| dbo:abstract
|
- La seqüència Shine-Dalgarno és una seqüència de ARN missatger pròpia dels transcrits de procariotes. Es tracta d'una seqüència situada uns 6 o 7 nucleòtids abans del de la traducció i regula la seva iniciació. Està formada per una seqüència consens característica: «AGGAGG», que és complementària a una zona del 3' del ARN ribosomal 16S (la denominada «seqüència anti-Shine-Dalgarno» i que posseeix, per tant, la forma «UCCUCC»). La interacció de totes dues seqüències fa possible la unió del ribosoma al 5' del ARN missatger, i facilita el reconeixement del codó d'inici i la subsegüent síntesi proteica. La seqüència va ser descrita pels investigadors australians i l'any 1975. Als eucariotes no existeix una seqüència tan conservada, fet que ha portat a suggerir que la interacció de l'ARN amb el ribosoma ocorre en regions properes a l'extrem 5', des d'on el ribosoma es mou fins a trobar la , iniciant la traducció en el codó AUG contingut en aquesta seqüència. (ca)
- سلسلة شاين دالغارنو (بالإنجليزية: Shine-Dalgarno sequence) هي موقع ارتباط الحمض النووي الريبوزي الرايبوسومي (rRNA) بالحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) في الخلايا بدائية النواة، كالبكتيريا والأشريكية القولونية. وتتكون «سلسلة شاين دالغارنو» من ثماني قواعد نيتروجينية تقريبًا، وتقع قبل الجين الذي يحتوي على «الكودون البادئ» (AUG) ويعتبر «الكودون البادئ» هو الشيفرة المسؤولة عن بداية تكوين البروتين. وتعمل «سلسلة شاين دالغارنو» على تجهيز وترتيب المواقع الموجودة في الرايبوسومات على الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) عند الكودون البادئ (AUG) لكي يتمكن من البدء ببناء البروتين. توجد "سلسلة شاين دالغارنو" في كل من البكتيريا والأشريكية القولونية، وتتواجد أيضا في بعض أنواع البلاستيدات الخضراء والميتوكندريا، وتتكون هذه السلسلة من القواعد النيتروجينية الآتية: (AGGAGG). فعلى سبيل المثال: فإن "سلسلة شاين دالغارنو" في "إشريكية القولون" (E.coli) عبارة عن (AGGAGGU), أما في "[[عاثية الأمعاء T4]]" فإن سلسلة شاين دالغارنو هي (GAGG), وهي المسؤولة عن الجينات المبكرة في الـ (E.coli) [1]. لقد تم اكتشاف سلسلة شاين دالغارنو من قبل عالمين أستراليين هما: جون شاين، ولين دالغارنو ولهذا سميت السلسلة على اسمي مكتشفيها. مراحل تكوين البروتين: ● (تكوين البروتين): وفقًا للطريقة التي وضعها هانت (Hunt)، قام العالمان شاين ودالغارنو باقتراح أن النيوكليوتيدات 3` في (16S-RNA) في بكتيريا الإشريكية القولونية (E.coli) وهي جزء من الوحدة الصغيرة (30S) للخلايا بدائية النواة وهي غنية بالبرميدين ومتممة لجميع أو لجزء من سلسلة شاين دالغارنو الغنية بالبيورين ولهذا فأن نهاية (mRNA) عند 5ˋ سوف ترتبط مع نهاية 3ˋ (16S-RNA) [1]. وقد أكدت العديد من الدراسات أن قاعدة الارتباط بين سلسلة الشاين دالغارنو في الـ (mRNA) وسلسلة الـ (16S rRNA) عند النهاية (3`end) هي الخطوة الرئيسية لبداية تكوين البروتين في البكتيريا[4][5].. وبناءً على وجود العلاقة المتممة بين ال (rRNA) وسلسلة شاين دالغارنو على ال (mRNA), اقترح العالمان أن سلسلة ال (rRNA) عند (3`end) منها، هي التي تحدد مدى قدرة رايبوسومات البكتيريا على ترجمة جينات معينة في ال (mRNA). حيث إن الارتباط هو عبارة عن عملية تلقائية، ولذلك يمكن للخلية أن تميز بين الكودون (AUG) البادئ ونفس الكودون (AUG) الموجود داخل الجين أو خارجه من خلال سلسلة شاين دالغارنو. وتؤدي قوة قاعدة الارتباط بين (rRNA) وسلسلة شاين دالغارنو دورًا كبيرًا في تحديد معدل سرعة البدء في تكوين البروتين به، حيث كلما زادت قوة قاعدة الارتباط بدأت عملية تكوين البروتين بشكل أسرع. علاقة الاتباط المتممة بين سلسلة شاين دالغارنو على mRNA مع 16SrRNA ● (تكوين البروتين): يوجد سلسلة في الخلايا حقيقية النوى تؤدي نفس الدور والوظيفة التي تقوم بها «سلسلة شاين دالغارنو» في بدائيات النوى، ولكنها تختلف عنها في