An Entity of Type: software, from Named Graph: http://dbpedia.org, within Data Space: dbpedia.org

In bioinformatics, the general feature format (gene-finding format, generic feature format, GFF) is a file format used for describing genes and other features of DNA, RNA and protein sequences.

Property Value
dbo:abstract
  • El General Feature Format, abreviat GFF, format de característiques generals en anglès, és un format de fitxer utilitzat per a descriure gens (p. ex., llur ubicació en els cromosomes) i altres característiques de l'ADN, l'ARN o les seqüències de proteïnes. L'extensió de fitxer que s'utilitza habitualment és .gff. (ca)
  • إن تنسيق السمات العامة (شكل اكتشاف الجينات، نسق المعالم العامة، GFF) هو تنسيق ملف يستخدم لوصف الجينات والميزات الأخرى لتسلسلات الدنا والرنا والبروتين. ملحق اسم الملف المقترن بمثل هذه الملفات هو.GFF ونوع المحتوى المرتبط بهما هو text / gff3 هناك إصداران لتنسيق ملف GFF في الاستخدام العام: * تنسيق عام Feature Format الإصدار 2.2 بشكل خاص في متغير GTF الخاص به * الإصدار العام لتنسيق الميزات الإصدار 3 (مشروع تواجد الوجود المتسلسل) إصدارات GFF : ان GFF الإصدار 2 (إلى جانب متغير GTF الأكثر شيوعًا) عددًا من القصور، ولا سيما أنه لا يمكن إلا أن تمثل التسلسلات الهرمية ميزة من مستويين ووبالتالي لا يمكن التعامل مع التسلسل الهرمي من ثلاثة مستويات من الجين → نسخة → exon. يعالج GFF3 هذا وأوجه القصور الأخرى. على سبيل المثال، يدعم العديد من المستويات الهرمية تعسفيًا، ويعطي معان محددة لعلامات معينة في حقل السمات. الهيكل العام GFF جميع تنسيقات GFF (GFF2 و GFF3 و GTF) هي ملفات مجدولة مع 9 حقول في كل سطر، مفصولة بعلامات تبويب. جميعهم يشاركون نفس البنية للحقول السبعة الأولى، بينما يختلفون في محتوى وشكل الحقل التاسع. (ar)
  • In bioinformatics, the general feature format (gene-finding format, generic feature format, GFF) is a file format used for describing genes and other features of DNA, RNA and protein sequences. (en)
  • Le format d'élément général, general feature format (gene-finding format, generic feature format, GFF) est un format de fichier utilisé pour décrire les gènes et d'autres éléments de séquences d'ADN, d'ARN et de protéines. L'extension de fichier associée à de tels fichiers est .GFF et le type de contenu qui leur est associé est text/gff3 . Il existe deux versions du format de fichier GFF généralement utilisées: * General Feature Format Version 2.2 en particulier dans sa variante GTF * Format d'entité générique version 3 (projet d'ontologie de séquence) Les serveurs qui génèrent ce format: Les clients qui utilisent ce format: (fr)
  • GFF (англ. General Feature Format, GFF) — формат файлов, используемый для хранения разметки генов и других элементов последовательностей ДНК, РНК и белков. Используемое для такого типа файлов расширение обозначается как .GFF. Формат был предложен исследователями из Института Сенгера, его версия GFF2 (старейшая из ныне используемых) вышла в 1998 году. (ru)
dbo:wikiPageExternalLink
dbo:wikiPageID
  • 7374160 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength
  • 7446 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID
  • 1069877008 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink
dbp:developer
  • Sanger Centre , Sequence Ontology Project (en)
dbp:extendedFrom
dbp:genre
dbp:name
  • General feature format (en)
dbp:open
  • yes (en)
dbp:text
  • For features of type "CDS", the phase indicates where the feature begins with reference to the reading frame. The phase is one of the integers 0, 1, or 2, indicating the number of bases that should be removed from the beginning of this feature to reach the first base of the next codon. (en)
dbp:url
dbp:wikiPageUsesTemplate
dcterms:subject
gold:hypernym
rdf:type
rdfs:comment
  • El General Feature Format, abreviat GFF, format de característiques generals en anglès, és un format de fitxer utilitzat per a descriure gens (p. ex., llur ubicació en els cromosomes) i altres característiques de l'ADN, l'ARN o les seqüències de proteïnes. L'extensió de fitxer que s'utilitza habitualment és .gff. (ca)
  • In bioinformatics, the general feature format (gene-finding format, generic feature format, GFF) is a file format used for describing genes and other features of DNA, RNA and protein sequences. (en)
  • GFF (англ. General Feature Format, GFF) — формат файлов, используемый для хранения разметки генов и других элементов последовательностей ДНК, РНК и белков. Используемое для такого типа файлов расширение обозначается как .GFF. Формат был предложен исследователями из Института Сенгера, его версия GFF2 (старейшая из ныне используемых) вышла в 1998 году. (ru)
  • إن تنسيق السمات العامة (شكل اكتشاف الجينات، نسق المعالم العامة، GFF) هو تنسيق ملف يستخدم لوصف الجينات والميزات الأخرى لتسلسلات الدنا والرنا والبروتين. ملحق اسم الملف المقترن بمثل هذه الملفات هو.GFF ونوع المحتوى المرتبط بهما هو text / gff3 هناك إصداران لتنسيق ملف GFF في الاستخدام العام: * تنسيق عام Feature Format الإصدار 2.2 بشكل خاص في متغير GTF الخاص به * الإصدار العام لتنسيق الميزات الإصدار 3 (مشروع تواجد الوجود المتسلسل) إصدارات GFF : الهيكل العام GFF (ar)
  • Le format d'élément général, general feature format (gene-finding format, generic feature format, GFF) est un format de fichier utilisé pour décrire les gènes et d'autres éléments de séquences d'ADN, d'ARN et de protéines. L'extension de fichier associée à de tels fichiers est .GFF et le type de contenu qui leur est associé est text/gff3 . Il existe deux versions du format de fichier GFF généralement utilisées: * General Feature Format Version 2.2 en particulier dans sa variante GTF * Format d'entité générique version 3 (projet d'ontologie de séquence) Les serveurs qui génèrent ce format: (fr)
rdfs:label
  • تنسيق السمات العامة (ar)
  • General Feature Format (ca)
  • General feature format (en)
  • General feature format (fr)
  • GFF (формат файла) (ru)
owl:sameAs
prov:wasDerivedFrom
foaf:isPrimaryTopicOf
is dbo:wikiPageDisambiguates of
is dbo:wikiPageRedirects of
is dbo:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of
Powered by OpenLink Virtuoso    This material is Open Knowledge     W3C Semantic Web Technology     This material is Open Knowledge    Valid XHTML + RDFa
This content was extracted from Wikipedia and is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License