About: Cosmid     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : owl:Thing, within Data Space : dbpedia.org associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.org/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FCosmid

A cosmid is a type of hybrid plasmid that contains a Lambda phage cos sequence. They are often used as a cloning vector in genetic engineering. Cosmids can be used to build genomic libraries. They were first described by Collins and Hohn in 1978.Cosmids can contain 37 to 52 (normally 45) kb of DNA, limits based on the normal bacteriophage packaging size. They can replicate as plasmids if they have a suitable origin of replication (ori): for example SV40 ori in mammalian cells, ColE1 ori for double-stranded DNA replication, or f1 ori for single-stranded DNA replication in prokaryotes. They frequently also contain a gene for selection such as antibiotic resistance, so that the transformed cells can be identified by plating on a medium containing the antibiotic. Those cells which did not take

AttributesValues
rdfs:label
  • كوزميد (ar)
  • Cosmidi (ca)
  • Cosmid (de)
  • Cósmido (es)
  • Cosmid (en)
  • Cosmide (fr)
  • Cosmide (it)
  • 코스미드 (ko)
  • コスミド (ja)
  • Kosmid (pl)
  • Космиды (ru)
  • 黏質體 (zh)
  • Косміди (uk)
rdfs:comment
  • Els cosmidis són uns tipus de vectors de clonació. Realment un cosmidi consisteix en un plasmidi al qual se li han afegit uns segments del genoma d'un bacteriòfag, el fag λ. (ca)
  • Un cosmide est un vecteur artificiel constitué d'un plasmide hybride contenant la séquence cos du phage lambda. Le nom « cosmide » est un mot-valise formé à partir de cos et plasmide. Les cosmides sont fréquemment utilisés comme vecteurs de clonage en génie génétique, et employés pour construire des banques génomiques. Ils ont été initialement décrits par Collins et Hohn en 1978. (fr)
  • コスミド (Cosmid) とはベクターのひとつである。コスミドベクターは、30kbp-45kbpの大きさのDNA断片を挿入することができる。このベクターは、という特殊な配列を有し、この配列をバクテリオファージが認識することで、パッケージングが行われる。 昔のコスミドベクターは、Cos領域が一つしかないものであったが、現在では2つあるものが主流である。このため、パッケージングの効率が大幅に上がり、コスミドベクターは実用的なものになった。 コスミドベクターにDNA断片をライゲーションしたあと、バクテリオファージにパッケージングし、そのファージが感染することで大腸菌を形質転換する。 このベクターは比較的大きなDNA断片を挿入できるので、二次代謝産物生合成遺伝子群などの解析のために使用されることもある。 (ja)
  • 코스미드(영어: cosmid)는 코스 계 람다 파지를 포함하는 하이브리드 플라스미드의 한 종류이다 이 코스미드의 DNA 서열은 람다 파지에서 유래 했다 그것들은 종종 유전공학의 클로닝 벡터로 사용된다. (ko)
  • Un cosmide, originariamente descritto da Collins e Hohn nel 1978, è un tipo di vettore utilizzabile nelle tecniche di clonaggio tipiche dell'ingegneria genetica. La tipicità dei cosmidi consiste nella presenza di sequenze cos (scoperte nel batteriofago lambda), che permettono al cosmide di alloggiare fino a 50kbps (mentre un plasmide può mantenerne al massimo 20). (it)
  • 黏質體(Cosmid,又譯黏粒)是一種以λ噬菌體(Lambda phage)中的cos sequences所建構而成的質體,是常用的(cloning vector)之一,可用於建構。最高可置入44000個鹼基對,高於質粒的10000到15000。 (zh)
  • كان كولينز وهون هما أول من وصفا الكوزميد (بالإنجليزية: cosmid)‏ في عام 1978 على أنه نوعاً من البلازميد (الذي يُستخدم غالباً ) يشتمل على سلاسل الكروموسومات، والتي تمثل سلاسل الحمض النووي (دنا) من عاثية لامدا (بالإنجليزية: lambda phage)‏. ونلاحظ أن الكوزميدات تُستخدم لبناء {{إنج| Library (biology)]]. (ar)
  • A cosmid is a type of hybrid plasmid that contains a Lambda phage cos sequence. They are often used as a cloning vector in genetic engineering. Cosmids can be used to build genomic libraries. They were first described by Collins and Hohn in 1978.Cosmids can contain 37 to 52 (normally 45) kb of DNA, limits based on the normal bacteriophage packaging size. They can replicate as plasmids if they have a suitable origin of replication (ori): for example SV40 ori in mammalian cells, ColE1 ori for double-stranded DNA replication, or f1 ori for single-stranded DNA replication in prokaryotes. They frequently also contain a gene for selection such as antibiotic resistance, so that the transformed cells can be identified by plating on a medium containing the antibiotic. Those cells which did not take (en)
