| dbo:abstract
|
- الميكروببتيد (بالإنجليزية: Micropeptide) ويُعرف كذلك باسم الميكروبروتين، هو عديد ببتيد طوله أقل من 100-150 حمض أميني يُشفر من إطارات قراءة مفتوحة قصيرة (sORFs). وفي هذا السياق، هو مختلف عن الكثير من الببتيدات الصغيرة النشطة الأخرى التي تنتج من قصٍ لبروتينات كبيرة أثناء تعديلات ما بعد الترجمة. من حيث الطول، الميكروبيبتيدات أقصر من البروتينات «المعيارية» التي متوسط طولها 330 في بدائيات النوى و449 في حقيقيات النوى. تسمى الميكروببتيدات أحيانا حسب موضعها الجينومي، على سبيل المثال: ناتج النسخ من (uORF) يمكن أن يُسمى: الببتيد المشفر من uORF (uPEP). لا تملك الميكروببتيدات تسلسلات تأشير في النهاية الأمينية، وهذا يوحي بأنها على الأرجح ستتموقع في السيتوبلازم. لكن تم العثور على بعض الميكروببتيدات في أحياز خلوية أخرى، كما يوحي به تواجد ميكروببتيدات عبر غشائية. وهي موجودة لدى كلٍ من حقيقيات وبدائيات النوى. إطارات القراءة المفتوحة الصغيرة التي تُترجم منها الميكروببتيدات يمكن أن تتواجد في المناطق 5' غير المترجمة (5'UTRs)، الجينات الصغيرة، الرنا الرسول عديد السيسترون. بعض الجينات المشفرة للميكروببتيدات تم توصيفها خطأً في البداية على أنها رنا غير مشفر طويل (lncRNA). نظرا لطولها الصغير، تم تجاهل الـsORFs، لكن تم تحديد مئات الآلاف من الميكروببتيدات المفترضة عبر عدة تقنيات في العديد من الكائنات. جزء صغير فقط من إطارات القراءة الصغيرة هذه التي تملك قابلية للترجمة تم تأكيد التعبير عنها وعن امتلاك الميكروببتيدات الناتجة منها لوظيفة. الميكروببتيدات التي تم تحديد وظائفها، تقوم في العموم بأدوارٍ في التأشير الخلوي، تخلق الأعضاء والفيسيولوجيا الخلوية. مع اكتشاف المزيد من الميكروببتيدات يتم اكتشاف وظائفها كذلك. أحد وظائفها التنظيمية هي عملها كمفتاح ببتيدي يقوم بمنع التعبير عن التسلسلات المشفرة مع الاتجاه بتعطيل الريبوسومات عبر تنشيطها المباشر أو غير المباشر بواسطة جزيئات صغيرة. (ar)
- Micropeptides (also referred to as microproteins) are polypeptides with a length of less than 100-150 amino acids that are encoded by short open reading frames (sORFs). In this respect, they differ from many other active small polypeptides, which are produced through the posttranslational cleavage of larger polypeptides. In terms of size, micropeptides are considerably shorter than "canonical" proteins, which have an average length of 330 and 449 amino acids in prokaryotes and eukaryotes, respectively. Micropeptides are sometimes named according to their genomic location. For example, the translated product of an upstream open reading frame (uORF) might be called a uORF-encoded peptide (uPEP). Micropeptides lack an N-terminal signaling sequences, suggesting that they are likely to be localized to the cytoplasm. However, some micropeptides have been found in other cell compartments, as indicated by the existence of transmembrane micropeptides. They are found in both prokaryotes and eukaryotes. The sORFs from which micropeptides are translated can be encoded in 5' UTRs, small genes, or polycistronic mRNAs. Some micropeptide-coding genes were originally mis-annotated as long non-coding RNAs (lncRNAs). Given their small size, sORFs were originally overlooked. However, hundreds of thousands of putative micropeptides have been identified through various techniques in a multitude of organisms. Only a small fraction of these with coding potential have had their expression and function confirmed. Those that have been functionally characterized, in general, have roles in cell signaling, organogenesis, and cellular physiology. As more micropeptides are discovered so are more of their functions. One regulatory function is that of peptoswitches, which inhibit expression of downstream coding sequences by stalling ribosomes, through their direct or indirect activation by small molecules. (en)
