Dideoxynucleotides are chain-elongating inhibitors of DNA polymerase, used in the Sanger method for DNA sequencing. They are also known as 2',3' because both the 2' and 3' positions on the ribose lack hydroxyl groups, and are abbreviated as ddNTPs (ddGTP, ddATP, ddTTP and ddCTP).
| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:label
| - Didesoxinucleòtid (ca)
- Dideoxyribonukleotid (cs)
- Didesoxyribonukleosid-Triphosphate (de)
- Didesoxinucleótido (es)
- Dideoxynucleotide (en)
- Dideossiribonucleotide (it)
- Didésoxyribonucléotide (fr)
- Dideoxynukleotid (sv)
- Дидеоксинуклеотид трифосфат (ru)
- 双脱氧核苷酸 (zh)
|
| rdfs:comment
| - Dideoxyribonukleotid (ddNTP) je derivát nukleotidů, který postrádá OH skupinu na 2' i 3' uhlíku svého cukru (dideoxy)ribózy. Zatímco totiž má ribonukleotid obě OH skupiny a deoxyribonukleotid jednu OH skupinu, dideoxynukleotid neobsahuje na těchto pozicích žádnou. Dideoxynukleotidy jako takové jsou pouze uměle připravené, nejsou schopné plnit správně funkci v buňce. Mají však pro výzkumníky význam např. v sekvenování DNA metodou Fredericka Sangera, neboť jsou schopné ukončit probíhající replikaci DNA. (cs)
- Los didesoxinucleótidos (abreviados como ddNTP) son nucleótidos que carecen de un grupo 3'-hidroxilo (-OH) en la desoxirribosa. La falta de este grupo hidroxilo implica la imposibilidad de formar un enlace fosfodiéster con otros nucleótidos, el cual se produce entre el grupo 5'-fosfato de uno y el grupo 3'-hidroxilo de otro. Por tanto, durante la replicación de una molécula de ADN, la adición de un ddNTP a la cadena de nueva síntesis supone que el proceso se detenga. Esto es útil en procesos de secuenciación de ADN, como en el método de Sanger. (es)
- Dideoxynucleotides are chain-elongating inhibitors of DNA polymerase, used in the Sanger method for DNA sequencing. They are also known as 2',3' because both the 2' and 3' positions on the ribose lack hydroxyl groups, and are abbreviated as ddNTPs (ddGTP, ddATP, ddTTP and ddCTP). (en)
- Un didésoxyribonucléotide (souvent abrégé ddNTP) est un nucléotide dont les groupements 2'OH et 3'OH du ribose sont absents. Les didésoxyribonucléotides sont utilisés dans différentes méthodes de séquençage de l'ADN. (fr)
- Дидеоксинуклеотид трифосфат (англ. Dideoxynucleotide triphosphate, ddNTP) - ингибитор удлинения цепи ДНК-полимеразы, используемый в методе Сэнгера для секвенирования ДНК. У дидеоксинуклеотид трифосфатов (ddNTP) отсутствует 3'-OH группа, которая необходима для удлинения цепи. Поскольку гидроксильная группа не может быть добавлена в 3' конец, дальнейшее удлинение цепи не происходит. Способность остановить текущую репликацию ДНК используется для сравнения с тем ДНК, которые продолжают репликацию дальше. Например так сравниваются ДНК раковых и здоровых клеток, чтобы найти место, на котором произошел сбой. (ru)
- 双脱氧核苷酸（英語：Dideoxynucleotide）是DNA聚合酶的链终止性抑制剂，应用于桑格DNA测序法。这些核苷酸亦称2',3'-双脱氧核苷酸，常简写为ddNTPs（ddGTP、ddATP、ddTTP与ddCTP）。 (zh)
- Un didesoxinucleòtid (abreviats ddNTP, ddGTP, ddATP, ddTTP i ddCTP) són nucleòtids que no tenen el grup 3'-hidroxil (-OH) propis de la desoxiribosa, inhibidors de la cadena d'allargament de la Polimerasa d'ADN, usats en la mètode de Sanger. (ca)
