Phred is a computer program for base calling, that is to say, identifying a nucleobase sequence from fluorescence "trace" data generated by an automated DNA sequencer that uses electrophoresis and 4-fluorescent dye method. When originally developed, Phred produced significantly fewer errors in the data sets examined than other methods, averaging 40–50% fewer errors. Phred quality scores have become widely accepted to characterize the quality of DNA sequences, and can be used to compare the efficacy of different sequencing methods.
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- Phred (ja)
- Phred (software) (en)
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| - Phred is a computer program for base calling, that is to say, identifying a nucleobase sequence from fluorescence "trace" data generated by an automated DNA sequencer that uses electrophoresis and 4-fluorescent dye method. When originally developed, Phred produced significantly fewer errors in the data sets examined than other methods, averaging 40–50% fewer errors. Phred quality scores have become widely accepted to characterize the quality of DNA sequences, and can be used to compare the efficacy of different sequencing methods. (en)
- Phred est un programme informatique permettant l'identification des bases d'une séquence d'ADN à partir de données d'un électrophorègramme générées par des séquences marquées à l'aide de fluorochromes et séparées par électrophorèse sur un séquenceur d'ADN automatisé. À l'époque de son développement, Phred produisait beaucoup moins d'erreurs lors de l'analyse de données que d'autres méthodes, réduisant le taux d'erreur de 40 à 50 %. Les scores de qualité phred sont par ailleurs devenus un standard pour caractériser la qualité d'une séquence d'ADN, pouvant être utilisés pour comparer l'efficacité des différentes . (fr)
- Phredとは、ベースコールを行うプログラム。自動DNAシークエンサーから出力されたトレースを読み込んで塩基配列を出力する。開発された時点では他の手法と比較して40-50%低いエラー率を誇っていた。その後、PhredクオリティスコアはDNAシークエンシングの品質評価の基準として広く受け入れられ、今日でもシークエンシング技術の有効性を比較する際に用いられている。 (ja)
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| - Phred is a computer program for base calling, that is to say, identifying a nucleobase sequence from fluorescence "trace" data generated by an automated DNA sequencer that uses electrophoresis and 4-fluorescent dye method. When originally developed, Phred produced significantly fewer errors in the data sets examined than other methods, averaging 40–50% fewer errors. Phred quality scores have become widely accepted to characterize the quality of DNA sequences, and can be used to compare the efficacy of different sequencing methods. (en)
- Phred est un programme informatique permettant l'identification des bases d'une séquence d'ADN à partir de données d'un électrophorègramme générées par des séquences marquées à l'aide de fluorochromes et séparées par électrophorèse sur un séquenceur d'ADN automatisé. À l'époque de son développement, Phred produisait beaucoup moins d'erreurs lors de l'analyse de données que d'autres méthodes, réduisant le taux d'erreur de 40 à 50 %. Les scores de qualité phred sont par ailleurs devenus un standard pour caractériser la qualité d'une séquence d'ADN, pouvant être utilisés pour comparer l'efficacité des différentes . (fr)
- Phredとは、ベースコールを行うプログラム。自動DNAシークエンサーから出力されたトレースを読み込んで塩基配列を出力する。開発された時点では他の手法と比較して40-50%低いエラー率を誇っていた。その後、PhredクオリティスコアはDNAシークエンシングの品質評価の基準として広く受け入れられ、今日でもシークエンシング技術の有効性を比較する際に用いられている。 (ja)
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