About: Systematic evolution of ligands by exponential enrichment     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : yago:TradeName106845599, within Data Space : dbpedia.org associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.org/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FSystematic_evolution_of_ligands_by_exponential_enrichment

Systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX), also referred to as in vitro selection or in vitro evolution, is a combinatorial chemistry technique in molecular biology for producing oligonucleotides of either single-stranded DNA or RNA that specifically bind to a target ligand or ligands. These single-stranded DNA or RNA are commonly referred to as aptamers. Although SELEX has emerged as the most commonly used name for the procedure, some researchers have referred to it as SAAB (selected and amplified binding site) and CASTing (cyclic amplification and selection of targets) SELEX was first introduced in 1990. In 2015, a special issue was published in the Journal of Molecular Evolution in the honor of quarter century of the discovery of SELEX.

AttributesValues
rdf:type
rdfs:label
  • تطور منظومي للربائط بواسطة الاغناء المطرد (ar)
  • SELEX (de)
  • Évolution systématique de ligands par enrichissement exponentiel (fr)
  • Evolução Sistemática de Ligantes por Enriquecimento Exponencial (pt)
  • Systematic evolution of ligands by exponential enrichment (en)
  • Систематическая эволюция лигандов экспоненциальным обогащением (ru)
  • SELEX (zh)
rdfs:comment
  • التطور المنظومي للربائط بواسطة الاغناء المطرد (بالإنجليزية: Systematic evolution of ligands by exponential enrichment)‏ واختصارا (سيليكس|SELEX) وتسمى كذلك بالاختيار الصناعي أو التطور الصناعي، هي تقنيةُ كيمياء توافقية في علم الأحياء الجزيئي لإنتاج قليلاتِ نوكليوتيدِ دنا أو رنا منفردة السلاسل والتي ترتبط بربيطة محددة أو عدة ربائط. رغم أن سيليكس يعتبر الاسم الأكثر شيوعا للإجراء، إلا أن بعض الباحثين يشيرون إله بـ (سآب-SAAB) (موقع الارتباط المختار والمضخم-selected and amplified binding site) وكذلك (كاستينغ-CASTing) (التضخيم الحلقي والاختياري للأهداف-cyclic amplification and selection of targets) تم تعريف الإجراء أول مرة سنة 1990 وفي سنة 2015 نُشرت نسخة خاصة من مجلة التطور الجزيئي بمناسبة مرور ربع قرن على الاكتشاف. (ar)
  • Unter dem Akronym SELEX (engl.: Systematic Evolution of Ligands by EXponential Enrichment, zu deutsch: Systematische Evolution von Liganden durch exponentielle Anreicherung) versteht man in der Molekularbiologie ein kombinatorisches Verfahren zur gerichteten Evolution von Oligonukleotid-Strängen, beispielsweise oder RNA. Diese können als Liganden spezifisch an ausgewählte Targets binden. (de)
  • La méthode Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment (SELEX), en français évolution systématique de ligands par enrichissement exponentiel, est une méthode de sélection in vitro, à partir de banques combinatoires d'oligonucléotides synthétiques. Les oligonucléotides sélectionnés sont capables de fixer sélectivement un ligand donné, avec une affinité élevée et spécifique. Initialement mise au point avec des ARN, cette technique a ensuite été généralisée aux oligonucléotides ADN. (fr)
  • SELEX是一種分子生物學試驗,用来找出和配體最親和的核酸序列。隨機核酸序列庫通過生物化學方法產生,序列庫和配體反應,然後通過免疫學方法分離出配體,清洁未和配體結合的核酸序列,然後再將結合了的核酸序列用聚合酵素鏈式反應複製数百萬倍,再選擇多次,和配體最親和既核酸序列就會產生。 (zh)
  • Systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX), also referred to as in vitro selection or in vitro evolution, is a combinatorial chemistry technique in molecular biology for producing oligonucleotides of either single-stranded DNA or RNA that specifically bind to a target ligand or ligands. These single-stranded DNA or RNA are commonly referred to as aptamers. Although SELEX has emerged as the most commonly used name for the procedure, some researchers have referred to it as SAAB (selected and amplified binding site) and CASTing (cyclic amplification and selection of targets) SELEX was first introduced in 1990. In 2015, a special issue was published in the Journal of Molecular Evolution in the honor of quarter century of the discovery of SELEX. (en)
  • Evolução Sistemática de Ligantes por Enriquecimento Exponencial (SELEX - Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment, em inglês) também conhecido por seleção in vitro ou evolução in vitro, é uma técnica de combinação química na biologia molecular para a produção de oligonucleotídios de DNA ou RNA de cadeia única que se ligam especificamente com um ligante ou ligantes alvo. Embora SELEX apareça como o nome mais usado geralmente para o procedimento, alguns pesquisadores têm referido ao procedimento como SAAB (área de ligação selecionada e amplificada) e CASTing (seleção e amplificação cíclica de alvos). (pt)
