| dbo:abstract
|
- ADN polimerasa I (o Pol I) és un enzim que participa en el procés de replicació de l'Adn en les procariotes. Està format per 928 aminoàcids, i és un exemple d'un enzim processiu (de l'anglès processivity) – pot catalitzar seqüencialment múltiples polimertitzacions. Va ser descobert el 1956 per Athur Kornberg, va ser la primera Adn polimerasa a ser coneguda ( i també el primer tipus de polimerasa). En un principi es va caracteritzar en E. coli, encara que és omnipresent en els procariotes. En E. coli i moltes altres bacteris, el gen que codifica Pol I és conegut com a PolA. Pol I té tres activitats enzimàtiques: 1.
* Una activitat DNA-polimerasa en direcció 5 '→ 3' (endavant), que requereix a l'extrem 3' un encebador i una cadena model. 2.
* Una activitat exonucleasa en sentit 3 '→ 5' (al revés) que permet la correcció de l'ADN. 3.
* Una activitat exonucleasa en direcció 5 '→ 3' (endavant) que permet la nick-translation durant la reparació de l'Adn. En el procés de replicació, la DNA polimerasa I elimina l'encebador d'ARN (creat per la primasa) de la cadena retardada i omple amb nucleòtids necessaris els fragments d'Okazaki (vegeu Replicació de l'ADN) en sentit 5 '→ 3', corregint els errors. És un enzim que depèn de la cadena model - només afegeix nucleòtids amb les seves parelles de bases corresponent si hi ha una cadena d'ADN existent que actui com a model. La ligasa després uneix els diferents fragments junts en una cadena contínua d'ADN. Tot i l'aviat caracterització de la Pol, aviat es va fer evident que la Pol no era l'enzim responsable de la majoria de síntesi d'ADN - en l'E. coli la replicació és d'aproximadament 1.000 nucleòtids / segon, mentre que la taxa de síntesi per la Pol I mitjana és de només 20 nucleòtids / segon. A més, la seva abundància cel·lular d'aproximadament 400 molècules per cèl·lula no es correlaciona amb el fet que normalment hi ha només dos forquilles de replicació en E. coli. D'altra banda, no és suficient processiu per copiar un genoma complet, ja que cau després de la incorporació de només 25-50 nucleòtids. El seu paper en la replicació va quedar demostrat quan, el 1969, John Cairns aïlla una pol I viable mutada que no tenia l'activitat de la polimerasa. Paula De Lucia, Assistent de Cairns laboratori ha creat milers d'extractes lliures de cèl·lules de les colònies d'E coli i ha analitzat l'activitat de la polimerasa d'ADN. El clon 3.478 contenia la Pol mutant, que va ser nomenada per Cairns al crèdit "Paula" [De Lucia]. No va ser fins al descobriment de la DNA polimerasa III, que el principal de l'ADN polimerasa replicatiu, finalment, va ser identificat. (ca)
- DNA polymeráza I je označení pro jednu z DNA polymeráz u bakterií. Byla objevena Arthurem Kornbergem v roce 1956, tzn. stala se první známou DNA polymerázou. Zároveň je u bakterií nejhojněji se vyskytující DNA polymerázou, schopnou především replikovat krátké úseky DNA a odstraňovat RNA primery po replikaci opožďujícího se (lagging) vlákna DNA. Hraje však méně významnou roli než DNA polymeráza III. Je schopná katalýzy těchto procesů: 1.
* Polymerace DNA ve směru 5' → 3', začínající na primeru 2.
* Oprava DNA (proofreading) ve směru 3' → 5', tzv. aktivita 3.
