About: BioModels

An Entity of Type: work, from Named Graph: http://dbpedia.org, within Data Space: dbpedia.org

BioModels is a free and open-source repository for storing, exchanging and retrieving quantitative models of biological interest created in 2006. All the models in the curated section of BioModels Database have been described in peer-reviewed scientific literature.

Property Value
dbo:abstract
  • Το BioModels είναι ένα δωρεάν αποθετήριο ανοιχτού κώδικα για την αποθήκευση, την ανταλλαγή και την ανάκτηση υπολογιστικών μοντέλων βιολογικού ενδιαφέροντος που δημιουργήθηκε το 2006. Όλα τα μοντέλα στην επιμελημένη ενότητα της Βάσης Δεδομένων BioModels έχουν αξιοποιηθεί σε επιστημονικά αξιολογημένη βιβλιογραφία. Τα μοντέλα που είναι αποθηκευμένα στο οργανωμένο τμήμα της BioModels είναι συμβατά με το MIRIAM, το πρότυπο επιμέλειας και σχολιασμού μοντέλων. Τα μοντέλα έχουν προσομοιωθεί από επιμελητές ώστε να ελέγχεται ότι όταν εκτελούνται σε προσομοιώσεις, παρέχουν τα ίδια αποτελέσματα με αυτά που περιγράφονται στη δημοσίευση. Τα στοιχεία του μοντέλου σημειώνονται, ώστε οι χρήστες να μπορούν εύκολα να αναγνωρίζουν κάθε στοιχείο του μοντέλου και να ανακτούν περαιτέρω πληροφορίες από άλλες πηγές. Οι μοντελιστές μπορούν να υποβάλουν τα μοντέλα σε μορφή SBML και CellML. Τα μοντέλα μπορούν, στη συνέχεια, να ληφθούν σε μορφή SBML, VCML, XPP, SciLab, Octave, BioPAX και RDF/XML. Τα δίκτυα αντίδρασης των μοντέλων παρουσιάζονται σε ορισμένες μορφές γραφικών, όπως PNG, SVG και γραφική μικροεφαρμογή Java, στην οποία ορισμένα δίκτυα παρουσιάστηκαν ακολουθώντας τη Γραφική Σημειογραφία της Βιολογίας Συστημάτων. Επίσης, μία αναγνώσιμη περίληψη κάθε μοντέλου είναι διαθέσιμη σε μορφή PDF. (el)
  • BioModels is a free and open-source repository for storing, exchanging and retrieving quantitative models of biological interest created in 2006. All the models in the curated section of BioModels Database have been described in peer-reviewed scientific literature. The models stored in BioModels' curated branch are compliant with MIRIAM, the standard of model curation and annotation. The models have been simulated by curators to check that when run in simulations, they provide the same results as described in the publication. Model components are annotated, so the users can conveniently identify each model element and retrieve further information from other resources. Modellers can submit the models in SBML and CellML. Models can subsequently be downloaded in SBML, VCML, XPP, SciLab, Octave, BioPAX and RDF/XML. The reaction networks of models are presented in some graphic formats, such as PNG, SVG and graphic Java applet, in which some networks were presented by following Systems Biology Graphical Notation. And a human readable summary of each model is available in PDF. (en)
  • BioModels Database (页面存档备份,存于互联网档案馆) 是一个完全免费的,用来存储描述生化反应的数学模型的数据库。同时也提供很多其他功能,例如反应模拟、提取子模型等。 (zh)
dbo:thumbnail
dbo:title
  • BioModels (en)
dbo:wikiPageExternalLink
dbo:wikiPageID
  • 6948407 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength
  • 6852 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID
  • 1088905444 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink
dbp:bookmark
  • yes (en)
dbp:center
dbp:curation
  • yes (en)
dbp:description
  • A repository for storing, exchanging and retrieving computational models of biological interest. (en)
dbp:download
dbp:format
  • SBML, BioPAX, SciLab, Octave, XPP, VCML, RDF/XML (en)
dbp:license
dbp:logo
  • 200 (xsd:integer)
dbp:organism
  • all (en)
dbp:pmid
  • 20587024 (xsd:integer)
dbp:released
  • 2005 (xsd:integer)
dbp:scope
  • computational models (en)
dbp:standard
dbp:title
  • BioModels (en)
dbp:url
dbp:version
  • 28 (xsd:integer)
dbp:webapp
  • Model display, multiple browsing strategies, advanced search, bulk download, model of the month (en)
dbp:webservice
dbp:wikiPageUsesTemplate
dc:description
  • A repository for storing, exchanging and retrieving computational models of biological interest.
dcterms:subject
rdf:type
rdfs:comment
  • BioModels Database (页面存档备份,存于互联网档案馆) 是一个完全免费的,用来存储描述生化反应的数学模型的数据库。同时也提供很多其他功能,例如反应模拟、提取子模型等。 (zh)
  • Το BioModels είναι ένα δωρεάν αποθετήριο ανοιχτού κώδικα για την αποθήκευση, την ανταλλαγή και την ανάκτηση υπολογιστικών μοντέλων βιολογικού ενδιαφέροντος που δημιουργήθηκε το 2006. Όλα τα μοντέλα στην επιμελημένη ενότητα της Βάσης Δεδομένων BioModels έχουν αξιοποιηθεί σε επιστημονικά αξιολογημένη βιβλιογραφία. (el)
  • BioModels is a free and open-source repository for storing, exchanging and retrieving quantitative models of biological interest created in 2006. All the models in the curated section of BioModels Database have been described in peer-reviewed scientific literature. (en)
rdfs:label
  • BioModels (en)
  • BioModels (el)
  • 生物模型数据库 (zh)
owl:sameAs
prov:wasDerivedFrom
foaf:depiction
foaf:homepage
foaf:isPrimaryTopicOf
is dbo:wikiPageRedirects of
is dbo:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of
Powered by OpenLink Virtuoso    This material is Open Knowledge     W3C Semantic Web Technology     This material is Open Knowledge    Valid XHTML + RDFa
This content was extracted from Wikipedia and is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License