  • Los cósmidos son vectores de clonación, que han sido ampliamente usados en la elaboración de genotecas de ADN genómicos de gran tamaño, ya que permiten la introducción de de ADN de hasta 45 kb, el doble que los vectores derivados de la eliminación de parte del genoma del fago λ, los fagémidos. Realmente un cósmido consiste en un plásmido al cual se le han adicionado unos segmentos del genoma de un bacteriófago, el fago λ. Un cósmido contiene: (es)
  • Als Cosmide bezeichnet man Plasmide, die sogenannte cos-sites (cohesive site) enthalten. Dabei handelt es sich um DNA-Sequenzen, die aus dem λ-Phagen stammen. Diese Abschnitte liegen an den Enden des linearen und sind jeweils von identischer Sequenz, weisen aber aufeinander zu (inverted repeat). Über diese kann die DNA einen Ring ausbilden (zirkularisieren) und wird somit nicht in der Wirtszelle abgebaut. (de)
  • Kosmidy – sztucznie wytworzone wektory do klonowania oparte na genomach bakteriofagów E. coli, mające zastosowanie w inżynierii genetycznej. Kosmidy tworzy się łącząc plazmidy z sekwencją cos bakteriofaga λ, przyjmują one formę konkatamerów. Dzięki temu tego rodzaju wektor zyskuje właściwości charakterystyczne zarówno dla plazmidu jak i dla faga; sekwencja cos gwarantuje cząsteczce rozpoznanie jej jako „genom λ” przez białka pakujące DNA do cząstek faga λ. Cząstki zawierające kosmidowy DNA nie umożliwiają syntezy nowych cząstek faga, natomiast replikują się jako plazmidy, nie niszcząc komórek gospodarza. DNA do sklonowania uzyskuje się z kolonii zainfekowanych bakterii. Replikacja kosmidów jest bardziej czasochłonna niż replikacja plazmidów (ze względu na duże rozmiary wprowadzonego obcego (pl)
  • Космиды (Cosmides) — плазмиды, содержащие фрагмент ДНК фага лямбда включая cos-участок. Вместе с системами упаковки в фаговые частицы in vitro используются как векторные молекулы для клонирования генов и при построении геномных библиотек. Космиды были впервые сконструированы Коллинсом и Брюнингом в 1978 году. Их название происходит от сокращения двух терминов: cos-участок (сам термин в свою очередь происходит от англ. cohesive ends — липкие концы) и плазмида. (ru)
  • Косміди (Cosmides) — плазміди, що містять фрагмент ДНК фага лямбда включно зі . Разом із системами пакування у фагові частинки in vitro використовуються як векторні молекули для клонування генів та при побудові геномних бібліотек. Косміди вперше сконструювали Коллінс та Брюнінг 1978 року. Їхня назва походить від скорочення двох термінів: cos-ділянка (сам термін у свою чергу походить від англ. cohesive ends — липкі кінці) та плазміда. (uk)
foaf:depiction
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Cosmid_(English).svg
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
Link from a Wikipage to an external page
sameAs
dbp:wikiPageUsesTemplate
thumbnail
has abstract
  • كان كولينز وهون هما أول من وصفا الكوزميد (بالإنجليزية: cosmid)‏ في عام 1978 على أنه نوعاً من البلازميد (الذي يُستخدم غالباً ) يشتمل على سلاسل الكروموسومات، والتي تمثل سلاسل الحمض النووي (دنا) من عاثية لامدا (بالإنجليزية: lambda phage)‏. ونلاحظ أن الكوزميدات تُستخدم لبناء {{إنج| Library (biology)]]. هذا وللكوزميدات القدرة على حمل ما بين 37 و 52 زوجاً قاعدياً، في حين لا تكون البلازميدات العادية قادرة على حمل سوى 1- 12 زوجاً قاعدياً. فهي قادرة على التنسخ مثل البلازميدات لو كان لها أصلٌ مناسبٌ للتنسخ: فعلى سبيل المثال في خلايا الثدييات، لتنسخ الحمض النووي (دنا) مزدوج الضفيرة أو لتنسخ الحمض النووي (دنا) أحادي الضفيرة في بدائيات النوى. كما أنها غالباً ما تحتوى مورثاً (جيناً) للانتقاء مثل مقاومة المضادات الحيوية، ومن ثم يمكن تحديد الخلايا الناقلة للعدوى من خلال التصفيح أو التبسيط على وسيطٍ يحتوي على مضادٍ حيويٍ. إلا أن تلك الخلايا التي لا تستعمر الكوزميد لن تكون قادرةً على النمو. و على عكس البلازميدات، يمكن حزم الكوزميدات في قفيصات عاثية، والتي تسمح بانتقال المورثات الأجنبية الغريبة إلى داخل أو بين الخلايا عبر عملية تنبيغٍ (transduction). كما تصبح البلازميدات غير مسمتقرة بعد دمج كمٍ معينٍ من الدنا داخلها، وذلك بسبب أن حجمها المتزايد يكون أكثر توصيلاً للتأشيب الجيني. وللتغلب على تلك الظاهرة، يتم استخدام تنبيغ العاثيات بدلاً من ذلك. ويمكن تحقيق ذلك بواسطة النهايات المتماسكة (cohesive ends)، والمعروفة أيضاً بمواقع cos. وبهذه الطريقة، تصبح الكوزميدات شبيهة لاستخدام عاثية لامبدا كناقل، إلا أنه تم إلغاء وفقط كل جينات لامبدا باستثناء تسلسل cos. و تقدر سلاسل cos بـ ~200 زوجاً قاعدياً طولاً والتي تعتبر ضرورية لعملية الحزم (packaging). هذا بالإضافة إلى أنها تشتمل على موقع cosN حيث يتم رصد الدنا في كل ضفيرة، بغض النظر عن كونها 12 زوجاً قاعدياً، بواسطة الترميناز (terminase). وهذا يتسبب في أن يصبح الكوزميد الدائري خطي ذو نهايتين لزجتين أو متماسكتين لاصقتين للإثني عشر زوجاً قاعدياً. حيث يجب أن يكون الحمض النووي (الدنا) خطياً ليتناسب ضمن رأس العاثية. هذا ويمسك cosB بالترميناز في أثناء رصد وفصل الضفائر. في حين يُمسك الترميناز بموقع cosQ الخاص بالكوزميد التالي (بسبب أن عملية تكرار الدائرة الدوارة غالباً ما تُسفِر عن متسلسلات خطية (concatemer))، وذلك كله بعد أن يتم حزم الكوزميد السابق، لمنع التدهور أو التفسخ بواسطة صورة الديوكسي ريبونيوكلياز (deoxyribonuclease) الخلوية. (ar)
  • Els cosmidis són uns tipus de vectors de clonació. Realment un cosmidi consisteix en un plasmidi al qual se li han afegit uns segments del genoma d'un bacteriòfag, el fag λ. (ca)
  • A cosmid is a type of hybrid plasmid that contains a Lambda phage cos sequence. They are often used as a cloning vector in genetic engineering. Cosmids can be used to build genomic libraries. They were first described by Collins and Hohn in 1978.Cosmids can contain 37 to 52 (normally 45) kb of DNA, limits based on the normal bacteriophage packaging size. They can replicate as plasmids if they have a suitable origin of replication (ori): for example SV40 ori in mammalian cells, ColE1 ori for double-stranded DNA replication, or f1 ori for single-stranded DNA replication in prokaryotes. They frequently also contain a gene for selection such as antibiotic resistance, so that the transformed cells can be identified by plating on a medium containing the antibiotic. Those cells which did not take up the cosmid would be unable to grow. Unlike plasmids, they can also be packaged in vitro into phage capsids, a step which requires cohesive ends, also known as cos sites also used in cloning with a lambda phage as a vector, however nearly all the lambda genes have been deleted with the exception of the cos sequence. The hybrid cosmid DNA in the capsids can then be transferred into bacterial cells by transduction. Since there is a requirement for in vitro packaging whereby at least 38 kb of DNA is required between the cos sites, the vector without insert DNA will not be packaged (plasmids instability is increased if the novel inserted DNA contains many direct repeats or palindromic (inverted repeats) DNA. This instability can largely be counteracted by using a host bacterium with specific mutations affecting DNA recombination (N.B. Absence of inverted repeats was noted in the first Hohn & Collins publication cited above; see also). (en)