* Rovněž také exonukleotická aktivita ve směru 5' → 3' (nick translation), rovněž během oprav DNA Jednou z DNA polymeráz I je i hojně využívaná Taq polymeráza. (cs)
- Die DNA-Polymerase I ist ein Enzym, welches die Synthese von DNA aus Desoxyribonukleotiden an einer DNA-Matrize katalysiert. Die DNA-Polymerase I spielt bei der prokaryotischen DNA-Replikation eine Rolle. Das wichtigste Merkmal ist seine 5'-3'-Exonukleaseaktivität. Neben DNA-Polymerase I sind auch noch zwei weitere DNA-Polymerasen in Prokaryoten bekannt. (de)
- DNA polymerase I (or Pol I) is an enzyme that participates in the process of prokaryotic DNA replication. Discovered by Arthur Kornberg in 1956, it was the first known DNA polymerase (and the first known of any kind of polymerase). It was initially characterized in E. coli and is ubiquitous in prokaryotes. In E. coli and many other bacteria, the gene that encodes Pol I is known as polA. The E. coli Pol I enzyme is composed of 928 amino acids, and is an example of a processive enzyme — it can sequentially catalyze multiple polymerisation steps without releasing the single-stranded template. The physiological function of Pol I is mainly to support repair of damaged DNA, but it also contributes to connecting Okazaki fragments by deleting RNA primers and replacing the ribonucleotides with DNA. (en)
- L'ADN polymérase I, ou pol I, est une ADN polymérase présente chez les bactéries et intervenant dans la réplication de l'ADN. Elle est la toute première polymérase découverte, en 1956. Chez E. coli, elle est codée dans le gène polA et compte 928 résidus d'acides aminés ; c'est un exemple d'enzyme processive, c'est-à-dire capable de catalyser un grand nombre de polymérisations successives. Elle possède quatre activités enzymatiques distinctes :
* activité polymérase 5’ → 3’, qui a besoin d'une amorce et d'un brin d'ADN servant de modèle appelé matrice ;
* activité exonucléase 3’ → 5’ permettant la correction des erreurs de polymérisation par excision des nucléotides incorrects du point de vue de l'appariement des bases nucléiques ;
* activité exonucléase 5’ → 3’ permettant la réparation de l'ADN ;
* activité transcriptase inverse, vraisemblablement sans signification biologique importante, permettant de produire des fragments d'ADN à partir d'un brin d'ARN, mais avec une efficacité considérablement réduite (environ 0,1 à 0,4 % de celle de l'activité transcriptase directe). Au cours de la réplication, la ribonucléase H (spécifique des hétéroduplexes (ARN/ADN) élimine du brin retardé l'amorce d'ARN générée par la primase permettant à l'ADN polymérase I de compléter les désoxyribonucléotides manquants entre les fragments d'Okazaki dans le sens 5’ → 3’, corrigeant les erreurs de transcription au fur et à mesure de sa progression. L'ADN ligase assure ensuite la suture entre les fragments d'Okazaki afin de produire un brin d'ADN continu. Bien qu'elle ait été découverte en premier, il est rapidement apparu évident que cette ADN polymérase n'était pas celle qui permettait d'expliquer la réplication de l'ADN chez E. coli. En effet, celle-ci requiert une vitesse d'environ 1 000 nucléotides par seconde, alors que la taux de l'ADN polymérase I avoisine 10 à 20 nucléotides par seconde. Par ailleurs, son abondance d'environ 400 molécules par cellule ne correspondait pas avec le fait qu'il y a typiquement deux fourches de réplication par cellule chez E. coli. Enfin, elle n'est pas suffisamment processive pour permettre la réplication d'un génome entier, car elle interrompt la réplication après l'insertion de 25 à 50 nucléotides. Ce n'est qu'avec la découverte de l'ADN polymérase III que la principale enzyme de réplication de l'ADN chez les bactéries a été identifiée. (fr)
- La DNA polimerasi I è un enzima (numero EC 2.7.7.7) che partecipa al processo di replicazione del DNA nei procarioti; fa parte della famiglia delle DNA polimerasi. Fu scoperto nel 1958 da Arthur Kornberg, che fu insignito del premio Nobel per la Medicina l'anno successivo per la scoperta dei meccanismi della sintesi biologica dell'acido deossiribonucleico. (it)
- A DNA polimerase I (ou Pol I) é uma enzima relacionada ao reparo do DNA, codificada pelo gene polA, altamente ativa em Escherichia coli, possui atividade tanto 5'-3' quanto 3'-5'. Além disso, começa o processo de elongamento do DNA após a primase na origem de replicação(ORI) 5'-3'. Contudo, sua baixa processividade é preterida pela alta velocidade da DNA polimerase III, que assume o papel principal da replicação do DNA em E. Coli aproximadamente 400 pares de base a jusante da origem. Além disso, possui um papel no processamento dos fragmentos de Okazaki. Há artigos na literatura que sugerem que a DNA polimerase I possua atividade de transcriptase reversa, tendo sua utilidade como tal em processos específicos, como a formação de repetições palindrômicas, além de ser uma possível “remanescente de enzimas ancestrais envolvidas tanto em replicação dependente de DNA e replicação dependente de DNA”.A Pol I é formada por uma única subunidade, uma única cadeia polipeptídica, que quando quebrada enzimaticamente de forma controlada libera sua subunidade catalítica, chamada de Fragmento Klenow. trissomia do 18. trissomia do 18. Referencias: Structure and mechanism of DNA polymerases.trissomia do 18. Encontrado em:https://web.archive.org/web/20130217013013/http://www-lehre.img.bio.uni-goettingen.de/Vorlesung_SS_2007/Kramer/pdf/Rothwell_Waksman_2005_review_Structure_mechanism_DNA_Polymerase_Adv_Prot_Chem_71_401.pdf(Acesso em 10/06/2012) E.coli DNA polymerase I as a reverse transcriptaseEncontrado em: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC413221/pdf/emboj00074-0027.pdf(Acesso em 09/06/2014) (pt)
- ДНК-полімераза I (англ. DNA Polymerase I або Pol I) — білок, один з ензимів, завдяки якому відбувається реплікація ДНК у бактерій. ДНК-полімераза I була відкрита Артуром Корнбергом в 1956 році і стала першою відомою ДНК-полімеразою (а також першою відомою полімеразою взагалі). Була вперше виділена з бактерії E. coli, проте згодом було показано, що цей ензим є у всіх прокаріотів. В E. coli та в багатьох інших бактеріях ДНК-полімераза I кодується геном polA. Поліпептидний ланцюг ДНК-полімерази I з E. coli складається з 928 амінокислотних залишків. ДНК-полімераза I є прикладом процесивного ензиму, тобто такого, що може послідовно каталізувати декілька елементарних стадій реакції полімеризації ДНК. ДНК-полімераза I має чотири різні типи ензиматичної активності, а саме: 1.
