| dbo:abstract
|
- Das Helix-Turn-Helix-Motiv (HTH) ist ein Sekundärstrukturelement in Proteinen. Es ist Bestandteil von DNA-bindenden Proteinen mit sequenzspezifischer DNA-Bindedomäne und setzt sich aus zwei α-Helices zusammen, die durch eine β-Schleife (auch β-turn) verbunden sind. Transkriptionsregulatoren in Bakterien enthalten oft ein HTH-Motiv. Homöodomänen enthalten ein Helix-Turn-Helix-Motiv. Eine Helix bindet als Erkennungshelix sequenzspezifisch in der großen Furche der DNA und geht mehrere molekulare Wechselwirkungen (z. B. Wasserstoffbrücken, Ionenbindungen und hydrophobe Wechselwirkungen) zwischen Aminosäuren und den Basen der DNA ein, die andere Helix positioniert sich im rechten Winkel dazu und festigt somit die labile Bindung mit der DNA. Eine solche Anordnung dient also einerseits der Stabilität des Protein-DNA-Komplexes,andererseits wird die Spezifität der Reaktion erhöht, da beide Bindungspartner eine ganz bestimmte räumliche Struktur aufweisen müssen. DNA-bindende Proteine dieser Art sind Homodimere oder Tetramere mit spiegelbildlich symmetrischen Anordnung der DNA-Bindedomäne. Die Zentren der Bindedomänen besitzen einen Abstand von 34 Å. Diese Länge entspricht der Ganghöhe der DNA, sodass die beiden Erkennungssequenzen in zwei aufeinander folgende Furchen der DNA passen. Die Bindungssequenzen sind Palindrome, d. h., sie sind aus zwei invertierten, spiegelbildlich angeordneten Sequenzen mit einem Abstand von 11 Basenpaaren aufgebaut, der ebenfalls der Ganghöhe der DNA entspricht. Dadurch liegen die beiden Erkennungssequenzen passgenau in aufeinander folgenden Furchen der DNA und werden so von den beiden Erkennungshelices eines dimeren Bindeproteins erkannt. (de)
- Helix-turn-helix is a DNA-binding protein (DBP). The helix-turn-helix (HTH) is a major structural motif capable of binding DNA. Each monomer incorporates two α helices, joined by a short strand of amino acids, that bind to the major groove of DNA. The HTH motif occurs in many proteins that regulate gene expression. It should not be confused with the helix–loop–helix motif. (en)
- En proteínas, la hélice-giro-hélice es uno de los principales motivos de estructura secundaria capaces de unirse al ADN. Se compone de dos hélices α unidas por una breve secuencia lineal de aminoácidos y se encuentra en muchas proteínas que regulan la expresión génica. No debe ser confundida con el dominio hélice-lazo-hélice. Su descubrimiento se basó en las similitudes entre los genes de Cro, PAC, y el represor λ, que comparten una secuencia de 20-25 aminoácidos que facilita el reconocimiento por el ADN. El reconocimiento y unión a ADN se hace a través de las dos hélices α, un ocupando el motivo N-terminal y la otra el motivo C-terminal. En la mayoría de los casos, como en el represor Cro, la segunda hélice contribuye más al reconocimiento del ADN y, por tanto, es a menudo llamada la "hélice de reconocimiento". Se une al surco mayor del ADN a través de una serie de puentes de hidrógeno e interacciones de van der Waals con las bases expuestas. La otra hélice α estabiliza la interacción entre proteínas y ADN, pero no juega un papel importante en el reconocimiento. (es)
