About: Cytoscape

An Entity of Type: company, from Named Graph: http://dbpedia.org, within Data Space: dbpedia.org

Cytoscape is an open source bioinformatics software platform for visualizing molecular interaction networks and integrating with gene expression profiles and other state data. Additional features are available as plugins. Plugins are available for network and molecular profiling analyses, new layouts, additional file format support and connection with databases and searching in large networks. Plugins may be developed using the Cytoscape open Java software architecture by anyone and plugin community development is encouraged. Cytoscape also has a JavaScript-centric sister project named Cytoscape.js that can be used to analyse and visualise graphs in JavaScript environments, like a browser.

Property Value
dbo:abstract
  • Το Cytoscape είναι πλατφόρμα λογισμικού βιοπληροφορικής η οποία κατασκευάστηκε τον Ιούλιο του 2002 για την απεικόνιση και ανάλυση δικτύων μοριακής αλληλεπίδρασης, χρησιμοποιώντας δεδομένα που έχουν προκύψει από πειράματα υψηλής απόδοσης (high-throughput expression data). Πρόσθετες λειτουργίες είναι διαθέσιμες ως plug-ins. Τα plug-ins είναι διαθέσιμα για ανάλυση και σύγκριση δικτύων και μοριακών προφίλ, ομαδοποίηση γράφων, ανάλυση προφιλ γονιδιακής έκφρασης, εντοπισμό συμπλόκων, αναγνώριση μοτίβων σε δίκτυα, νέες διατάξεις, πρόσθετη υποστήριξη μορφής και σύνδεσης αρχείων με βάσεις δεδομένων και αναζήτηση σε μεγάλα πρωτεϊνικά δίκτυα. Τα plug-ins μπορούν να αναπτυχθούν χρησιμοποιώντας το λογισμικό του Cytoscape με αρχιτεκτονική Java . Το Cytoscape διαθέτει επίσης ένα συγγενικό πρόγραμμα με όνομα Cytoscape.js το οποίο μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την ανάλυση και την απεικόνιση γραφημάτων σε περιβάλλοντα JavaScript, όπως ένα πρόγραμμα περιήγησης. (el)
  • Cytoscape is an open source bioinformatics software platform for visualizing molecular interaction networks and integrating with gene expression profiles and other state data. Additional features are available as plugins. Plugins are available for network and molecular profiling analyses, new layouts, additional file format support and connection with databases and searching in large networks. Plugins may be developed using the Cytoscape open Java software architecture by anyone and plugin community development is encouraged. Cytoscape also has a JavaScript-centric sister project named Cytoscape.js that can be used to analyse and visualise graphs in JavaScript environments, like a browser. (en)
  • Cytoscape est un logiciel libre utilisé en bioinformatique pour la visualisation de réseaux d'interaction moléculaire. Plus généralement, il permet l'analyse et la visualisation des réseaux complexes. (fr)
  • Cytoscape è un programma libero (disponibile sotto licenza GPL) utilizzato in bioinformatica per la visualizzazione delle reti di interazione molecolare. Molte caratteristiche aggiuntive sono rese disponibili mediante una serie di plugin. Vi sono plugin per la profilatura delle reti molecolari, per nuovi layout, per il supporto di file aggiuntivi e per la connessione con i Database. Ulteriori plugin possono essere sviluppati utilizzando l'architettura Cytoscape open Java e la realizzazione di nuovi plugin è incoraggiata. (it)
  • Cytoscapeは代謝経路網の可視化や遺伝子発現プロフィールと関連データの統合などに用いられるオープンソースのバイオインフォマティクスソフトウェアプラットフォームである。プラグインにより機能が追加でき、ネットワークや分子プロファイリング分析、レイアウトの変更、新規ファイル形式のサポートや外部ネットワークへの検索が利用可能になる。プラグインはコミュニティにより開発されており、利用者のコミュニティへの参加や新規プラグインの開発が奨励されている。Ver3.0以降については、モジュール化、拡張性、保守性を重視した開発が続けられている。 (ja)
  • Cytoscape ([ˌsaɪtə(u)'skeɪp], сайтоскейп, в русском биоинформатическом сленге — цитоскейп) — биоинформатическая платформа с открытым исходным кодом, предназначенная для визуализации сетей молекулярных взаимодействий и биологических путей с возможностью использования дополнительных данных, таких как функциональная аннотация, информация об уровне экспрессии генов и прочих. Несмотря на то, что исходно Cytoscape был разработан для биологических исследований, сейчас он широко используется для решения различных задач по анализу сетей и их визуализации. (ru)
dbo:author
dbo:developer
dbo:genre
dbo:latestReleaseDate
  • 2020-10-29 (xsd:date)
dbo:latestReleaseVersion
  • 3.8.2
dbo:license
dbo:operatingSystem
dbo:programmingLanguage
dbo:thumbnail
dbo:wikiPageExternalLink
