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- The BED (Browser Extensible Data) format is a text file format used to store genomic regions as coordinates and associated annotations. The data are presented in the form of columns separated by spaces or tabs. This format was developed during the Human Genome Project and then adopted by other sequencing projects. As a result of this increasingly wide use, this format had already become a de facto standard in bioinformatics before a formal specification was written. One of the advantages of this format is the manipulation of coordinates instead of nucleotide sequences, which optimizes the power and computation time when comparing all or part of genomes. In addition, its simplicity makes it easy to manipulate and read (or parsing) coordinates or annotations using word processing and scripting languages such as Python, Ruby or Perl or more specialized tools such as . (en)
- Le format BED (ou format Browser Extensible Data) est un format de fichier texte utilisé pour stocker des régions génomiques sous forme de coordonnées ainsi que les annotations associées. Les données se présentent sous forme de colonnes séparées par des espaces ou bien des tabulations. Ce format fut développé au cours du Projet Génome Humain puis adopté par d'autres projets de séquençage. De par cette utilisation de plus en plus large, ce format est devenu un standard de facto en bioinformatique sans pour autant recevoir de spécifications officielles. L'un des avantages de ce format réside dans la manipulation de coordonnées en lieu et place de séquences nucléotidiques permettant une optimisation de la puissance et du temps de calculs lors de la comparaison tout ou partie de génomes. De plus, sa simplicité rend la manipulation et la lecture (ou parsing) des coordonnées ou des annotations aisée par l'utilisation d'outils de traitement de texte et de langages de script tels que Python, Ruby ou Perl ou par des outils plus spécialisés tel que . (fr)
- BED（Browser Extensible Data，字面意思是“（基因组）浏览器可延展数据”）是一种基因组学中用于表示、标记基因组区域位置信息中的文件格式，于人类基因组计划中首次出现。BED文件是目前基因组学事实上的标准格式之一。 (zh)
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- BED（Browser Extensible Data，字面意思是“（基因组）浏览器可延展数据”）是一种基因组学中用于表示、标记基因组区域位置信息中的文件格式，于人类基因组计划中首次出现。BED文件是目前基因组学事实上的标准格式之一。 (zh)
- The BED (Browser Extensible Data) format is a text file format used to store genomic regions as coordinates and associated annotations. The data are presented in the form of columns separated by spaces or tabs. This format was developed during the Human Genome Project and then adopted by other sequencing projects. As a result of this increasingly wide use, this format had already become a de facto standard in bioinformatics before a formal specification was written. (en)
- Le format BED (ou format Browser Extensible Data) est un format de fichier texte utilisé pour stocker des régions génomiques sous forme de coordonnées ainsi que les annotations associées. Les données se présentent sous forme de colonnes séparées par des espaces ou bien des tabulations. Ce format fut développé au cours du Projet Génome Humain puis adopté par d'autres projets de séquençage. De par cette utilisation de plus en plus large, ce format est devenu un standard de facto en bioinformatique sans pour autant recevoir de spécifications officielles. (fr)
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- BED (file format) (en)
- BED (format de fichier) (fr)
- BED (文件格式) (zh)
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