An Entity of Type: protein, from Named Graph: http://dbpedia.org, within Data Space: dbpedia.org:8891

Cre recombinase is a tyrosine recombinase enzyme derived from the P1 bacteriophage. The enzyme uses a topoisomerase I-like mechanism to carry out site specific recombination events. The enzyme (38kDa) is a member of the integrase family of site specific recombinase and it is known to catalyse the site specific recombination event between two DNA recognition sites (LoxP sites). This 34 base pair (bp) loxP recognition site consists of two 13 bp palindromic sequences which flank an 8bp spacer region. The products of Cre-mediated recombination at loxP sites are dependent upon the location and relative orientation of the loxP sites. Two separate DNA species both containing loxP sites can undergo fusion as the result of Cre mediated recombination. DNA sequences found between two loxP sites are s

Property Value
dbo:abstract
  • Cre recombinase is a tyrosine recombinase enzyme derived from the P1 bacteriophage. The enzyme uses a topoisomerase I-like mechanism to carry out site specific recombination events. The enzyme (38kDa) is a member of the integrase family of site specific recombinase and it is known to catalyse the site specific recombination event between two DNA recognition sites (LoxP sites). This 34 base pair (bp) loxP recognition site consists of two 13 bp palindromic sequences which flank an 8bp spacer region. The products of Cre-mediated recombination at loxP sites are dependent upon the location and relative orientation of the loxP sites. Two separate DNA species both containing loxP sites can undergo fusion as the result of Cre mediated recombination. DNA sequences found between two loxP sites are said to be "floxed". In this case the products of Cre mediated recombination depends upon the orientation of the loxP sites. DNA found between two loxP sites oriented in the same direction will be excised as a circular loop of DNA whilst intervening DNA between two loxP sites that are opposingly orientated will be inverted. The enzyme requires no additional cofactors (such as ATP) or accessory proteins for its function. The enzyme plays important roles in the life cycle of the P1 bacteriophage, such as cyclization of the linear genome and resolution of dimeric chromosomes that form after DNA replication. Cre recombinase is a widely used tool in the field of molecular biology. The enzyme's unique and specific recombination system is exploited to manipulate genes and chromosomes in a huge range of research, such as gene knock out or knock in studies. The enzyme's ability to operate efficiently in a wide range of cellular environments (including mammals, plants, bacteria, and yeast) enables the Cre-Lox recombination system to be used in a vast number of organisms, making it a particularly useful tool in scientific research. (en)
  • CRE est une recombinase (enzyme permettant d'effectuer des recombinaisons spécifiques). Elle va permettre la recombinaison entre elles de séquences LOXP : les deux séquences vont alors se "fusionner". On l’utilise en thérapie génique chez des animaux génétiquement modifiés au préalable pour avoir des séquences LOXP présentes de part et d’autre d’une séquence d’intérêt. Il y a alors deux cas de figure. (fr)
  • Rekombinaza Cre - topoizomeraza typu I pochodząca z bakteriofaga P1, która katalizuje zlokalizowaną rekombinację cząsteczek DNA między sekwencjami zwanymi loxP. Sekwencja loxP ma długość 34 par zasad i składa się z dwóch odcinków o długości 13 pz o identycznej sekwencji ale odwrotnej orientacji, które otaczają rdzeń - asymetryczną sekwencję o długości 8 pz. W biologii molekularnej system Cre/loxP umożliwia ukierunkowane wycinanie fragmentów genomu. Do genomu organizmu należy wprowadzić gen kodujący rekombinazę Cre, a także umieścić elementy loxP w taki sposób, aby otaczały gen, który ma zostać usunięty. Kiedy komórka rozpocznie produkcję rekombinazy Cre, gen otoczony sekwencjami loxP zostanie wycięty. Dzięki umieszczeniu genu Cre pod kontrolą odpowiedniego promotora (np. tkankowo-specyficznego lub indukowalnego) można pozbawić organizm genu tylko w niektórych tkankach lub w odpowiedzi na określone czynniki. Modyfikacje tego enzymu pozwoliły na uzyskanie między innymi rekombinazy Tre, dzięki której można usunąć wirus HIV z genomów zainfekowanych komórek w hodowlach tkankowych. (pl)
dbo:thumbnail
dbo:wikiPageID
  • 4468576 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength
  • 15057 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID
  • 1064343322 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink
dbp:caption
  • Structure of a Cre recombinase enzyme bound to its substrate DNA (en)
dbp:chromosome
  • genome (en)
dbp:ecnumber
  • 2.700000 (xsd:double)
dbp:entrezchromosome
  • NC_005856.1 (en)
dbp:entrezgene
  • 2777477 (xsd:integer)
dbp:genlocEnd
  • 1621 (xsd:integer)
dbp:genlocStart
  • 280 (xsd:integer)
dbp:name
  • Cre recombinase (en)
dbp:organism
  • Enterobacteria phage P1 (en)
dbp:refseqprotein
  • YP_006472.1 (en)
dbp:symbol
  • cre (en)
dbp:taxid
  • 10678 (xsd:integer)
dbp:uniprot
  • P06956 (en)
dbp:wikiPageUsesTemplate
dcterms:subject
gold:hypernym
rdf:type
rdfs:comment
  • CRE est une recombinase (enzyme permettant d'effectuer des recombinaisons spécifiques). Elle va permettre la recombinaison entre elles de séquences LOXP : les deux séquences vont alors se "fusionner". On l’utilise en thérapie génique chez des animaux génétiquement modifiés au préalable pour avoir des séquences LOXP présentes de part et d’autre d’une séquence d’intérêt. Il y a alors deux cas de figure. (fr)
  • Cre recombinase is a tyrosine recombinase enzyme derived from the P1 bacteriophage. The enzyme uses a topoisomerase I-like mechanism to carry out site specific recombination events. The enzyme (38kDa) is a member of the integrase family of site specific recombinase and it is known to catalyse the site specific recombination event between two DNA recognition sites (LoxP sites). This 34 base pair (bp) loxP recognition site consists of two 13 bp palindromic sequences which flank an 8bp spacer region. The products of Cre-mediated recombination at loxP sites are dependent upon the location and relative orientation of the loxP sites. Two separate DNA species both containing loxP sites can undergo fusion as the result of Cre mediated recombination. DNA sequences found between two loxP sites are s (en)
  • Rekombinaza Cre - topoizomeraza typu I pochodząca z bakteriofaga P1, która katalizuje zlokalizowaną rekombinację cząsteczek DNA między sekwencjami zwanymi loxP. Sekwencja loxP ma długość 34 par zasad i składa się z dwóch odcinków o długości 13 pz o identycznej sekwencji ale odwrotnej orientacji, które otaczają rdzeń - asymetryczną sekwencję o długości 8 pz. Modyfikacje tego enzymu pozwoliły na uzyskanie między innymi rekombinazy Tre, dzięki której można usunąć wirus HIV z genomów zainfekowanych komórek w hodowlach tkankowych. (pl)
rdfs:label
  • Cre recombinase (en)
  • CRE (recombinase) (fr)
  • Rekombinaza Cre (pl)
rdfs:seeAlso
owl:sameAs
prov:wasDerivedFrom
foaf:depiction
foaf:isPrimaryTopicOf
is dbo:wikiPageDisambiguates of
is dbo:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of
Powered by OpenLink Virtuoso    This material is Open Knowledge     W3C Semantic Web Technology     This material is Open Knowledge    Valid XHTML + RDFa
This content was extracted from Wikipedia and is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License