التسمية، حيث تسمى السلسلة بـ (5`-methl guanosine Cap). وفي عام 1973م، اقترح شاين ودالغارنو أن الـ (3`end) من سلسلة الـ (18S rRNA) للوحدة الصغيرة في الخلايا حقيقية النوى قد تؤدي دورا في المرحلة النهائية لتكوين البروتين، وذلك من خلال قاعدة الارتباط المتممة والمكملة للكودونات الختامية (UAA,UAG,UGA) [7]. وجاء ذلك من خلال ملاحظة كون الـ (3`end) التي في طرف سلسلة الـ (18S rRNA) الموجودة في ذبابة الفاكهة سوداء البطن، والموجودة كذلك في خلايا الأرنب، مطابقة للكودون النهائي (GAUCAUUA-3`OH). لذا، فإن وجود تلك السلسلة أيضا في حقيقيات النوى، يؤكد أن قطعة النيوكليوتيد تلك تؤدي دورا مهما في الخلية. ولأجل ذلك، ذهبا إلى أن لهذه السلسلة دورا في المرحلة النهائية لتكوين البروتين في الخلايا حقيقية النوى، حيث إن تلك السلسلة متممة لكل من الكودونات النهائية الثلاثة (UAA,UAG,UGA) المسؤولة عن انتهاء تكوين البروتين. وفي عام 1974 , قام الباحثان بتطبيق الفكرة نفسها لمعرفة العلاقة بين الـ (3`end) الخاصة بـ (16S rRNA) والكودونات النهائية في الـ (E.coli)، وتوصلا إلى أن قواعد الارتباط المتممة هي العلاقة الأساسية في ارتباط طرف الـ 3` من (UUA-OH) في الـ (16S rRNA) بالكودونات النهائية في الـ (E.coli). أما في F1 phage، وهو نوع من الفيروسات التي تصيب البكتيريا، فنجد أن سلسلة الترميز تحتوي على الكودونات الثلاثة النهائية معا، ولكن يتم الارتباط بالكودون الأول فقط الموجود في السلسلة ليتم إنهاء تكوين البروتين، دون استخدام الكودونين الأخريْن. وتعليقا على ذلك، لوحظ أن قاعدة الارتباط المتممة مع طرف الـ3` من الـ (16S rRNA) قد تؤثر في تكوين الروابطة الببتيدية بعد الانتهاء من مرحلة البدء. علاقة «سلسلة شاين دالغارنو» وتحويل الجين إلى بروتين: عندما تحدث طفرة في سلسلة شاين دالغارنو، وتعني وجود خلل في ترتيب القواعد النيتروجينية وارتباطها المتمم بعضها لبعض، فإن ذلك يؤدي إلى زيادة أو نقصان في مرحلة الترجمة في الخلايا بدائية النواة، بسب نقصان أو زيادة فعالية منطقة الارتباط الرايبوسومي في (mRNA), ولكن ذلك لا يوقف عملية بناء البروتين بشكل كامل، بل يؤثر فقط على فعالية ارتباط الرايبوسومات وقوتها، فإذا لم يحدث الارتباط فيمكن أن يؤدي هذا إلى حدوث خلل ما، ولا تتم عملية الارتباط وتكوين البروتين في الأماكن السليمة والمتممة من ال (16S rRNA). (ar)
- Die Shine-Dalgarno-Sequenz ist eine Sequenz der mRNA bei Prokaryoten, die als Teil der ribosomalen Bindungsstelle (RBS) von den Ribosomen erkannt wird und damit den Startpunkt der Translation markiert. Im Jahre 1975 entdeckten J. Shine und L. Dalgarno die Basenpaarung zwischen mRNA und 16S rRNA bei Prokaryoten. Der Sequenzabschnitt auf der mRNA, der komplementär zur 16S rRNA ist, wird als Shine-Dalgarno-Sequenz 5'…AGGAGGU…3'bezeichnet. Die Sequenz, die auf der 16S rRNA komplementär zur Shine-Dalgarno Sequenz liegt, wird mitunter als Anti-Shine-Dalgarno Sequenz bezeichnet. Mittels RNA-Protein-Crosslinking-Experimenten wurden die Proteine S1 und S21 als jene bestimmt, die mit dem 3'-Ende der 16S rRNA wechselwirken und bei der Initiation der Translation beteiligt sind. Die mRNA besitzt vor dem Translationsstartpunkt (Startcodon) eine sogenannte Leader-Sequenz, auch 5'-Nicht-Kodierungsbereich (5'-UTR für 5' untranslated region) genannt. Diese besitzt, entgegen früheren Annahmen, eine entscheidende Funktion für die Translation: Der Abschnitt, der 4–14 Nukleotide vor dem Startcodon liegt, geht Basenpaarungen mit komplementären Sequenzen am 3'-Ende der 16S rRNA ein und ermöglicht so ein Binden der 30S-Untereinheit des Ribosomen. Die Länge des komplementären Abschnittes und sein Abstand vom Start-Codon bestimmen die Stabilität des Initiationskomplexes. Bei Eukaryoten übernimmt die Kozak-Sequenz die Funktion der Shine-Dalgarno-Sequenz. (de)
