Pentapeptide repeats are a family of sequence motifs found in multiple tandem copies in protein molecules. Pentapeptide repeat proteins are found in all species, but they are found in many copies in cyanobacterial genomes. The repeats were first identified by Black and colleagues in the hglK protein. The later Bateman et al. showed that a large family of related pentapeptide repeat proteins existed. The function of these repeats is uncertain in most proteins. However, in the MfpA protein a DNA gyrase inhibitor it has been suggested that the pentapeptide repeat structure mimics the structure of DNA. The repeats form a regular right handed four sided beta helix structure known as the Rfr-fold.
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| - Pentapeptide Repeat (de)
- Répétition pentapeptidique (fr)
- Pentapeptide repeat (en)
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| - Das Pentapeptide Repeat (zu deutsch ‚Pentapeptidwiederholung‘) ist ein Sequenzmotiv in manchen Proteinen. (de)
- Pentapeptide repeats are a family of sequence motifs found in multiple tandem copies in protein molecules. Pentapeptide repeat proteins are found in all species, but they are found in many copies in cyanobacterial genomes. The repeats were first identified by Black and colleagues in the hglK protein. The later Bateman et al. showed that a large family of related pentapeptide repeat proteins existed. The function of these repeats is uncertain in most proteins. However, in the MfpA protein a DNA gyrase inhibitor it has been suggested that the pentapeptide repeat structure mimics the structure of DNA. The repeats form a regular right handed four sided beta helix structure known as the Rfr-fold. (en)
- Une répétition pentapeptidique, ou répétition de pentapeptides, est un type de séquence peptidique observé dans les protéines sous forme de copies adjacentes de séquences de cinq résidus d'acides aminés. On les trouve chez toutes les espèces, mais sont particulièrement présentes chez les cyanobactéries. Une telle répétition a été identifiée pour la première fois dans la protéine hglK avant d'être observée dans de nombreuses autres protéines bactériennes. La fonction de ces répétitions n'est pas connue avec certitude dans la plupart des cas, cependant, il a été proposé que celle de la protéine MfpA, un inhibiteur de l'ADN gyrase, reproduit la structure tridimensionnelle de l'ADN. Ces répétitions forment une hélice β droite régulière à quatre côtés appelée repliement Rfr. (fr)
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| - Structure of the pentapeptide repeat protein HetL. (en)
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| - Das Pentapeptide Repeat (zu deutsch ‚Pentapeptidwiederholung‘) ist ein Sequenzmotiv in manchen Proteinen. (de)
- Une répétition pentapeptidique, ou répétition de pentapeptides, est un type de séquence peptidique observé dans les protéines sous forme de copies adjacentes de séquences de cinq résidus d'acides aminés. On les trouve chez toutes les espèces, mais sont particulièrement présentes chez les cyanobactéries. Une telle répétition a été identifiée pour la première fois dans la protéine hglK avant d'être observée dans de nombreuses autres protéines bactériennes. La fonction de ces répétitions n'est pas connue avec certitude dans la plupart des cas, cependant, il a été proposé que celle de la protéine MfpA, un inhibiteur de l'ADN gyrase, reproduit la structure tridimensionnelle de l'ADN. Ces répétitions forment une hélice β droite régulière à quatre côtés appelée repliement Rfr. Les répétitions pentapeptidiques observées dans les protéines sont à peu près de la forme Ala–(Asp/Asn)–Leu–Xaa–Xaa, soit, en utilisant les codes à une lettre, A(D/N)LXX. La position centrale de ces pentapeptides est généralement occupée par un résidu de leucine et est appelée position i ; les deux positions précédentes sont désignées par i-1 et i-2, tandis que les deux suivantes sont désignées par i+1 et i+2. Le résidu en i-2 est généralement une alanine. Les chaînes latérales des positions i-2 et i pointent vers l'intérieur hydrophobe de la protéine, tandis que les chaînes latérales des positions i-1, i+1 et i+2 sont exposées à la surface de la molécule. On pensait initialement que les répétitions pentapeptidiques formaient des hélices β droites à trois côtés mais la première structure d'une telle protéine observée par cristallographie aux rayons X a révélé une hélice droite à quatre côtés, chaque tour d'hélice étant constitué de quatre répétitions, l'ensemble formant un domaine en solénoïde. (fr)
- Pentapeptide repeats are a family of sequence motifs found in multiple tandem copies in protein molecules. Pentapeptide repeat proteins are found in all species, but they are found in many copies in cyanobacterial genomes. The repeats were first identified by Black and colleagues in the hglK protein. The later Bateman et al. showed that a large family of related pentapeptide repeat proteins existed. The function of these repeats is uncertain in most proteins. However, in the MfpA protein a DNA gyrase inhibitor it has been suggested that the pentapeptide repeat structure mimics the structure of DNA. The repeats form a regular right handed four sided beta helix structure known as the Rfr-fold. (en)
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