| dbo:abstract
|
- Diethyldicarbonat, auch Diethylpyrocarbonat (DEPC), ist ein Ester der (Pyrocarbonat, Dicarbonat). (de)
- Diethyl pyrocarbonate (DEPC), also called diethyl dicarbonate (IUPAC name), is used in the laboratory to inactivate RNase enzymes in water and on laboratory utensils. It does so by the covalent modification of histidine (most strongly), lysine, cysteine, and tyrosine residues. DEPC-treated (and therefore RNase-free) water is used in handling of RNA in the laboratory to reduce the risk of RNA being degraded by RNases. Water is usually treated with 0.1% v/v DEPC for at least 2 hours at 37 °C and then autoclaved (at least 15 min) to inactivate traces of DEPC. Inactivation of DEPC in this manner yields CO2 and ethanol. Higher concentrations of DEPC are capable of deactivating larger amounts of RNase, but remaining traces or byproducts may inhibit further biochemical reactions such as in vitro transcription. Furthermore, chemical modification of RNA such as carboxymethylation is possible when traces of DEPC or its byproducts are present, resulting in impaired recovery of intact RNA even after buffer exchange (after precipitation). DEPC is unstable in water and susceptible to hydrolysis to carbon dioxide and ethanol, especially in the presence of a nucleophile. For this reason, DEPC cannot be used with Tris or HEPES buffers. In contrast, it can be used with phosphate-buffered saline or MOPS. A handy rule is that enzymes or chemicals which have active -O:, -N: or -S: cannot be treated with DEPC to become RNase-free, as DEPC reacts with these species. Furthermore, DEPC degradation products can inhibit in vitro transcription. DEPC derivatization of histidines is also used to study the importance of histidyl residues in enzymes. Modification of histidine by DEPC results in carbethoxylated derivates at the N-omega-2 nitrogen of the imidazole ring. DEPC modification of histidines can be reversed by treatment with 0.5 M hydroxylamine at neutral pH. DEPC can also be used for probing the structure of double-stranded DNA. (en)
- Le pyrocarbonate d'éthyle, aussi nommé diéthyl pyrocarbonate, diéthyl dicarbonate ou DEPC, est un composé organique utilisé en biochimie pour sa capacité à réagir spécifiquement avec les acides aminés histidine et, dans une moindre mesure, tyrosine des protéines. (fr)
- Dietil pirokarbonat (DEPC), juga disebut dietil dikarbonat (nama IUPAC), digunakan di laboratorium untuk menonaktifkan enzim RNase di air dan pada peralatan laboratorium. Ia melakukannya dengan modifikasi kovalen residu histidin (paling kuat), lisin, sistein dan tirosin . Air yang diberi perlakuan dengan DEPC (sehingga bebas RNase) digunakan dalam penanganan RNA di laboratorium untuk mengurangi risiko degradasi RNA oleh RNase. Air biasanya diberi perlakuan dengan DEPC 0,1% (v/v) selama sekurang-kurangnya 2 jam pada 37 °C dan kemudian diautoklaf (minimal 15 menit) untuk menonaktifkan sisa DEPC renik. Inaktivasi DEPC dengan cara ini menghasilkan CO2 dan etanol. Konsentrasi DEPC yang lebih tinggi mampu menonaktifkan RNase dalam jumlah yang lebih besar, tetapi jejak atau produk sampingan yang tersisa dapat menghambat reaksi