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Proteopedia is a wiki, 3D encyclopedia of proteins and other molecules.The site contains a page for every entry in the Protein Data Bank (>130,000 pages), as well as pages that are more descriptive of protein structures in general such as acetylcholinesterase, hemoglobin, and the photosystem II with a Jmol view that highlights functional sites and ligands. It employs a scene-authoring tool so that users do not have to learn JSmol script language to create customized molecular scenes. Custom scenes are easily attached to "green links" in descriptive text that display those scenes in JSmol. A web browser is all that is needed to access the site and the 3D information; no viewers are required to be installed.

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  • بروتيوبيديا
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  • بروتيوبيديا (بالإنجليزية: Proteopedia) هي موسوعة ويكي ثلاثية الأبعاد للبروتينات والجزيئات الأخرى.يحتوي هذا الموقع على صفحة لكل مدخل في بنك بيانات البروتينات (أكثر من 100000 صفحة) وكذلك صفحات أكثر توضيحا لتراكيب البروتينات بصورة عامة مثل أستيل كولين إستراز والهيموغلوبين مع منظر جمول لإلقاء نظرة على المواقع الوظيفية والربيطات. حصل موقع بروتيوبيديا على جائزة أحسن موقع في عام 2010، وهذه الجائزة مقدمة من مجلة .
  • Proteopedia is a wiki, 3D encyclopedia of proteins and other molecules.The site contains a page for every entry in the Protein Data Bank (>130,000 pages), as well as pages that are more descriptive of protein structures in general such as acetylcholinesterase, hemoglobin, and the photosystem II with a Jmol view that highlights functional sites and ligands. It employs a scene-authoring tool so that users do not have to learn JSmol script language to create customized molecular scenes. Custom scenes are easily attached to "green links" in descriptive text that display those scenes in JSmol. A web browser is all that is needed to access the site and the 3D information; no viewers are required to be installed.
  • Proteopedia est une encyclopédie en ligne, en anglais, présentant des images 3D, fonctionnant sur le principe des wikis. Elle traite des protéines et autres molécules relevant de la biologie. Le site de l'encyclopédie propose une page pour chaque entrée du Protein Data Bank (plus de 77 000 pages), mais aussi des pages concernant la description des structures des constituants des protéines au sens large et des articles annexes portant par exemple sur les acétylcholinestérases, l’hémoglobine ou le Photosystème II. Ces descriptions 3D utilisent des images élaborées via Jmol, une applet Java. Les images mettent en évidence les emplacements fonctionnels (appelés sites) et les ligands (molécules avec leurs liaisons).
  • La Proteopedia è una enciclopedia online delle proteine e di altre molecole, presentate anche con immagini tridimensionali, che è facile da modificare dai suoi stessi utenti perché si serve del software Mediawiki. Il sito contiene una pagina per ogni possibile voce del Protein Data Bank (più di 64.500 pagine), come anche pagine che sono più descrittive delle strutture proteiche in generale, ad es. Photosystem_II, Acetylcholinesterase e Hemoglobin, con una visualizzazione Jmol che evidenzia i siti funzionali e i ligandi.
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  • Joel L. Sussman, Eran Hodis, and Jaime Prilusky
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  • بروتيوبيديا (بالإنجليزية: Proteopedia) هي موسوعة ويكي ثلاثية الأبعاد للبروتينات والجزيئات الأخرى.يحتوي هذا الموقع على صفحة لكل مدخل في بنك بيانات البروتينات (أكثر من 100000 صفحة) وكذلك صفحات أكثر توضيحا لتراكيب البروتينات بصورة عامة مثل أستيل كولين إستراز والهيموغلوبين مع منظر جمول لإلقاء نظرة على المواقع الوظيفية والربيطات. حصل موقع بروتيوبيديا على جائزة أحسن موقع في عام 2010، وهذه الجائزة مقدمة من مجلة .
  • La Proteopedia è una enciclopedia online delle proteine e di altre molecole, presentate anche con immagini tridimensionali, che è facile da modificare dai suoi stessi utenti perché si serve del software Mediawiki. Il sito contiene una pagina per ogni possibile voce del Protein Data Bank (più di 64.500 pagine), come anche pagine che sono più descrittive delle strutture proteiche in generale, ad es. Photosystem_II, Acetylcholinesterase e Hemoglobin, con una visualizzazione Jmol che evidenzia i siti funzionali e i ligandi. Proteopedia adopera uno strumento per la costruzione degli ambienti e strutture ("scene-authoring tool") in modo che gli utenti non debbano imparare gli script del linguaggio informatico Jmol per creare scene molecolari apposite ("customized molecular scenes"). Alle ambientazioni realizzate ad hoc ("customized") sono facilmente aggiunti "link verdi" che fanno apparire testi descrittivi che mostrano quelle scene in Jmol. Per accedere al sito e visualizzare i suoi contenuti in 3D basta un normale web browser, in effetti non sono necessari "" scaricabili da installare. Tutto il contenuto, aggiunto da utenti certificati è gratuito e viene rilasciato sotto licenza GNU Free Documentation License.
  • Proteopedia est une encyclopédie en ligne, en anglais, présentant des images 3D, fonctionnant sur le principe des wikis. Elle traite des protéines et autres molécules relevant de la biologie. Le site de l'encyclopédie propose une page pour chaque entrée du Protein Data Bank (plus de 77 000 pages), mais aussi des pages concernant la description des structures des constituants des protéines au sens large et des articles annexes portant par exemple sur les acétylcholinestérases, l’hémoglobine ou le Photosystème II. Ces descriptions 3D utilisent des images élaborées via Jmol, une applet Java. Les images mettent en évidence les emplacements fonctionnels (appelés sites) et les ligands (molécules avec leurs liaisons). Le site utilise un outil de réalisation de représentations 3D qui fait que les auteurs n’ont pas à apprendre le langage de script de Jmol pour créer des représentations personnalisées de molécules. Les contributeurs peuvent facilement relier les emplacements fonctionnels (appelés les sites) et les ligands dans chacune de ces représentations par des liens verts qui apparaissent dans le texte de description sous la vue 3D. En cliquant sur un lien vert, les éléments correspondants sont mis en évidence dans la vue en 3D. On n’a besoin que d’un navigateur internet pour accéder au site et aux informations 3D, il n’est pas nécessaire de télécharger et d’installer une visionneuse. Tout le contenu est gratuit sous couvert du respect de la licence de documentation libre GNU. Proteopedia est hébergée au Israel Structural Proteomics Center à l’Institut Weizmann. L’Award 2010 a été décerné à Proteopedia en tant que meilleur site Internet par le mensuel (en).
  • Proteopedia is a wiki, 3D encyclopedia of proteins and other molecules.The site contains a page for every entry in the Protein Data Bank (>130,000 pages), as well as pages that are more descriptive of protein structures in general such as acetylcholinesterase, hemoglobin, and the photosystem II with a Jmol view that highlights functional sites and ligands. It employs a scene-authoring tool so that users do not have to learn JSmol script language to create customized molecular scenes. Custom scenes are easily attached to "green links" in descriptive text that display those scenes in JSmol. A web browser is all that is needed to access the site and the 3D information; no viewers are required to be installed. Proteopedia was the winner of the 2010 award for the best website by The Scientist magazine.
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