- Didesoxyribonukleosid-Triphosphate (ddNTP) sind artifizielle DNA-Nukleotide, die bei der DNA-Sequenzierung nach Sanger Verwendung finden. Die ddNTPs sind wie die Desoxyribonukleosid-Triphosphate (dNTPs) aufgebaut. Allerdings ist die Ribose (Zucker) an Position 2’ und 3’ desoxidiert. Dadurch fehlt am 3'-Kohlenstoff-Atom die Hydroxygruppe, an der bei der Polymerisation das nächste Nukleotid angehängt wird. (de)
- I dideossinucleotidi o ddNTP, sono deossiribonucleotidi sintetici che presentano lo zucchero desossiribosio privo del gruppo ossidrilico in posizione 3'. Il deossiribosio manca già del gruppo ossidrilico in posizione 2'. La mancanza di questo gruppo ossidrilico 3' comporta che, dopo essere stato aggiunto da una DNA polimerasi ad una catena nucleotidica crescente, non possono essere aggiunti ulteriori nucleotidi dato che nessun legame fosfodiesterico può essere formato in base al fatto che i deossiribonucleosidi trifosfati (che sono i blocchi di costruzione del DNA) permettono la sintesi della catena del DNA, attraverso una reazione di condensazione tra il gruppo fosfato 5' (dopo la scissione del pirofosfato) del nucleotide da aggiungere e il gruppo ossidrilico 3' del nucleotide precedente. (it)
- Dideoxynukleotider, eller ddNTP's, är nukleotider som saknar en 3'-hydroxylgrupp på sitt deoxiribos-socker. DNA-molekylen är uppbyggt av sammanlänkade nukleotider, där vardera nukleotid innehåller en deoxyribos-enhet. En nukleotid i DNA-kedjan som saknar en hydroxylgrupp på ribosens 3'-kol innebär att då det tillsätts till en växande DNA-kedja av ett DNA-förlängande DNA-polymeras kommer DNA-polymeraset inte kunna fortsätta förlänga kedjan. Anledningen till detta är att förlängandet av kedjan sker genom att DNA-polymeraset katalyserar (hjälper till med) bildandet av en bindning mellan 5'-fosfaten på den aktuella nukleotiden och just 3'-hydroxylgruppen på den föregående nukleotiden. Saknar den föregående nukleotiden en 3'-hydroxylgrupp, alltså är en dideoxynukleotid, kan reaktionen inte geno (sv)
|
| foaf:depiction
| |
| dcterms:subject
| |
| Wikipage page ID
| |
| Wikipage revision ID
| |
| Link from a Wikipage to another Wikipage
| |
| sameAs
| |
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| thumbnail
| |
| has abstract
| - Un didesoxinucleòtid (abreviats ddNTP, ddGTP, ddATP, ddTTP i ddCTP) són nucleòtids que no tenen el grup 3'-hidroxil (-OH) propis de la desoxiribosa, inhibidors de la cadena d'allargament de la Polimerasa d'ADN, usats en la mètode de Sanger. La manca d'aquest grup hidroxil implica que després d'haver estat afegit per una polimerasa d'ADN a una cadena de nucleòtids en creixement, no es poden afegir més nucleòtids com un enllaç fosfodièster, el qual es produeix entre el grup 5'-fosfat d'un i el grup 3'-hidroxil de l'altre (després de l'escissió del pirofosfat). Per tant, durant la replicació d'una molècula d'ADN, l'addició d'un ddNTP a la cadena de nova síntesis suposa que el procés es pari. Això pot ser útil en processos de seqüenciació d'ADN (per exemple, en el mètode de Sanger. Per tant, aquestes molècules formen la base de la mètode de terminació de cadena didesòxid de la seqüenciació de l'ADN, que va ser desenvolupat per Frederick Sanger en 1977. Els didesoxinucleòtids són útils en la seqüenciació d'ADN en combinació amb l'electroforesi. Una mostra d'ADN que se sotmet a PCR (reacció en cadena de la polimerasa) en una barreja que