An Entity of Type: software, from Named Graph: http://dbpedia.org, within Data Space: dbpedia.org

AFLP-PCR or just AFLP is a PCR-based tool used in genetics research, DNA fingerprinting, and in the practice of genetic engineering. Developed in the early 1990s by , AFLP uses restriction enzymes to digest genomic DNA, followed by ligation of adaptors to the sticky ends of the restriction fragments. A subset of the restriction fragments is then selected to be amplified. This selection is achieved by using primers complementary to the adaptor sequence, the restriction site sequence and a few nucleotides inside the restriction site fragments (as described in detail below). The amplified fragments are separated and visualized on denaturing on agarose gel electrophoresis , either through autoradiography or fluorescence methodologies, or via automated capillary sequencing instruments.

Property Value
dbo:abstract
  • Als AFLP (Abk. für engl. amplified fragment-length polymorphism) wird in der Molekularbiologie eine Technik bezeichnet, mit der ein Genetischer Fingerabdruck erstellt werden kann. Bei der AFLP wird die DNA durch zwei Restriktionsenzyme in Fragmente zerschnitten. Danach werden mit Hilfe zweier Polymerase-Kettenreaktionen einige Fragmente vervielfältigt (amplifiziert). Durch Unterschiede in der Anzahl der Restriktionsstellen entstehen verschieden lange Fragmente, deren Muster auf einem Elektrophorese-Gel zur Unterscheidung von Individuen und auch zur Darstellung naher Verwandtschaften genutzt werden kann. Die AFLP-Technik wurde 1995 durch die Arbeitsgruppe von Pieter Vos entwickelt. (de)
  • AFLP-PCR or just AFLP is a PCR-based tool used in genetics research, DNA fingerprinting, and in the practice of genetic engineering. Developed in the early 1990s by , AFLP uses restriction enzymes to digest genomic DNA, followed by ligation of adaptors to the sticky ends of the restriction fragments. A subset of the restriction fragments is then selected to be amplified. This selection is achieved by using primers complementary to the adaptor sequence, the restriction site sequence and a few nucleotides inside the restriction site fragments (as described in detail below). The amplified fragments are separated and visualized on denaturing on agarose gel electrophoresis , either through autoradiography or fluorescence methodologies, or via automated capillary sequencing instruments. Although AFLP should not be used as an acronym, it is commonly referred to as "Amplified fragment length polymorphism". However, the resulting data are not scored as length polymorphisms, but instead as presence-absence polymorphisms. AFLP-PCR is a highly sensitive method for detecting polymorphisms in DNA. The technique was originally described by Vos and Zabeau in 1993. In detail, the procedure of this technique is divided into three steps: 1. * Digestion of total cellular DNA with one or more restriction enzymes and ligation of restriction half-site specific adaptors to all restriction fragments. 2. * Selective amplification of some of these fragments with two PCR primers that have corresponding adaptor and restriction site specific sequences. 3. * Electrophoretic separation of amplicons on a gel matrix, followed by visualisation of the band pattern. (en)
  • Los polimorfismos en la longitud de fragmentos amplificados, más conocidos por su acrónimo inglés AFLP ("Amplified fragment length polymorphism"), son un tipo de marcador molecular que está basado en la restricción del ADN genómico mediante enzimas de restricción y en la subsecuente amplificación de algunos de esos fragmentos mediante la reacción en cadena de la polimerasa. Son una herramienta poderosa de análisis del genoma dado que poseen un alto poder de detección de la variabilidad genética. El ensayo de AFLP combina la especificidad, resolución y poder de muestreo de la digestión con enzimas de restricción con la velocidad y practicidad de la detección de polimorfismos mediante PCR, sin necesidad de disponer de información previa del genoma a estudiar, lo cual supone una ventaja considerable pues otras técnicas para detección de variabilidad genética necesitan una etapa previa en la cual se secuencia el DNA genomico.La técnica de AFLP es propiedad de la empresa de biotecnología holandesa .​ (es)
  • Le polymorphisme de longueur des fragments amplifiés, ou AFLP (sigle anglais de amplified fragment-length polymorphism) est un outil utilisé en génétique et en transgénèse. (fr)
