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- Phyloscan is a web service for DNA sequence analysis that is free and open to all users (without login requirement). For locating matches to a user-specified sequence motif for a regulatory binding site, Phyloscan provides a statistically sensitive scan of user-supplied mixed aligned and unaligned DNA sequence data. Phyloscan's strength is that it brings together
* the Staden method for computing statistical significance,
* the "phylogenetic motif model" scanning functionality of the MONKEY software that models evolutionary relationships among aligned sequences,
* the use of the Bailey & Gribskov method for combining statistics across non-aligned sequence data, and
* the Neuwald & Green technique for combining statistics across multiple binding sites found within a single gene promoter region. (en)
- Phyloscan é um serviço web service para de ADN que é livre e aberto a todos usuários (sem necessidade de login). Para a localização de pareamentos de especificadas pelo usuário para um regulatório, Phyloscan fornece uma varredura estatisticamente sensível de seqüência mistas de ADN alinhados e não alinhados fornecidas pelo usuário. A força do Phyloscan é que ele reúne
* O método Staden para computação da significância estatística,
* O "modelo de motivo de filogenética" funcionalidade de digitalização do software MONKEY este modela relacionamentos evolutivos entre seqüências alinhadas,
* O uso do método Bailey & Gribskov para combinar as estatísticas não-alinhadas em seqüência de dados, e
* A técnica Neuwald & Green para combinar estatísticas em vários sítios de ligação encontrados dentro de uma única região do gene promotor. (pt)
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- Wadsworth Center, New York State Department of Health (en)
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- Phyloscan is a web service for DNA sequence analysis that is free and open to all users (without login requirement). For locating matches to a user-specified sequence motif for a regulatory binding site, Phyloscan provides a statistically sensitive scan of user-supplied mixed aligned and unaligned DNA sequence data. Phyloscan's strength is that it brings together (en)
- Phyloscan é um serviço web service para de ADN que é livre e aberto a todos usuários (sem necessidade de login). Para a localização de pareamentos de especificadas pelo usuário para um regulatório, Phyloscan fornece uma varredura estatisticamente sensível de seqüência mistas de ADN alinhados e não alinhados fornecidas pelo usuário. A força do Phyloscan é que ele reúne (pt)
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- Phyloscan (en)
- Phyloscan (pt)
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