| dbo:abstract
|
- هومولوجين أداة من المركز الوطني للمعلومات التقنية الحيوية أو "NCBI"، وهو نظام للكشف الآلي عن التنادد بين الجينات المشروحة للعديد من الجينومات حقيقية النواة المتسلسلة. (ar)
- HomoloGene ist ein Service des National Center for Biotechnology Information (NCBI), der Informationen darüber gibt, ob und welche Homologien es für ein bestimmtes Gen in anderen Spezies gibt. Die Verarbeitung der Suchanfragen erfolgt automatisch und ist ein relativ verlässliches Werkzeug, um Verwandtschaften von Genen unterschiedlicher Arten zu analysieren. (de)
- HomoloGene, a tool of the United States National Center for Biotechnology Information (NCBI), is a system for automated detection of homologs (similarity attributable to descent from a common ancestor) among the annotated genes of several completely sequenced eukaryotic genomes. The HomoloGene processing consists of the protein analysis from the input organisms. Sequences are compared using blastp, then matched up and put into groups, using a taxonomic tree built from sequence similarity, where closer related organisms are matched up first, and then further organisms are added to the tree. The protein alignments are mapped back to their corresponding DNA sequences, and then distance metrics as molecular distances Jukes and Cantor (1969), Ka/Ks ratio can be calculated. The sequences are matched up by using a heuristic algorithm for maximizing the score globally, rather than locally, in a bipartite matching (see complete bipartite graph). And then it calculates the statistical significance of each match. Cutoffs are made per position and Ks values are set to prevent false "orthologs" from being grouped together. “Paralogs” are identified by finding sequences that are closer within species than other species. (en)
- HomoloGene es una herramienta del Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI) que es utilizada como sistema de detección automática de homólogos (similitud atribuible a la descendencia de un ancestro común) entre los genes anotados de varios genomas eucariotas completamente secuenciados. El procesamiento de HomoloGene consiste en el análisis de proteínas de los organismos de entrada. Las secuencias se compararon mediante blastp, a continuación, los empareja y agrupa, utilizando un árbol taxonómico construido a partir de la similitud de secuencias, donde los organismos más estrechamente relacionados se emparejan primero, y luego los siguientes son añadidos al árbol. Las alineaciones de proteínas se asignan a sus secuencias de ADN correspondientes; luego, las distancias métricas tales como las de o la se pueden calcular. Las secuencias se emparejan utilizando un algoritmo heurístico para maximizar la puntuación global en una coincidencia bipartita (véase grafo bipartito completo), más que a nivel local. Y luego, se calcula la significación estadística de cada pareja. En cada posición se realizan puntos de corte, y se establecen valores de Ks para evitar falsos ortólogos cuando sean agrupados; además, los parálogos son identificados a través de la búsqueda de secuencias entre aquellas especies más relacionadas. (es)
- HomoloGene est un outil du Centre national américain pour l'information en biotechnologie (NCBI) des États-Unis, plus spécialement un système de détection automatisée de gènes homologues parmi les gènes de plusieurs génomes eucaryotes complètement séquencés. Cet outil permet ainsi la recherche de gènes homologues, paralogues et orthologues basés sur la similarité des séquences de protéines. La base de données (en) utilise l'outil de recherche HomoloGene pour découvrir des relations de parenté entre les gènes de souris et les gènes de diverses espèces de vertébrés: humains, chimpanzés, macaques rhésus, chiens, bovins, rats, poulets, crapaud (Xenopus tropicalis) et poissons zèbres. (fr)