* ДНК-залежна ДНК-полімеразна активність у напрямку 5'→3' (пряма). Вимагає наявності 3'-праймерного гідроксилу впритул до одноланцюгової ДНК-матриці. 2.
* екзонуклеазна активність у напрямку 3'→5' (зворотня), завдяки якій відбувається корекція помилок 3.
* екзонуклеазна активність у напрямку 5'→3' (пряма), завдяки якій відбувається трансляція одноланцюгових розривів (англ. «nick translation») при репарації ДНК. 4.
* РНК-залежна ДНК-полімеразна активність у напрямку 5'→3' (пряма). ДНК-полімераза I може оперувати на РНК-матрицях із незначною ефективністю (0,1–0,4 %) порівняно з ДНК-матрицями; ця активність, ймовірно, не відіграє важливої біологічної ролі. В процесі реплікації ДНК РНКаза H видаляє РНК-праймери (що створюються праймазою) з відстаючого ланцюга ДНК, після чого ДНК-полімераза I заповнює нуклеотидами пробіли між фрагментами Окадзакі (див. статтю Реплікація ДНК) в напрямку 5'→3'. ДНК-полімераза I є матричним ензимом, тобто вона вбудовує нові нуклеотиди до складу ДНК згідно з комплементарністю до ДНК-матриці. Дуже швидко стало очевидним, що ДНК-полімераза I не є ДНК-полімеразою, що відповідає за реплікацію основного масиву бактеріальної ДНК. Реплікація ДНК в E. coli відбувається зі швидкістю 1000 нуклеотидів на секунду, тоді як швидкість полімеризації ДНК у присутності ДНК-полімерази I складає лише 10–20 нуклеотидів на секунду. Більше того, висока кількість копій цього ензиму у бактеріальній клітині (близько 400 молекул на клітину) протиречила тому факту, що одночасно існують лише дві реплікаційні вилки. Окрім цього, відкритий ензим виявився недостатньо процесивним для реплікації бактеріального геному — ензим дисоціює з ДНК-матриці після полімеризації 25–50 нуклеотидів. Те, що роль ДНК-полімерази I в реплікації ДНК не є вирішальною, було встановлено в 1969 році, коли Джон Кеїрнс (англ. John Cairns) отримав життєздатну бактерію, що містила мутовану ДНК-полімеразу I із відсутньою ДНК-полімеразною активністю. Пізніше було встановлено що головною ДНК-полімеразою у бактерії є ДНК-полімераза III. (uk)
- DNA聚合酶I（DNA polymerase I；Pol I）是最早发现的一种DNA聚合酶（也是最早发现的聚合酶），於1956年由阿瑟·科恩伯格（Arthur Kornberg）从大肠杆菌中分离出，被 Kornberg 发现具有在体外催化DNA合成的性质，故又称 Kornberg 酶。Pol I 由928个氨基酸残基组成，大小约109000，只含一条肽链。除具有5'→3' DNA聚合酶活性外，还有5'→3'和3'→5'的活性。 (zh)
|
| rdfs:comment
|
- Die DNA-Polymerase I ist ein Enzym, welches die Synthese von DNA aus Desoxyribonukleotiden an einer DNA-Matrize katalysiert. Die DNA-Polymerase I spielt bei der prokaryotischen DNA-Replikation eine Rolle. Das wichtigste Merkmal ist seine 5'-3'-Exonukleaseaktivität. Neben DNA-Polymerase I sind auch noch zwei weitere DNA-Polymerasen in Prokaryoten bekannt. (de)
- DNA polymerase I (or Pol I) is an enzyme that participates in the process of prokaryotic DNA replication. Discovered by Arthur Kornberg in 1956, it was the first known DNA polymerase (and the first known of any kind of polymerase). It was initially characterized in E. coli and is ubiquitous in prokaryotes. In E. coli and many other bacteria, the gene that encodes Pol I is known as polA. The E. coli Pol I enzyme is composed of 928 amino acids, and is an example of a processive enzyme — it can sequentially catalyze multiple polymerisation steps without releasing the single-stranded template. The physiological function of Pol I is mainly to support repair of damaged DNA, but it also contributes to connecting Okazaki fragments by deleting RNA primers and replacing the ribonucleotides with DNA. (en)