  • Polimorfisme panjang fragmen teramplifikasi (bahasa Inggris: Amplified Fragment Length Polymorphism, AFLP) adalah teknik dalam biologi molekuler yang digunakan untuk penandaan genetik berbasis hasil amplifikasi (perbanyakan) PCR terhadap potongan-potongan (fragmen) DNA yang terbentuk akibat aktivitas enzim restriksi tertentu. Oleh pembuatnya, AFLP dimaksudkan sebagai salah satu alat untuk pengujian DNA. AFLP memperbaiki sejumlah kelemahan RFLP, seperti proses yang memakan waktu dan banyaknya kuantitas DNA yang dibutuhkan. Dalam AFLP, berkas DNA sampel dipotong oleh sepasang enzim restriksi. Selanjutnya PCR selektif dilakukan menggunakan primer yang memiliki adapter yang bersesuaian dengan lokasi restriksi. Hasil amplifikasi ini lalu dideteksi melalui elektroforesis gel. Teknik ini menghasilkan penanda yang berperilaku dominan, seperti RAPD, namun lebih stabil seperti RFLP. Frekuensi polimorfismenya jauh lebih tinggi daripada RFLP dan pelaksanaannya juga lebih cepat. AFLP adalah merek dagang yang hak patennya dipegang oleh Keygene, perusahaan bioteknologi asal Belanda. (in)
  • La AFLP-PCR o semplicemente AFLP è un'analisi basata sulla PCR utilizzata in genetica, per il DNA fingerprinting, ed in Ingegneria genetica. È un metodo estremamente sensibile per individuare polimorfismi a livello del DNA, descritto per la prima volta da Vos et al. nel 1993. La procedura è divisa in tre passaggi: 1. * Digestione del DNA cellulare totale con uno o più Enzimi di restrizione e legame delle semi-sequenze di restrizione presenti sui frammenti a specifici adattori (frammenti a sequenza conosciuta); 2. * Amplificazione selettiva di alcuni di questi frammenti (ampliconi) con due primer per PCR complementari alla sequenza "adattore + semisequenza di restrizione + sequenza selettiva; 3. * Separazione degli ampliconi mediante elettroforesi su gel seguita da visualizzazione delle bande. AFLP non è un acronimo ed è incorretto, nonostante numerosissime pubblicazioni tendano a farlo, riferirsi a questo metodo come "Amplified fragment length polymorphism", poiché quelli analizzati da questo metodo non si considerano polimorfismi di lunghezza quanto piuttosto polimorfismi di presenza-assenza. Una variante dell'AFLP è la cDNA-AFLP, utilizzata per quantificare le differenze in termini di espressione genica. (it)
  • Amplification Fragment Length Polymorphism (AFLP®) is een identificatietechniek om het genoom van bacteriën en fagen en alle andere denkbare organismen van elkaar te kunnen onderscheiden en genotyperen. Er wordt gebruikgemaakt van willekeurig gekozen primers die goede resultaten blijken te geven. De techniek is ontwikkeld en gepatenteerd door Het is een combinatie van een restrictie/ligatie-reactie met een polymerase chain reaction (PCR). Na het isoleren van het DNA uit het staal wordt het DNA in stukjes geknipt met restrictie-enzymen. Tegelijkertijd worden stukjes kunstmatig gesynthetiseerd DNA (adapters) aan deze knipplaatsen geligeerd. Voor de daaropvolgende PCR worden primers toegevoegd die de adaptersequentie herkennen. De DNA-fragmenten worden samen met de adapters vermenigvuldigd in de PCR. Men kan het aantal geamplificeerde restrictiefragmenten regelen door aan de primers één of meerdere extra nucleotiden toe te voegen. Voor eenvoudige genomen zoals die van fagen worden primers zonder overhang gebruikt, zodat alle verkregen restrictiefragmenten geamplificeerd worden. Uiteindelijk kan de detectie van de geamplificeerde fragmenten gebeuren door capillair-elektroforese. Hierbij worden de fragmenten gescheiden tijdens migratie door een polymeer in een capillair. De eigenlijke detectie gebeurt met een laserstraal die de fluorescentie van de fluorescerend gemerkte primers meet. Aan elk AFLP-product wordt een interne standaard toegevoegd zodat de lengte van de fragmenten berekend kan worden. Een andere methode van scheiden van fragmenten maakt gebruik van een polymere gelmatrix, waar de (radioactief) gelabelde monsters door middel van een elektrische stroom doorheen worden getrokken. Detectie gebeurt dan door de hele gel te belichten tegen een fotografische plaat of een scanner die gevoelig is voor de radioactieve of fluorescerende signalen. (nl)
  • Ме́тод поліморфі́зму довжини́ ампліфіко́ваних фрагме́нтів — (англ. AFLP, amplified fragment length polymorphism)— це молекулярно-генетичний метод, головним призначення якого є ідентифікація організмів. AFLP аналіз використовується для створення бактеріального геному. (uk)
dbo:thumbnail
dbo:wikiPageExternalLink
dbo:wikiPageID
  • 2203789 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength
  • 6406 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID
  • 1110035680 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink
dbp:wikiPageUsesTemplate
dcterms:subject
gold:hypernym
rdf:type
rdfs:comment
  • Le polymorphisme de longueur des fragments amplifiés, ou AFLP (sigle anglais de amplified fragment-length polymorphism) est un outil utilisé en génétique et en transgénèse. (fr)
