About: UniFrac

An Entity of Type: Thing, from Named Graph: http://dbpedia.org, within Data Space: dbpedia.org

UniFrac is a distance metric used for comparing biological communities. It differs from dissimilarity measures such as Bray-Curtis dissimilarity in that it incorporates information on the relative relatedness of community members by incorporating phylogenetic distances between observed organisms in the computation.

Property Value
dbo:abstract
  • UniFrac je vzdálenostní metrika , která se používá k vyjádření míry odlišnosti biologických komunit. Od jiných vyjádření míry odlišnosti jako je se liší tím, že nese navíc informaci o příbuznosti členů zkoumaných komunit. Součástí výpočtu je totiž fylogenetická vzdálenost mezi jednotlivými organismy v komunitách. UniFrac má dvě varianty výpočtu: Nevážená (kvalitativní) varianta počítá jen s přítomností či absencí jednotlivých druhů organismů, zatímco vážená forma (kvantitativní) zahrnuje i jejich četnost. Obě dvě varianty mají široké využití zejména v . Tato metoda byla navržena americkou mikrobioložkou v roce 2005, když pracovala pod vedením na Coloradské Univerzitě v Boulderu. (cs)
  • UniFrac is a distance metric used for comparing biological communities. It differs from dissimilarity measures such as Bray-Curtis dissimilarity in that it incorporates information on the relative relatedness of community members by incorporating phylogenetic distances between observed organisms in the computation. Both weighted (quantitative) and unweighted (qualitative) variants of UniFrac are widely used in microbial ecology, where the former accounts for abundance of observed organisms, while the latter only considers their presence or absence. The method was devised by Catherine Lozupone, when she was working with Rob Knight of the University of Colorado at Boulder in 2005. (en)
dbo:thumbnail
dbo:wikiPageExternalLink
dbo:wikiPageID
  • 29343799 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength
  • 6203 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID
  • 1111464130 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink
dbp:wikiPageUsesTemplate
dcterms:subject
rdfs:comment
  • UniFrac je vzdálenostní metrika , která se používá k vyjádření míry odlišnosti biologických komunit. Od jiných vyjádření míry odlišnosti jako je se liší tím, že nese navíc informaci o příbuznosti členů zkoumaných komunit. Součástí výpočtu je totiž fylogenetická vzdálenost mezi jednotlivými organismy v komunitách. UniFrac má dvě varianty výpočtu: Nevážená (kvalitativní) varianta počítá jen s přítomností či absencí jednotlivých druhů organismů, zatímco vážená forma (kvantitativní) zahrnuje i jejich četnost. Obě dvě varianty mají široké využití zejména v . Tato metoda byla navržena americkou mikrobioložkou v roce 2005, když pracovala pod vedením na Coloradské Univerzitě v Boulderu. (cs)
  • UniFrac is a distance metric used for comparing biological communities. It differs from dissimilarity measures such as Bray-Curtis dissimilarity in that it incorporates information on the relative relatedness of community members by incorporating phylogenetic distances between observed organisms in the computation. (en)
rdfs:label
  • UniFrac (cs)
  • UniFrac (es)
  • UniFrac (en)
owl:sameAs
prov:wasDerivedFrom
foaf:depiction
foaf:isPrimaryTopicOf
is dbo:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of
Powered by OpenLink Virtuoso    This material is Open Knowledge     W3C Semantic Web Technology     This material is Open Knowledge    Valid XHTML + RDFa
This content was extracted from Wikipedia and is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License