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- Les Pelagibacterales sont un ordre dans les Alphaproteobacteria composé de bactéries libres (non attachées à des particules) qui constituent environ une cellule sur trois à la surface de l'océan. Globalement, les membres des Pelagibacterales constitueraient entre un quart et la moitié de toutes les cellules procaryotes de l'océan. Initialement, ce taxon était connu uniquement par des données métagénomiques et était connu comme le clade SAR11. Il a d'abord été placé dans les Rickettsiales, mais a ensuite été élevé au rang d'ordre, puis placé comme ordre sœur des Rickettsiales dans la sous-classe des Rickettsidae. Il comprend l'espèce marine très abondante Pelagibacter ubique. Les bactéries de ce clade ont une taille exceptionnellement petite. En raison de leur petite taille de génome et de leur fonctions métaboliques limitées, les Pelagibacterales sont devenues un organisme modèle pour les études dans le cadre de la « théorie de la rationalisation ». P. ubique et les espèces apparentées sont des oligotrophes (détritivores) et se nourrissent de carbone organique dissous et d'azote organique dissous. Ils sont incapables de fixer le carbone ou l'azote, mais peuvent effectuer le cycle de Krebs avec un bypass de glyoxylate et sont capables de synthétiser tous les acides aminés à l'exception de la glycine, ainsi que certains cofacteurs. Ils ont également un besoin inhabituel et inattendu de soufre réduit. P. ubique et les membres du sous-groupe océanique I utilisent la gluconéogenèse, tandis que d'autres sous-groupes sont capables d'utiliser la voie de la glycolyse typique. Contrairement à Acaryochloris marina, P. ubique n'est pas photosynthétique — en particulier, elle n'utilise pas la lumière pour augmenter l'énergie de liaison d'une paire d'électrons — mais elle possède de la protéorhodopsine (incluant la voie de biosynthèse du rétinol) pour sa production d'ATP à partir de la lumière. Les bactéries SAR11 sont à l'origine d'une grande partie du méthane dissous à la surface de l'océan. Elles extraient le phosphate de l'acide méthylphosphonique. Bien que le taxon dérive son nom de l'espèce type P. ubique (espèce à statut Candidatus), cette espèce n'a pas encore été officiellement publiée de façon validée par la communauté scientifique, et donc ni le nom d'ordre ni le nom d'espèce n'ont de statut taxonomique officiel. (fr)
- The Pelagibacterales are an order in the Alphaproteobacteria composed of free-living marine bacteria that make up roughly one in three cells at the ocean's surface. Overall, members of the Pelagibacterales are estimated to make up between a quarter and a half of all prokaryotic cells in the ocean. Initially, this taxon was known solely by metagenomic data and was known as the SAR11 clade. It was first placed in the Rickettsiales, but was later raised to the rank of order, and then placed as sister order to the Rickettsiales in the subclass Rickettsidae. It includes the highly abundant marine species Pelagibacter ubique. Bacteria in this order are unusually small. Due to their small genome size and limited metabolic function, Pelagibacterales have become a model organism for 'streamlining theory'. P. ubique and related species are oligotrophs (scavengers) and feed on dissolved organic carbon and nitrogen. They are unable to fix carbon or nitrogen, but can perform the TCA cycle with glyoxylate bypass and are able to synthesise all amino acids except glycine, as well as some cofactors. They