- Un domaine hélice-coude-hélice (HTH, ou Helix-Turn-Helix en anglais) est un élément de structure secondaire des protéines et un motif structurel important des protéines de liaison à l'ADN. Distinct du domaine hélice-boucle-hélice avec lequel il ne doit pas être confondu, il est formé de deux hélices α reliées par un court segment fléchi et est présent dans de nombreuses protéines intervenant dans la régulation de l'expression génétique. Son identification résulte de l'observation de similitudes entre des gènes codant les protéines Cro, (en) et répresseur λ de régulation de la transcription chez le phage λ et Escherichia coli, qui se trouvent posséder en commun une séquence de 20 à 25 résidus d'acides aminés facilitant la reconnaissance de l'ADN. (fr)
- Nelle proteine, la configurazione elica-giro-elica (helix-turn-helix o HTH) è il motivo strutturale principale in grado di legare il DNA. È composta da due α-eliche unite da una piccola sequenza di amminoacidi e si trova in molte proteine che regolano l'espressione genica. Il riconoscimento e la capacità di legame al DNA è dovuta alle due α-eliche: una occupa l'N-terminale della struttura, l'altra il C-terminale. In molti casi la seconda elica contribuisce maggiormente al riconoscimento del DNA. Il motivo si lega al solco maggiore del DNA tramite una serie di legami idrogeno e diverse interazioni di van der Waals con le basi esposte. L'altra α elica stabilizza l'interazione tra la proteina ed il DNA, ma non gioca un ruolo particolare nel suo riconoscimento. (it)
- ヘリックスターンヘリックス（Helix-turn-helix、HTH）とは、タンパク質の主要な構造モチーフの一つで、DNAに結合する性質を持つ。2つのαヘリックスが短いペプチド鎖で繋がった構造を持ち、遺伝子発現を制御するタンパク質に特に多く見られる。 このモチーフは、Cro、CAP、λリプレッサーに存在する20-25アミノ酸残基の共通配列として発見された。特にDNAを認識し結合する部位は2つのヘリックスのうち1つのN末端ともう1つのC末端にある。またCroリプレッサーを含む多くの場合は2つ目のヘリックスはDNAの認識に関わっている。DNAへの結合は水素結合と塩基部分のファンデルワールス力によっている。もう1つのヘリックスはDNAとタンパク質の結合を安定化させるが、その認識にはあまり関わらない。 (ja)
- Het helix-draai-helix of HTH (Engels: helix-turn-helix) is een supersecundaire structuur dat uit drie segmenten bestaat. Het vormt een bestanddeel van DNA-bindende eiwitten met een sequentiespecifiek DNA-bindingsdomein en bestaat uit twee α-helices, die door een β-draai verbonden zijn. De ene bezet het N-terminale begin van het motief, de andere de C-terminus. Transcriptieregulatoren in bacteriën bevatten vaak een HTH-motief. Dit eiwit behoort tot de homeobox-domeinen. Een helix bindt als herkenningshelix sequentiespecifiek in de grote groeve van het DNA en gaat een aantal intermoleculaire interacties aan, zoals waterstofbruggen en vanderwaalskrachten tussen aminozuren en de basen van het DNA, terwijl de andere helix een rechte hoek vormt, waardoor een labiele binding met het DNA gevormd wordt. Zo'n verbinding geeft enerzijds stabiliteit aan het eiwit-DNA-complex en anderzijds wordt de specificiteit van de reactie verhoogd, aangezien beide bindingspartners een zeer specifieke ruimtelijke structuur moeten vormen. Dergelijke DNA-bindende eiwitten zijn homo-dimeren of tetrameren met een spiegelbeeldsymmetrische ordening van de DNA-bindingsdomeinen. Tussen de centra van de bindingsdomeinen zit een afstand van 34 Å. Deze afstand komt overeen met een draai van het DNA, zodat de beide herkenningssequenties in twee op elkaar volgende groeven van het DNA passen. De bindingssequenties zijn palindromen, opgebouwd uit twee omgekeerd geordende sequenties op een afstand van 11 basenparen van elkaar, die eveneens overeenkomen met een draai van het DNA. Daardoor liggen de beide herkenningssequenties precies in op elkaar volgende groeven van het DNA en worden zo door de beide herkenningshelices van een dimeer eiwit herkend. (nl)