conté tots quatre desoxiribonucleòtids i un didesoxinucleòtid produirà brins de longitud igual a la posició de cada base del tipus que complementa el tipus que té un didesoxinucleòtid present. És a dir, cada base de nucleòtids d'aquest tipus particular té una probabilitat de ser unit no a un desoxinucleòtid sinó més aviat a un didesoxinucleòtid, que acaba la cadena d'elongació. Per tant, si la mostra se sotmet a electroforesi, hi haurà una banda present per a cada longitud a la qual està present l'ADN complementari del didesoxinucleòtid. Ara és habitual l'ús de didesoxinucleòtids fluorescents tals que cadascun dels quatre té una fluorescència diferent que pot ser detectada per un seqüenciador; per tant només es necessita una reacció. (ca)
- Dideoxyribonukleotid (ddNTP) je derivát nukleotidů, který postrádá OH skupinu na 2' i 3' uhlíku svého cukru (dideoxy)ribózy. Zatímco totiž má ribonukleotid obě OH skupiny a deoxyribonukleotid jednu OH skupinu, dideoxynukleotid neobsahuje na těchto pozicích žádnou. Dideoxynukleotidy jako takové jsou pouze uměle připravené, nejsou schopné plnit správně funkci v buňce. Mají však pro výzkumníky význam např. v sekvenování DNA metodou Fredericka Sangera, neboť jsou schopné ukončit probíhající replikaci DNA. (cs)
- Los didesoxinucleótidos (abreviados como ddNTP) son nucleótidos que carecen de un grupo 3'-hidroxilo (-OH) en la desoxirribosa. La falta de este grupo hidroxilo implica la imposibilidad de formar un enlace fosfodiéster con otros nucleótidos, el cual se produce entre el grupo 5'-fosfato de uno y el grupo 3'-hidroxilo de otro. Por tanto, durante la replicación de una molécula de ADN, la adición de un ddNTP a la cadena de nueva síntesis supone que el proceso se detenga. Esto es útil en procesos de secuenciación de ADN, como en el método de Sanger. (es)
- Dideoxynucleotides are chain-elongating inhibitors of DNA polymerase, used in the Sanger method for DNA sequencing. They are also known as 2',3' because both the 2' and 3' positions on the ribose lack hydroxyl groups, and are abbreviated as ddNTPs (ddGTP, ddATP, ddTTP and ddCTP). (en)
- Didesoxyribonukleosid-Triphosphate (ddNTP) sind artifizielle DNA-Nukleotide, die bei der DNA-Sequenzierung nach Sanger Verwendung finden. Die ddNTPs sind wie die Desoxyribonukleosid-Triphosphate (dNTPs) aufgebaut. Allerdings ist die Ribose (Zucker) an Position 2’ und 3’ desoxidiert. Dadurch fehlt am 3'-Kohlenstoff-Atom die Hydroxygruppe, an der bei der Polymerisation das nächste Nukleotid angehängt wird. Baut die DNA-Polymerase während der Replikation an einer Stelle ein solches ddNTP ein, so kann kein weiteres Nukleotid angehängt werden und die Polymerisation bricht an dieser Stelle ab. Man kann deshalb vereinfacht von Stopp-Nukleotiden sprechen. Bei der DNA-Sequenzierung nach Sanger werden nun die vier natürlichen dNTPs und eines der vier artifiziellen ddNTPs zu einem PCR-Ansatz mit der zu sequenzierenden DNA und einem entsprechenden Primer gegeben. Die Polymerase baut nun gelegentlich in statistischer Verteilung ein ddNTP ein, wodurch die Polymerisation abbricht. Es entsteht somit ein Gemisch unterschiedlich langer Stücke des zu sequenzierenden Abschnitts der DNA. Man führt dieses Experiment mit allen vier ddNTPs durch und trägt die vier Ansätze in einer Polyacrylamid-Gelelektrophorese nebeneinander auf. Aus dem Muster der entstehenden Banden kann man dann die Abfolge der Basen auf dem DNA-Abschnitt ablesen. (de)