also have an unusual and unexpected requirement for reduced sulfur. P. ubique and members of the oceanic subgroup I possess gluconeogenesis, but not a typical glycolysis pathway, whereas other subgroups are capable of typical glycolysis. Unlike Acaryochloris marina, P. ubique is not photosynthetic — specifically, it does not use light to increase the bond energy of an electron pair — but it does possess proteorhodopsin (including retinol biosynthesis) for ATP production from light. SAR11 bacteria are responsible for much of the dissolved methane in the ocean surface. They extract phosphate from methylphosphonic acid. Although the taxon derives its name from the type species P. ubique (status Candidatus species), this species has not yet been validly published, and therefore neither the order name nor the species name has official taxonomic standing. (en)
- ペラジバクター目(ペラジバクターもく、Pelagibacterales)は、海洋表層中の自由生活性細菌の実に約3分の1を構成する、αプロテオバクテリア綱に含まれる目である。この目に属する系統は、海洋中の全原核生物細胞の25-50%を占めると推定されている。当初、この分類群はメタゲノムデータによってのみ存在が知られており、SAR11クレードと名前がつけられた。初期はリケッチア目に分類されていたが、後に再分類され、現在ではリケッチア亜綱の下でリケッチア目と共に分類されている。この系統は、海洋において非常に存在量が多い種であるPelagibacter ubiqueを含んでいる。 このクレードの細菌は細胞サイズが異常に小さい。また、ゲノムサイズも小さく代謝機能が制限されていることが知られており、ゲノム縮小(合理化)理論のモデル生物の一つとなっている。 P. ubiqueおよびその関連種は貧栄養生物（スカベンジャー）であり、溶存有機炭素や窒素を消費している。炭素や窒素を固定することはできないが、グリオキシル酸回路を用いてTCAサイクルを回すことができ、グリシンを除くすべてのアミノ酸やいくつかの補因子を合成できる。また、生育に還元硫黄を必須とする珍しい性質を持っている。P. ubiqueと海洋性サブグループIのメンバーは糖新生の能力を持っているが、典型的な解糖経路は持っていない。なお、他のサブグループは典型的な解糖能力を保持している。P. ubiqueは光合成を行わない。すなわち、光を使用して電子対の結合エネルギーを増加させない。一方で、光からのATP生成のためにとレチノール生合成経路を保持している。またこの系統群は、海洋表層中に溶けているメタンを作り出す大きな原因の一つであるほか、メチルホスホン酸からリン酸塩を抽出することができる。 分類群の名前はCandidatus P. ubiqueに由来する。ただし、この種は未記載種であり、暫定的な系統として登録されているため、正式な分類名とはみなされていない。そのため、ペラジバクター目という系統名も同様に、正式な分類学的名称とは認められていない。 (ja)
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- Les Pelagibacterales sont un ordre dans les Alphaproteobacteria composé de bactéries libres (non attachées à des particules) qui constituent environ une cellule sur trois à la surface de l'océan. Globalement, les membres des Pelagibacterales constitueraient entre un quart et la moitié de toutes les cellules procaryotes de l'océan. P. ubique et les membres du sous-groupe océanique I utilisent la gluconéogenèse, tandis que d'autres sous-groupes sont capables d'utiliser la voie de la glycolyse typique. (fr)
- The Pelagibacterales are an order in the Alphaproteobacteria composed of free-living marine bacteria that make up roughly one in three cells at the ocean's surface. Overall, members of the Pelagibacterales are estimated to make up between a quarter and a half of all prokaryotic cells in the ocean. Bacteria in this order are unusually small. Due to their small genome size and limited metabolic function, Pelagibacterales have become a model organism for 'streamlining theory'. (en)
- ペラジバクター目(ペラジバクターもく、Pelagibacterales)は、海洋表層中の自由生活性細菌の実に約3分の1を構成する、αプロテオバクテリア綱に含まれる目である。この目に属する系統は、海洋中の全原核生物細胞の25-50%を占めると推定されている。当初、この分類群はメタゲノムデータによってのみ存在が知られており、SAR11クレードと名前がつけられた。初期はリケッチア目に分類されていたが、後に再分類され、現在ではリケッチア亜綱の下でリケッチア目と共に分類されている。この系統は、海洋において非常に存在量が多い種であるPelagibacter ubiqueを含んでいる。 このクレードの細菌は細胞サイズが異常に小さい。また、ゲノムサイズも小さく代謝機能が制限されていることが知られており、ゲノム縮小(合理化)理論のモデル生物の一つとなっている。 分類群の名前はCandidatus P. ubiqueに由来する。ただし、この種は未記載種であり、暫定的な系統として登録されているため、正式な分類名とはみなされていない。そのため、ペラジバクター目という系統名も同様に、正式な分類学的名称とは認められていない。 (ja)
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- Pelagibacterales (fr)
- ペラジバクター目 (ja)
- Pelagibacterales (en)
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