комплекс, который также связывает миРНК, на базе которого происходит дальнейшая сборка RISC путём присоединения других белков. Семейство белков Argonaute представлено среди эукариот, некоторых архей и даже бактерий, например, Aquifex aeolicus. По данным сравнительной геномики, семейство Argonaute, по-видимому, произошло от факторов инициации трансляции. (ru)
- Аргонавт (англ. Argonaute) – загальна назва білків, що беруть участь у процесі РНК інтерференції. Білки родини Аргонавт формують РНК-індукований комплекс заглушення генів RISC (англ. RNA-induced silencing complex), що виконує функцію специфічного "виключення" генів-мішеней за допомогою коротких некодуючих РНК (мікроРНК, та піРНК).Білки родини аргонавт дуже консервативні у всіх еукаріотів, за винятком дріжджів Saccharomyces cerevisiae, що втратили здатність до РНК інтерференції. Також Аргонавт білки присутні у архей і бактерій, але їхня функція там не до кінця з'ясована. (uk)
- Argonaute蛋白質家族是參與RNA干擾（RNAi）的一系列蛋白質，可與siRNA、miRNA與piRNA等小非編碼RNA結合，為RNA誘導沉默複合體（RISC）的重要組成部分，RISC可與和其中小RNA序列互補的mRNA，進而促進其降解或抑制其轉譯，達到基因靜默的效果。此蛋白家族的名稱來自扁船蛸的學名（Argonauta argo），因發表者認為AGO1基因突變的阿拉伯芥外形和其相似而得名。 Argonaute蛋白質家族的蛋白從N端自C端包含N、L1、、L2、M與PIWI等6個結構域，其中可識別小RNA3′端的單股突出鹼基而與之結合；PIWI結構域有內切酶活性，可負責切割目標mRNA，但也有些Argonaute家族蛋白的PIWI在演化過程中喪失了內切酶的功能。人類基因組共編碼8種Argonaute蛋白，其中AGO1－4均可與miRNA結合，但僅AGO2具有內切酶活性。植物的AGO1參與miRNA介導的mRNA降解，其AGO4則不參與mRNA降解，但與siRNA結合後可啟動DNA甲基化等表觀遺傳調控而抑制目標基因表現。 (zh)
|
| dbo:symbol
| |
| dbo:thumbnail
| |
| dbo:wikiPageExternalLink
| |
| dbo:wikiPageID
| |
| dbo:wikiPageLength
|
- 17984 (xsd:nonNegativeInteger)
|
| dbo:wikiPageRevisionID
| |
| dbo:wikiPageWikiLink
| |
| dbp:caption
|
- An argonaute protein from ''Pyrococcus furiosus. PDB . PIWI domain is on the right, PAZ domain to the left. (en)
|
| dbp:cdd
| |
| dbp:interpro
|
- IPR003165 (en)
- IPR021103 (en)
|
| dbp:name
|
- Argonaute Paz domain (en)
- Argonaute Piwi domain (en)
|
| dbp:pfam
|
- PF02171 (en)
- PF12212 (en)
|
| dbp:prosite
| |
| dbp:scop
| |
| dbp:symbol
| |
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| dcterms:subject
| |
| rdf:type
| |
| rdfs:comment
|
- Argonaut je označení pro rodinu proteinů přítomných v určité formě u všech forem pozemského života, které tvoří součást RISC komplexu a váží (siRNA, miRNA, ). Vyznačují se přítomností čtyř domén: (kterou sdílejí s Dicerem), (která je pro Ago unikátní) a domény N a Mid. PAZ a Mid doména váží řetězec RNA, PIWI doména je v některých případech schopná RNázové aktivity. (cs)
- Argonautenproteine (AGO) sind eine Familie von Proteinen, deren Vertreter evolutionär stark konserviert sind. Sie kommen in fast allen Organismen vor, wo sie eine wichtige Rolle in der Aktivierung und Regulation von Genen spielen. Vertreter der AGO-Familie sind an dem posttranskriptionellen Gen-Silencing (PTGS) beteiligt, wozu die RNA-Interferenz (RNAi) und der durch microRNA bedingte mRNA Abbau zählt. (de)
- アルゴノート（英: Argonaute）タンパク質ファミリーは、RNA誘導サイレンシング複合体（RISC）の必須構成要素として、RNAサイレンシングプロセスにおいて中心的な役割を果たしている。RISCは、RNA干渉（RNAi）として知られる遺伝子サイレンシング現象を担っている。アルゴノートタンパク質は、マイクロRNA（miRNA）、低分子干渉RNA（siRNA）、（piRNA）など、さまざまなクラスの低分子非コードRNAと結合する。低分子RNAは、配列相補性（塩基対形成）を通じてアルゴノートタンパク質を特定の標的へ誘導し、次にmRNAを切断または翻訳の抑制を引き起こす。 このタンパク質ファミリーの名前は、Bohmertらによって、シロイヌナズナ（Arabidopsis thaliana）のAGO1の突然変異による表現型が、遠洋性タコのアオイガイ（Argonauta argo）の外観に例えられたことに由来する。 (ja)
- Аргонавт (англ. Argonaute) – загальна назва білків, що беруть участь у процесі РНК інтерференції. Білки родини Аргонавт формують РНК-індукований комплекс заглушення генів RISC (англ. RNA-induced silencing complex), що виконує функцію специфічного "виключення" генів-мішеней за допомогою коротких некодуючих РНК (мікроРНК, та піРНК).Білки родини аргонавт дуже консервативні у всіх еукаріотів, за винятком дріжджів Saccharomyces cerevisiae, що втратили здатність до РНК інтерференції. Також Аргонавт білки присутні у архей і бактерій, але їхня функція там не до кінця з'ясована. (uk)