- La secuencia Shine-Dalgarno es una secuencia de ARN mensajero propia de los transcritos de procariotas. Se trata de una secuencia situada unos 6 o 7 nucleótidos antes del codón de inicio de la traducción, y regula la iniciación de ésta. Posee una secuencia consenso característica: «AGGAGG», que es complementaria a una zona del 3' del ARN ribosomal 16S (denominada «secuencia anti-Shine-Dalgarno» y que posee por tanto la forma «UCCUCC»). La interacción de ambas secuencias posibilita la unión del ribosoma al 5' del ARN mensajero, lo que facilita el reconocimiento del codón de inicio y la subsiguiente síntesis proteica. La secuencia fue descrita por los investigadores australianos y en 1975. En eucariotas no existe una secuencia tan conservada, lo que ha llevado a sugerir que la interacción del ácido ribonucleico con el ribosoma ocurre en regiones próximas al extremo 5', desde donde el ribosoma se desliza hasta encontrar la secuencia Kozak, iniciando la traducción en el codón AUG, contenido en dicha secuencia. Las secuencias de Shine-Dalgarno también están presentes en todos los virus que infectan procariotas lo cual es una herramienta que permite separar virus procariotas de virus eucariotas. (es)
- La séquence de Shine-Dalgarno ou site de fixation du ribosome (en anglais RBS, pour ribosome binding site) est une séquence de nucléotides présente sur les ARN messagers des bactéries, en amont du codon d'initiation. Ce motif, riche en purines, permet le positionnement de la sous-unité 30S du ribosome au niveau du début du cistron codant une protéine et participe ainsi au processus du démarrage de la traduction procaryotique. Ce motif, long de 3 à 9 nucléotides consécutifs, est situé 6 à 12 nucléotides en amont du codon d'initiation de la traduction. Il a initialement été proposé par John Shine et Lynn Dalgarno. La séquence Shine-Dalgarno canonique complète est la suivante : AGGAGGUAA Elle est rarement trouvée sous forme complète en amont des gènes, mais en général sous forme partielle, comportant 4 à 6 nucléotides consécutifs de la séquence ci-dessus (exemple : AGGA ou GGAGG). Lors de la formation du complexe de démarrage de la traduction avec le ribosome, cette séquence forme un appariement ARN-ARN avec l'extrémité 3' de l'ARN ribosomique 16S, ce qui permet de pré-positionner le ribosome au voisinage immédiat du codon de démarrage. L'existence de cette interaction ARN-ARN a été formellement démontrée par l'étude structurale du ribosome, une trentaine d'années après le postulat initial de Shine et Dalgarno. Ce mécanisme est essentiel au ribosome bactérien pour lui permettre de reconnaître les codons de démarrage sur les ARNm, en particulier sur les ARN polycistroniques qui codent plusieurs protéines. Il permet au ribosome de distinguer les codons AUG qui servent de codon d'initiation de ceux qui se trouvent à l'intérieur des cistrons et qui codent des méthionines internes aux chaînes protéiques. On ne trouve pas de mécanisme analogue chez les eucaryotes, dont les ARNm sont monocistroniques et pour lesquels la reconnaissance du codon de démarrage s'effectue par un mécanisme de balayage. Il existe cependant aussi un motif conservé autour du codon AUG de démarrage, qu'on appelle la séquence de Kozak. (fr)
