About: OpenWorm

An Entity of Type: Band, from Named Graph: http://dbpedia.org, within Data Space: dbpedia.org

OpenWorm is an international open science project for the purpose of simulating the roundworm Caenorhabditis elegans at the cellular level. Although the long-term goal is to model all 959 cells of the C. elegans, the first stage is to model the worm's locomotion by simulating the 302 neurons and 95 muscle cells. This bottom up simulation is being pursued by the OpenWorm community.

Property Value
dbo:abstract
  • OpenWorm is an international open science project for the purpose of simulating the roundworm Caenorhabditis elegans at the cellular level. Although the long-term goal is to model all 959 cells of the C. elegans, the first stage is to model the worm's locomotion by simulating the 302 neurons and 95 muscle cells. This bottom up simulation is being pursued by the OpenWorm community. As of 2014, a physics engine called Sibernetic has been built for the project and models of the neural connectome and a muscle cell have been created in NeuroML format. A 3D model of the worm anatomy can be accessed through the web via the OpenWorm browser. The OpenWorm project is also contributing to develop Geppetto, a web-based multi-algorithm, multi-scale simulation platform engineered to support the simulation of the whole organism. (en)
  • OpenWorm — международный проект по созданию компьютерной модели (in silico) на клеточном уровне одного из наиболее полно изученных современной биологией микроорганизмов — червя Caenorhabditis elegans. Конечной целью проекта является полная модель, которая включает все клетки C. elegans (чуть менее тысячи). На первой стадии будет моделироваться передвижение червя, для чего симулируется работа 302 нервных клеток и 95 мышечных. На 2014 год были созданы модели нейронного коннектома и мышечных клеток. На сайте проекта доступен трехмерный интерактивный анатомический атлас червя. Участники проекта OpenWorm также развивают платформу geppetto, предназначенную для моделирования целых организмов. В 2015 году координатор проекта С. Ларсон заявил, что поставленные цели выполнены на 20—30 %. (ru)
  • 开放蠕虫(OpenWorm)是一项旨在从细胞层面在电脑上模拟秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)的国际性开放科学项目。 尽管该项目的长远目标是模拟整个秀丽隐杆线虫的全部959个细胞,第一阶段的计划是建立包含302个神经元和95个肌肉细胞的模型来模拟蠕虫运动。这种自底向上的模拟是开放蠕虫社区追求的目标。目前,此项目的物理引擎Sibernetic已经建好,神经连接组和肌肉细胞也已创建为NeuroML格式。整个蠕虫的三维解剖模型可以通过浏览器自由查看。开放蠕虫项目也参与了“Geppetto模拟框架”的开发,这是一个为开发有机体的整体建模而创设的多重算法、多尺度的模拟平台。 (zh)
dbo:thumbnail
dbo:wikiPageExternalLink
dbo:wikiPageID
  • 41077350 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength
  • 11672 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID
  • 1115264285 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink
dbp:wikiPageUsesTemplate
dcterms:subject
gold:hypernym
rdf:type
rdfs:comment
  • 开放蠕虫(OpenWorm)是一项旨在从细胞层面在电脑上模拟秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)的国际性开放科学项目。 尽管该项目的长远目标是模拟整个秀丽隐杆线虫的全部959个细胞,第一阶段的计划是建立包含302个神经元和95个肌肉细胞的模型来模拟蠕虫运动。这种自底向上的模拟是开放蠕虫社区追求的目标。目前,此项目的物理引擎Sibernetic已经建好,神经连接组和肌肉细胞也已创建为NeuroML格式。整个蠕虫的三维解剖模型可以通过浏览器自由查看。开放蠕虫项目也参与了“Geppetto模拟框架”的开发,这是一个为开发有机体的整体建模而创设的多重算法、多尺度的模拟平台。 (zh)
  • OpenWorm is an international open science project for the purpose of simulating the roundworm Caenorhabditis elegans at the cellular level. Although the long-term goal is to model all 959 cells of the C. elegans, the first stage is to model the worm's locomotion by simulating the 302 neurons and 95 muscle cells. This bottom up simulation is being pursued by the OpenWorm community. (en)
  • OpenWorm — международный проект по созданию компьютерной модели (in silico) на клеточном уровне одного из наиболее полно изученных современной биологией микроорганизмов — червя Caenorhabditis elegans. Конечной целью проекта является полная модель, которая включает все клетки C. elegans (чуть менее тысячи). На первой стадии будет моделироваться передвижение червя, для чего симулируется работа 302 нервных клеток и 95 мышечных. На 2014 год были созданы модели нейронного коннектома и мышечных клеток. На сайте проекта доступен трехмерный интерактивный анатомический атлас червя. Участники проекта OpenWorm также развивают платформу geppetto, предназначенную для моделирования целых организмов. (ru)
rdfs:label
  • OpenWorm (en)
  • OpenWorm (ru)
  • 开放蠕虫 (zh)
owl:sameAs
prov:wasDerivedFrom
foaf:depiction
foaf:isPrimaryTopicOf
is dbo:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of
Powered by OpenLink Virtuoso    This material is Open Knowledge     W3C Semantic Web Technology     This material is Open Knowledge    Valid XHTML + RDFa
This content was extracted from Wikipedia and is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License