| dbo:abstract
|
- Lokiarchaeota jsou skupina archeí, jejíž členové jsou nejbližšími známými příbuznými eukaryot. (cs)
- Die Lokiarchaeota (deutsch: Lokiarchaeen) sind eine systematische Gruppe von Mikroorganismen im taxonomischen Rang eines Stammes, die der Domäne der Archaeen zugeordnet wird. Die Errichtung des Taxons im Jahr 2015 fußte vor allem auf molekulargenetischen Daten. Obgleich die Lokiarchaeen Prokaryoten sind, finden sich in ihnen einige Gene, welche bislang nur bei Tieren, Pflanzen, Pilzen und anderen Eukaryoten gefunden wurden, sogenannte eukaryotische Signaturgene. Die Lokiarchaeen werden daher auch als eine Art Missing Link zwischen Archaeen und Eukaryoten diskutiert. Es sind jedoch weitere Untersuchungen nötig, um die Missing-Link-Hypothese zu festigen, beispielsweise der Nachweis eines dynamischen Zytoskeletts unter dem Mikroskop. Das organische Material, in dem die spezielle genetische Signatur der Lokiarcheen identifiziert wurde, stammt aus Proben von marinen Sedimenten, die in einem Geothermalgebiet in der arktischen Tiefsee zwischen Nordwesteuropa und Grönland entnommen wurden. Dieses Geothermalgebiet wurde wegen der bizarren Formen der Schlote seiner Schwarzen Raucher von seinen Entdeckern „Lokis Schloss“ (englisch Loki’s Castle) genannt. Der Name „Lokiarchaeota“ nimmt zudem darauf Bezug, dass die Lokiarchaeen ihre Zellform ändern können und der nordische Gott Loki, der Sage nach, ein Formwandler war. (de)
- Lokiarchaeota est un phylum des Archaea défini en 2015. (fr)
- Lokiarchaeia o Lokiarchaeota es una nueva clase propuesta para integrar la sistemática de las arqueas. Ha sido identificado mediante el análisis genético y comprende microbios cuya apariencia o aspecto visual recién se está conociendo debido al cultivo de Prometheoarchaeum (2020). En castellano pasarían posiblemente a designarse loquiarqueas y su nombre es alusivo al personaje mitológico Loki, aunque más exactamente al lugar del hallazgo en las proximidades de la fuente hidrotermal conocida como el Castillo de Loki en el Ártico. Su importancia proviene del análisis filogenético que demostraría la existencia de una agrupación monofilética compuesta conjuntamente por las loquiarqueas y los eucariotas, por lo que se considera que este nuevo microorganismo constituye el eslabón perdido entre los seres eucariotas y su origen procariota. La presencia de varios genes de funciones vinculadas a la membrana celular, brindan pábulo a la hipótesis del hospedador arqueano, respaldando la hipótesis del eocito para el origen y evolución de los eucariontes. La nomenclatura de este taxón -clase Lokiarchaeia- se introdujo en 2020, tras identificarse un genoma candidato al realizar un análisis metagenómico (destructivo) de una muestra de sedimentos centro-oceánicos. Esa identificación sugiere la existencia de un género de vida terrestre unicelular, antes desconocido, que ha sido designado como Lokiarchaeum. La muestra se obtuvo a 15 km de una fuente hidrotermal conocida como el Castillo de Loki, sobre la Dorsal de Gakkel en el océano Ártico (mar de Groenlandia), en el sedimento del fondo marino a 2.352 metros de profundidad, 0,3 °C y sin señales de vida eucariota. El descubrimiento de este taxón tan elevado constituiría una muestra de la mediación epistémica progresiva, o progresión del conocimiento sistemático o taxonómico. Este conocimiento avanza desde disponer, al principio, solamente de señales radiadas por máquinas que realizan análisis