- Argonaute蛋白質家族是參與RNA干擾（RNAi）的一系列蛋白質，可與siRNA、miRNA與piRNA等小非編碼RNA結合，為RNA誘導沉默複合體（RISC）的重要組成部分，RISC可與和其中小RNA序列互補的mRNA，進而促進其降解或抑制其轉譯，達到基因靜默的效果。此蛋白家族的名稱來自扁船蛸的學名（Argonauta argo），因發表者認為AGO1基因突變的阿拉伯芥外形和其相似而得名。 Argonaute蛋白質家族的蛋白從N端自C端包含N、L1、、L2、M與PIWI等6個結構域，其中可識別小RNA3′端的單股突出鹼基而與之結合；PIWI結構域有內切酶活性，可負責切割目標mRNA，但也有些Argonaute家族蛋白的PIWI在演化過程中喪失了內切酶的功能。人類基因組共編碼8種Argonaute蛋白，其中AGO1－4均可與miRNA結合，但僅AGO2具有內切酶活性。植物的AGO1參與miRNA介導的mRNA降解，其AGO4則不參與mRNA降解，但與siRNA結合後可啟動DNA甲基化等表觀遺傳調控而抑制目標基因表現。 (zh)
- The Argonaute protein family, first discovered for its evolutionarily conserved stem cell function, plays a central role in RNA silencing processes as essential components of the RNA-induced silencing complex (RISC). RISC is responsible for the gene silencing phenomenon known as RNA interference (RNAi). Argonaute proteins bind different classes of small non-coding RNAs, including microRNAs (miRNAs), small interfering RNAs (siRNAs) and Piwi-interacting RNAs (piRNAs). Small RNAs guide Argonaute proteins to their specific targets through sequence complementarity (base pairing), which then leads to mRNA cleavage, translation inhibition, and/or the initiation of mRNA decay. (en)
- Argonaute est une famille de protéines s'associant avec les petits ARN interférents et conférant le silencing de gènes. Les protéines argonautes sont des composants catalytiques du complexe RISC à l'origine du phénomène de silencing ou interférence par ARN.Elles peuvent se lier à différentes classes de petits ARN non codants, notamment les microARN (miARN), ARN interférents (ARNi) et ARN interagissant avec Piwi (ARNpi).Les petits ARN guident les protéines Argonaute à leur cible spécifique par complémentarité des séquences, permettant typiquement le silencing de la cible.Certaines protéines Argonautes ont une activité endonucléasique dirigée vers les brins d'ARN messagers (ARNm) ayant une bonne complémentarité avec le petit ARN auquel elles sont liées (activité de "slicer").Ces protéines pa (fr)
- Le proteine argonaute (l'accezione italiana argonauta è meno usata) sono la componente catalitica dell'RNA-induced silencing complex (comunemente chiamato RISC), il complesso riboproteico responsabile del processo di silenziamento dell'espressione genica noto come RNA interference (o RNAi). Le proteine sono state localizzate ad elevate concentrazioni in regioni del citoplasma cellulare note come . (it)
- Argonaute — белки, которые являются каталитическими компонентами RISC (RNA-induced silencing complex) — белкового комплекса, обеспечивающего сайленсинг генов по механизму РНК-интерференции (RNAi). Белки Argonaute связывают малые интерферирующие РНК (siRNA) и имеют эндонуклеазную активность по отношению к мРНК, комплементарным связанному фрагменту siRNA. У эукариот белки Argonaute идентифицированы в высоких концентрациях в районах цитоплазмы клеток, известных как , в которых разрушаются мРНК. Белки Argonaute также участвуют в образовании и регуляции активности микроРНК. (ru)
|
| rdfs:label
|
- Argonaute (en)
- Argonaut (protein) (cs)
- Argonautenproteine (de)
- Argonaute (it)
- Argonaute (protéine) (fr)
- アルゴノート (タンパク質) (ja)
- Argonaute (ru)
- Аргонавт (білок) (uk)
- Argonaute (zh)
|
| owl:differentFrom
| |
| owl:sameAs
| |
| prov:wasDerivedFrom
| |
| foaf:depiction
| |
| foaf:isPrimaryTopicOf
| |
| is dbo:wikiPageDisambiguates
of | |
| is dbo:wikiPageRedirects
of | |
| is dbo:wikiPageWikiLink
of | |
| is foaf:primaryTopic
of | |
