About: MALBAC

An Entity of Type: software, from Named Graph: http://dbpedia.org, within Data Space: dbpedia.org

Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles (MALBAC) is a quasilinear whole genome amplification method. Unlike conventional DNA amplification methods that are non-linear or exponential (in each cycle, DNA copied can serve as template for subsequent cycles), MALBAC utilizes special primers that allow amplicons to have complementary ends and therefore to loop, preventing DNA from being copied exponentially. This results in amplification of only the original genomic DNA and therefore reduces amplification bias. MALBAC is “used to create overlapped shotgun amplicons covering most of the genome”. For next generation sequencing, MALBAC is followed by regular PCR which is used to further amplify amplicons.

Property Value
dbo:abstract
  • Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles (MALBAC) is a quasilinear whole genome amplification method. Unlike conventional DNA amplification methods that are non-linear or exponential (in each cycle, DNA copied can serve as template for subsequent cycles), MALBAC utilizes special primers that allow amplicons to have complementary ends and therefore to loop, preventing DNA from being copied exponentially. This results in amplification of only the original genomic DNA and therefore reduces amplification bias. MALBAC is “used to create overlapped shotgun amplicons covering most of the genome”. For next generation sequencing, MALBAC is followed by regular PCR which is used to further amplify amplicons. (en)
  • La MALBAC ou Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles est une méthode quasilinéaire d'amplification du génome complet.Les méthodes d'amplification de l'ADN traditionnelles sont exponentielles, c'est-à-dire que chaque copie d'ADN produite peut être copiée elle-même au cycle suivant. Il en résulte que les régions les plus facilement copiées seront amplifiées beaucoup plus vite que les régions moins accessibles, d'où un biais d'amplification qui peut être problématique quand on veut amplifier un génome complet.La MALBAC permet une amplification linéaire en empêchant les copies d'être elles-mêmes recopiées, ce qui réduit largement le biais d'amplification. Cette technique est toutefois très sensible à la contamination, et reste limitée dans sa couverture du génome, un tiers des SNP d'une cellule n'étant pas détectées par séquençage après MALBAC. (fr)
  • 多重退火循环扩增法 (英語:Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles,缩写MALBAC) 是一种准线性的全基因组扩增方法。与非线性或指数的传统DNA扩增方法不同(在每个循环中,复制的DNA可以作为后续循环的模板),MALBAC利用特殊引物使具有互补末端以形成环状,防止DNA被指数复制。这导致仅扩增原始基因组DNA,因此减少了扩增偏差。 MALBAC“用于鸟枪法生成有重疊、涵盖大部分基因组的扩增子”。为了进行下一代测序,MALBAC完成后再进行常规PCR进一步扩增。 (zh)
dbo:thumbnail
dbo:wikiPageExternalLink
dbo:wikiPageID
  • 38610814 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength
  • 14462 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID
  • 1123482599 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink
dbp:wikiPageUsesTemplate
dcterms:subject
gold:hypernym
rdf:type
rdfs:comment
  • Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles (MALBAC) is a quasilinear whole genome amplification method. Unlike conventional DNA amplification methods that are non-linear or exponential (in each cycle, DNA copied can serve as template for subsequent cycles), MALBAC utilizes special primers that allow amplicons to have complementary ends and therefore to loop, preventing DNA from being copied exponentially. This results in amplification of only the original genomic DNA and therefore reduces amplification bias. MALBAC is “used to create overlapped shotgun amplicons covering most of the genome”. For next generation sequencing, MALBAC is followed by regular PCR which is used to further amplify amplicons. (en)
  • 多重退火循环扩增法 (英語:Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles,缩写MALBAC) 是一种准线性的全基因组扩增方法。与非线性或指数的传统DNA扩增方法不同(在每个循环中,复制的DNA可以作为后续循环的模板),MALBAC利用特殊引物使具有互补末端以形成环状,防止DNA被指数复制。这导致仅扩增原始基因组DNA,因此减少了扩增偏差。 MALBAC“用于鸟枪法生成有重疊、涵盖大部分基因组的扩增子”。为了进行下一代测序,MALBAC完成后再进行常规PCR进一步扩增。 (zh)
  • La MALBAC ou Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles est une méthode quasilinéaire d'amplification du génome complet.Les méthodes d'amplification de l'ADN traditionnelles sont exponentielles, c'est-à-dire que chaque copie d'ADN produite peut être copiée elle-même au cycle suivant. Il en résulte que les régions les plus facilement copiées seront amplifiées beaucoup plus vite que les régions moins accessibles, d'où un biais d'amplification qui peut être problématique quand on veut amplifier un génome complet.La MALBAC permet une amplification linéaire en empêchant les copies d'être elles-mêmes recopiées, ce qui réduit largement le biais d'amplification. (fr)
rdfs:label
  • MALBAC (fr)
  • MALBAC (en)
  • 多重退火循环扩增法 (zh)
rdfs:seeAlso
owl:sameAs
prov:wasDerivedFrom
foaf:depiction
foaf:isPrimaryTopicOf
is dbo:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of
Powered by OpenLink Virtuoso    This material is Open Knowledge     W3C Semantic Web Technology     This material is Open Knowledge    Valid XHTML + RDFa
This content was extracted from Wikipedia and is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License