automáticos, quizás destructivos; estas máquinas pueden situarse en el laboratorio o incluso ser operadas bajo control remoto en sitios recónditos (tales como el del hallazgo de Lokiarchaeum, o en la exploración de posibles biósferas extraterrestres), hasta el sucesivo refinamiento de esos datos con la repetición y mejora de los análisis y ensayos y, eventualmente y por otros medios, la visualización o hasta el recobro de ejemplares muertos o vivos, que puedan ser conservados en repositorios, ceparios o museos. Este es el caso de los loquiarqueotas. En efecto, hasta el momento se cuenta solamente con las señales provenientes de sistemas de análisis automático de sedimento submarino, cuyos datos en el futuro serían progresivamente refinados hasta que, finalmente, pueda identificarse a los microbios vivos y sea posible, tal vez, traer holotipo y a la superficie, y finalmente reproducirlos o cultivarlos en condiciones controladas; esto, sin embargo, tal vez por largo tiempo no resulte posible, debido a deformaciones impuestas por la extracción desde su hábitat. (es)
- Lokiarchaeota is a proposed phylum of the Archaea. The phylum includes all members of the group previously named Deep Sea Archaeal Group (DSAG), also known as Marine Benthic Group B (MBG-B). Lokiarchaeota is part of the superphylum Asgard containing the phyla: Lokiarchaeota, Thorarchaeota, Odinarchaeota, Heimdallarchaeota, and . A phylogenetic analysis disclosed a monophyletic grouping of the Lokiarchaeota with the eukaryotes. The analysis revealed several genes with cell membrane-related functions. The presence of such genes support the hypothesis of an archaeal host for the emergence of the eukaryotes; the eocyte-like scenarios. Lokiarchaeota was introduced in 2015 after the identification of a candidate genome in a metagenomic analysis of a mid-oceanic sediment sample. This analysis suggests the existence of a genus of unicellular life dubbed Lokiarchaeum. The sample was taken near a hydrothermal vent at a vent field known as Loki's Castle located at the bend between /Knipovich ridge in the Arctic Ocean. (en)
- Lokiarchaeota merupakan filum yang diusulkan dari Archaea. Filum tersebut mencakup semua anggota kelompok yang sebelumnya bernama Deep Sea Archaeal Group (DSAG) atau Kelompok Archaea Laut Dalam, dan juga dikenal sebagai Marine Benthic Group B (MBG-B) atau Kelompok Bentik Laut B. Analisis filogenetik mengungkapkan pengelompokan Lokiarchaeota bersifat monofiletik dengan eukariota. Analisis ini juga mengungkapkan beberapa gen dengan fungsi yang berkaitan dengan membran sel. Kehadiran gen tersebut mendukung hipotesis inang archaea untuk kemunculan eukariota; skenario seperti eosit. Lokiarchaeota pertama kali diperkenalkan pada tahun 2015 setelah identifikasi genom kandidat dalam analisis metagenomik dari sampel sedimen samudra tengah. Analisis ini menunjukkan keberadaan suatu genus dari organisme uniseluler yang disebut Lokiarchaeum. Sampel diambil di dekat ventilasi hidrotermal di bidang ventilasi bernama sebagai Kastil Loki yang terletak di tikungan antara pegunungan / Knipovitch di Samudra Arktik . (in)
