An Entity of Type: software, from Named Graph: http://dbpedia.org, within Data Space: dbpedia.org

The RNA integrity number (RIN) is an algorithm for assigning integrity values to RNA measurements. The integrity of RNA is a major concern for gene expression studies and traditionally has been evaluated using the 28S to 18S rRNA ratio, a method that has been shown to be inconsistent. This inconsistency arises because subjective, human interpretation is necessary to compare the 28S and 18S gel images. The RIN algorithm was devised to overcome this issue. The RIN algorithm is applied to electrophoretic RNA measurements, typically obtained using capillary gel electrophoresis, and based on a combination of different features that contribute information about the RNA integrity to provide a more universal measure. RIN has been demonstrated to be robust and reproducible in studies comparing it t

Property Value
dbo:abstract
  • رقم سلامة الحمض النووي الريبي (RIN) هو خوارزمية لتعيين قيم النزاهة لقياسات الحمض النووي الريبي. تُعد سلامة الحمض النووي الريبي مصدر قلق كبير لدراسات التعبير الجيني وقد تم تقييمها تقليديًا باستخدام الرنا الريفي 28S إلى 18S ، وهي طريقة ثبت أنها غير متسقة. [1] ينشأ عدم التناسق هذا لأن التفسير البشري الذاتي ضروري لمقارنة الصورتين 28S و 18S. تم تصميم خوارزمية RIN للتغلب على هذه المشكلة. يتم تطبيق خوارزمية RIN على قياسات الحمض النووي الريبي الكهربي ، والتي يتم الحصول عليها عادةً باستخدام الرحلان الكهربائي الهلامي ، وبناءً على مجموعة من الميزات المختلفة التي تساهم في معلومات حول سلامة الحمض النووي الريبي لتوفير مقياس أكثر عالمية. لقد أثبت RIN أنه قوي وقابل للتكرار في الدراسات التي تقارنه مع خوارزميات حساب سلامة الحمض النووي الريبي الأخرى ، مما يعزز موقعه كطريقة مفضلة لتحديد جودة الحمض النووي الريبي المراد تحليله (ar)
  • The RNA integrity number (RIN) is an algorithm for assigning integrity values to RNA measurements. The integrity of RNA is a major concern for gene expression studies and traditionally has been evaluated using the 28S to 18S rRNA ratio, a method that has been shown to be inconsistent. This inconsistency arises because subjective, human interpretation is necessary to compare the 28S and 18S gel images. The RIN algorithm was devised to overcome this issue. The RIN algorithm is applied to electrophoretic RNA measurements, typically obtained using capillary gel electrophoresis, and based on a combination of different features that contribute information about the RNA integrity to provide a more universal measure. RIN has been demonstrated to be robust and reproducible in studies comparing it to other RNA integrity calculation algorithms, cementing its position as a preferred method of determining the quality of RNA to be analyzed. A major criticism to RIN is when using with plants or in studies of eukaryotic-prokaryotic cells interactions. The RIN algorithm is unable to differentiate eukaryotic/prokaryotic/chloroplastic ribosomal RNA, creating serious quality index underestimation in such situations. (en)
  • RNA integrity number (RIN)は、遺伝子発現解析などに用いるRNA試料の品質を評価するための指標の1つである。 (ja)
dbo:thumbnail
dbo:wikiPageExternalLink
dbo:wikiPageID
  • 12280976 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength
  • 16998 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID
  • 1077145897 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink
dbp:wikiPageUsesTemplate
dcterms:subject
gold:hypernym
rdf:type
rdfs:comment
  • RNA integrity number (RIN)は、遺伝子発現解析などに用いるRNA試料の品質を評価するための指標の1つである。 (ja)
  • رقم سلامة الحمض النووي الريبي (RIN) هو خوارزمية لتعيين قيم النزاهة لقياسات الحمض النووي الريبي. تُعد سلامة الحمض النووي الريبي مصدر قلق كبير لدراسات التعبير الجيني وقد تم تقييمها تقليديًا باستخدام الرنا الريفي 28S إلى 18S ، وهي طريقة ثبت أنها غير متسقة. [1] ينشأ عدم التناسق هذا لأن التفسير البشري الذاتي ضروري لمقارنة الصورتين 28S و 18S. تم تصميم خوارزمية RIN للتغلب على هذه المشكلة. يتم تطبيق خوارزمية RIN على قياسات الحمض النووي الريبي الكهربي ، والتي يتم الحصول عليها عادةً باستخدام الرحلان الكهربائي الهلامي ، وبناءً على مجموعة من الميزات المختلفة التي تساهم في معلومات حول سلامة الحمض النووي الريبي لتوفير مقياس أكثر عالمية. لقد أثبت RIN أنه قوي وقابل للتكرار في الدراسات التي تقارنه مع خوارزميات حساب سلامة الحمض النووي الريبي الأخرى ، مما يعزز موقعه كطريقة مفضلة لتحديد جودة الحمض النووي الري (ar)
  • The RNA integrity number (RIN) is an algorithm for assigning integrity values to RNA measurements. The integrity of RNA is a major concern for gene expression studies and traditionally has been evaluated using the 28S to 18S rRNA ratio, a method that has been shown to be inconsistent. This inconsistency arises because subjective, human interpretation is necessary to compare the 28S and 18S gel images. The RIN algorithm was devised to overcome this issue. The RIN algorithm is applied to electrophoretic RNA measurements, typically obtained using capillary gel electrophoresis, and based on a combination of different features that contribute information about the RNA integrity to provide a more universal measure. RIN has been demonstrated to be robust and reproducible in studies comparing it t (en)
rdfs:label
  • رقم سلامة الحمض النووي الريبي (ar)
  • RNA integrity number (ja)
  • RNA integrity number (en)
owl:sameAs
prov:wasDerivedFrom
foaf:depiction
foaf:isPrimaryTopicOf
is dbo:wikiPageDisambiguates of
is dbo:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of
Powered by OpenLink Virtuoso    This material is Open Knowledge     W3C Semantic Web Technology     This material is Open Knowledge    Valid XHTML + RDFa
This content was extracted from Wikipedia and is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License