- Mikropeptida (juga disebut mikroprotein) adalah polipeptida dengan panjang kurang dari 100-150 asam amino yang disandi oleh rangka baca terbuka pendek (short open reading frame, sORF). Dalam hal ini, mikropeptida berbeda dari banyak polipeptida kecil aktif lainnya, yang diproduksi melalui pembelahan pascatranslasional dari polipeptida yang lebih besar. Dalam hal ukuran, mikropeptida jauh lebih pendek daripada protein "kanonik", yang memiliki panjang rata-rata 330 dan 449 asam amino dalam prokariota dan eukariota secara berturut-turut. Mikropeptida kadang-kadang dinamai sesuai dengan lokasi genomiknya. Misalnya, produk translasi dari (upstream open reading frame, uORF) dapat disebut peptida yang disandi uORF (uORF-encoded peptide, uPEP). Mikropeptida tidak memiliki urutan pensinyalan terminal-N, yang menunjukkan bahwa mikropeptida cenderung terlokalisasi di sitoplasma. Namun, beberapa mikropeptida telah ditemukan di kompartemen sel lain, seperti yang ditunjukkan oleh keberadaan mikropeptida . Mikropeptida dapat ditemukan dalam prokariota dan eukariota. sORF yang menjadi asal mikropeptida yang ditranslasi dapat disandi dalam , gen kecil, atau . Beberapa gen penyandi mikropeptida pada awalnya dianotasi secara salah sebagai (long non-coding RNA, lncRNA). Karena ukurannya yang kecil, sORF pada awalnya diabaikan. Namun, ratusan ribu mikropeptida diduga telah diidentifikasi melalui berbagai teknik pada banyak organisme. Hanya sebagian kecil dari ini dengan potensi penyandian yang memiliki ekspresi dan fungsi yang dikonfirmasi. Mikropeptida yang telah dikarakterisasi secara fungsional, secara umum, memiliki peran dalam pensinyalan sel, organogenesis, dan . Semakin banyak mikropeptida yang ditemukan, semakin banyak fungsinya. Salah satu fungsi regulasi adalah fungsi peptoswitch, yang menghambat ekspresi urutan penyandi hilir dengan menghentikan ribosom, melalui aktivasi langsung atau tidak langsung oleh molekul kecil. (in)
|
| rdfs:comment
|
- الميكروببتيد (بالإنجليزية: Micropeptide) ويُعرف كذلك باسم الميكروبروتين، هو عديد ببتيد طوله أقل من 100-150 حمض أميني يُشفر من إطارات قراءة مفتوحة قصيرة (sORFs). وفي هذا السياق، هو مختلف عن الكثير من الببتيدات الصغيرة النشطة الأخرى التي تنتج من قصٍ لبروتينات كبيرة أثناء تعديلات ما بعد الترجمة. من حيث الطول، الميكروبيبتيدات أقصر من البروتينات «المعيارية» التي متوسط طولها 330 في بدائيات النوى و449 في حقيقيات النوى. تسمى الميكروببتيدات أحيانا حسب موضعها الجينومي، على سبيل المثال: ناتج النسخ من (uORF) يمكن أن يُسمى: الببتيد المشفر من uORF (uPEP). لا تملك الميكروببتيدات تسلسلات تأشير في النهاية الأمينية، وهذا يوحي بأنها على الأرجح ستتموقع في السيتوبلازم. لكن تم العثور على بعض الميكروببتيدات في أحياز خلوية أخرى، كما يوحي به تواجد ميكروببتيدات عبر غشائية. وهي موجودة لدى كلٍ من حقيقيات وبدائيات (ar)
- Micropeptides (also referred to as microproteins) are polypeptides with a length of less than 100-150 amino acids that are encoded by short open reading frames (sORFs). In this respect, they differ from many other active small polypeptides, which are produced through the posttranslational cleavage of larger polypeptides. In terms of size, micropeptides are considerably shorter than "canonical" proteins, which have an average length of 330 and 449 amino acids in prokaryotes and eukaryotes, respectively. Micropeptides are sometimes named according to their genomic location. For example, the translated product of an upstream open reading frame (uORF) might be called a uORF-encoded peptide (uPEP). Micropeptides lack an N-terminal signaling sequences, suggesting that they are likely to be local (en)
- Mikropeptida (juga disebut mikroprotein) adalah polipeptida dengan panjang kurang dari 100-150 asam amino yang disandi oleh rangka baca terbuka pendek (short open reading frame, sORF). Dalam hal ini, mikropeptida berbeda dari banyak polipeptida kecil aktif lainnya, yang diproduksi melalui pembelahan pascatranslasional dari polipeptida yang lebih besar. Dalam hal ukuran, mikropeptida jauh lebih pendek daripada protein "kanonik", yang memiliki panjang rata-rata 330 dan 449 asam amino dalam prokariota dan eukariota secara berturut-turut. Mikropeptida kadang-kadang dinamai sesuai dengan lokasi genomiknya. Misalnya, produk translasi dari (upstream open reading frame, uORF) dapat disebut peptida yang disandi uORF (uORF-encoded peptide, uPEP). Mikropeptida tidak memiliki urutan pensinyalan termi (in)
|