- The Shine–Dalgarno (SD) sequence is a ribosomal binding site in bacterial and archaeal messenger RNA, generally located around 8 bases upstream of the start codon AUG. The RNA sequence helps recruit the ribosome to the messenger RNA (mRNA) to initiate protein synthesis by aligning the ribosome with the start codon. Once recruited, tRNA may add amino acids in sequence as dictated by the codons, moving downstream from the translational start site. The Shine–Dalgarno sequence is common in bacteria, but rarer in archaea. It is also present in some chloroplast and mitochondrial transcripts. The six-base consensus sequence is AGGAGG; in Escherichia coli, for example, the sequence is AGGAGGU, while the shorter GAGG dominates in E. coli virus T4 early genes. The Shine–Dalgarno sequence was proposed by Australian scientists John Shine and Lynn Dalgarno. (en)
- シャイン・ダルガノ配列 (Shine-Dalgarno sequence) とは、原核生物のmRNAにおいて、開始コドンの上流に見られる共通配列で、シャイン・ダルガノボックス、SD配列とも言う。コードとしては-AGGAGG-のようにプリン塩基（アデニン・グアニン）に富んだ3ないし9塩基（平均4.8塩基）の長さの配列となっている。 原核生物の16SrRNAには3'末端に‐CCUCCUAの配列（アンチ・シャイン・ダルガノ配列）があり、これがシャイン・ダルガノ配列と相補的対合を行う。このため、リボゾーム結合部位となっている。 オーストラリアの科学者、とによって提唱された。SD配列はmRNAにリボソームを動員するのを助け、リボソームを開始コドンに配置することによってタンパク質合成を開始させる。真核生物にあるSD配列に類似した配列はコザック配列と呼ばれている。SD配列の例を挙げると大腸菌はAGGAGGAである。 SD配列に突然変異が起こると翻訳効率が低下することがある。この低下はmRNA-リボソーム対合効率の低下に原因がある。このことは、リボソームのほうのアンチSD配列に、この突然変異に相補的な突然変異を起こしてやると翻訳効率が回復したことから証明された。 SD配列とアンチSD配列が対合すると翻訳開始因子IF2-GTP、IF1、IF3および開始tRNAであるfMet-tRNA(fMET)がリボソームに動員される。 (ja)
- 샤인-달가노 서열(영어: Shine-Dalgarno Sequence 샤인달가노 시퀀스[*]) 또는 SD 서열(영어: SD sequence 에스디 시퀀스[*])은 원핵세포 메신저 RNA의 리보솜 결합 부위이며, 일반적으로 시작 코돈 AUG의 8염기 앞쪽에 위치한다. 이 RNA 배열은 리보솜을 메신저 RNA(mRNA)로 끌어들여 시작코돈위치에 리보솜을 배열하여 단백질 합성이 시작하는 것을 돕는다. 샤인-달가노 서열은 세균(bacteria)과 고균(archaea) 모두에 존재한다. 또한, 이 배열은 몇몇 엽록체와 미토콘드리아 전사물(transcript)에서도 존재한다. 여섯개의 공통적인 배열은 AGGAGG이다. 예를 들어, 대장균에서는 AGGAGGU인 반면, 대장균 바이러스 T4 초기에는 GAGG 배열이 우세하다. 샤인-달가노 서열은 호주 과학자 존샤인(John Shine)과 린 달가노(Lynn Dalgarno)에 의해 처음 제안되었다. (ko)
- De Shine-Dalgarnosequentie (of Shine-Dalgarno box) is een naam die binnen het domein van de biochemie en de genetica gegeven wordt aan een welbepaalde opeenvolging van nucleotiden op het mRNA. Het heeft een speciale functie binnen het proces van eiwitsynthese. De Shine-Dalgarnosequentie is een ribosomale bindingsplaats op het mRNA die zich voornamelijk bevindt op 16 nucleotiden van het startcodon AUG (richting 5' uiteinde). Het concept van deze sequentie werd geïntroduceerd door de Australische wetenschappers en . De sequentie bestaat enkel bij prokaryoten. De consensussequentie van zes basen is AGGAGG; bij E. coli bijvoorbeeld is de sequentie AGGAGGU. Deze sequentie helpt het ribosoom naar het mRNA zodat eiwitsynthese van start kan gaan. Hierbij zal het op een lijn komen te staan met de startcodon. De complementaire sequentie (CCUCCU) wordt de anti-Shine-Dalgarnosequentie genoemd en bevindt zich op het 3' uiteinde van het van het ribosoom. Het eukaryoot equivalent van de Shine-Dalgarnosequentie wordt de genoemd. Mutaties in de Shine-Dalgarnosequentie kunnen translaties laten afnemen. Deze vermindering is het gevolg van een afgenomen mRNA-ribosoom bindingsefficiëntie van complementaire basen. Dit wordt aangetoond door het feit dat complementaire mutaties in de anti-Shine-Dalgarnosequentie translaties terug in werking kunnen stellen. Wanneer de Shine-Dalgarnoseqentie en de anti-Shine-Dalgarnosequentie aan elkaar binden, zullen de initiatiefactoren (IF2-GTP, IF1, IF3) voor de translatie en het inleidende tRNA fMet-tRNA (N-Formylmethionine) naar het ribosoom gebracht worden. (nl)