  • Als Cosmide bezeichnet man Plasmide, die sogenannte cos-sites (cohesive site) enthalten. Dabei handelt es sich um DNA-Sequenzen, die aus dem λ-Phagen stammen. Diese Abschnitte liegen an den Enden des linearen und sind jeweils von identischer Sequenz, weisen aber aufeinander zu (inverted repeat). Über diese kann die DNA einen Ring ausbilden (zirkularisieren) und wird somit nicht in der Wirtszelle abgebaut. Cosmide werden in Phagenstrukturen aus Proteinen verpackt, und so können die fremden Gene in Bakterien transduziert (eingeschleust) werden. Enthalten die Cosmide z. B. Gene für Antibiotika-Resistenzen, werden die transduzierten Bakterien in die Lage versetzt, in einer Kulturlösung trotz Zugabe des jeweiligen Antibiotikums zu überleben und sich zu vermehren. Cosmide werden verwendet, um Genbibliotheken eines Genoms anzulegen. (de)
  • Los cósmidos son vectores de clonación, que han sido ampliamente usados en la elaboración de genotecas de ADN genómicos de gran tamaño, ya que permiten la introducción de de ADN de hasta 45 kb, el doble que los vectores derivados de la eliminación de parte del genoma del fago λ, los fagémidos. Realmente un cósmido consiste en un plásmido al cual se le han adicionado unos segmentos del genoma de un bacteriófago, el fago λ. Un cósmido contiene: * Del plásmido, el y un gen de resistencia a un antibiótico, esto depende del tipo de plásmido del cual derive y, por tanto puede contener más segmentos como por ejemplo el gen , que permite la de las colonias. * Del fago λ, los , extremos complementarios del genoma del fago y que se emplean para la recircularización del mismo. Estos vectores facilitan el trabajo porque permiten el empaquetamiento in vitro de las secuencias entre dos extremos COS y usar los fagos empaquetados para transfectar cepas de E. coli, consiguiendo un plásmido en la bacteria, ya que el cósmido se recirculariza al entrar gracias a los extremos COS. También tiene genes de resistencia a antibióticos de origen plasmídico, que ayudan en la identificación de células huéspedes que contienen los cósmidos recombinantes.Después de insertar fragmentos de ADN, los cósmidos recombinantes se empaquetan en la cápside proteica de λ para formar partículas fágicas infectivas. Una vez que en la célula huésped, el cósmido se replica como plásmido. (es)
  • Un cosmide est un vecteur artificiel constitué d'un plasmide hybride contenant la séquence cos du phage lambda. Le nom « cosmide » est un mot-valise formé à partir de cos et plasmide. Les cosmides sont fréquemment utilisés comme vecteurs de clonage en génie génétique, et employés pour construire des banques génomiques. Ils ont été initialement décrits par Collins et Hohn en 1978. (fr)
  • コスミド (Cosmid) とはベクターのひとつである。コスミドベクターは、30kbp-45kbpの大きさのDNA断片を挿入することができる。このベクターは、という特殊な配列を有し、この配列をバクテリオファージが認識することで、パッケージングが行われる。 昔のコスミドベクターは、Cos領域が一つしかないものであったが、現在では2つあるものが主流である。このため、パッケージングの効率が大幅に上がり、コスミドベクターは実用的なものになった。 コスミドベクターにDNA断片をライゲーションしたあと、バクテリオファージにパッケージングし、そのファージが感染することで大腸菌を形質転換する。 このベクターは比較的大きなDNA断片を挿入できるので、二次代謝産物生合成遺伝子群などの解析のために使用されることもある。 (ja)
  • 코스미드(영어: cosmid)는 코스 계 람다 파지를 포함하는 하이브리드 플라스미드의 한 종류이다 이 코스미드의 DNA 서열은 람다 파지에서 유래 했다 그것들은 종종 유전공학의 클로닝 벡터로 사용된다. (ko)
  • Kosmidy – sztucznie wytworzone wektory do klonowania oparte na genomach bakteriofagów E. coli, mające zastosowanie w inżynierii genetycznej. Kosmidy tworzy się łącząc plazmidy z sekwencją cos bakteriofaga λ, przyjmują one formę konkatamerów. Dzięki temu tego rodzaju wektor zyskuje właściwości charakterystyczne zarówno dla plazmidu jak i dla faga; sekwencja cos gwarantuje cząsteczce rozpoznanie jej jako „genom λ” przez białka pakujące DNA do cząstek faga λ. Cząstki zawierające kosmidowy DNA nie umożliwiają syntezy nowych cząstek faga, natomiast replikują się jako plazmidy, nie niszcząc komórek gospodarza. DNA do sklonowania uzyskuje się z kolonii zainfekowanych bakterii. Replikacja kosmidów jest bardziej czasochłonna niż replikacja plazmidów (ze względu na duże rozmiary wprowadzonego obcego DNA), a liczba kopii kosmidów jest niższa niż plazmidów w danej komórce. Dzięki kosmidom możliwe jest klonowanie długich fragmentów DNA (do około 45 kb), na co nie pozwala użycie plazmidów. Opracowano także wektory PAC, będące bardziej rozbudowaną wersją kosmidów, dzięki czemu pojemność wektora wzrasta. (pl)
