In bioinformatics, a sequence logo is a graphical representation of the sequence conservation of nucleotides (in a strand of DNA/RNA) or amino acids (in protein sequences).A sequence logo is created from a collection of aligned sequences and depicts the consensus sequence and diversity of the sequences.Sequence logos are frequently used to depict sequence characteristics such as protein-binding sites in DNA or functional units in proteins.
| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:label
| - Logo de seqüències (ca)
- Logo de secuencias (es)
- Sequence logo (en)
- Логотип последовательностей (ru)
|
| rdfs:comment
| - En bioinformàtica, un logo de seqüències és una representació gràfica del grau de conservació dels nucleòtids en una seqüència d'ADN o ARN, o dels aminoàcids d'una seqüència proteica. Els logos de seqüències es creen a partir d'una col·lecció de seqüències alineades i mostren tant la seqüència consens com la diversitat de les seqüències. Els logos de seqüències freqüentment s'utilitzen per representar característiques de seqüència com llocs d'unió de proteïnes en el DNA o unitats funcionals en proteïnes. (ca)
- In bioinformatics, a sequence logo is a graphical representation of the sequence conservation of nucleotides (in a strand of DNA/RNA) or amino acids (in protein sequences).A sequence logo is created from a collection of aligned sequences and depicts the consensus sequence and diversity of the sequences.Sequence logos are frequently used to depict sequence characteristics such as protein-binding sites in DNA or functional units in proteins. (en)
- Логотип последовательностей (англ. Sequence logo) (в биоинформатике) — метод графического представления консервативности нуклеотидов (в цепи РНК или ДНК) или аминокислот (в белках). Логотип строится по набору выровненных последовательностей. Этот метод позволяет на одном графике отразить следующие характеристики анализируемого участка:
* консенсусную последовательность выравнивания;
* относительные частоты встречаемости элементов в каждой позиции последовательности;
* информационное содержание каждой позиции в последовательности (измеренное в битах);
* наличие специфического локуса. (ru)
- En bioinformática, un logo de secuencias es una representación gráfica de la conservación de una secuencia de nucleótidos (en una cadena de ADN o de ARN), o de aminoácidos (en secuencias de proteínas). Según lo visto, las letras de mayor altura representarán residuos únicos. Además, y por consenso, las bases más conservadas (las de mayor frecuencia de aparición y, por lo tanto, las más probables para esa determinada posición) se representan en la parte más alta de las pilas de residuos y, a la inversa, las menos conservadas irán ocupando, de forma proporcional, las posiciones inferiores. (es)
|
| foaf:depiction
| |
| dcterms:subject
| |
| Wikipage page ID
| |
| Wikipage revision ID
| |
| Link from a Wikipage to another Wikipage
| |
| Link from a Wikipage to an external page
| |
| sameAs
| |
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| thumbnail
| |
| date
| |
| reason
| - where was that used? (en)
|
| has abstract
| - En bioinformàtica, un logo de seqüències és una representació gràfica del grau de conservació dels nucleòtids en una seqüència d'ADN o ARN, o dels aminoàcids d'una seqüència proteica. Els logos de seqüències es creen a partir d'una col·lecció de seqüències alineades i mostren tant la seqüència consens com la diversitat de les seqüències. Els logos de seqüències freqüentment s'utilitzen per representar característiques de seqüència com llocs d'unió de proteïnes en el DNA o unitats funcionals en proteïnes. (ca)
- En bioinformática, un logo de secuencias es una representación gráfica de la conservación de una secuencia de nucleótidos (en una cadena de ADN o de ARN), o de aminoácidos (en secuencias de proteínas). Para crear logos de secuencias, las secuencias relacionadas de ADN, ARN o proteínas, o bien secuencias de ADN que comparten lugares de unión conservados, son alineadas hasta que las partes más conservadas crean buenos alineamientos. Se puede crear entonces un logo de secuencias a partir del alineamiento múltiple de secuencias conservadas. El logo de secuencias pondrá de manifiesto el grado de conservación de los residuos en cada posición: un menor número de residuos diferentes provocará mayor tamaño en las letras, ya que la conservación es mejor en esa posición. Los residuos diferentes en la misma posición se escalarán de acuerdo a su frecuencia. Los logos de secuencias pueden usarse para representar sitios conservados de unión al ADN, donde quedan unidos los factores de transcripción. Según lo visto, las letras de mayor altura representarán residuos únicos. Además, y por consenso, las bases más conservadas (las de mayor frecuencia de aparición y, por lo tanto, las más probables para esa determinada posición) se representan en la parte más alta de las pilas de residuos y, a la inversa, las menos conservadas irán ocupando, de forma proporcional, las posiciones inferiores. (es)
- In bioinformatics, a sequence logo is a graphical representation of the sequence conservation of nucleotides (in a strand of DNA/RNA) or amino acids (in protein sequences).A sequence logo is created from a collection of aligned sequences and depicts the consensus sequence and diversity of the sequences.Sequence logos are frequently used to depict sequence characteristics such as protein-binding sites in DNA or functional units in proteins. (en)
- Логотип последовательностей (англ. Sequence logo) (в биоинформатике) — метод графического представления консервативности нуклеотидов (в цепи РНК или ДНК) или аминокислот (в белках). Логотип строится по набору выровненных последовательностей. Этот метод позволяет на одном графике отразить следующие характеристики анализируемого участка:
* консенсусную последовательность выравнивания;
* относительные частоты встречаемости элементов в каждой позиции последовательности;
* информационное содержание каждой позиции в последовательности (измеренное в битах);
* наличие специфического локуса. (ru)
|
| gold:hypernym
| |
| prov:wasDerivedFrom
| |
| page length (characters) of wiki page
| |
| foaf:isPrimaryTopicOf
| |
| is Link from a Wikipage to another Wikipage
of | |
| is Wikipage redirect
of | |
| is Wikipage disambiguates
of | |
| is foaf:primaryTopic
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)