- Спираль-поворот-спираль (от англ. Helix-Turn-Helix, HTH-мотив) — мотив в белках, способный взаимодействовать с ДНК. Он состоит из двух α-спиралей, соединенных короткой цепью аминокислот и входит в состав многих белков, регулирующих экспрессию генов. Не следует путать с доменом типа «спираль-петля-спираль» (англ. helix-loop-helix domain). (ru)
- 螺旋-轉角-螺旋（英語：helix-turn-helix，简称为HTH）是一種蛋白質的結構基序（structural motif），可與DNA進行結合。此結構是由一條氨基酸短鏈將兩個α螺旋連結在一起，可見於許多專門調節基因表現的蛋白質。與DNA的結合，是經由蛋白質與鹼基之間的氫鍵及范德华力來進行，結合位置是DNA的大凹槽（參見DNA條目，例外：TATA联结蛋白的该结构结合位置为小凹槽）。 (zh)
- У білках спіраль-поворот-спіраль (HTH) є головним структурним мотивом, здатним зв'язувати ДНК. Кожен мономер містить два спіралі α, з'єднані короткою ланцюгом амінокислот, які зв'язуються з основною канавкою ДНК. Мотив HTH зустрічається у багатьох білках, які регулюють експресію генів. Його не слід плутати з мотивом helix-loop-helix. (uk)
|
| dbo:symbol
|
- HTH_1
- HTH_10
- HTH_11
- HTH_12
- HTH_13
- HTH_15
- HTH_16
- HTH_17
- HTH_18
- HTH_19
- HTH_20
- HTH_3
- HTH_5
- HTH_6
- HTH_7
- HTH_8
- HTH_9
- HTH_AraC
- HTH_CodY
- HTH_DeoR
- HTH_IclR
- HTH_Mga
- HTH_OrfB_IS605
- HTH_Tnp_1
- HTH_Tnp_IS1
- HTH_Tnp_IS630
- HTH_Tnp_IS66
- HTH_Tnp_Mu_1
- HTH_Tnp_Mu_2
- HTH_Tnp_Tc3_1
- HTH_Tnp_Tc3_2
- HTH_Tnp_Tc5
- HTH_WhiA
- HTH_psq
|
| dbo:thumbnail
| |
| dbo:wikiPageExternalLink
| |
| dbo:wikiPageID
| |
| dbo:wikiPageLength
|
- 23799 (xsd:nonNegativeInteger)
|
| dbo:wikiPageRevisionID
| |
| dbo:wikiPageWikiLink
| |
| dbp:title
|
- Pfam infoboxes for Helix-turn-helix domains (en)
|
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| dcterms:subject
| |
| gold:hypernym
| |
| rdf:type
| |
| rdfs:comment
|
- Helix-turn-helix is a DNA-binding protein (DBP). The helix-turn-helix (HTH) is a major structural motif capable of binding DNA. Each monomer incorporates two α helices, joined by a short strand of amino acids, that bind to the major groove of DNA. The HTH motif occurs in many proteins that regulate gene expression. It should not be confused with the helix–loop–helix motif. (en)
- Un domaine hélice-coude-hélice (HTH, ou Helix-Turn-Helix en anglais) est un élément de structure secondaire des protéines et un motif structurel important des protéines de liaison à l'ADN. Distinct du domaine hélice-boucle-hélice avec lequel il ne doit pas être confondu, il est formé de deux hélices α reliées par un court segment fléchi et est présent dans de nombreuses protéines intervenant dans la régulation de l'expression génétique. Son identification résulte de l'observation de similitudes entre des gènes codant les protéines Cro, (en) et répresseur λ de régulation de la transcription chez le phage λ et Escherichia coli, qui se trouvent posséder en commun une séquence de 20 à 25 résidus d'acides aminés facilitant la reconnaissance de l'ADN. (fr)
