About: GENCODE

An Entity of Type: Band, from Named Graph: http://dbpedia.org, within Data Space: dbpedia.org

GENCODE is a scientific project in genome research and part of the ENCODE (ENCyclopedia Of DNA Elements) scale-up project. The GENCODE consortium was initially formed as part of the pilot phase of the ENCODE project to identify and map all protein-coding genes within the ENCODE regions (approx. 1% of Human genome). Given the initial success of the project, GENCODE now aims to build an “Encyclopedia of genes and genes variants”.

Property Value
dbo:abstract
  • GENCODE es un proyecto científico de investigación de genomas que forma parte de la plataforma ENCODE (del inglés ENCyclopedia Of DNA Elements). El consorcio GENCODE se creó inicialmente como una parte de la fase piloto del proyecto ENCODE, para identificar y mapear todos los genes codificantes de proteínas de las regiones ENCODE (aproximadamente un 1% del genoma humano). ​ Tras el éxito obtenido en esta primera fase, GENCODE pretende crear ahora una “Enciclopedia de genes y variantes genéticas” identificando todas las características genéticas del genoma humano y de ratón, mediante una combinación de análisis computacional, anotación manual y validación experimental. También tiene como objetivo anotar todas las características de los genes de todo el genoma humano con la máxima precisión posible. ​ El resultado será una recopilación de anotaciones, que incluirá todos los loci que codifican para proteínas con variantes transcritas alternativamente,​ loci no codificantes ​ con tránscritos encontrados y pseudogenes. ​ Los genes de GENCODE se utilizan como genes de referencia en todo el consorcio ENCODE, además de en otros muchos proyectos, como es el caso de: el Human Cell Atlas (HCA), Genotype-Tissue Expression (GTEx), The Cancer Genome Atlas (TCGA), International Cancer Genome Consortium (ICGC), NIH Roadmap Epigenomics Mapping Consortium, Blueprint Epigenome Project, Exome Aggregation Consortium (EXAC), Genome Aggregation Database (gnomAD) y 1000 Genomes Project. ​ (es)
  • GENCODE is a scientific project in genome research and part of the ENCODE (ENCyclopedia Of DNA Elements) scale-up project. The GENCODE consortium was initially formed as part of the pilot phase of the ENCODE project to identify and map all protein-coding genes within the ENCODE regions (approx. 1% of Human genome). Given the initial success of the project, GENCODE now aims to build an “Encyclopedia of genes and genes variants”. The result will be a set of annotations including all protein-coding loci with alternatively transcribed variants, non-coding loci with transcript evidence, and pseudogenes. (en)
  • GENCODE — проект геномных исследований, являющийся составной частью проекта «Энциклопедия элементов ДНК» (ENCODE). GENCODE был создан в рамках пилотной фазы проекта ENCODE с целью определить и картировать все белок-кодирующие гены из библиотеки ENCODE. Сейчас проект нацелен на создание энциклопедии генов и их вариантов с полным описанием их структурных характеристик в геномах человека и мыши с помощью методов вычислительного анализа, ручной аннотации и экспериментальной проверки. Конечная цель проекта — создание базы аннотаций, включающей все белок-кодирующие локусы с альтернативными транскриптами, некодирующие локусы с обнаруженными транскриптами и псевдогены. (ru)
  • GENCODE — проект геномних досліджень, що є складовою частиною проекту «Енциклопедія елементів ДНК» (ENCODE). (uk)
dbo:thumbnail
dbo:title
  • GENCODE (en)
dbo:wikiPageExternalLink
dbo:wikiPageID
  • 23167397 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength
  • 33673 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID
  • 1113676831 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink
dbp:author
  • Harrow J, et al (en)
dbp:center
dbp:description
  • Encyclopædia of genes and gene variants (en)
dbp:frequency
  • Human - Quarterly (en)
  • Mouse - Half yearly (en)
dbp:license
  • Open Access (en)
dbp:pmid
  • 22955987 (xsd:integer)
dbp:scope
  • All gene features in Human & mouse genome (en)
dbp:title
  • GENCODE (en)
dbp:url
dbp:version
  • Human - Release 37 (en)
  • Mouse - Release M26 (en)
dbp:wikiPageUsesTemplate
dc:description
  • Encyclopædia of genes and gene variants
dcterms:subject
gold:hypernym
rdf:type
rdfs:comment
  • GENCODE — проект геномних досліджень, що є складовою частиною проекту «Енциклопедія елементів ДНК» (ENCODE). (uk)
  • GENCODE is a scientific project in genome research and part of the ENCODE (ENCyclopedia Of DNA Elements) scale-up project. The GENCODE consortium was initially formed as part of the pilot phase of the ENCODE project to identify and map all protein-coding genes within the ENCODE regions (approx. 1% of Human genome). Given the initial success of the project, GENCODE now aims to build an “Encyclopedia of genes and genes variants”. (en)
  • GENCODE es un proyecto científico de investigación de genomas que forma parte de la plataforma ENCODE (del inglés ENCyclopedia Of DNA Elements). El consorcio GENCODE se creó inicialmente como una parte de la fase piloto del proyecto ENCODE, para identificar y mapear todos los genes codificantes de proteínas de las regiones ENCODE (aproximadamente un 1% del genoma humano). ​ (es)
  • GENCODE — проект геномных исследований, являющийся составной частью проекта «Энциклопедия элементов ДНК» (ENCODE). GENCODE был создан в рамках пилотной фазы проекта ENCODE с целью определить и картировать все белок-кодирующие гены из библиотеки ENCODE. Сейчас проект нацелен на создание энциклопедии генов и их вариантов с полным описанием их структурных характеристик в геномах человека и мыши с помощью методов вычислительного анализа, ручной аннотации и экспериментальной проверки. (ru)
rdfs:label
  • GENCODE (en)
  • GENCODE (es)
  • GENCODE (ru)
  • GENCODE (uk)
owl:sameAs
prov:wasDerivedFrom
foaf:depiction
foaf:homepage
foaf:isPrimaryTopicOf
is dbo:knownFor of
is dbo:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of
Powered by OpenLink Virtuoso    This material is Open Knowledge     W3C Semantic Web Technology     This material is Open Knowledge    Valid XHTML + RDFa
This content was extracted from Wikipedia and is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License