- In biologia molecolare si definisce sequenza di Shine-Dalgarno la regione di ogni mRNA procariotico grazie alla quale un ribosoma riesce ad ancorarsi ad esso in modo da iniziare la traduzione nella corretta fase di lettura; prende il nome dai suoi scopritori, i ricercatori australiani John Shine e Lynn Dalgarno. È anche definita RBS: Ribosome Binding Site. Si tratta una sequenza, ricca in purine, contenente sempre la sequenza AGGAGG, sita fra i 3 e i 10 nucleotidi a monte del codone di inizio della traduzione, la quale, per semplice appaiamento fra basi nucleotidiche complementari, riconosce una regione ricca in pirimidine al terminale 3' dell'rRNA 16S della subunità ribosomale minore (la 30S), contenente sempre la sequenza UCCUCC e detta sequenza anti-Shine-Dalgarno. In questo modo viene facilitato l'assemblaggio del complesso ribosomale stesso e l'avvio della traduzione. Solo dopo che le due sequenze sono appaiate, infatti, può formarsi il complesso d'inizio completo 70S, cioè può avvenire il legame al complesso d'inizio incompleto 30S da parte della subunità ribosomale maggiore 50S. Negli Eucarioti, per l'inizio della traduzione, non è richiesto alcun appaiamento fra basi complementari dell'mRNA ed rRNA; di solito, ma non sempre, il codone d'inizio della traduzione è il primo codone AUG partendo dal 5' dell'mRNA, e si trova inserito in una corta sequenza detta sequenza di Kozak, riconosciuta dalla subunità ribosomale minore eucariotica (la 40S) dopo che questa ha esplorato in continuo l'mRNA a partire dal cappuccio al 5'. (it)
- Sekwencja Shine-Dalgarno (5’-AGGAGG-3’) – sekwencja nukleotydów w mRNA prokariotów stanowiąca rybosomu. Nazwa sekwencji pochodzi od jej odkrywców – australijskich naukowców i . Sekwencja ta bogata w puryny znajduje się w odległości 3–10 nukleotydów powyżej kodonu inicjującego (miejsca rozpoczęcia translacji). Kodem inicjującym jest zwykle AUG (rzadziej GUG lub UUG). Jednak kodon AUG nie zawsze jest kodonem startu, może on również kodować metioninę wewnątrz łańcucha polipeptydowego. Dopiero wystąpienie w pobliżu inicjującego kodonu sekwencji Shine-Dalgarno jest sygnałem inicjującym translację. Sekwencja Shine-Dalgarno jest komplementarna do sekwencji znajdującej się na końcu 3' 16S rRNA (tzw. sekwencja anty-Shine-Dalgarno) wchodzącego w skład małej podjednostki rybosomu, umożliwiając związanie się z mRNA. W różnych genach sekwencja ta może wykazywać różny stopień komplementarności, zwykle są to jednak niewielkie modyfikacje rdzenia GGAGG. Przykładowo u E. coli sekwencja najwyższej zgodności to AGGAGGU. Inicjacja translacji jest u bakterii uważana za etap limitujący w tłumaczeniu mRNA na białko i determinuje ogólną ekspresję genu. Nie wszystkie geny prokariotów mają taką sekwencję, która transkrybowanemu mRNA nadawałaby sekwencję Shine-Dalgarno. Słabe kodony startu (GUG, UUG) oraz brak sekwencji Shine-Dalgarno może znacznie zmniejszyć ekspresję danego genu. Jedno mRNA może zawierać więcej niż jedną sekwencję Shine-Dalgarno znajdującą się w sąsiedztwie kodonu inicjującego, a wtedy może ono kodować wiele polipeptydów. Takie mRNA określa się jako policistronowe. Są one transkryptami operonów, np. u E. coli operon laktozowy koduje pojedynczy mRNA, który zawiera informację o trzech białkach. U eukariotów inicjacja translacji przebiega inaczej – mała jednostka rybosomowa rozpoznaje czapeczkę na końcu 5’ mRNA. Następnie przesuwa się w kierunku końca 3’ aż pojawi się kodon inicjujący. Zwykle jest to kodon AUG w obrębie sekwencji Kozak. (pl)