- ヘリックスターンヘリックス（Helix-turn-helix、HTH）とは、タンパク質の主要な構造モチーフの一つで、DNAに結合する性質を持つ。2つのαヘリックスが短いペプチド鎖で繋がった構造を持ち、遺伝子発現を制御するタンパク質に特に多く見られる。 このモチーフは、Cro、CAP、λリプレッサーに存在する20-25アミノ酸残基の共通配列として発見された。特にDNAを認識し結合する部位は2つのヘリックスのうち1つのN末端ともう1つのC末端にある。またCroリプレッサーを含む多くの場合は2つ目のヘリックスはDNAの認識に関わっている。DNAへの結合は水素結合と塩基部分のファンデルワールス力によっている。もう1つのヘリックスはDNAとタンパク質の結合を安定化させるが、その認識にはあまり関わらない。 (ja)
- Спираль-поворот-спираль (от англ. Helix-Turn-Helix, HTH-мотив) — мотив в белках, способный взаимодействовать с ДНК. Он состоит из двух α-спиралей, соединенных короткой цепью аминокислот и входит в состав многих белков, регулирующих экспрессию генов. Не следует путать с доменом типа «спираль-петля-спираль» (англ. helix-loop-helix domain). (ru)
- 螺旋-轉角-螺旋（英語：helix-turn-helix，简称为HTH）是一種蛋白質的結構基序（structural motif），可與DNA進行結合。此結構是由一條氨基酸短鏈將兩個α螺旋連結在一起，可見於許多專門調節基因表現的蛋白質。與DNA的結合，是經由蛋白質與鹼基之間的氫鍵及范德华力來進行，結合位置是DNA的大凹槽（參見DNA條目，例外：TATA联结蛋白的该结构结合位置为小凹槽）。 (zh)
- У білках спіраль-поворот-спіраль (HTH) є головним структурним мотивом, здатним зв'язувати ДНК. Кожен мономер містить два спіралі α, з'єднані короткою ланцюгом амінокислот, які зв'язуються з основною канавкою ДНК. Мотив HTH зустрічається у багатьох білках, які регулюють експресію генів. Його не слід плутати з мотивом helix-loop-helix. (uk)
- Das Helix-Turn-Helix-Motiv (HTH) ist ein Sekundärstrukturelement in Proteinen. Es ist Bestandteil von DNA-bindenden Proteinen mit sequenzspezifischer DNA-Bindedomäne und setzt sich aus zwei α-Helices zusammen, die durch eine β-Schleife (auch β-turn) verbunden sind. Transkriptionsregulatoren in Bakterien enthalten oft ein HTH-Motiv. Homöodomänen enthalten ein Helix-Turn-Helix-Motiv. (de)
- En proteínas, la hélice-giro-hélice es uno de los principales motivos de estructura secundaria capaces de unirse al ADN. Se compone de dos hélices α unidas por una breve secuencia lineal de aminoácidos y se encuentra en muchas proteínas que regulan la expresión génica. No debe ser confundida con el dominio hélice-lazo-hélice. (es)
- Nelle proteine, la configurazione elica-giro-elica (helix-turn-helix o HTH) è il motivo strutturale principale in grado di legare il DNA. È composta da due α-eliche unite da una piccola sequenza di amminoacidi e si trova in molte proteine che regolano l'espressione genica. (it)
- Het helix-draai-helix of HTH (Engels: helix-turn-helix) is een supersecundaire structuur dat uit drie segmenten bestaat. Het vormt een bestanddeel van DNA-bindende eiwitten met een sequentiespecifiek DNA-bindingsdomein en bestaat uit twee α-helices, die door een β-draai verbonden zijn. De ene bezet het N-terminale begin van het motief, de andere de C-terminus. Transcriptieregulatoren in bacteriën bevatten vaak een HTH-motief. Dit eiwit behoort tot de homeobox-domeinen. (nl)
|
| rdfs:label
|
- Helix-Turn-Helix-Motiv (de)
- Hélice-giro-hélice (es)
- Hélice-coude-hélice (fr)
- Helix-turn-helix (en)
- Elica-giro-elica (it)
- ヘリックスターンヘリックス (ja)
- Helix-draai-helix (nl)
- Мотив «спираль-поворот-спираль» (ru)
- Спіраль-поворот-спіраль (uk)
- 螺旋-轉角-螺旋 (zh)
|
| owl:sameAs
| |
| prov:wasDerivedFrom
| |
| foaf:depiction
| |
| foaf:isPrimaryTopicOf
| |
| is dbo:wikiPageDisambiguates
of | |
| is dbo:wikiPageRedirects
of | |
| is dbo:wikiPageWikiLink
of | |
| is rdfs:seeAlso
of | |
| is foaf:primaryTopic
of | |