biokimia lebih lanjut seperti translasi in vitro. Selain itu, modifikasi kimia RNA seperti karboksimetilasi mungkin terjadi ketika terdapat jejak DEPC atau produk sampingannya, mengakibatkan gangguan pemulihan RNA secara utuh bahkan setelah pertukaran dapar (pasca presipitasi). DEPC ini tidak stabil dalam air dan rentan terhadap hidrolisis menjadi karbon dioksida dan etanol, terutama dengan adanya nukleofil. Oleh karena alasan ini, DEPC tidak dapat digunakan dengan dapar Tris atau . Sebaliknya, DEPC dapat digunakan dengan (phosphate-buffered saline) atau . Aturan yang berguna adalah bahwa enzim atau bahan kimia yang memiliki -O:, -N: atau -S: aktif tidak dapat diberi perlakuan dengan DEPC untuk menjadikannya bebas RNase, karena DEPC bereaksi dengan spesies ini. Selain itu, produk degradasi DEPC dapat menghambat transkripsi in vitro. DEPC dari histidin juga digunakan untuk mempelajari pentingnya residu histidil dalam enzim. Modifikasi histidin oleh DEPC menghasilkan derivatnya yang terkarbetoksilasi di nitrogen N-omega-2 dari cincin imidazol. Modifikasi DEPC pada histidin dapat dibalik dengan perlakuan menggunakan hidroksilamin 0,5M pada pH netral. DEPC juga dapat digunakan untuk menyelidiki struktur untai ganda DNA. (in)
- ジエチルピロカーボネート（Diethylpyrocarbonate; DEPC）は分子生物学の実験において、RNAを分解する酵素である RNase を失活させるために使う試薬である。RNase を失活させた DEPC 処理水は、研究室において RNA を扱う際に、分解のリスクを避けるためによく用いられる。 この作用は、DEPC が RNase のヒスチジン残基に対して共有結合修飾を行うことによる。そのため、同様に修飾のターゲットとなるTrisやHEPESバッファには DEPC は使えない。PBS、MOPS には使用可能である。簡単な法則として、反応性のある -O:、-N:、-S: といった残基を持つ酵素や化学物質に対しては、DEPC で RNase フリー処理を行うことはできない。 水に含まれる RNase を失活させるには、まず水に対して0.1％量の DEPC を添加し、37℃で一時間以上反応させる。その後121℃のオートクレーブで15分以上処理し、未反応の DEPC を不活性化させる。この方法で DEPC を不活性化（分解）した場合、水・二酸化炭素・エタノールが生じる。DEPC の濃度を上げればより多くの RNase を失活させることができるが、DEPC や分解時の副生成物が残ってしまうと、in vitro 翻訳などその後の実験操作に悪影響を及ぼす。また RNA 自体もカルボキシメチル化などの修飾を受けて有効量が低下してしまうことがあり、これはバッファ交換を行っても回復しない。 DEPC によるヒスチジンの誘導体化は、酵素におけるヒスチジン残基の重要性を確認する目的でも使われる。DEPC によるヒスチジン修飾は、イミダゾール環の窒素に対するエトキシカルボニル化である。この修飾は可逆的であり、中性条件下において0.5Mのヒドロキシルアミンで処理すると戻すことができる。 (ja)
- Il dietilpirocarbonato (DEPC) è usato nei laboratori di biologia molecolare per inattivare le RNAsi eventualmente presenti nell'acqua e sugli strumenti. Agisce legandosi ai residui di istidina, lisina, cisteina e tirosina. L'acqua trattata con DEPC (e quindi esente da RNAsi) riduce il rischio che l'RNA possa venire degradato da tracce di RNAsi durante le operazioni di laboratorio. L'acqua è generalmente trattata con lo 0,1% v/v di DEPC per almeno due ore a 37 °C e quindi passata per almeno 15 minuti in autoclave per eliminare le tracce di DEPC non reagito. Il trattamento in autoclave idrolizza il DEPC in anidride carbonica, acqua ed etanolo. Benché concentrazioni maggiori di DEPC possano eliminare maggiori quantità di RNAsi, non si utilizzano quantità elevate di DEPC perché il DEPC e i suoi sottoprodotti potrebbero successivamente inibire alcune reazioni biochimiche in vitro o promuovere reazioni di carbossimetilazione a danno del campione di RNA. Flaconi di acqua trattata con DEPC Il DEPC è instabile in acqua e subisce idrolisi, soprattutto in presenza di specie nucleofile. Per questo motivo il DEPC non può essere