dbo:abstract
|
- In molecular biology, autophagy related 3 (Atg3) is the E2 enzyme for the LC3 lipidation process. It is essential for autophagy. The super protein complex, the Atg16L complex, consists of multiple Atg12-Atg5 conjugates. Atg16L has an E3-like role in the LC3 lipidation reaction. The activated intermediate, LC3-Atg3 (E2), is recruited to the site where the lipidation takes place. Atg3 catalyses the conjugation of Atg8 and phosphatidylethanolamine (PE). Atg3 has an alpha/beta-fold, and its core region is topologically similar to canonical E2 enzymes. Atg3 has two regions inserted in the core region and another with a long alpha-helical structure that protrudes from the core region as far as 30 A. It interacts with atg8 through an intermediate thioester bond between Cys-288 and the C-terminal Gly of atg8. It also interacts with the C-terminal region of the E1-like atg7 enzyme. Autophagocytosis is a starvation-induced process responsible for transport of cytoplasmic proteins to the lysosome/vacuole. Atg3 is a ubiquitin like modifier that is topologically similar to the canonical E2 enzyme. It catalyses the conjugation of Atg8 and phosphatidylethanolamine. Atg3 consists of three domains, an N-terminal domain, a catalytic domain and a C-terminal domain. The catalytic domain contains a cysteine residue within an HPC motif, this is the putative active-site residue for recognition of the Apg5 subunit of the autophagosome complex. The small C-terminal domain is likely to be a distinct binding region for the stability of the autophagosome complex. It carries a highly characteristic conserved FLKF sequence motif. (en)
- ATG3 (англ. Autophagy related 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 314 амінокислот, а молекулярна маса — 35 864. Послідовність амінокислот A: АланінC: ЦистеїнD: Аспарагінова кислотаE: Глутамінова кислотаF: ФенілаланінG: ГліцинH: ГістидинI: ІзолейцинK: ЛізинL: ЛейцинM: МетіонінN: АспарагінP: ПролінQ: ГлутамінR: АргінінS: СеринT: ТреонінV: ВалінW: Триптофан Y: Тирозин Кодований геном білок за функцією належить до лігаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі. (uk)
|
dbo:symbol
|
- Autophagy_Cterm
- Autophagy_N
- Autophagy_act_C
|
dbo:wikiPageID
| |
dbo:wikiPageLength
|
- 5794 (xsd:nonNegativeInteger)
|
dbo:wikiPageRevisionID
| |
dbo:wikiPageWikiLink
| |
dbp:caption
|
- the crystal structure of saccharomyces cerevisiae atg3 (en)
|
dbp:interpro
|
- IPR007134 (en)
- IPR007135 (en)
- IPR019461 (en)
|
dbp:name
|
- Autophagocytosis associated protein C-terminal (en)
- Autophagocytosis associated protein N-terminal (en)
- Autophagocytosis associated protein active site domain (en)
|
dbp:pfam
|
- PF03986 (en)
- PF03987 (en)
- PF10381 (en)
|
dbp:symbol
|
- Autophagy_Cterm (en)
- Autophagy_N (en)
- Autophagy_act_C (en)
|
dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
dcterms:subject
| |
rdf:type
| |
rdfs:comment
|
- In molecular biology, autophagy related 3 (Atg3) is the E2 enzyme for the LC3 lipidation process. It is essential for autophagy. The super protein complex, the Atg16L complex, consists of multiple Atg12-Atg5 conjugates. Atg16L has an E3-like role in the LC3 lipidation reaction. The activated intermediate, LC3-Atg3 (E2), is recruited to the site where the lipidation takes place. (en)
- ATG3 (англ. Autophagy related 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 314 амінокислот, а молекулярна маса — 35 864. Послідовність амінокислот A: АланінC: ЦистеїнD: Аспарагінова кислотаE: Глутамінова кислотаF: ФенілаланінG: ГліцинH: ГістидинI: ІзолейцинK: ЛізинL: ЛейцинM: МетіонінN: АспарагінP: ПролінQ: ГлутамінR: АргінінS: СеринT: ТреонінV: ВалінW: Триптофан Y: Тирозин (uk)
|
rdfs:label
| |
owl:sameAs
| |
prov:wasDerivedFrom
| |
foaf:isPrimaryTopicOf
| |
is dbo:wikiPageRedirects
of | |
is dbo:wikiPageWikiLink
of | |
is foaf:primaryTopic
of | |