This HTML5 document contains 139 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
yago-reshttp://yago-knowledge.org/resource/
dbohttp://dbpedia.org/ontology/
n23http://dbpedia.org/resource/File:
foafhttp://xmlns.com/foaf/0.1/
dbpedia-cahttp://ca.dbpedia.org/resource/
n25http://scit.us/projects/
n9https://global.dbpedia.org/id/
yagohttp://dbpedia.org/class/yago/
dbthttp://dbpedia.org/resource/Template:
n21http://dbpedia.org/resource/The_Immortals_(Cosmos:
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
freebasehttp://rdf.freebase.com/ns/
n20http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/
dbpedia-fahttp://fa.dbpedia.org/resource/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
dbpedia-arhttp://ar.dbpedia.org/resource/
owlhttp://www.w3.org/2002/07/owl#
n15http://dbpedia.org/resource/Cosmos:
wikipedia-enhttp://en.wikipedia.org/wiki/
dbchttp://dbpedia.org/resource/Category:
dbphttp://dbpedia.org/property/
provhttp://www.w3.org/ns/prov#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
wikidatahttp://www.wikidata.org/entity/
dbrhttp://dbpedia.org/resource/

Statements

Subject Item
dbr:Substitution_model
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
n15:_A_Spacetime_Odyssey
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Ancestral_reconstruction
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Ancestral_sequence_reconstruction
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Viral_phylodynamics
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Molecular_clock
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Molecular_phylogenetics
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:WPGMA
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Stochastic_matrix
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Complete-linkage_clustering
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Hadamard_transform
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Anania_shanxiensis
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Frances_James_(ecologist)
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Bacterial_phylodynamics
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
n21:_A_Spacetime_Odyssey)
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Models_of_DNA_evolution
rdf:type
yago:Object100002684 yago:Model110324560 yago:YagoLegalActor yago:YagoLegalActorGeo yago:Worker109632518 yago:WikicatMarkovModels yago:CausalAgent100007347 yago:Person100007846 yago:Organism100004475 yago:PhysicalEntity100001930 yago:LivingThing100004258 yago:Assistant109815790 yago:Whole100003553
rdfs:label
Models of DNA evolution نماذج تطور الحمض النووي Models d'evolució de l'ADN
rdfs:comment
A number of different Markov models of DNA sequence evolution have been proposed. These substitution models differ in terms of the parameters used to describe the rates at which one nucleotide replaces another during evolution. These models are frequently used in molecular phylogenetic analyses. In particular, they are used during the calculation of likelihood of a tree (in Bayesian and maximum likelihood approaches to tree estimation) and they are used to estimate the evolutionary distance between sequences from the observed differences between the sequences. تم اقتراح عدد من نماذج سلسلة ماركوف المختلفة لتطور تسلسل الحمض النووي. تختلف نماذج الاستبدال هذه من حيث المعايير المستخدمة لوصف النسب التي يستبدل فيها أحد النوكليوتيدات مكان الآخر خلال التطور. وكثيرا ما تستخدم هذه النماذج في تحليلات التطور الجزيئية ( النسالة الجزيئية ) . على وجه الخصوص، يتم استخدامها أثناء حساب احتمالية الشجرة (في استدلال بايزي و تقدير الاحتمال) ويتم استخدامها لتقدير المسافة التطورية بين التسلسلات من الاختلافات المرصودة بينها. S'ha proposat un nombre de models d'evolució de l'ADN de Màrkov. Aquests difereixen pel que fa als paràmetres emprats per a descriure les taxes de mutació, és a dir en les que els nucleòtids reemplacen a altres amb el pas de les generacions. Aquests models s'utilitzen freqüentment en anàlisis de filogènia molecular. En particular, s'utilitzen en el càlcul de la versemblança d'un arbre, en aproximacions de l'estimació dels arbres bayesians i de màxima versemblança (Maximum Likehood), i s'utilitzen per a estimar la distància evolutiva entre seqüències a partir de les diferències observades entre aquestes.