- Последовательность Шайна — Дальгарно (англ. Shine-Dalgarno sequence, Shine-Dalgarno box) — сайт связывания рибосом на молекуле мРНК прокариот, обычно на расстоянии около 10 нуклеотидов до стартового кодона AUG. Описана австралийскими учёными Джоном Шайном и . Консенсусом является последовательность из шести нуклеотидов AGGAGG; в случае E. coli последовательность Шайна — Дальгарно — AGGAGGU. Комплементарная последовательность CCUCCU, называемая последовательностью анти-Шайна — Дальгарно, располагается на 3'-конце молекулы 16S рибосомной РНК. Комплементарное взаимодействие между последовательностями Шайна — Дальгарно и анти-Шайна — Дальгарно служит для помещения старт-кодона мРНК в P-сайт рибосомы для начала биосинтеза белка. Мутации в последовательности Шайна — Дальгарно снижают эффективность трансляции. Это обусловлено снижением эффективности образования комплекса «мРНК — 30S-рибосомная субъединица». Показано, что комплементарные мутации в последовательности анти-Шайна — Дальгарно обеспечивают восстановление эффективности трансляции. В момент образования комплекса последовательности Шайна — Дальгарно и анти-Шайна — Дальгарно, с 30S-рибосомной субъединицей связываются и факторы инициации трансляции IF2-GTP, IF1, IF3, а также инициаторная -тРНК. К образовавшемуся преинициаторному комплексу затем присоединяется 50S-рибосомная субъединица. (ru)
- A sequência de Shine-Dalgarno (SD) é uma sequência do RNA mensageiro de bactérias e arqueas localizado a cerca de 8 bases a montante do códon de início AUG. Essa sequência de RNA ajuda a recrutar o ribossomo ao RNA mensageiro (mRNA) para iniciar a síntese de proteínas, alinhando o ribossomo com o códon de início. O Shine-Dalgarno seqüência foi proposta pelos cientistas australianos John Shine e Lynn Dalgarno. (pt)
- Послідовністю Шайна — Дальгарно називають сайт зв'язування рибосоми в матричній РНК бактерій та архей. Цей сайт зазвичай розташований на відстані 8 нуклеотидів до старт-кодону AUG. Послідовність Шайна — Дальгарно необхідна для рекрутингу рибосоми на мРНК та ініціації трансляції. Окрім бактерії та архей, послідовність Шайна—Дальгарно присутня в мРНК хлоропластів та мітохондрій. Консенсусна шестинуклеотидна послідовність це AGGAGG. Повною послідовністю у Escherichia coli є AGGAGGU. Послідовність була відкрита австралійцями Джоном Шайном (англ. John Shine, нар.1946 р.) та Лін Дальгарно (англ. Lynn Dalgarno, нар. 1935 р.). (uk)
- 夏因-达尔加诺序列（英語：Shine-Dalgarno sequence，常简称为SD序列）是由澳大利亚科学家与所提出的一个存在于信使RNA上的核糖体结合位点，通常位于起始密码子AUG的的八个碱基对处。夏因-达尔加诺序列只存在于原核生物中。六个碱基的共有序列是AGGAGG；例如，在大肠杆菌中，这个序列为AGGAGGU。该序列帮助动员核糖体结合到信使RNA上并将其校准到起始密码子上以启动蛋白质生物合成。该序列的互补序列（CCUCCU）被称为反夏因-达尔加诺序列，它位于核糖体中16S 核糖体RNA的3'端：以大肠杆菌为例，反夏因-达尔加诺序列位于其16S核糖体RNA的第1534～1540号核苷酸左右处。真核生物中与夏因-达尔加诺序列相等价的序列被称为科扎克共有序列。 (zh)
|
| rdfs:comment
|
- 샤인-달가노 서열(영어: Shine-Dalgarno Sequence 샤인달가노 시퀀스[*]) 또는 SD 서열(영어: SD sequence 에스디 시퀀스[*])은 원핵세포 메신저 RNA의 리보솜 결합 부위이며, 일반적으로 시작 코돈 AUG의 8염기 앞쪽에 위치한다. 이 RNA 배열은 리보솜을 메신저 RNA(mRNA)로 끌어들여 시작코돈위치에 리보솜을 배열하여 단백질 합성이 시작하는 것을 돕는다. 샤인-달가노 서열은 세균(bacteria)과 고균(archaea) 모두에 존재한다. 또한, 이 배열은 몇몇 엽록체와 미토콘드리아 전사물(transcript)에서도 존재한다. 여섯개의 공통적인 배열은 AGGAGG이다. 예를 들어, 대장균에서는 AGGAGGU인 반면, 대장균 바이러스 T4 초기에는 GAGG 배열이 우세하다. 샤인-달가노 서열은 호주 과학자 존샤인(John Shine)과 린 달가노(Lynn Dalgarno)에 의해 처음 제안되었다. (ko)
- A sequência de Shine-Dalgarno (SD) é uma sequência do RNA mensageiro de bactérias e arqueas localizado a cerca de 8 bases a montante do códon de início AUG. Essa sequência de RNA ajuda a recrutar o ribossomo ao RNA mensageiro (mRNA) para iniciar a síntese de proteínas, alinhando o ribossomo com o códon de início. O Shine-Dalgarno seqüência foi proposta pelos cientistas australianos John Shine e Lynn Dalgarno. (pt)