- HomoloGene, uma ferramenta do Centro Nacional de Informações sobre Biotecnologia dos Estados Unidos (NCBI), é um sistema para detecção automatizada de homólogos (similaridade atribuível à descendência de um ancestral comum) entre os genes anotados de vários genomas eucarióticos completamente sequenciados. O processamento do HomoloGene consiste na análise de proteínas dos organismos de entrada. As sequências são comparadas usando o blastp (programas que pesquisam bancos de dados de proteínas usando uma consulta de proteína.), então combinadas e colocadas em grupos, usando uma árvore taxonômica construída a partir da similaridade da seqüência, onde organismos mais próximos são combinados primeiro, e então outros organismos são adicionados à árvore. Os alinhamentos de proteínas são mapeados de volta para suas seqüências de DNA correspondentes e, em seguida, métricas de distância como distâncias moleculares de a pode ser calculada. (pt)
- HomoloGene — інструмент Національного центру біотехнологічної інформації США (NCBI), система автоматичного виявлення гомологій (подібність, спричинена походженням від загального предка) серед анотованих генів декількох повністю впорядкованих еукаріотичних геномів. Методи HomoloGene базуються на аналізі білка організмів. Послідовності порівнюють з використанням blastp, потім їх узгоджують і розподіляють у групи, використовуючи таксономічне дерево, побудоване з подібності послідовностей, де спочатку зближуються споріднені організми, а потім до дерева додають додаткові організми. Вирівнювання білків відбувається до відповідних послідовностей ДНК, а потім розраховують показники відстані на основі (1969). Послідовності узгоджуються з використанням евристичного алгоритму для максимізації глобальної, а не локальної оцінки парних порівнянь (див. Повний двочастковий граф). Після цього обчислюється статистична значимість кожного зближення. В інструменті використовуються технології анлізу великих даних. Статистичні обчислення реалізовані засобами мови R. (uk)
|
| rdfs:comment
|
- هومولوجين أداة من المركز الوطني للمعلومات التقنية الحيوية أو "NCBI"، وهو نظام للكشف الآلي عن التنادد بين الجينات المشروحة للعديد من الجينومات حقيقية النواة المتسلسلة. (ar)
- HomoloGene ist ein Service des National Center for Biotechnology Information (NCBI), der Informationen darüber gibt, ob und welche Homologien es für ein bestimmtes Gen in anderen Spezies gibt. Die Verarbeitung der Suchanfragen erfolgt automatisch und ist ein relativ verlässliches Werkzeug, um Verwandtschaften von Genen unterschiedlicher Arten zu analysieren. (de)
- HomoloGene est un outil du Centre national américain pour l'information en biotechnologie (NCBI) des États-Unis, plus spécialement un système de détection automatisée de gènes homologues parmi les gènes de plusieurs génomes eucaryotes complètement séquencés. Cet outil permet ainsi la recherche de gènes homologues, paralogues et orthologues basés sur la similarité des séquences de protéines. La base de données (en) utilise l'outil de recherche HomoloGene pour découvrir des relations de parenté entre les gènes de souris et les gènes de diverses espèces de vertébrés: humains, chimpanzés, macaques rhésus, chiens, bovins, rats, poulets, crapaud (Xenopus tropicalis) et poissons zèbres. (fr)
- HomoloGene, a tool of the United States National Center for Biotechnology Information (NCBI), is a system for automated detection of homologs (similarity attributable to descent from a common ancestor) among the annotated genes of several completely sequenced eukaryotic genomes. (en)
- HomoloGene es una herramienta del Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI) que es utilizada como sistema de detección automática de homólogos (similitud atribuible a la descendencia de un ancestro común) entre los genes anotados de varios genomas eucariotas completamente secuenciados. (es)
- HomoloGene, uma ferramenta do Centro Nacional de Informações sobre Biotecnologia dos Estados Unidos (NCBI), é um sistema para detecção automatizada de homólogos (similaridade atribuível à descendência de um ancestral comum) entre os genes anotados de vários genomas eucarióticos completamente sequenciados. (pt)
- HomoloGene — інструмент Національного центру біотехнологічної інформації США (NCBI), система автоматичного виявлення гомологій (подібність, спричинена походженням від загального предка) серед анотованих генів декількох повністю впорядкованих еукаріотичних геномів. Послідовності узгоджуються з використанням евристичного алгоритму для максимізації глобальної, а не локальної оцінки парних порівнянь (див. Повний двочастковий граф). Після цього обчислюється статистична значимість кожного зближення. (uk)
|