- ロキ古細菌門（ロキアーキオータ門、Lokiarchaeota）は、2015年に提唱された古細菌の候補門である。系統解析では真核生物に近接し、膜の複雑化を支える遺伝子を多数持つ。おおよそ20億年前に、この系統から真核生物が派生したとする説がある。 2010年に北極海のガッケル海嶺にあるロキの城と呼ばれる熱水噴出口の付近から採取された。発見場所にちなんで"ロキ"古細菌と名付けられたが、これに倣ってアスガルド系統の古細菌には北欧神話の神の名前が付けられるようになった。培養には成功していないものの、メタゲノム解析により5,381の遺伝子を含む5.1Mbp（全体の92%）のゲノムが再構築された。この中には真核生物様の遺伝子が175程度含まれており、他のエオサイトにも含まれるアクチン様タンパクに加え、低分子量GTPアーゼやESCRTシリーズ（ESCRT I, II, III）、、BAR/IMDスーパーファミリーを始めとした細胞骨格や細胞変形、小胞体制御に必要な遺伝子が多数含まれる。また、ユビキチン-プロテアソーム系遺伝子も持つ。特にプロフィリンは、ウサギアクチンと相互作用を起こすことができると報告されている。 生態は不明だが、"Lokiarchaeum" sp. GC14_75のゲノム情報から嫌気性の水素依存性生物と予想されている。 2017年にはロキ古細菌と近縁な古細菌がいくつか報告されており、この中にはロキ古細菌よりも更に真核生物に近いと考えられるヘイムダル古細菌や、チューブリンを持つとされるオーディン古細菌も報告されている。真核生物に近いこれらの系統を総称してアスガルド古細菌と呼ばれる。この解析では、アスガルド古細菌はTACK系統の内部系統ではなく、姉妹群という。 2019年にはメタゲノムアセンブルゲノム（MAG）を再構築して６種のゲノムが同定されており、それぞれのゲノムサイズは3.4 - 4.5Mbpの範囲にあることが判明していた。2020年には、この門に属すと思われる"Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum"の培養が報告され、ゲノムサイズは4.4Mbpであることが判明している。 (ja)
- Lokiarchaeota är ett fylum av arkéer inom riket Proteoarchaeota och överfylumet Asgard. Lokiarchaeota beskrevs år 2015 av Anja Spang, Jimmy H. Saw, Steffen L. Jørgensen, Katarzyna Zaremba-Niedzwiedzka, Joran Martijn, Anders E. Lind, Roel van Eijk, Christa Schleper, Lionel Guy och Thijs J. G. Ettema. (sv)
- Lokiarchaeota (лат.) — предполагаемый тип архей. Тип был описан в 2015 году на основании генома, собранного при метагеномном анализе образцов, полученных рядом с гидротермальными источниками в Атлантическом океане на глубине 2,35 км. Филогенетический анализ показал, что Lokiarchaeota и эукариоты образуют монофилетический таксон. Геном Lokiarchaeota содержит около 5400 генов, кодирующих белки. Среди них были обнаружены гены, близкие к генам эукариот. В частности, гены, кодирующие белки, отвечающие за изменение формы клеточной мембраны, определение формы клетки и динамический цитоскелет. Таким образом, находит своё подтверждение , согласно которой эукариоты представляют собой группу внутри архей, приобретшую митохондрии путем симбиогенеза. (ru)
- Lokiarchaeota — передбачуваний тип архей. Тип було описано у 2015 році на підставі генома, зібраного при метагеномному аналізі зразків, отриманих поруч з гідротермальних джерелами в Атлантичному океані на глибині 2,35 км. Філогенетичний аналіз показав, що Lokiarchaeota і еукаріоти утворюють монофілетичний таксон. Геном Lokiarchaeota містить близько 5400 генів, що кодують білки. Серед них були виявлені гени, близькі до генів еукаріот. Зокрема, гени, що кодують білки, що відповідають за зміну форми клітинної мембрани, визначення форми клітини і динамічний цитоскелет. Таким чином, знаходить своє підтвердження , згідно з якою еукаріоти представляють собою групу всередині архей, яка придбала мітохондрії. (uk)
|
| rdfs:comment
|
- Lokiarchaeota jsou skupina archeí, jejíž členové jsou nejbližšími známými příbuznými eukaryot. (cs)
- Lokiarchaeota est un phylum des Archaea défini en 2015. (fr)
- Lokiarchaeota är ett fylum av arkéer inom riket Proteoarchaeota och överfylumet Asgard. Lokiarchaeota beskrevs år 2015 av Anja Spang, Jimmy H. Saw, Steffen L. Jørgensen, Katarzyna Zaremba-Niedzwiedzka, Joran Martijn, Anders E. Lind, Roel van Eijk, Christa Schleper, Lionel Guy och Thijs J. G. Ettema. (sv)
- Lokiarchaeota (лат.) — предполагаемый тип архей. Тип был описан в 2015 году на основании генома, собранного при метагеномном анализе образцов, полученных рядом с гидротермальными источниками в Атлантическом океане на глубине 2,35 км. Филогенетический анализ показал, что Lokiarchaeota и эукариоты образуют монофилетический таксон. Геном Lokiarchaeota содержит около 5400 генов, кодирующих белки. Среди них были обнаружены гены, близкие к генам эукариот. В частности, гены, кодирующие белки, отвечающие за изменение формы клеточной мембраны, определение формы клетки и динамический цитоскелет. Таким образом, находит своё подтверждение , согласно которой эукариоты представляют собой группу внутри архей, приобретшую митохондрии путем симбиогенеза. (ru)