- 夏因-达尔加诺序列（英語：Shine-Dalgarno sequence，常简称为SD序列）是由澳大利亚科学家与所提出的一个存在于信使RNA上的核糖体结合位点，通常位于起始密码子AUG的的八个碱基对处。夏因-达尔加诺序列只存在于原核生物中。六个碱基的共有序列是AGGAGG；例如，在大肠杆菌中，这个序列为AGGAGGU。该序列帮助动员核糖体结合到信使RNA上并将其校准到起始密码子上以启动蛋白质生物合成。该序列的互补序列（CCUCCU）被称为反夏因-达尔加诺序列，它位于核糖体中16S 核糖体RNA的3'端：以大肠杆菌为例，反夏因-达尔加诺序列位于其16S核糖体RNA的第1534～1540号核苷酸左右处。真核生物中与夏因-达尔加诺序列相等价的序列被称为科扎克共有序列。 (zh)
- سلسلة شاين دالغارنو (بالإنجليزية: Shine-Dalgarno sequence) هي موقع ارتباط الحمض النووي الريبوزي الرايبوسومي (rRNA) بالحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) في الخلايا بدائية النواة، كالبكتيريا والأشريكية القولونية. وتتكون «سلسلة شاين دالغارنو» من ثماني قواعد نيتروجينية تقريبًا، وتقع قبل الجين الذي يحتوي على «الكودون البادئ» (AUG) ويعتبر «الكودون البادئ» هو الشيفرة المسؤولة عن بداية تكوين البروتين. وتعمل «سلسلة شاين دالغارنو» على تجهيز وترتيب المواقع الموجودة في الرايبوسومات على الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) عند الكودون البادئ (AUG) لكي يتمكن من البدء ببناء البروتين. مراحل تكوين البروتين: (ar)
- La seqüència Shine-Dalgarno és una seqüència de ARN missatger pròpia dels transcrits de procariotes. Es tracta d'una seqüència situada uns 6 o 7 nucleòtids abans del de la traducció i regula la seva iniciació. Està formada per una seqüència consens característica: «AGGAGG», que és complementària a una zona del 3' del ARN ribosomal 16S (la denominada «seqüència anti-Shine-Dalgarno» i que posseeix, per tant, la forma «UCCUCC»). La interacció de totes dues seqüències fa possible la unió del ribosoma al 5' del ARN missatger, i facilita el reconeixement del codó d'inici i la subsegüent síntesi proteica. La seqüència va ser descrita pels investigadors australians i l'any 1975. (ca)
- Die Shine-Dalgarno-Sequenz ist eine Sequenz der mRNA bei Prokaryoten, die als Teil der ribosomalen Bindungsstelle (RBS) von den Ribosomen erkannt wird und damit den Startpunkt der Translation markiert. Im Jahre 1975 entdeckten J. Shine und L. Dalgarno die Basenpaarung zwischen mRNA und 16S rRNA bei Prokaryoten. Die Länge des komplementären Abschnittes und sein Abstand vom Start-Codon bestimmen die Stabilität des Initiationskomplexes. Bei Eukaryoten übernimmt die Kozak-Sequenz die Funktion der Shine-Dalgarno-Sequenz. (de)
- La secuencia Shine-Dalgarno es una secuencia de ARN mensajero propia de los transcritos de procariotas. Se trata de una secuencia situada unos 6 o 7 nucleótidos antes del codón de inicio de la traducción, y regula la iniciación de ésta. Posee una secuencia consenso característica: «AGGAGG», que es complementaria a una zona del 3' del ARN ribosomal 16S (denominada «secuencia anti-Shine-Dalgarno» y que posee por tanto la forma «UCCUCC»). La interacción de ambas secuencias posibilita la unión del ribosoma al 5' del ARN mensajero, lo que facilita el reconocimiento del codón de inicio y la subsiguiente síntesis proteica. La secuencia fue descrita por los investigadores australianos y en 1975. (es)
- The Shine–Dalgarno (SD) sequence is a ribosomal binding site in bacterial and archaeal messenger RNA, generally located around 8 bases upstream of the start codon AUG. The RNA sequence helps recruit the ribosome to the messenger RNA (mRNA) to initiate protein synthesis by aligning the ribosome with the start codon. Once recruited, tRNA may add amino acids in sequence as dictated by the codons, moving downstream from the translational start site. The Shine–Dalgarno sequence was proposed by Australian scientists John Shine and Lynn Dalgarno. (en)