  • Un cosmide, originariamente descritto da Collins e Hohn nel 1978, è un tipo di vettore utilizzabile nelle tecniche di clonaggio tipiche dell'ingegneria genetica. La tipicità dei cosmidi consiste nella presenza di sequenze cos (scoperte nel batteriofago lambda), che permettono al cosmide di alloggiare fino a 50kbps (mentre un plasmide può mantenerne al massimo 20). (it)
  • 黏質體(Cosmid,又譯黏粒)是一種以λ噬菌體(Lambda phage)中的cos sequences所建構而成的質體,是常用的(cloning vector)之一,可用於建構。最高可置入44000個鹼基對,高於質粒的10000到15000。 (zh)
  • Косміди (Cosmides) — плазміди, що містять фрагмент ДНК фага лямбда включно зі . Разом із системами пакування у фагові частинки in vitro використовуються як векторні молекули для клонування генів та при побудові геномних бібліотек. Косміди вперше сконструювали Коллінс та Брюнінг 1978 року. Їхня назва походить від скорочення двох термінів: cos-ділянка (сам термін у свою чергу походить від англ. cohesive ends — липкі кінці) та плазміда. Косміда має розмір приблизно 5 т.п.н. і обов'язково включає такі елементи: cos-ділянку, необхідну для запаковування у віріони фага лямбда, плазміди для реплікації у клітині бактерії, сайти розпізнавання ендонуклеазами рестрикції та (наприклад ген резистентності до якогось антибіотику). За допомогою космід можна клонувати ділянки ДНК розміром 32-47 т.п.н.. Для цього косміду та чужорідну ДНК обробляють однією і тією ж ендонуклеазою рестрикції, після чого отримані лінійні фрагменти змішують і проводять реакцію . Далі відбувається пакування ДНК у фагові голівки in vitro, вона розрізається у cos-ділянках. Цей процес супроводжується селекцією фрагментів за розміром, оскільки запаковуватись може тільки ДНК довжиною 78—105% від геному фага лямбда. Таким чином у віріони потраплять переважно рекомбінантні косміди, що містять клоновану ділянку ДНК. Продукти лігування між двома космідами будуть замалими для пакування, а між двома фрагментами чужорідної ДНК — завеликими. Отримані фагові частинки із рекомбінантними космідами використовують для інфікування клітин кишкової палички. У цитоплазмі косміди циклізуються завдяки з'єднанню липких кінців і далі реплікуються як звичайні плазміди, не проявляючи ніяких функцій фага лямбда. Селекція трансформованих клітин проводиться за маркерним геном присутнім у векторній молекулі. (uk)
  • Космиды (Cosmides) — плазмиды, содержащие фрагмент ДНК фага лямбда включая cos-участок. Вместе с системами упаковки в фаговые частицы in vitro используются как векторные молекулы для клонирования генов и при построении геномных библиотек. Космиды были впервые сконструированы Коллинсом и Брюнингом в 1978 году. Их название происходит от сокращения двух терминов: cos-участок (сам термин в свою очередь происходит от англ. cohesive ends — липкие концы) и плазмида. С помощью космид можно клонировать участки ДНК размером 32-47 т.п.н. Плазмиды, если клонировать в них участки ДНК больше 4-5 т.п.н. становятся нестабильными из-за возрастающей склонности к рекомбинации. К тому же, космиды упаковываются в фаговые частицы, что позволяет доставить их в бактерию при помощи трансдукции. (ru)
gold:hypernym
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3330 as of Mar 19 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (62 GB total memory, 40 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software