usato con i tamponi Tris e HEPES. Può invece essere usato con tamponi fosfato salini e . Una regola mnemonica è che non è possibile eliminare le RNAsi con DEPC da enzimi e prodotti chimici aventi atomi di -O:, -N: o -S: attivi, perché il DEPC reagisce prima con queste specie. La reazione di derivatizzazione dei residui di istidina con DEPC è anche usata per studiare il ruolo dei residui di istidina negli enzimi. La reazione dell'istidina con DEPC produce derivati carbossietilati all'azoto imidazolico. Queste reazioni sono reversibili per trattamento con idrossilammina 0,5 M a pH neutro. (it)
- Диэтилпирокарбонат (DEPC) — химическое соединение. Является ингибитором рибонуклеаз, благодаря чему используется в препаративной биохимии. С его помощью обрабатывают инструменты и материалы, используемые для выделения рибонуклеиновой кислоты. Обработка воды с помощью диэтилпирокарбоната происходит следующим образом. Раствор реагента 0,1 % об. выдерживается не менее часа при 37 °C, после чего автоклавируется не менее 15 минут для дезактивации следов DEPC. При этом DEPC гидролизуется с образованием этанола и CO2. (ru)
- Діети́лпірокарбона́т (ДЕПК, DEPC) — хімічна сполука, естер . Використовується в молекулярній біології як інгібітор рибонуклеаз — ферментів, що руйнують РНК. Розчином діетилпірокарбонату оброблюють прилади та матеріали, які безпосередньо контактують з розчинами РНК. (uk)
- Dicarbonato de dietila, também chamado pirocarbonato de dietila (abreviado DEPC, do inglês diethylpyrocarbonate), oxidiformato de dietila, anidrido etoxifórmico ou éster dietílico do ácido pirocarbônico, é usado em laboratório para inativar enzimas RNase em água e em utensílios laboratoriais. (pt)
- 焦碳酸二乙酯（英語：Diethyl pyrocarbonate, DEPC），分子式C6H10O5，在生物实验室中被用来灭活水和实验用具上的核糖核酸酶。其原理是共价修饰組氨酸（最强）、赖氨酸、半胱氨酸和酪氨酸残基。水一般用0.1%DEPC在37°C下处理至少2小时，然后灭菌至少15分钟以灭活残留的DEPC。 (zh)
|
| dbo:iupacName
| |
| dbo:thumbnail
| |
| dbo:wikiPageExternalLink
| |
| dbo:wikiPageID
| |
| dbo:wikiPageLength
|
- 5299 (xsd:nonNegativeInteger)
|
| dbo:wikiPageRevisionID
| |
| dbo:wikiPageWikiLink
| |
| dbp:imagefile
|
- Diethyl pyrocarbonate.svg (en)
- Diethyl pyrocarbonate3d.png (en)
|
| dbp:pin
| |
| dbp:verifiedrevid
| |
| dbp:watchedfields
| |
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| dcterms:subject
| |
| rdf:type
| |
| rdfs:comment
|
- Diethyldicarbonat, auch Diethylpyrocarbonat (DEPC), ist ein Ester der (Pyrocarbonat, Dicarbonat). (de)
- Le pyrocarbonate d'éthyle, aussi nommé diéthyl pyrocarbonate, diéthyl dicarbonate ou DEPC, est un composé organique utilisé en biochimie pour sa capacité à réagir spécifiquement avec les acides aminés histidine et, dans une moindre mesure, tyrosine des protéines. (fr)
- Диэтилпирокарбонат (DEPC) — химическое соединение. Является ингибитором рибонуклеаз, благодаря чему используется в препаративной биохимии. С его помощью обрабатывают инструменты и материалы, используемые для выделения рибонуклеиновой кислоты. Обработка воды с помощью диэтилпирокарбоната происходит следующим образом. Раствор реагента 0,1 % об. выдерживается не менее часа при 37 °C, после чего автоклавируется не менее 15 минут для дезактивации следов DEPC. При этом DEPC гидролизуется с образованием этанола и CO2. (ru)
