About: HaeIII

An Entity of Type: protein, from Named Graph: http://dbpedia.org, within Data Space: dbpedia.org

HaeIII is one of many restriction enzymes (endonucleases) a type of prokaryotic DNA that protects organisms from unknown, foreign DNA. It is a restriction enzyme used in molecular biology laboratories. It was the third endonuclease to be isolated from the Haemophilus aegyptius bacteria. The enzyme's recognition site—the place where it cuts DNA molecules—is the GGCC nucleotide sequence which means it cleaves DNA at the site 5′-GG/CC-3. The recognition site is usually around 4-8 bps.This enzyme's gene has been sequenced and cloned. This is done to make DNA fragments in blunt ends. HaeIII is not effective for single stranded DNA cleavage.

Property Value
dbo:abstract
  • Das Enzym HaeIII gehört zu den Restriktionsendonukleasen und ist in der Lage DNA an spezifischen Stellen zu schneiden. HaeIII ist ein TypII-Restriktionsenzym und ist das dritte aus dem Bakterium Haemophilus aegyptius isolierte Restriktionsenzym. Das codierende Gen wurde sequenziert und kloniert, wodurch es für viele Anwendungen in der Molekularbiologie genutzt werden kann. Die molare Masse des Enzyms beträgt 37.126 Da. Wie viele andere Restriktionsenzyme bindet HaeIII an Stellen der DNA, die eine bestimmte Nukleotid-Sequenz aufweisen. Beim Schneiden der doppelsträngigen DNA entsteht ein glatter Schnitt ohne Überhänge. Die Enden der DNA-Bruchstücke werden deswegen als glatte Enden oder blunt ends bezeichnet. (de)
  • HaeIII is one of many restriction enzymes (endonucleases) a type of prokaryotic DNA that protects organisms from unknown, foreign DNA. It is a restriction enzyme used in molecular biology laboratories. It was the third endonuclease to be isolated from the Haemophilus aegyptius bacteria. The enzyme's recognition site—the place where it cuts DNA molecules—is the GGCC nucleotide sequence which means it cleaves DNA at the site 5′-GG/CC-3. The recognition site is usually around 4-8 bps.This enzyme's gene has been sequenced and cloned. This is done to make DNA fragments in blunt ends. HaeIII is not effective for single stranded DNA cleavage. (en)
  • HaeIII es una enzima de restricción de tipo II (EC 3.1.21.4)​ producida por el microorganismo que posee una diana de restricción en el ADN de cadena doble dependiente de una secuencia no metilada, palindrómica y no escalonada, sobre la cual su actividad catalítica hidrolasa genera extremos romos. La diana de restricción puede representarse según este diagrama: (es)
  • HaeIII – endonukleaza wyizolowana po raz pierwszy ze szczepu Haemophilus aegyptius, o masie cząsteczkowej 37 126 Da, wykazująca aktywność star. W biologii molekularnej enzym HaeIII jest używany jako restrykcyjny. Przy cięciu DNA tnie on obie nici w dokładnie przeciwległych miejscach i tworzy (czyli nie końce lepkie). Sekwencją rozpoznawaną i ciętą przez enzym jest sekwencja palindromowa 5'-GG▼CC-3' ( 3'-CC▲GG-5'). Metylacja drugiej guaniny w sekwencji (GGm5CC) chroni DNA przed cięciem, natomiast efektu tego nie ma metylacja cytozyny (GGCm5C). Enzym ten został w pełni zsekwencjonowany; znana jest także jego struktura krystaliczna. (pl)
  • HaeIII är ett restriktionsenzym som finns i Haemophilus aegyptius. Dess funktion är att klyva DNA-strängar vid sekvensen GGCC. Den klyver rakt av vilket kallas , tvärt emot klistriga ändar. (sv)
dbo:symbol
  • RE_HaeIII
dbo:thumbnail
dbo:wikiPageID
  • 7967411 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength
  • 4785 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID
  • 1088544755 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink
dbp:caption
  • The crystal structure of HaeIII enzyme convalently complexed to DNA: an extrahelical cytosine and rearranged base pairing. (en)
dbp:chromosome
  • Genomic (en)
dbp:ecnumber
  • 3.100000 (xsd:double)
dbp:entrezchromosome
  • NC_014920.1 (en)
dbp:genlocEnd
  • 699745 (xsd:integer)
dbp:genlocStart
  • 698503 (xsd:integer)
dbp:interpro
  • IPR019059 (en)
dbp:name
  • HaeIIIR (en)
  • Type-2 restriction enzyme HaeIII (en)
dbp:organism
  • Haemophilus aegyptius (en)
dbp:pfam
  • PF09556 (en)
dbp:refseqprotein
  • WP_006996034.1 (en)
dbp:symbol
  • RE_HaeIII (en)
  • haeIIIR (en)
dbp:taxid
  • 197575 (xsd:integer)
dbp:uniprot
  • O68584 (en)
dbp:wikiPageUsesTemplate
dcterms:subject
gold:hypernym
rdf:type
rdfs:comment
  • HaeIII is one of many restriction enzymes (endonucleases) a type of prokaryotic DNA that protects organisms from unknown, foreign DNA. It is a restriction enzyme used in molecular biology laboratories. It was the third endonuclease to be isolated from the Haemophilus aegyptius bacteria. The enzyme's recognition site—the place where it cuts DNA molecules—is the GGCC nucleotide sequence which means it cleaves DNA at the site 5′-GG/CC-3. The recognition site is usually around 4-8 bps.This enzyme's gene has been sequenced and cloned. This is done to make DNA fragments in blunt ends. HaeIII is not effective for single stranded DNA cleavage. (en)
  • HaeIII es una enzima de restricción de tipo II (EC 3.1.21.4)​ producida por el microorganismo que posee una diana de restricción en el ADN de cadena doble dependiente de una secuencia no metilada, palindrómica y no escalonada, sobre la cual su actividad catalítica hidrolasa genera extremos romos. La diana de restricción puede representarse según este diagrama: (es)
  • HaeIII är ett restriktionsenzym som finns i Haemophilus aegyptius. Dess funktion är att klyva DNA-strängar vid sekvensen GGCC. Den klyver rakt av vilket kallas , tvärt emot klistriga ändar. (sv)
  • Das Enzym HaeIII gehört zu den Restriktionsendonukleasen und ist in der Lage DNA an spezifischen Stellen zu schneiden. HaeIII ist ein TypII-Restriktionsenzym und ist das dritte aus dem Bakterium Haemophilus aegyptius isolierte Restriktionsenzym. Das codierende Gen wurde sequenziert und kloniert, wodurch es für viele Anwendungen in der Molekularbiologie genutzt werden kann. Die molare Masse des Enzyms beträgt 37.126 Da. Wie viele andere Restriktionsenzyme bindet HaeIII an Stellen der DNA, die eine bestimmte Nukleotid-Sequenz aufweisen. (de)
  • HaeIII – endonukleaza wyizolowana po raz pierwszy ze szczepu Haemophilus aegyptius, o masie cząsteczkowej 37 126 Da, wykazująca aktywność star. W biologii molekularnej enzym HaeIII jest używany jako restrykcyjny. Przy cięciu DNA tnie on obie nici w dokładnie przeciwległych miejscach i tworzy (czyli nie końce lepkie). Sekwencją rozpoznawaną i ciętą przez enzym jest sekwencja palindromowa 5'-GG▼CC-3' ( 3'-CC▲GG-5'). Metylacja drugiej guaniny w sekwencji (GGm5CC) chroni DNA przed cięciem, natomiast efektu tego nie ma metylacja cytozyny (GGCm5C). (pl)
rdfs:label
  • HaeIII (de)
  • HaeIII (es)
  • HaeIII (en)
  • HaeIII (pl)
  • HaeIII (sv)
owl:sameAs
prov:wasDerivedFrom
foaf:depiction
foaf:isPrimaryTopicOf
is dbo:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of
Powered by OpenLink Virtuoso    This material is Open Knowledge     W3C Semantic Web Technology     This material is Open Knowledge    Valid XHTML + RDFa
This content was extracted from Wikipedia and is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License