About: Beta barrel     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : yago:WikicatProteinStructuralMotifs, within Data Space : dbpedia.org associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.org/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FBeta_barrel

In protein structures, a beta barrel is a beta sheet composed of tandem repeats that twists and coils to form a closed toroidal structure in which the first strand is bonded to the last strand (hydrogen bond). Beta-strands in many beta-barrels are arranged in an antiparallel fashion. Beta barrel structures are named for resemblance to the barrels used to contain liquids. Most of them are water-soluble proteins and frequently bind hydrophobic ligands in the barrel center, as in lipocalins. Others span cell membranes and are commonly found in porins. Porin-like barrel structures are encoded by as many as 2–3% of the genes in Gram-negative bacteria. It has been shown that more than 600 proteins with various function (e.g., oxidase, dismutase, amylase) contain the beta barrel structure.

AttributesValues
rdf:type
rdfs:label
  • Β-Fass (de)
  • Beta barrel (en)
  • Barril beta (es)
  • Tonneau bêta (fr)
  • Barile β (it)
  • Βバレル (ja)
  • Bèta-barrel (nl)
  • Barril beta (pt)
  • Бета-цилиндр (ru)
  • Бета-циліндр (структура білків) (uk)
  • Β桶状结构 (zh)
rdfs:comment
  • Ein β-Fass (engl. β-barrel) ist ein Proteinstruktur-Motiv, das besonders in porenbildenden Proteinen vorkommt. Es besteht aus mindestens fünf β-Faltblättern, die im Kreis angeordnet sind und so eine Röhre (die Pore) bilden, die meist für die Funktion des Proteins als Transportprotein verantwortlich ist. Der Innendurchmesser einer solchen Pore kann von wenigen bis mehreren Dutzend Ångström betragen. (de)
  • Le strutture a barile β (strutture a manicotto) sono particolari strutture che derivano dalla struttura secondaria foglietto β. Sono formate da catene laterali apolari all'esterno (contatto con catene idrofobiche dei fosfolipidi di membrana) e catene laterali polari verso l'interno. (it)
  • βバレル(Beta barrel)はタンパク質の三次構造の1つであり、大きなβシートがねじれてコイル状になり、両端が水素結合で結合した構造をしている。βバレル中のβストランドは通常は平行に配列している。この構造はポリンや、細胞膜を貫通する他のタンパク質、などの疎水性リガンドと結合するタンパク質で見られる。グラム陰性細菌の遺伝子の2-3%はポリン様のタンパク質をコードしている。 多くの場合、ストランドのアミノ酸は極性のものと疎水性のものが1つおきに並び、疎水残基はバレルの内側を向いて疎水性中心を作り、極性残基は外側を向いて溶媒に露出している。ただし脂質中ではこれとは逆になり、疎水性残基が外側、極性残基が内側にくることがある。 全てのβバレルは、βシート中のストランドの数を表すnとシートSという中のストランドのずれSという2つのパラメータによって分類される。これらのパラメータはβバレルの軸に対するストランドの偏向角に関係する。 (ja)
  • Um barril beta é uma grande folha-beta que se torce e se enrola para formar uma estrutura fechada na qual a primeira fita está ligada à última através de ligações de hidrogénio. as folhas-beta em barris beta estão tipicamente arranjados de uma forma antiparalela. Estruturas em barril são encontradas de maneira comum em porinas e outras proteínas de atravessam a membrana celular e proteínas de se ligam a ligandos hidrofóbicos no centro do barril, como em lipocalinas. Estruturas em barril semelhantes a porinas representam entre 2 a 3% dos genes em bactérias Gram negativas. (pt)
  • Бета-циліндр (англ. beta-barrel) -- це антипаралельні бета-ланцюги, що утворюють гідрофобне білкове ядро ​​з великим бета-листом. Бета-лист скручується, в результаті чого утворюється замкнута структура, в якій перший ланцюг зв'язаний водневим зв'язком з останнім. У багатьох випадках структура містить поперечні полярні та гідрофобні амінокислоти так, що гідрофобні залишки орієнтуються у внутрішню частину циліндра з утворенням гідрофобного ядра, а полярні залишки орієнтуються на зовнішню сторону циліндра на поверхні, що піддається розчиннику. (uk)
  • β桶状结构(英语:Beta barrel)是蛋白质的一种三级构造。它由多条β折叠带通过反平行重叠成桶状,两段则由肽链残基间的氢键结束。常见采取这种构造的蛋白有孔蛋白、跨膜蛋白以及其他需要与非极性分子打交道的蛋白。 在β桶中,β折叠带往往同时带有亲水与疏水性残基。根据外部环境与管道需要,再将内外分别整理成亲水或疏水的管道面。 (zh)