  • Системати́ческая эволю́ция лига́ндов экспоненциа́льным обогаще́нием (англ. SELEX от Systematic Evolution of Ligands by EXponential Enrichment) — метод комбинаторной химии, используемый в молекулярной биологии для получения олигонуклеотидов (коротких одноцепочечных молекул РНК или ДНК), которые специфически связываются с определённым лигандом (или лигандами). Такие олигонуклеотиды называют аптамерами. Чаще всего этот метод называют SELEX, но встречаются также сокращения SAAB (от англ. selected and amplified binding site — отобранный и амплифицированный сайт связывания) и CASTing (от англ. cyclic amplification and selection of targets — циклическая амплификация и отбор мишеней). SELEX был разработан в 1990 году. В 2015 году журнал посвятил этому методу специальный выпуск в связи с 25-летием (ru)
foaf:depiction
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Aptamer_biotin.png
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/SELEX_schematic.png
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
Link from a Wikipage to an external page
sameAs
dbp:wikiPageUsesTemplate
thumbnail
has abstract
  • التطور المنظومي للربائط بواسطة الاغناء المطرد (بالإنجليزية: Systematic evolution of ligands by exponential enrichment)‏ واختصارا (سيليكس|SELEX) وتسمى كذلك بالاختيار الصناعي أو التطور الصناعي، هي تقنيةُ كيمياء توافقية في علم الأحياء الجزيئي لإنتاج قليلاتِ نوكليوتيدِ دنا أو رنا منفردة السلاسل والتي ترتبط بربيطة محددة أو عدة ربائط. رغم أن سيليكس يعتبر الاسم الأكثر شيوعا للإجراء، إلا أن بعض الباحثين يشيرون إله بـ (سآب-SAAB) (موقع الارتباط المختار والمضخم-selected and amplified binding site) وكذلك (كاستينغ-CASTing) (التضخيم الحلقي والاختياري للأهداف-cyclic amplification and selection of targets) تم تعريف الإجراء أول مرة سنة 1990 وفي سنة 2015 نُشرت نسخة خاصة من مجلة التطور الجزيئي بمناسبة مرور ربع قرن على الاكتشاف. (ar)
  • Unter dem Akronym SELEX (engl.: Systematic Evolution of Ligands by EXponential Enrichment, zu deutsch: Systematische Evolution von Liganden durch exponentielle Anreicherung) versteht man in der Molekularbiologie ein kombinatorisches Verfahren zur gerichteten Evolution von Oligonukleotid-Strängen, beispielsweise oder RNA. Diese können als Liganden spezifisch an ausgewählte Targets binden. (de)
  • La méthode Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment (SELEX), en français évolution systématique de ligands par enrichissement exponentiel, est une méthode de sélection in vitro, à partir de banques combinatoires d'oligonucléotides synthétiques. Les oligonucléotides sélectionnés sont capables de fixer sélectivement un ligand donné, avec une affinité élevée et spécifique. Initialement mise au point avec des ARN, cette technique a ensuite été généralisée aux oligonucléotides ADN. (fr)
  • Systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX), also referred to as in vitro selection or in vitro evolution, is a combinatorial chemistry technique in molecular biology for producing oligonucleotides of either single-stranded DNA or RNA that specifically bind to a target ligand or ligands. These single-stranded DNA or RNA are commonly referred to as aptamers. Although SELEX has emerged as the most commonly used name for the procedure, some researchers have referred to it as SAAB (selected and amplified binding site) and CASTing (cyclic amplification and selection of targets) SELEX was first introduced in 1990. In 2015, a special issue was published in the Journal of Molecular Evolution in the honor of quarter century of the discovery of SELEX. The process begins with the synthesis of a very large oligonucleotide library, consisting of randomly generated sequences of fixed length flanked by constant 5' and 3' ends. The constant ends serve as primers, while a small number of random regions are expected to bind specifically to the chosen target. For a randomly generated region of length n, the number of possible sequences in the library using conventional DNA or RNA is 4n (n positions with four possibilities (A,T,C,G) at each position). The sequences in the library are exposed to the target ligand - which may be a protein or a small organic compound - and those that do not bind the target are removed, usually by affinity chromatography or target capture on paramagnetic beads. The bound sequences are eluted and amplified by PCR to prepare for subsequent rounds of selection in which the stringency of the elution conditions can be increased to identify the tightest-binding sequences. A caution to consider in this method is that the selection of extremely high, sub-nanomolar binding affinity entities may not in fact improve specificity for the target molecule. Off-target binding to related molecules could have significant clinical effects. SELEX has been used to develop a number of aptamers that bind targets interesting for both clinical and research purposes. Nucleotides with chemically modified sugars and bases have been incorporated into SELEX reactions to increase the chemical diversity at each base, expanding the possibilities for specific and sensitive binding, or increasing stability in serum or in vivo. (en)