dbo:wikiPageID
  • 10921962 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength
  • 8686 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID
  • 1117968151 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink
dbp:author
dbp:caption
  • Cytoscape home page (en)
dbp:developer
dbp:genre
dbp:latestReleaseDate
  • 2020-10-29 (xsd:date)
dbp:latestReleaseVersion
  • 3.800000 (xsd:double)
dbp:license
dbp:name
  • Cytoscape (en)
dbp:operatingSystem
  • Any (en)
dbp:programmingLanguage
dbp:released
  • July 2002 (en)
dbp:screenshot
  • CytoscapeHome.png (en)
dbp:screenshotSize
  • 200 (xsd:integer)
dbp:website
dbp:wikiPageUsesTemplate
dbp:wordnet_type
dcterms:subject
gold:hypernym
rdf:type
rdfs:comment
  • Cytoscape is an open source bioinformatics software platform for visualizing molecular interaction networks and integrating with gene expression profiles and other state data. Additional features are available as plugins. Plugins are available for network and molecular profiling analyses, new layouts, additional file format support and connection with databases and searching in large networks. Plugins may be developed using the Cytoscape open Java software architecture by anyone and plugin community development is encouraged. Cytoscape also has a JavaScript-centric sister project named Cytoscape.js that can be used to analyse and visualise graphs in JavaScript environments, like a browser. (en)
  • Cytoscape est un logiciel libre utilisé en bioinformatique pour la visualisation de réseaux d'interaction moléculaire. Plus généralement, il permet l'analyse et la visualisation des réseaux complexes. (fr)
  • Cytoscape è un programma libero (disponibile sotto licenza GPL) utilizzato in bioinformatica per la visualizzazione delle reti di interazione molecolare. Molte caratteristiche aggiuntive sono rese disponibili mediante una serie di plugin. Vi sono plugin per la profilatura delle reti molecolari, per nuovi layout, per il supporto di file aggiuntivi e per la connessione con i Database. Ulteriori plugin possono essere sviluppati utilizzando l'architettura Cytoscape open Java e la realizzazione di nuovi plugin è incoraggiata. (it)
  • Cytoscapeは代謝経路網の可視化や遺伝子発現プロフィールと関連データの統合などに用いられるオープンソースのバイオインフォマティクスソフトウェアプラットフォームである。プラグインにより機能が追加でき、ネットワークや分子プロファイリング分析、レイアウトの変更、新規ファイル形式のサポートや外部ネットワークへの検索が利用可能になる。プラグインはコミュニティにより開発されており、利用者のコミュニティへの参加や新規プラグインの開発が奨励されている。Ver3.0以降については、モジュール化、拡張性、保守性を重視した開発が続けられている。 (ja)
  • Cytoscape ([ˌsaɪtə(u)'skeɪp], сайтоскейп, в русском биоинформатическом сленге — цитоскейп) — биоинформатическая платформа с открытым исходным кодом, предназначенная для визуализации сетей молекулярных взаимодействий и биологических путей с возможностью использования дополнительных данных, таких как функциональная аннотация, информация об уровне экспрессии генов и прочих. Несмотря на то, что исходно Cytoscape был разработан для биологических исследований, сейчас он широко используется для решения различных задач по анализу сетей и их визуализации. (ru)
  • Το Cytoscape είναι πλατφόρμα λογισμικού βιοπληροφορικής η οποία κατασκευάστηκε τον Ιούλιο του 2002 για την απεικόνιση και ανάλυση δικτύων μοριακής αλληλεπίδρασης, χρησιμοποιώντας δεδομένα που έχουν προκύψει από πειράματα υψηλής απόδοσης (high-throughput expression data). Πρόσθετες λειτουργίες είναι διαθέσιμες ως plug-ins. Τα plug-ins είναι διαθέσιμα για ανάλυση και σύγκριση δικτύων και μοριακών προφίλ, ομαδοποίηση γράφων, ανάλυση προφιλ γονιδιακής έκφρασης, εντοπισμό συμπλόκων, αναγνώριση μοτίβων σε δίκτυα, νέες διατάξεις, πρόσθετη υποστήριξη μορφής και σύνδεσης αρχείων με βάσεις δεδομένων και αναζήτηση σε μεγάλα πρωτεϊνικά δίκτυα. Τα plug-ins μπορούν να αναπτυχθούν χρησιμοποιώντας το λογισμικό του Cytoscape με αρχιτεκτονική Java . (el)
rdfs:label
  • Cytoscape (en)
  • Cytoscape (el)
  • Cytoscape (fr)
  • Cytoscape (it)
  • Cytoscape (ja)
  • Cytoscape (ru)
owl:sameAs
prov:wasDerivedFrom
foaf:depiction
foaf:homepage
foaf:isPrimaryTopicOf
foaf:name
  • Cytoscape (en)
is dbo:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of
Powered by OpenLink Virtuoso    This material is Open Knowledge     W3C Semantic Web Technology     This material is Open Knowledge    Valid XHTML + RDFa
This content was extracted from Wikipedia and is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License