DIALIGN-TX is a multiple sequence alignment program written by Amarendran R. Subramanian and is substantial improvement of DIALIGN-T by combining greedy and progressive alignment strategies in a new algorithm.
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| - DIALIGN-TX is a multiple sequence alignment program written by Amarendran R. Subramanian and is substantial improvement of DIALIGN-T by combining greedy and progressive alignment strategies in a new algorithm. (en)
- DIALIGN-TX é um programa de alinhamento múltiplo de seqüência escrita por Amarendran R. Subramanian e é uma melhoria substancial do DIALIGN-T, combinando estratégias de alinhamento gananciosas e progressivas em um novo algoritmo. (pt)
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| - DIALIGN-TX is a multiple sequence alignment program written by Amarendran R. Subramanian and is substantial improvement of DIALIGN-T by combining greedy and progressive alignment strategies in a new algorithm. The original DIALIGN-T is a reimplementation of the multiple-alignment program DIALIGN. Due to several algorithmic improvements, it produces significantly better alignments on locally and globally related sequence sets than previous versions of DIALIGN. However, like the original implementation of the program, DIALIGN-T uses a straightforward greedy approach to assemble multiple alignments from local pairwise sequence similarities. Such greedy approaches may be vulnerable to spurious random similarities and can therefore lead to suboptimal results. DIALIGN-TX is a substantial improvement of DIALIGN-T that combines the previous greedy algorithm with a progressive alignment approach. (en)
- DIALIGN-TX é um programa de alinhamento múltiplo de seqüência escrita por Amarendran R. Subramanian e é uma melhoria substancial do DIALIGN-T, combinando estratégias de alinhamento gananciosas e progressivas em um novo algoritmo. O programa original, DIALIGN-T é uma reimplementação do programa de alinhamento múltiplo DIALIGN, de Burkhard Morgenstern. Devido a várias melhorias de algoritmos, ele produz alinhamentos significativamente melhores em conjuntos de seqüências tanto localmente quanto globalmente em relação as versões anteriores do DIALIGN. DIALIGN é baseado na computação de blocos livres de lacunas entre pares de segmentos (diagonais). No entanto, como na implementação original do programa, DIALIGN-T utiliza uma abordagem gananciosa simples e direta para montar alinhamentos múltiplos de seqüência a partir de de semelhanças locais entre pares. Tais abordagens gananciosas podem ser vulneráveis a falsas semelhanças aleatórias e podem, portanto, levar a resultados abaixo do ideal. DIALIGN-TX é uma melhoria substancial de DIALIGN-T, que combina o algoritmo ganancioso anterior com uma abordagem de alinhamento progressivo. (pt)
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