foaf:depiction
n20:Jukes_and_Cantor_(1969)_JC69_Pij_Pii.jpg
dcterms:subject
dbc:Computational_phylogenetics dbc:Phylogenetics dbc:Markov_models dbc:Bioinformatics
dbo:wikiPageID
7025924
dbo:wikiPageRevisionID
1115179345
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Chargaff's_rules dbr:Homoplasy dbc:Markov_models dbr:Nucleotide dbr:Transition_(genetics) dbr:Stationary_process dbr:Hamming_distance dbr:Locus_(genetics) dbc:Phylogenetics dbr:Neutral_theory_of_molecular_evolution dbr:Transversions dbr:Thomas_H._Jukes dbr:Jukes–Cantor dbr:Transversion dbr:Molecular_clock dbr:Iid dbr:Molecular_evolution dbr:GC-content dbr:Markov_chain dbr:Molecular_phylogenetics dbr:Masatoshi_Nei dbr:Proteins dbr:Motoo_Kimura dbr:Codon dbr:Markov_chains dbr:Hadamard_transform dbr:Joseph_Felsenstein dbr:Simon_Tavaré dbr:Mutation_rates dbc:Bioinformatics dbr:Bayesian_inference dbr:Substitution_model dbr:UPGMA dbr:Purifying_selection n23:Jukes_and_Cantor_(1969)_JC69_Pij_Pii.jpg dbr:Charles_Cantor dbr:Matrix_exponentiation dbr:Sufficient_statistic dbr:Maximum_likelihood dbc:Computational_phylogenetics
dbo:wikiPageExternalLink
n25:dawg
owl:sameAs
n9:4s363 freebase:m.05cbm7 dbpedia-ca:Models_d'evolució_de_l'ADN yago-res:Models_of_DNA_evolution wikidata:Q6888417 dbpedia-fa:مدل‌های_سیر_فرگشتی_دی‌ان‌ای freebase:m.0h0x_0 dbpedia-ar:نماذج_تطور_الحمض_النووي
dbp:wikiPageUsesTemplate
dbt:Anchor dbt:Cite_journal dbt:Reflist dbt:Evolution dbt:Refend dbt:Refbegin dbt:More_footnotes dbt:MolecularEvolution dbt:Short_description
dbo:thumbnail
n20:Jukes_and_Cantor_(1969)_JC69_Pij_Pii.jpg?width=300
dbo:abstract
S'ha proposat un nombre de models d'evolució de l'ADN de Màrkov. Aquests difereixen pel que fa als paràmetres emprats per a descriure les taxes de mutació, és a dir en les que els nucleòtids reemplacen a altres amb el pas de les generacions. Aquests models s'utilitzen freqüentment en anàlisis de filogènia molecular. En particular, s'utilitzen en el càlcul de la versemblança d'un arbre, en aproximacions de l'estimació dels arbres bayesians i de màxima versemblança (Maximum Likehood), i s'utilitzen per a estimar la distància evolutiva entre seqüències a partir de les diferències observades entre aquestes. Aquests models són descripcions fenomenològiques de l'evolució de l'ADN com una cadena de quatre estats discrets. Aquests models de Màrkov no representen explícitament el mecanisme de mutació ni l'acció de la selecció natural. Més aviat descriuen les taxes relatives dels diferents canvis. Per exemple, biaixos de mutació i afavoreixen els cansi conservatius i probablement ambdós són responsables de la taxa relativament elevada de en comparació amb les en les seqüències que evolucionen. Tanmateix, el model de Kimura (K80) que es descriu més avall senzillament intenta capturar l'efecte de les dues forces en un paràmetre que reflecteix la taxa relativa de transicions i transversions. Les anàlisis evolutives de seqüències es duen a terme en una àmplia varietat d'escales temporals. Per això és convenient expressar aquests models en termes de taxes instantànies de canvis entre diferents estats (les matrius Q de sota). Si donem un estat inicial (ancestral) a la primera posició, la matriu del model Q i la longitud de la branca expressant el nombre esperat de canvis que s'han donat des de l'ancestre, aleshores podem derivar la probabilitat de la seqüència descendent tenint cadascun dels quatre estadis. Els detalls matemàtics d'aquesta transformació des de taxa-matriu a matriu de probabilitats en descriuen a la secció de models matemàtics de substitució de la pàgina de . Expressant en termes de taxes instantànies de canvi podem evitar estimar grans nombres de paràmetres per a cada branca en un arbre filogenètic (o cada comparació si l'anàlisi inclou moltes comparacions de seqüències per parelles). تم اقتراح عدد من نماذج سلسلة ماركوف المختلفة لتطور تسلسل الحمض النووي. تختلف نماذج الاستبدال هذه من حيث المعايير المستخدمة لوصف النسب التي يستبدل فيها أحد النوكليوتيدات مكان الآخر خلال التطور. وكثيرا ما تستخدم هذه النماذج في تحليلات التطور الجزيئية ( النسالة الجزيئية ) . على وجه الخصوص، يتم استخدامها أثناء حساب احتمالية الشجرة (في استدلال بايزي و تقدير الاحتمال) ويتم استخدامها لتقدير المسافة التطورية بين التسلسلات من الاختلافات المرصودة بينها. A number of different Markov models of DNA sequence evolution have been proposed. These substitution models differ in terms of the parameters used to describe the rates at which one nucleotide replaces another during evolution. These models are frequently used in molecular phylogenetic analyses. In particular, they are used during the calculation of likelihood of a tree (in Bayesian and maximum likelihood approaches to tree estimation) and they are used to estimate the evolutionary distance between sequences from the observed differences between the sequences.
prov:wasDerivedFrom
wikipedia-en:Models_of_DNA_evolution?oldid=1115179345&ns=0
dbo:wikiPageLength
36009
foaf:isPrimaryTopicOf
wikipedia-en:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Single-linkage_clustering
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Source_attribution
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Methylophaga_muralis
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Markov_chain
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Olinguito
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Substitution_matrix
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Phylogenetic_invariants
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Trigonopterus_dacrycarpi
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Zospeum_tholussum
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:UPGMA
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Outline_of_machine_learning
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Xrate
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Models_of_DNA_Evolution
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
dbo:wikiPageRedirects
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Models_of_Nucleotide_Substitution
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
dbo:wikiPageRedirects
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Kimura's_two_parameter_model
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
dbo:wikiPageRedirects
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:K2P
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
dbo:wikiPageRedirects
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Nucleotide_substitution_rate
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
dbo:wikiPageRedirects
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Jukes-Cantor
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
dbo:wikiPageRedirects
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Model_of_evolution
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
dbo:wikiPageRedirects
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Models_of_nucleotide_substitution
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
dbo:wikiPageRedirects
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Evolution_of_DNA
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
dbo:wikiPageRedirects
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
dbr:Evolutionary_model
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Models_of_DNA_evolution
dbo:wikiPageRedirects
dbr:Models_of_DNA_evolution
Subject Item
wikipedia-en:Models_of_DNA_evolution
foaf:primaryTopic
dbr:Models_of_DNA_evolution