  • In protein structures, a beta barrel is a beta sheet composed of tandem repeats that twists and coils to form a closed toroidal structure in which the first strand is bonded to the last strand (hydrogen bond). Beta-strands in many beta-barrels are arranged in an antiparallel fashion. Beta barrel structures are named for resemblance to the barrels used to contain liquids. Most of them are water-soluble proteins and frequently bind hydrophobic ligands in the barrel center, as in lipocalins. Others span cell membranes and are commonly found in porins. Porin-like barrel structures are encoded by as many as 2–3% of the genes in Gram-negative bacteria. It has been shown that more than 600 proteins with various function (e.g., oxidase, dismutase, amylase) contain the beta barrel structure. (en)
  • Un barril beta es una estructura de proteínas formada por una serie de láminas beta que se tuercen y enrollan para formar una estructura cerrada en donde la primera cadena de láminas beta se une a la última a través de enlaces por puente de hidrógeno. Estas láminas beta generalmente forman arreglos antiparalelos. Las estructuras de barril se encuentran comúnmente en porinas y otras proteínas que se atraviesan membranas celulares y proteínas que se unen a ligandos hidrofóbicos en el centro del barril, como en las lipocalinas. Las estructuras de barril tipo porinas son hasta el 2-3% de los genes de una bacteria Gram negativas.​En muchos casos, la alternancia de cadenas contienen residuos aminoacídicos polares e hidrofóbicos, de modo que los residuos hidrofóbicos están orientados hacia el int (es)
  • Un tonneau β est une structure protéique constituée d'un grand feuillet β qui se tord et s'enroule pour former une structure quasi-cylindrique fermée par des liaisons hydrogène. Les feuillets bêta sont généralement arrangés de façon antiparallèle, le premier brin étant lié au dernier par liaisons hydrogène. (fr)
  • De bèta-barrel of het bèta-vat is een vouwingspatroon in eiwitten bestaande uit herhalende bèta-platen die in een cilindrische conformatie zijn gedraaid. Beta-barrels zijn vernoemd naar hun gelijkenis met vaten (Engels: barrels) waarin men vloeistoffen bewaart. De meeste bèta-barrels zijn wateroplosbare eiwitten die een hydrofoob ligand kunnen binden. Ze komen ook voor in membranen en spelen dan een rol als selectief doorlatend membraaneiwit. Maar liefst 2–3% van de genen van gramnegatieve bacteriën coderen voor bèta-barrels in membranen. (nl)
  • β-цилиндр — разновидность третичной структуры белков; β-складчатый слой, свернутый с образованием замкнутой структуры, в которой первая цепь водородными связями связана с последней. Как правило, β-цепи в β-цилиндрах расположены в антипараллельной ориентации. Чаще всего β-цилиндры формируют такие белки, как порины и другие пронизывающие мембраны белки, и белки, связывающие внутри цилиндра гидрофобные лиганды, такие как липокалины. Примерно 2-3 % генов в грамотрицательных бактериальных геномах кодируют бета-цилиндры. (ru)
foaf:depiction
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/1RRX_pdb_slab_1.png
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/1RRX_pdb_slab_2.png
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/1RRX_pdb_slab_3.png
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/1RRX_pdb_slab_4.png
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/MupwithSBT.jpg
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Rbp_1brp.png
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Shear_Number_GFP.svg
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Sucrose_porin_1a0s.png
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
Link from a Wikipage to an external page
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3330 as of Mar 19 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (62 GB total memory, 50 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software