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Structural alignment attempts to establish homology between two or more polymer structures based on their shape and three-dimensional conformation. This process is usually applied to protein tertiary structures but can also be used for large RNA molecules. In contrast to simple structural superposition, where at least some equivalent residues of the two structures are known, structural alignment requires no a priori knowledge of equivalent positions. Structural alignment is a valuable tool for the comparison of proteins with low sequence similarity, where evolutionary relationships between proteins cannot be easily detected by standard sequence alignment techniques. Structural alignment can therefore be used to imply evolutionary relationships between proteins that share very little common

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  • تراصف بنيوي (ar)
  • Strukturní alignment (cs)
  • Alineamiento estructural (es)
  • Structural alignment (en)
  • Alinhamento estrutural (pt)
  • Пространственное выравнивание (ru)
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  • التراصف البنيوي هو أحد أشكال التراصف التسلسلي المعتمد على مقارنة الشكل. هذه التراصفات تحاول أن تؤسس توازنات بين اثنين أو أكثر من البنى البوليمرات استنادا على شكلهم ثلاثي الأبعاد. هذه العمليات تطبق عادة على للبروتينات لكن يمكن استخدامها أيضا لجزيئات الرنا الضخمة. بعكس البنيوي structural superposition البسيط، حيث تقوم تعرف فقط ثمالتين على الأقل، فإن طرق التراصف البنيوي لا تتطلب أي معرفة مسبقة بالمواقع المكافئة. التراصف البنيوي يشكل أداة قيمة لمقارنة البروتينات ذات التشابه التسلسي الضئيل، حيث تكون العلاقات التطورية بين هذه البروتينات غير قابلة للكشف بسهولة عن طريق تقنيات التراصف التسلسلي المعيارية. يمكن أيضا أن تستخدم طرق التراصف البنيوي للتحقق من علاقات تطورية بين البروتنيات التي تتشارك تسلسلات مشتركة ضئيلة جدا. في جميع الأحوال يجب أن نكون حذرين عند استعمال هذه النتائج كإثباتات لأصل تطوري (ar)
  • Strukturní alignment je způsob porovnávání polymerních struktur na základě jejich tvaru a prostorového rozložení. Kromě určování podobností proteinů nachází využití i při porovnávání molekul RNA. Určení podobnosti proteinů patří mezi důležité faktory správné klasifikace proteinů, ze strukturní podobnosti s ostatními proteiny lze vyvodit informace o evolučním vývoji, nebo biologické funkci, čehož se využívá např. při klasifikaci nově objevených proteinů, u kterých je známa pouze struktura. Pro strukturní alignment není potřeba předem znát informace o společných oblastech proteinů. V případě, že mají proteiny velkou sekvenční podobnost, využívá se spíše sekvenční alignment namísto strukturního. (cs)
  • Un alineamiento estructural es un tipo de alineamiento de secuencias basado en la comparación de la forma. Estos alineamientos intentan establecer equivalencias entre dos o más estructuras de polímeros basándose en su forma y conformación tridimensional. El proceso se aplica normalmente a las estructuras terciarias de las proteínas, pero también puede usarse para largas moléculas de ARN. En contraste a la simple superposición estructural, donde al menos se conocen algunos residuos equivalentes de las dos estructuras, el alineamiento estructural no requiere un conocimiento previo de posiciones equivalentes. Es una valiosa herramienta para la comparación de proteínas con baja similitud entre sus secuencias, en donde las relaciones evolutivas entre proteínas no pueden ser fácilmente detectada (es)
  • Structural alignment attempts to establish homology between two or more polymer structures based on their shape and three-dimensional conformation. This process is usually applied to protein tertiary structures but can also be used for large RNA molecules. In contrast to simple structural superposition, where at least some equivalent residues of the two structures are known, structural alignment requires no a priori knowledge of equivalent positions. Structural alignment is a valuable tool for the comparison of proteins with low sequence similarity, where evolutionary relationships between proteins cannot be easily detected by standard sequence alignment techniques. Structural alignment can therefore be used to imply evolutionary relationships between proteins that share very little common (en)
  • Um alinhamento estrutural é um tipo de alinhamento de sequências baseado na comparação da forma das moléculas. Estes alinhamentos tentam estabelecer equivalências entre duas ou mais estruturas de polímeros baseando-se na sua forma e . O processo normalmente aplica-se às das proteínas, mas também pode ser usado para longas moléculas de RNA. Ao contrário da sobreposição estrutural simples, onde se conhecem alguns resíduos equivalentes das duas estruturas, o alinhamento estrutural não requer um conhecimento prévio de posições equivalentes. É uma valiosa ferramenta para a comparação de proteínas que têm poucas semelhanças entre as suas sequências, onde as relações evolutivas entre proteínas não podem ser facilmente detectadas por técnicas padrão de alinhamento de seqüências. Portanto, o alinh (pt)
  • Простра́нственное выра́внивание — способ установления гомологии между двумя или более полимерными структурами на основании их трёхмерной структуры. Этот процесс обычно применяется к третичной структуре белков, но может также использоваться и для больших молекул РНК. В противоположность простому наложению структур, когда известно по крайней мере несколько эквивалентных аминокислотных остатков, пространственное выравнивание не требует никаких предварительных данных, кроме координат атомов. (ru)
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  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Alignment_of_thioredoxins2.png
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Ssap-vectors.png
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