| dbo:abstract
|
- تحليل المفساح بين الجينات للرَّنا الرِّيباسِيّ (rRNA) هو طريقة للتحليل الاجتماعي الميكروبي الذي يقدم وسائل المقارنة بين البيئات المختلفة أو التأثيرات العلاجية بدون الانحياز للمناهج المعتمدة على الثقافة. ويُشار إلى هذا النوع من التحليل غالبًا بالبصم الاجتماعي. ويتضمن تحليل المفساح بين الجينات للرَّنا الرِّيباسِيّ تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل لناحية جين الرَّنا الرِّيباسِيّ بين الوحيديات الصغيرة (16S) والكبيرة (23S) والتي يطلق عليها اسم ناحية المفساح بين الجينات (ISR). وباستخدام المشرعات قَليلة النُّوكليوتيد التي تستهدف النواحي المحمية في الجينات 16S و23S، فإن تحليل المفساح بين الجينات للرَّنا الرِّيباسِيّ يمكن أن يتم إنشاؤه من أغلب البكتيريا المهيمنة الموجودة في العينة البيئية. وفي حالة ما إن تخدم أغلبية مشاغل تحليل المفساح بين الجينات للرَّنا الرِّيباسِيّ الوظيفة البنائية، فإن أقسام الناحية بين الجينية 16S-23S يمكن أن تسجل الرَّنا الرِّيباسِيّ الناقل اعتمادًا على الأنواع البكتيرية. ومن ناحية أخرى، فإن القيمة التصنيفية للناحية المفساح بين الجينات تقع في تَغايُرِيَّة المهمة في التسلسل الطولي والنُوكْلِيُوتيد. وفي تحليل المفساح بين الجينات للرَّنا الرِّيباسِيّ، فقد حاولنا استثمار التَغايُرِيَّة الطولية لناحية المفساح بين الجينات والذي أظهر معدلًا يتراوح ما بين 150 و1500 درجة مع أغلبية ناحية المفساح بين الجينات بأطوال تتراوح ما بين 150 و500 درجة. كما يعد منتج تفاعل البوليميراز المتسلسل عبارة عن خليط من الشُدْفَات المشتركة في الأعضاء الاجتماعية المهيمنة العديدة. ويتم تحريك هذا المنتج كهربيًا في هلامة بولي أكريلاميد، ومن ثم يظهر الحمض النووي بعد التلوين. وتعد النتيجة عبارة عن نموذج اِسْتِشْرَاط معقد يقدم مرتسمًا مجتمعيًا خاصًا مع كل شريط للحمض النووي المتوافق مع الجمهرة الجرثومية على التجميع الأصلي. (ar)
- Ribosomal RNA (rRNA) intergenic spacer analysis (RISA) is a method of microbial community analysis that provides a means of comparing differing environments or treatment impacts without the bias imposed by culture- dependent approaches. RISA involves PCR amplification of a region of the rRNA gene operon between the small (16S) and large (23S) subunits called the intergenic spacer region ISR. By using oligonucleotide primers targeted to conserved regions in the 16S and 23S genes, RISA fragments can be generated from most of the dominant bacteria in an environmental sample. While the majority of the rRNA operon serves a structural function, portions of the 16S-23S intergenic region can encode tRNAs depending on the bacterial species. However the taxonomic value of the ISR lies in the significant heterogeneity in both length and nucleotide sequence. In RISA, we attempt to exploit the length heterogeneity of the ISR, which has been shown to range between 150 and 1500 bp with the majority of the ISR lengths being between 150 and 500 bp. The resulting PCR product will be a mixture of fragments contributed by several dominant community members. This product is electrophoresed in a polyacrylamide gel, and the DNA is visualized following staining. The result is a complex banding pattern that provides a community-specific profile, with each DNA band corresponding to a bacterial population on the original assemblage. (en)
|
| dbo:wikiPageID
| |
| dbo:wikiPageLength
|
- 2922 (xsd:nonNegativeInteger)
|
| dbo:wikiPageRevisionID
| |
| dbo:wikiPageWikiLink
| |
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| dcterms:subject
| |
| rdfs:comment
|
- تحليل المفساح بين الجينات للرَّنا الرِّيباسِيّ (rRNA) هو طريقة للتحليل الاجتماعي الميكروبي الذي يقدم وسائل المقارنة بين البيئات المختلفة أو التأثيرات العلاجية بدون الانحياز للمناهج المعتمدة على الثقافة. ويُشار إلى هذا النوع من التحليل غالبًا بالبصم الاجتماعي. ويتضمن تحليل المفساح بين الجينات للرَّنا الرِّيباسِيّ تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل لناحية جين الرَّنا الرِّيباسِيّ بين الوحيديات الصغيرة (16S) والكبيرة (23S) والتي يطلق عليها اسم ناحية المفساح بين الجينات (ISR). (ar)
- Ribosomal RNA (rRNA) intergenic spacer analysis (RISA) is a method of microbial community analysis that provides a means of comparing differing environments or treatment impacts without the bias imposed by culture- dependent approaches. RISA involves PCR amplification of a region of the rRNA gene operon between the small (16S) and large (23S) subunits called the intergenic spacer region ISR. (en)
|
| rdfs:label
|
- تحليل المفساح الريبوسومي بين الجينات (ar)
- Ribosomal intergenic spacer analysis (en)
|
| owl:sameAs
| |
| prov:wasDerivedFrom
| |
| foaf:isPrimaryTopicOf
| |
| is dbo:wikiPageRedirects
of | |
| is dbo:wikiPageWikiLink
of | |
| is foaf:primaryTopic
of | |