- Lokiarchaeota — передбачуваний тип архей. Тип було описано у 2015 році на підставі генома, зібраного при метагеномному аналізі зразків, отриманих поруч з гідротермальних джерелами в Атлантичному океані на глибині 2,35 км. Філогенетичний аналіз показав, що Lokiarchaeota і еукаріоти утворюють монофілетичний таксон. Геном Lokiarchaeota містить близько 5400 генів, що кодують білки. Серед них були виявлені гени, близькі до генів еукаріот. Зокрема, гени, що кодують білки, що відповідають за зміну форми клітинної мембрани, визначення форми клітини і динамічний цитоскелет. Таким чином, знаходить своє підтвердження , згідно з якою еукаріоти представляють собою групу всередині архей, яка придбала мітохондрії. (uk)
- Die Lokiarchaeota (deutsch: Lokiarchaeen) sind eine systematische Gruppe von Mikroorganismen im taxonomischen Rang eines Stammes, die der Domäne der Archaeen zugeordnet wird. Die Errichtung des Taxons im Jahr 2015 fußte vor allem auf molekulargenetischen Daten. (de)
- Lokiarchaeia o Lokiarchaeota es una nueva clase propuesta para integrar la sistemática de las arqueas. Ha sido identificado mediante el análisis genético y comprende microbios cuya apariencia o aspecto visual recién se está conociendo debido al cultivo de Prometheoarchaeum (2020). En castellano pasarían posiblemente a designarse loquiarqueas y su nombre es alusivo al personaje mitológico Loki, aunque más exactamente al lugar del hallazgo en las proximidades de la fuente hidrotermal conocida como el Castillo de Loki en el Ártico. (es)
- Lokiarchaeota is a proposed phylum of the Archaea. The phylum includes all members of the group previously named Deep Sea Archaeal Group (DSAG), also known as Marine Benthic Group B (MBG-B). Lokiarchaeota is part of the superphylum Asgard containing the phyla: Lokiarchaeota, Thorarchaeota, Odinarchaeota, Heimdallarchaeota, and . A phylogenetic analysis disclosed a monophyletic grouping of the Lokiarchaeota with the eukaryotes. The analysis revealed several genes with cell membrane-related functions. The presence of such genes support the hypothesis of an archaeal host for the emergence of the eukaryotes; the eocyte-like scenarios. (en)
- Lokiarchaeota merupakan filum yang diusulkan dari Archaea. Filum tersebut mencakup semua anggota kelompok yang sebelumnya bernama Deep Sea Archaeal Group (DSAG) atau Kelompok Archaea Laut Dalam, dan juga dikenal sebagai Marine Benthic Group B (MBG-B) atau Kelompok Bentik Laut B. Analisis filogenetik mengungkapkan pengelompokan Lokiarchaeota bersifat monofiletik dengan eukariota. Analisis ini juga mengungkapkan beberapa gen dengan fungsi yang berkaitan dengan membran sel. Kehadiran gen tersebut mendukung hipotesis inang archaea untuk kemunculan eukariota; skenario seperti eosit. (in)
- ロキ古細菌門（ロキアーキオータ門、Lokiarchaeota）は、2015年に提唱された古細菌の候補門である。系統解析では真核生物に近接し、膜の複雑化を支える遺伝子を多数持つ。おおよそ20億年前に、この系統から真核生物が派生したとする説がある。 2010年に北極海のガッケル海嶺にあるロキの城と呼ばれる熱水噴出口の付近から採取された。発見場所にちなんで"ロキ"古細菌と名付けられたが、これに倣ってアスガルド系統の古細菌には北欧神話の神の名前が付けられるようになった。培養には成功していないものの、メタゲノム解析により5,381の遺伝子を含む5.1Mbp（全体の92%）のゲノムが再構築された。この中には真核生物様の遺伝子が175程度含まれており、他のエオサイトにも含まれるアクチン様タンパクに加え、低分子量GTPアーゼやESCRTシリーズ（ESCRT I, II, III）、、BAR/IMDスーパーファミリーを始めとした細胞骨格や細胞変形、小胞体制御に必要な遺伝子が多数含まれる。また、ユビキチン-プロテアソーム系遺伝子も持つ。特にプロフィリンは、ウサギアクチンと相互作用を起こすことができると報告されている。 生態は不明だが、"Lokiarchaeum" sp. GC14_75のゲノム情報から嫌気性の水素依存性生物と予想されている。 (ja)
|
