This HTML5 document contains 52 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dcthttp://purl.org/dc/terms/
dbohttp://dbpedia.org/ontology/
foafhttp://xmlns.com/foaf/0.1/
n9https://global.dbpedia.org/id/
dbthttp://dbpedia.org/resource/Template:
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
freebasehttp://rdf.freebase.com/ns/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
dbpedia-arhttp://ar.dbpedia.org/resource/
owlhttp://www.w3.org/2002/07/owl#
wikipedia-enhttp://en.wikipedia.org/wiki/
dbphttp://dbpedia.org/property/
dbchttp://dbpedia.org/resource/Category:
provhttp://www.w3.org/ns/prov#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
goldhttp://purl.org/linguistics/gold/
wikidatahttp://www.wikidata.org/entity/
dbrhttp://dbpedia.org/resource/

Statements

Subject Item
dbr:Selection_and_amplification_binding_assay
rdf:type
dbo:TopicalConcept
rdfs:label
Selection and amplification binding assay فحص ربط الاختيار والتضخيم
rdfs:comment
Selection and amplification binding assay (SAAB) is a molecular biology technique typically used to find the DNA binding site for proteins. It was developed by and Harold M. Weintraub in 1990. فحص ربط الاختيار والتضخيم (SAAB) هي تقنية في علم الأحياء الجزيئي طورها تي كيث بلاكويل وهارولد اينتروب عام 1990. ويتركز استخدامها الرئيسي في العثور على موضع ربط الحمض النووي الخاص بالبروتينات. التفاصيل التجريبية يتكون الإجراء التجريبي لساب (SAAB) من عدة خطوات، وفقًا للمعرفة المتوفرة عن موضع الربط. تتكون تجربة ساب (SAAB) المثالية من الخطوات التالية 2. نموذج الحضن المعلق المعلم المزدوج مع البروتينينبغي عادةً تجميع البروتين في خلية مضيفة بواسطة تقنيات الاندماج. ويتم توفير وقت احتضان أطول وكمية كبيرة في حالة موضع الربط غير المحدد. تطبيقات ساب (SAAB)
dct:subject
dbc:Laboratory_techniques dbc:Biotechnology dbc:DNA_profiling_techniques dbc:Molecular_biology dbc:Molecular_biology_techniques dbc:Amplifiers dbc:Polymerase_chain_reaction
dbo:wikiPageID
26068545
dbo:wikiPageRevisionID
1077675675
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Harold_M._Weintraub dbr:Molecular_biology dbc:DNA_profiling_techniques dbr:T._Keith_Blackwell dbc:Biotechnology dbr:DNA_sequencing dbc:Molecular_biology dbc:Molecular_biology_techniques dbr:Homeobox dbr:DNA dbr:Morphogenesis dbr:Protein dbr:Electrophoretic_mobility_shift_assay dbc:Amplifiers dbr:Prosencephalon dbr:Quail dbr:Mesencephalon dbc:Polymerase_chain_reaction dbc:Laboratory_techniques
owl:sameAs
n9:GEew wikidata:Q12230376 dbpedia-ar:فحص_ربط_الاختيار_والتضخيم freebase:m.0b6f89w
dbp:wikiPageUsesTemplate
dbt:Refbegin dbt:Short_description dbt:Cite_journal dbt:Refimprove dbt:Refend dbt:Reflist dbt:DNA_sequence
dbo:abstract
Selection and amplification binding assay (SAAB) is a molecular biology technique typically used to find the DNA binding site for proteins. It was developed by and Harold M. Weintraub in 1990. فحص ربط الاختيار والتضخيم (SAAB) هي تقنية في علم الأحياء الجزيئي طورها تي كيث بلاكويل وهارولد اينتروب عام 1990. ويتركز استخدامها الرئيسي في العثور على موضع ربط الحمض النووي الخاص بالبروتينات. التفاصيل التجريبية يتكون الإجراء التجريبي لساب (SAAB) من عدة خطوات، وفقًا للمعرفة المتوفرة عن موضع الربط. تتكون تجربة ساب (SAAB) المثالية من الخطوات التالية 1. توليف نموذج بتسلسل عشوائي في موضع ربطهناك ثلاثة أوضاع ممكنة: (أ) عندما يكون كل من موضع الربط والبروتين معروفين ومتوفرين؛ (ب) عندما يتوفر فقط موضع ربط متوافق ولا يتوفر البروتين؛ (جـ) عندما يكون البروتين متوفرًا، ولكن موضع الربط غير معروف. عندما يكون موضع الربط معروفًا، فيجب أن يكون عدد مواضع النوكليوتيدات العشوائي في النموذج كبيرًا 2. نموذج الحضن المعلق المعلم المزدوج مع البروتينينبغي عادةً تجميع البروتين في خلية مضيفة بواسطة تقنيات الاندماج. ويتم توفير وقت احتضان أطول وكمية كبيرة في حالة موضع الربط غير المحدد. 