  • Evolução Sistemática de Ligantes por Enriquecimento Exponencial (SELEX - Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment, em inglês) também conhecido por seleção in vitro ou evolução in vitro, é uma técnica de combinação química na biologia molecular para a produção de oligonucleotídios de DNA ou RNA de cadeia única que se ligam especificamente com um ligante ou ligantes alvo. Embora SELEX apareça como o nome mais usado geralmente para o procedimento, alguns pesquisadores têm referido ao procedimento como SAAB (área de ligação selecionada e amplificada) e CASTing (seleção e amplificação cíclica de alvos). O processo começa com a síntese de uma enorme biblioteca de oligonucleotídios consistindo de sequências geradas aleatoriamente de comprimento fixo cercado por extremidades 5' e 3' que servem como iniciadores. Para uma região aleatória de comprimento n, o número de sequências possíveis na biblioteca é 4ⁿ (n posições com 4 possibilidades (A,T,C,G) em cada posição). As sequências na biblioteca são expostas para o ligante alvo - o qual pode ser uma proteína ou um pequeno componente orgânico - e aqueles que não se ligam ao alvo são removidos, normalmente por cromatografia de afinidade. As sequências ligadas são decantadas e amplificadas por RCP para serem preparadas para as etapas subsequentes da seleção, em que a rigidez das condições da decantação são aumentadas para identificar as sequências de mais ligações mais fortes. Um avanço no método original permite uma biblioteca de RNA omitir as regiões constantes de iniciadores, as quais podem ser difícil de remover após o processo de seleção porque elas estabilizam estruturas secundárias que são instáveis quando formadas por uma única região aleatória. A técnina tem sido utilizada para evolver aptâmeros de extrema afinidade de ligação com uma variedade de ligantes alvos, incluindo moléculas pequenas como o ATP, a adenosina e proteínas como os príons e VEGF (fator de cerscimento endotelial vascular). Usos clínicos da técnica são recomendados por aptâmetos que se ligam a marcadores de tumor a um ligante-VEGF aptâmero, nomeado comercialmente de Macugen foi aprovado pela FDA para tratamento de degeneração macular. Um cuidado avançado em relação com o método enfatiza que a seleção para ligações de afinidade extrema e sub-nanomolar podem de fato não beneficiar a especificidade para a molécula alvo. Ligações fora do alvo relacionado com moléculas podem ter efeitos clínicos significantes. (pt)
  • Системати́ческая эволю́ция лига́ндов экспоненциа́льным обогаще́нием (англ. SELEX от Systematic Evolution of Ligands by EXponential Enrichment) — метод комбинаторной химии, используемый в молекулярной биологии для получения олигонуклеотидов (коротких одноцепочечных молекул РНК или ДНК), которые специфически связываются с определённым лигандом (или лигандами). Такие олигонуклеотиды называют аптамерами. Чаще всего этот метод называют SELEX, но встречаются также сокращения SAAB (от англ. selected and amplified binding site — отобранный и амплифицированный сайт связывания) и CASTing (от англ. cyclic amplification and selection of targets — циклическая амплификация и отбор мишеней). SELEX был разработан в 1990 году. В 2015 году журнал посвятил этому методу специальный выпуск в связи с 25-летием со времени его изобретения. Процесс начинается с синтеза очень большой олигонуклеотидов, состоящей из случайных последовательностей фиксированной длины с константными 5'- и 3'-участками, которые служат местами отжига праймеров (то есть комплементарного связывания праймеров с матрицей). Далее олигонуклеотиды, входящие в состав библиотеки, взаимодействуют с интересующим исследователя лигандом (чаще всего белком или небольшим органическим соединением). Те олигонуклеотиды, которые не смогли связаться с лигандом, удаляются при помощи аффинной хроматографии или магнитных шариков. Олигонуклеотиды, связавшиеся с лигандом, элюируют, амплифицируют с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) и подвергаются последующим циклам отбора, чтобы отобрать молекулы с наибольшим сродством к лиганду. Метод SELEX уже был успешно использован для разработки ряда аптамеров для клинических и исследовательских целей. С помощью SELEX также были получены аптамеры с нуклеотидами, включающими химически модифицированные сахара или азотистые основания. Модифицированные нуклеотиды могут давать аптамерам дополнительные возможности связывания, а также повышать их стабильность. (ru)
  • SELEX是一種分子生物學試驗,用来找出和配體最親和的核酸序列。隨機核酸序列庫通過生物化學方法產生,序列庫和配體反應,然後通過免疫學方法分離出配體,清洁未和配體結合的核酸序列,然後再將結合了的核酸序列用聚合酵素鏈式反應複製数百萬倍,再選擇多次,和配體最親和既核酸序列就會產生。 (zh)
gold:hypernym
prov:wasDerivedFrom
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3330 as of Mar 19 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (378 GB total memory, 48 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software