- Un didésoxyribonucléotide (souvent abrégé ddNTP) est un nucléotide dont les groupements 2'OH et 3'OH du ribose sont absents. Les didésoxyribonucléotides sont utilisés dans différentes méthodes de séquençage de l'ADN. (fr)
- I dideossinucleotidi o ddNTP, sono deossiribonucleotidi sintetici che presentano lo zucchero desossiribosio privo del gruppo ossidrilico in posizione 3'. Il deossiribosio manca già del gruppo ossidrilico in posizione 2'. La mancanza di questo gruppo ossidrilico 3' comporta che, dopo essere stato aggiunto da una DNA polimerasi ad una catena nucleotidica crescente, non possono essere aggiunti ulteriori nucleotidi dato che nessun legame fosfodiesterico può essere formato in base al fatto che i deossiribonucleosidi trifosfati (che sono i blocchi di costruzione del DNA) permettono la sintesi della catena del DNA, attraverso una reazione di condensazione tra il gruppo fosfato 5' (dopo la scissione del pirofosfato) del nucleotide da aggiungere e il gruppo ossidrilico 3' del nucleotide precedente. I dideossiribonucleotidi sono privi del gruppo ossidrilico in 3', pertanto nessun ulteriore allungamento della catena può verificarsi una volta che questo dideossiribonucleotide viene aggiunto alla catena. Ciò comporta la cessazione dell'allungamento della sequenza di DNA. Questa caratteristica costituisce la base del metodo della terminazione della catena per il sequenziamento del DNA sviluppato da Frederick Sanger nel 1977. (it)
- Dideoxynukleotider, eller ddNTP's, är nukleotider som saknar en 3'-hydroxylgrupp på sitt deoxiribos-socker. DNA-molekylen är uppbyggt av sammanlänkade nukleotider, där vardera nukleotid innehåller en deoxyribos-enhet. En nukleotid i DNA-kedjan som saknar en hydroxylgrupp på ribosens 3'-kol innebär att då det tillsätts till en växande DNA-kedja av ett DNA-förlängande DNA-polymeras kommer DNA-polymeraset inte kunna fortsätta förlänga kedjan. Anledningen till detta är att förlängandet av kedjan sker genom att DNA-polymeraset katalyserar (hjälper till med) bildandet av en bindning mellan 5'-fosfaten på den aktuella nukleotiden och just 3'-hydroxylgruppen på den föregående nukleotiden. Saknar den föregående nukleotiden en 3'-hydroxylgrupp, alltså är en dideoxynukleotid, kan reaktionen inte genomföras och ingen påbyggnad sker. (sv)
- Дидеоксинуклеотид трифосфат (англ. Dideoxynucleotide triphosphate, ddNTP) - ингибитор удлинения цепи ДНК-полимеразы, используемый в методе Сэнгера для секвенирования ДНК. У дидеоксинуклеотид трифосфатов (ddNTP) отсутствует 3'-OH группа, которая необходима для удлинения цепи. Поскольку гидроксильная группа не может быть добавлена в 3' конец, дальнейшее удлинение цепи не происходит. Способность остановить текущую репликацию ДНК используется для сравнения с тем ДНК, которые продолжают репликацию дальше. Например так сравниваются ДНК раковых и здоровых клеток, чтобы найти место, на котором произошел сбой. (ru)
- 双脱氧核苷酸（英語：Dideoxynucleotide）是DNA聚合酶的链终止性抑制剂，应用于桑格DNA测序法。这些核苷酸亦称2',3'-双脱氧核苷酸，常简写为ddNTPs（ddGTP、ddATP、ddTTP与ddCTP）。 (zh)
|
| gold:hypernym
| |
| prov:wasDerivedFrom
| |
| page length (characters) of wiki page
| |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)