- La DNA polimerasi I è un enzima (numero EC 2.7.7.7) che partecipa al processo di replicazione del DNA nei procarioti; fa parte della famiglia delle DNA polimerasi. Fu scoperto nel 1958 da Arthur Kornberg, che fu insignito del premio Nobel per la Medicina l'anno successivo per la scoperta dei meccanismi della sintesi biologica dell'acido deossiribonucleico. (it)
- DNA聚合酶I（DNA polymerase I；Pol I）是最早发现的一种DNA聚合酶（也是最早发现的聚合酶），於1956年由阿瑟·科恩伯格（Arthur Kornberg）从大肠杆菌中分离出，被 Kornberg 发现具有在体外催化DNA合成的性质，故又称 Kornberg 酶。Pol I 由928个氨基酸残基组成，大小约109000，只含一条肽链。除具有5'→3' DNA聚合酶活性外，还有5'→3'和3'→5'的活性。 (zh)
- ADN polimerasa I (o Pol I) és un enzim que participa en el procés de replicació de l'Adn en les procariotes. Està format per 928 aminoàcids, i és un exemple d'un enzim processiu (de l'anglès processivity) – pot catalitzar seqüencialment múltiples polimertitzacions. Va ser descobert el 1956 per Athur Kornberg, va ser la primera Adn polimerasa a ser coneguda ( i també el primer tipus de polimerasa). En un principi es va caracteritzar en E. coli, encara que és omnipresent en els procariotes. En E. coli i moltes altres bacteris, el gen que codifica Pol I és conegut com a PolA. (ca)
- DNA polymeráza I je označení pro jednu z DNA polymeráz u bakterií. Byla objevena Arthurem Kornbergem v roce 1956, tzn. stala se první známou DNA polymerázou. Zároveň je u bakterií nejhojněji se vyskytující DNA polymerázou, schopnou především replikovat krátké úseky DNA a odstraňovat RNA primery po replikaci opožďujícího se (lagging) vlákna DNA. Hraje však méně významnou roli než DNA polymeráza III. Je schopná katalýzy těchto procesů: Jednou z DNA polymeráz I je i hojně využívaná Taq polymeráza. (cs)
- L'ADN polymérase I, ou pol I, est une ADN polymérase présente chez les bactéries et intervenant dans la réplication de l'ADN. Elle est la toute première polymérase découverte, en 1956. Chez E. coli, elle est codée dans le gène polA et compte 928 résidus d'acides aminés ; c'est un exemple d'enzyme processive, c'est-à-dire capable de catalyser un grand nombre de polymérisations successives. Elle possède quatre activités enzymatiques distinctes : Ce n'est qu'avec la découverte de l'ADN polymérase III que la principale enzyme de réplication de l'ADN chez les bactéries a été identifiée. (fr)
- A DNA polimerase I (ou Pol I) é uma enzima relacionada ao reparo do DNA, codificada pelo gene polA, altamente ativa em Escherichia coli, possui atividade tanto 5'-3' quanto 3'-5'. Além disso, começa o processo de elongamento do DNA após a primase na origem de replicação(ORI) 5'-3'. Contudo, sua baixa processividade é preterida pela alta velocidade da DNA polimerase III, que assume o papel principal da replicação do DNA em E. Coli aproximadamente 400 pares de base a jusante da origem. Além disso, possui um papel no processamento dos fragmentos de Okazaki. trissomia do 18. (pt)
- ДНК-полімераза I (англ. DNA Polymerase I або Pol I) — білок, один з ензимів, завдяки якому відбувається реплікація ДНК у бактерій. ДНК-полімераза I була відкрита Артуром Корнбергом в 1956 році і стала першою відомою ДНК-полімеразою (а також першою відомою полімеразою взагалі). Була вперше виділена з бактерії E. coli, проте згодом було показано, що цей ензим є у всіх прокаріотів. В E. coli та в багатьох інших бактеріях ДНК-полімераза I кодується геном polA. Поліпептидний ланцюг ДНК-полімерази I з E. coli складається з 928 амінокислотних залишків. ДНК-полімераза I є прикладом процесивного ензиму, тобто такого, що може послідовно каталізувати декілька елементарних стадій реакції полімеризації ДНК. (uk)
|