- La séquence de Shine-Dalgarno ou site de fixation du ribosome (en anglais RBS, pour ribosome binding site) est une séquence de nucléotides présente sur les ARN messagers des bactéries, en amont du codon d'initiation. Ce motif, riche en purines, permet le positionnement de la sous-unité 30S du ribosome au niveau du début du cistron codant une protéine et participe ainsi au processus du démarrage de la traduction procaryotique. AGGAGGUAA (fr)
- シャイン・ダルガノ配列 (Shine-Dalgarno sequence) とは、原核生物のmRNAにおいて、開始コドンの上流に見られる共通配列で、シャイン・ダルガノボックス、SD配列とも言う。コードとしては-AGGAGG-のようにプリン塩基（アデニン・グアニン）に富んだ3ないし9塩基（平均4.8塩基）の長さの配列となっている。 原核生物の16SrRNAには3'末端に‐CCUCCUAの配列（アンチ・シャイン・ダルガノ配列）があり、これがシャイン・ダルガノ配列と相補的対合を行う。このため、リボゾーム結合部位となっている。 オーストラリアの科学者、とによって提唱された。SD配列はmRNAにリボソームを動員するのを助け、リボソームを開始コドンに配置することによってタンパク質合成を開始させる。真核生物にあるSD配列に類似した配列はコザック配列と呼ばれている。SD配列の例を挙げると大腸菌はAGGAGGAである。 SD配列に突然変異が起こると翻訳効率が低下することがある。この低下はmRNA-リボソーム対合効率の低下に原因がある。このことは、リボソームのほうのアンチSD配列に、この突然変異に相補的な突然変異を起こしてやると翻訳効率が回復したことから証明された。 (ja)
- In biologia molecolare si definisce sequenza di Shine-Dalgarno la regione di ogni mRNA procariotico grazie alla quale un ribosoma riesce ad ancorarsi ad esso in modo da iniziare la traduzione nella corretta fase di lettura; prende il nome dai suoi scopritori, i ricercatori australiani John Shine e Lynn Dalgarno. È anche definita RBS: Ribosome Binding Site. (it)
- De Shine-Dalgarnosequentie (of Shine-Dalgarno box) is een naam die binnen het domein van de biochemie en de genetica gegeven wordt aan een welbepaalde opeenvolging van nucleotiden op het mRNA. Het heeft een speciale functie binnen het proces van eiwitsynthese. Mutaties in de Shine-Dalgarnosequentie kunnen translaties laten afnemen. Deze vermindering is het gevolg van een afgenomen mRNA-ribosoom bindingsefficiëntie van complementaire basen. Dit wordt aangetoond door het feit dat complementaire mutaties in de anti-Shine-Dalgarnosequentie translaties terug in werking kunnen stellen. (nl)
- Sekwencja Shine-Dalgarno (5’-AGGAGG-3’) – sekwencja nukleotydów w mRNA prokariotów stanowiąca rybosomu. Nazwa sekwencji pochodzi od jej odkrywców – australijskich naukowców i . Sekwencja ta bogata w puryny znajduje się w odległości 3–10 nukleotydów powyżej kodonu inicjującego (miejsca rozpoczęcia translacji). Kodem inicjującym jest zwykle AUG (rzadziej GUG lub UUG). Jednak kodon AUG nie zawsze jest kodonem startu, może on również kodować metioninę wewnątrz łańcucha polipeptydowego. Dopiero wystąpienie w pobliżu inicjującego kodonu sekwencji Shine-Dalgarno jest sygnałem inicjującym translację. (pl)
- Последовательность Шайна — Дальгарно (англ. Shine-Dalgarno sequence, Shine-Dalgarno box) — сайт связывания рибосом на молекуле мРНК прокариот, обычно на расстоянии около 10 нуклеотидов до стартового кодона AUG. Описана австралийскими учёными Джоном Шайном и . Мутации в последовательности Шайна — Дальгарно снижают эффективность трансляции. Это обусловлено снижением эффективности образования комплекса «мРНК — 30S-рибосомная субъединица». Показано, что комплементарные мутации в последовательности анти-Шайна — Дальгарно обеспечивают восстановление эффективности трансляции. (ru)
- Послідовністю Шайна — Дальгарно називають сайт зв'язування рибосоми в матричній РНК бактерій та архей. Цей сайт зазвичай розташований на відстані 8 нуклеотидів до старт-кодону AUG. Послідовність Шайна — Дальгарно необхідна для рекрутингу рибосоми на мРНК та ініціації трансляції. Окрім бактерії та архей, послідовність Шайна—Дальгарно присутня в мРНК хлоропластів та мітохондрій. Консенсусна шестинуклеотидна послідовність це AGGAGG. Повною послідовністю у Escherichia coli є AGGAGGU. (uk)
|