  • Ме́тод поліморфі́зму довжини́ ампліфіко́ваних фрагме́нтів — (англ. AFLP, amplified fragment length polymorphism)— це молекулярно-генетичний метод, головним призначення якого є ідентифікація організмів. AFLP аналіз використовується для створення бактеріального геному. (uk)
  • AFLP-PCR or just AFLP is a PCR-based tool used in genetics research, DNA fingerprinting, and in the practice of genetic engineering. Developed in the early 1990s by , AFLP uses restriction enzymes to digest genomic DNA, followed by ligation of adaptors to the sticky ends of the restriction fragments. A subset of the restriction fragments is then selected to be amplified. This selection is achieved by using primers complementary to the adaptor sequence, the restriction site sequence and a few nucleotides inside the restriction site fragments (as described in detail below). The amplified fragments are separated and visualized on denaturing on agarose gel electrophoresis , either through autoradiography or fluorescence methodologies, or via automated capillary sequencing instruments. (en)
  • Als AFLP (Abk. für engl. amplified fragment-length polymorphism) wird in der Molekularbiologie eine Technik bezeichnet, mit der ein Genetischer Fingerabdruck erstellt werden kann. Bei der AFLP wird die DNA durch zwei Restriktionsenzyme in Fragmente zerschnitten. Danach werden mit Hilfe zweier Polymerase-Kettenreaktionen einige Fragmente vervielfältigt (amplifiziert). Durch Unterschiede in der Anzahl der Restriktionsstellen entstehen verschieden lange Fragmente, deren Muster auf einem Elektrophorese-Gel zur Unterscheidung von Individuen und auch zur Darstellung naher Verwandtschaften genutzt werden kann. (de)
  • Los polimorfismos en la longitud de fragmentos amplificados, más conocidos por su acrónimo inglés AFLP ("Amplified fragment length polymorphism"), son un tipo de marcador molecular que está basado en la restricción del ADN genómico mediante enzimas de restricción y en la subsecuente amplificación de algunos de esos fragmentos mediante la reacción en cadena de la polimerasa. Son una herramienta poderosa de análisis del genoma dado que poseen un alto poder de detección de la variabilidad genética. El ensayo de AFLP combina la especificidad, resolución y poder de muestreo de la digestión con enzimas de restricción con la velocidad y practicidad de la detección de polimorfismos mediante PCR, sin necesidad de disponer de información previa del genoma a estudiar, lo cual supone una ventaja consi (es)
  • Polimorfisme panjang fragmen teramplifikasi (bahasa Inggris: Amplified Fragment Length Polymorphism, AFLP) adalah teknik dalam biologi molekuler yang digunakan untuk penandaan genetik berbasis hasil amplifikasi (perbanyakan) PCR terhadap potongan-potongan (fragmen) DNA yang terbentuk akibat aktivitas enzim restriksi tertentu. Oleh pembuatnya, AFLP dimaksudkan sebagai salah satu alat untuk pengujian DNA. AFLP adalah merek dagang yang hak patennya dipegang oleh Keygene, perusahaan bioteknologi asal Belanda. (in)
  • La AFLP-PCR o semplicemente AFLP è un'analisi basata sulla PCR utilizzata in genetica, per il DNA fingerprinting, ed in Ingegneria genetica. È un metodo estremamente sensibile per individuare polimorfismi a livello del DNA, descritto per la prima volta da Vos et al. nel 1993. La procedura è divisa in tre passaggi: Una variante dell'AFLP è la cDNA-AFLP, utilizzata per quantificare le differenze in termini di espressione genica. (it)
  • Amplification Fragment Length Polymorphism (AFLP®) is een identificatietechniek om het genoom van bacteriën en fagen en alle andere denkbare organismen van elkaar te kunnen onderscheiden en genotyperen. Er wordt gebruikgemaakt van willekeurig gekozen primers die goede resultaten blijken te geven. De techniek is ontwikkeld en gepatenteerd door (nl)
rdfs:label
  • AFLP (de)
  • Amplified fragment length polymorphism (en)
  • Polimorfismos en la longitud de fragmentos amplificados (es)
  • Polimorfisme panjang fragmen teramplifikasi (in)
  • Polymorphisme de longueur des fragments amplifiés (fr)
  • Amplified fragment length polymorphism (it)
  • Amplification fragment length polymorphism (nl)
  • Поліморфізм довжини ампліфікованих фрагментів (uk)
owl:sameAs
prov:wasDerivedFrom
foaf:depiction
foaf:isPrimaryTopicOf
is dbo:wikiPageDisambiguates of
is dbo:wikiPageRedirects of
is dbo:wikiPageWikiLink of
is rdfs:seeAlso of
is foaf:primaryTopic of
Powered by OpenLink Virtuoso    This material is Open Knowledge     W3C Semantic Web Technology     This material is Open Knowledge    Valid XHTML + RDFa
This content was extracted from Wikipedia and is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License