About: Pentatricopeptide repeat     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : yago:Whole100003553, within Data Space : dbpedia.org associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.org/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FPentatricopeptide_repeat

The pentatricopeptide repeat (PPR) is a 35-amino acid sequence motif. Pentatricopeptide-repeat-containing proteins are a family of proteins commonly found in the plant kingdom. They are distinguished by the presence of tandem degenerate PPR motifs and by the relative lack of introns in the genes coding for them. Approximately 450 such proteins have been identified in the Arabidopsis genome, and another 477 in the rice genome. Despite the large size of the protein family, genetic data suggest that there is little or no redundancy of function between the PPR proteins in Arabidopsis.

AttributesValues
rdf:type
rdfs:label
  • Protéine à motifs PPR (fr)
  • Pentatricopeptide repeat (en)
  • PPR-білки (uk)
rdfs:comment
  • Les protéines PPR (pour pentatricopeptide repeat) sont des protéines possédant plusieurs motifs dégénérés d’environ 35 acides aminés, appelés motifs PPR. Cette famille de protéines est très présente chez les Eucaryotes, particulièrement chez les Embryophytes. Les protéines PPR se distinguent par la présence de plusieurs motifs PPR (de 2 à 30) répétés en tandem. Les protéines PPR sont capables de lier des ARN de façon séquence spécifique. (fr)
  • PPR-білки (англ. Pentatricopeptide repeat), білки з пентатрикопептидним повтором — родина білків, які мають у своїй структурі мотив з 35 амінокислотних залишків. Гени цієї родини наявні у всіх гілках евкаріотів, але найбільш поширені в рослин, де виконують різноманітні функції, включно з редагуванням РНК у мітохондріях та хлоропластах. Також виявляються в окремих прокаріотів, але, скоріш за все, набуті шляхом горизонтального перенесення генів. (uk)
  • The pentatricopeptide repeat (PPR) is a 35-amino acid sequence motif. Pentatricopeptide-repeat-containing proteins are a family of proteins commonly found in the plant kingdom. They are distinguished by the presence of tandem degenerate PPR motifs and by the relative lack of introns in the genes coding for them. Approximately 450 such proteins have been identified in the Arabidopsis genome, and another 477 in the rice genome. Despite the large size of the protein family, genetic data suggest that there is little or no redundancy of function between the PPR proteins in Arabidopsis. (en)
name
  • Pentatricopeptide repeat (en)
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
sameAs
dbp:wikiPageUsesTemplate
PROSITE
  • PS51375 (en)
InterPro
  • IPR002885 (en)
Pfam
  • PF01535 (en)
Pfam clan
  • CL0020 (en)
symbol
  • PPR (en)
has abstract
  • Les protéines PPR (pour pentatricopeptide repeat) sont des protéines possédant plusieurs motifs dégénérés d’environ 35 acides aminés, appelés motifs PPR. Cette famille de protéines est très présente chez les Eucaryotes, particulièrement chez les Embryophytes. Les protéines PPR se distinguent par la présence de plusieurs motifs PPR (de 2 à 30) répétés en tandem. Les protéines PPR sont capables de lier des ARN de façon séquence spécifique. (fr)
  • The pentatricopeptide repeat (PPR) is a 35-amino acid sequence motif. Pentatricopeptide-repeat-containing proteins are a family of proteins commonly found in the plant kingdom. They are distinguished by the presence of tandem degenerate PPR motifs and by the relative lack of introns in the genes coding for them. Approximately 450 such proteins have been identified in the Arabidopsis genome, and another 477 in the rice genome. Despite the large size of the protein family, genetic data suggest that there is little or no redundancy of function between the PPR proteins in Arabidopsis. The purpose of PPR proteins is currently under dispute. It has been shown that a good deal of those in Arabidopsis interact (often essentially) with mitochondria and other organelles and that they are possibly involved in RNA editing. However many trans proteins are required for this editing to occur and research continues to look at which proteins are needed. The structure of the PPR has been resolved. It folds into a helix-turn-helix structure similar to those found in the tetratricopeptide repeat. Several repeats of the protein forms a ring around a molecule in a sequence-sensitive way reminiscent of TAL effectors. (en)
  • PPR-білки (англ. Pentatricopeptide repeat), білки з пентатрикопептидним повтором — родина білків, які мають у своїй структурі мотив з 35 амінокислотних залишків. Гени цієї родини наявні у всіх гілках евкаріотів, але найбільш поширені в рослин, де виконують різноманітні функції, включно з редагуванням РНК у мітохондріях та хлоропластах. Також виявляються в окремих прокаріотів, але, скоріш за все, набуті шляхом горизонтального перенесення генів. (uk)
gold:hypernym
prov:wasDerivedFrom
page length (characters) of wiki page
Symbol
  • PPR
foaf:isPrimaryTopicOf
is Link from a Wikipage to another Wikipage of
is Wikipage redirect of
is foaf:primaryTopic of
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3330 as of Mar 19 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (62 GB total memory, 54 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software