| dbo:abstract
|
- Skórovací funkce (anglicky Scoring functions) jsou zodpovědné za identifikaci pózy, která je z termodynamického hlediska nejpravděpodobnější. Své využití nacházejí především v aproximaci, jež vypovídá o tom, jak se bude molekula vázat pomocí daných parametrů do daného vazebného místa. Konkrétně se s skórovací funkcí je možné setkat zejména při tzv. dokování, které funguje na principu předpovídání vazebné energie ligandu s receptorem v různých prostorových pózách. Skórovací funkce obecně plní dvojí funkci, řídí dokování a zároveň předpovídají vazebnou afinitu finálního vazebného módu. Na skórovací funkci jsou kladeny požadavky, aby byla rychlá a dostatečně objektivní pro všechny systémy, avšak takovou funkci je velmi obtížné naleznout. Optimální skórovací funkce odpovídá nejnižší volné energii. Jednotlivé skórovací funkce je možné kombinovat pro lepší a přesnější aproximaci. Sestrojením nejlepší skórovací funkce jsme schopni vybrat optimální ligand na dokování. (cs)
- In the fields of computational chemistry and molecular modelling, scoring functions are mathematical functions used to approximately predict the binding affinity between two molecules after they have been docked. Most commonly one of the molecules is a small organic compound such as a drug and the second is the drug's biological target such as a protein receptor. Scoring functions have also been developed to predict the strength of intermolecular interactions between two proteins or between protein and DNA. (en)
- 計算化学や分子モデリングの分野では、スコアリング関数 (scoring functions) は、ドッキングした2つの分子の分子間における結合親和性を概算するために使用される数学的な関数である。最も一般的には、分子の1つは薬剤のような低分子有機化合物で、2つ目はタンパク質受容体のような薬剤の生物学的標的である。また、2つのタンパク質間またはタンパク質とDNAの間の分子間相互作用の強さを予測するためのスコアリング関数も開発されている。 (ja)
|
| dbo:wikiPageID
| |
| dbo:wikiPageLength
|
- 22788 (xsd:nonNegativeInteger)
|
| dbo:wikiPageRevisionID
| |
| dbo:wikiPageWikiLink
| |
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| dcterms:subject
| |
| rdfs:comment
|
- In the fields of computational chemistry and molecular modelling, scoring functions are mathematical functions used to approximately predict the binding affinity between two molecules after they have been docked. Most commonly one of the molecules is a small organic compound such as a drug and the second is the drug's biological target such as a protein receptor. Scoring functions have also been developed to predict the strength of intermolecular interactions between two proteins or between protein and DNA. (en)
- 計算化学や分子モデリングの分野では、スコアリング関数 (scoring functions) は、ドッキングした2つの分子の分子間における結合親和性を概算するために使用される数学的な関数である。最も一般的には、分子の1つは薬剤のような低分子有機化合物で、2つ目はタンパク質受容体のような薬剤の生物学的標的である。また、2つのタンパク質間またはタンパク質とDNAの間の分子間相互作用の強さを予測するためのスコアリング関数も開発されている。 (ja)
- Skórovací funkce (anglicky Scoring functions) jsou zodpovědné za identifikaci pózy, která je z termodynamického hlediska nejpravděpodobnější. Své využití nacházejí především v aproximaci, jež vypovídá o tom, jak se bude molekula vázat pomocí daných parametrů do daného vazebného místa. Konkrétně se s skórovací funkcí je možné setkat zejména při tzv. dokování, které funguje na principu předpovídání vazebné energie ligandu s receptorem v různých prostorových pózách. Skórovací funkce obecně plní dvojí funkci, řídí dokování a zároveň předpovídají vazebnou afinitu finálního vazebného módu. Na skórovací funkci jsou kladeny požadavky, aby byla rychlá a dostatečně objektivní pro všechny systémy, avšak takovou funkci je velmi obtížné naleznout. Optimální skórovací funkce odpovídá nejnižší volné ener (cs)
|
| rdfs:label
|
- Skórovací funkce (bioinformatika) (cs)
- スコアリング関数 (分子) (ja)
- Scoring functions for docking (en)
|
| owl:sameAs
| |
| prov:wasDerivedFrom
| |
| foaf:isPrimaryTopicOf
| |
| is dbo:wikiPageRedirects
of | |
| is dbo:wikiPageWikiLink
of | |
| is foaf:primaryTopic
of | |