3. عزل بروتين الحمض النووي المرتبط بواسطة فحص تغير التَحَرُّك الرَحَلانِيّ (EMSA)يتم عزل بروتين الحمض النووي المرتبط، المرحل في هلام الأرالامايد، بواسطة تصوير الإشعاع الذاتي بحسب بروتوكول فحص تغير التَحَرُّك الرَحَلانِيّ (EMSA). 4. تضخيم نموذج الربط بواسطة تفاعل سلسلة البوليميرات (PCR). وللسيطرة الإيجابية، يتم أيضًا تضخيم نموذج البدءيتم كذلك عزل الحمض النووي المرتبط بواسطة هلام الاستئصال وتطهيره، وتضخيمه باستخدام تفاعل سلسلة البوليميرات (PCR). 5. تسمية موضع الربط المضخّم وإعادة تحديده للربط بواسطة EMSA (عادة 5 مرات) الاستمرار في خطوة الربط خمس مرات على الأقل بعينة الحمض النووي المضخمة التي تمت تسميتها وبروتين الاندماج. 6. تسلسل الحمض النوويبعد خطوة الاختيار والرحلان الكهربائي الأخيرة، يتم استنساخ الحمض النووي داخل أحد ناقلات الاستنساخ وجعله متسلسلاً. في الأصل تستخدم بلاكويل بايرو التسلسل، والتي يمكن الاستعاضة عنها بالأساليب الحديثة. تحديد تسلسل ربط الحمض النووي Quox_1 Homeodomain باستخدام ساب (SAAB) (مثال وصفي من دراسة حديثة)- مثالكوكس1 هو جين هيموبوكس جديد (الهيموبوكس هو تسلسل الحمض النووي الموجود داخل الجينات التي تشارك في تنظيم أنماط التنمية (التخلق) في الحيوانات، والفطريات، والنباتات، والمفصولة في الأصل عن مكتبة كدنا (cDNA) لأجنة السمان (كويل هو اسم جماعي للعديد من أجناس الطيور متوسطة الحجم) ذات الأسابيع الخمسة. وهو الجنس الوحيد في فصيلة هوكس (hox) الذي وجد ليعبر عن كل من الدِّماغُ المُقَدَّم والدماغ المتوسط المرتبط بالتفريق بين الخلايا العصبية المركزية والمحيطية. وقد تم تحديد موضع ربط الحمض النووي الأمثل لكوكس1 أو خواصه الثديية بواسطة تقنية ساب في 2004.وتم الحصول على تسلسل هوموبوكس الخاص بكوكس1 بواسطة تضخيم تفاعل سلسلة البوليميرات (PCR) من أجنة بشرية بمكتبة كدنا (cDNA) من خلال إجراء قياسي. وقد تم استيعاب شظية الحمض النووي المضخمة بواسطة إكورف (EcoRV) وإكسوي (XhoI) واستنساخه داخل موضع تقيد سماي (SmaI) وإكسوي (XhoI) الخاص بالتعبير الموجه pGEMEXxBal. وقد تم نقل البلازميدات المؤتلفة داخل سلالة إشريكية قولونية مختصة بي إل 21 (BL21) وعزل بروتينات اندماج كوكس1 (Quox1) بواسطة تقنيات الكروماتوغرافي. كما تم تطوير الراديو المسمى probe باستخدام 25 بمول من البروتين المنقى والمنصهر Quox1في منطقة الربط العازلة لفحص تغير التَحَرُّك الرَحَلانِيّ (EMSA). وتم تحديد الحمض النووي المرتبط بالبروتين من خلال تصوير الإشعاع الذاتي، واستئصال الشرائط التي تمثل تجمعات البروتين والحمض النووي من الهلام، وتضخيم الحمض النووي المزال بواسطة تفاعل سلسلة البوليميرات (PCR) باستخدام بادئات تكميلية للسلاسل المرافقة غير العشوائية 20 بي بي. وبعد خمس مجموعات لنفس الإجراء، تم استنساخ الحمض النووي المطهّر داخل دائرة إدارة البرامج 18تي (pMD 18T) ووضعه في تسلسل. وأخيرًا تم تحديد التسلسل CAATC كتسلسل ربط متوافق للمجال المتماثل كوكس1 (Quox1 homeodomain). تطبيقات ساب (SAAB) من خلال جمع اختيار طاقة التسلسل العشوائي مع التسلسل المجمع، فإن فحص ساب المنشور يتيح فرز عدد كبير من مسوخ موضع الربط في وقت متزامن. كما يتيح ساب أيضًا تحديد المواضع بتقارب ربط عالٍ نسبيًا حيث إن المنافسة تكمن في البروتوكول. يمكن أيضًا تحديد المواقع المحايدة أو القواعد المحددة التي يمكن أن تتداخل مع الربط، مثل تي عند ــ 4 في نصف الموضع E47. ويمكننا تطبيق هذه التقنية في التسلسل ذي الربط المتقارب، شريطة أن تبقى نسبة تركيز بروتين الربط عالية في كل خطوة من خطوات الربط. كما يمكن تحديد موضع الربط حتى ولو كان البروتين والتسلسل غير معروفين.
gold:hypernym
dbr:Technique
prov:wasDerivedFrom
wikipedia-en:Selection_and_amplification_binding_assay?oldid=1077675675&ns=0
dbo:wikiPageLength
6463
foaf:isPrimaryTopicOf
wikipedia-en:Selection_and_amplification_binding_assay
Subject Item
dbr:Harold_M._Weintraub
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Selection_and_amplification_binding_assay
Subject Item
wikipedia-en:Selection_and_amplification_binding_assay
foaf:primaryTopic
dbr:Selection_and_amplification_binding_assay