- Діети́лпірокарбона́т (ДЕПК, DEPC) — хімічна сполука, естер . Використовується в молекулярній біології як інгібітор рибонуклеаз — ферментів, що руйнують РНК. Розчином діетилпірокарбонату оброблюють прилади та матеріали, які безпосередньо контактують з розчинами РНК. (uk)
- Dicarbonato de dietila, também chamado pirocarbonato de dietila (abreviado DEPC, do inglês diethylpyrocarbonate), oxidiformato de dietila, anidrido etoxifórmico ou éster dietílico do ácido pirocarbônico, é usado em laboratório para inativar enzimas RNase em água e em utensílios laboratoriais. (pt)
- 焦碳酸二乙酯（英語：Diethyl pyrocarbonate, DEPC），分子式C6H10O5，在生物实验室中被用来灭活水和实验用具上的核糖核酸酶。其原理是共价修饰組氨酸（最强）、赖氨酸、半胱氨酸和酪氨酸残基。水一般用0.1%DEPC在37°C下处理至少2小时，然后灭菌至少15分钟以灭活残留的DEPC。 (zh)
- Diethyl pyrocarbonate (DEPC), also called diethyl dicarbonate (IUPAC name), is used in the laboratory to inactivate RNase enzymes in water and on laboratory utensils. It does so by the covalent modification of histidine (most strongly), lysine, cysteine, and tyrosine residues. DEPC-treated (and therefore RNase-free) water is used in handling of RNA in the laboratory to reduce the risk of RNA being degraded by RNases. DEPC can also be used for probing the structure of double-stranded DNA. (en)
- Dietil pirokarbonat (DEPC), juga disebut dietil dikarbonat (nama IUPAC), digunakan di laboratorium untuk menonaktifkan enzim RNase di air dan pada peralatan laboratorium. Ia melakukannya dengan modifikasi kovalen residu histidin (paling kuat), lisin, sistein dan tirosin . Air yang diberi perlakuan dengan DEPC (sehingga bebas RNase) digunakan dalam penanganan RNA di laboratorium untuk mengurangi risiko degradasi RNA oleh RNase. DEPC juga dapat digunakan untuk menyelidiki struktur untai ganda DNA. (in)
- ジエチルピロカーボネート（Diethylpyrocarbonate; DEPC）は分子生物学の実験において、RNAを分解する酵素である RNase を失活させるために使う試薬である。RNase を失活させた DEPC 処理水は、研究室において RNA を扱う際に、分解のリスクを避けるためによく用いられる。 この作用は、DEPC が RNase のヒスチジン残基に対して共有結合修飾を行うことによる。そのため、同様に修飾のターゲットとなるTrisやHEPESバッファには DEPC は使えない。PBS、MOPS には使用可能である。簡単な法則として、反応性のある -O:、-N:、-S: といった残基を持つ酵素や化学物質に対しては、DEPC で RNase フリー処理を行うことはできない。 DEPC によるヒスチジンの誘導体化は、酵素におけるヒスチジン残基の重要性を確認する目的でも使われる。DEPC によるヒスチジン修飾は、イミダゾール環の窒素に対するエトキシカルボニル化である。この修飾は可逆的であり、中性条件下において0.5Mのヒドロキシルアミンで処理すると戻すことができる。 (ja)
- Il dietilpirocarbonato (DEPC) è usato nei laboratori di biologia molecolare per inattivare le RNAsi eventualmente presenti nell'acqua e sugli strumenti. Agisce legandosi ai residui di istidina, lisina, cisteina e tirosina. L'acqua trattata con DEPC (e quindi esente da RNAsi) riduce il rischio che l'RNA possa venire degradato da tracce di RNAsi durante le operazioni di laboratorio. Flaconi di acqua trattata con DEPC (it)
|
| rdfs:label
|
- Diethyldicarbonat (de)
- Diethyl pyrocarbonate (en)
- Pyrocarbonate d'éthyle (fr)
- Dietil pirokarbonat (in)
- Dietilpirocarbonato (it)
- ジエチルピロカーボネート (ja)
- Dicarbonato de dietila (pt)
- Диэтилпирокарбонат (ru)
- 焦碳酸二乙酯 (zh)
- Діетилпірокарбонат (uk)
|
| owl:sameAs
| |
| prov:wasDerivedFrom
| |
| foaf:depiction
| |
| foaf:isPrimaryTopicOf
| |
| is dbo:wikiPageRedirects
of | |
| is dbo:wikiPageWikiLink
of | |
| is foaf:primaryTopic
of | |
