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| - قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات (بالإنجليزية: Structural Classification of Proteins database) (مختصرها سكوب أو SCOP) هو دليل تصنيفي إلى حد كبير في على أساس تشابه هياكلها الأحماض الأمينية. الدافع وراء هذا التصنيف هو تحديد العلاقة التطورية بين البروتينات. توضع البروتينات التي تتصف بأشكال متشابهة ولكنها تتصف بوجود القليل من التشابه في التسلسل أو الوظيفة في عوائل رئيسية مختلفة، لكن توضع فرضية أن السلف المشترك بعيد جداً، كما توضع البروتينات التي لها نفس الشكل وبعض التشابه في التسلسل أو الوظيفة في الأسر ذاتها، ويفترض أن يكون لها سلف مشترك أوثق. (ar)
- La classificació estructural de proteïnes (Structural Classification of Proteins, SCOP) de bases de dades és en gran part una classificació manual dels dominis de basats en les similituds de les seves estructures i seqüències d'aminoàcids. Una de les motivacions per aquesta classificació és determinar les relacions evolutives entre les proteïnes. Les proteïnes amb les mateixes formes però que tenen poc o seqüència de similitud funcional es col·loquen en diferents "superfamilies", i se suposa que només tenen un avantpassat comú molt llunyà. Les proteïnes que tenen la mateixa forma i una similitud de seqüència i/o funció es col·loquen en "famílies", i se suposa que tenen un ancestre comú més prop. (ca)
- Base de datos de clasificación estructural de proteínas (SCOP Structural Classification Of Protein) es una clasificación en gran parte manual de dominios estructurales de proteínas basada en similitudes de sus estructuras y secuencias de aminoácidos. Un objetivo de esta clasificación es determinar la relación evolutiva entre proteínas. Las proteínas con las mismas formas pero con poca secuencia o similitud funcional se colocan en diferentes superfamilias , y se supone que solo tienen un ancestro común muy distante. Las proteínas que tienen la misma forma y alguna similitud de secuencia y / o función se colocan en "familias" y se supone que tienen un ancestro común más cercano.Similar a las bases de datos y Pfam , SCOP proporciona una clasificación de dominios estructurales individuales d (es)
- The Structural Classification of Proteins (SCOP) database is a largely manual classification of protein structural domains based on similarities of their structures and amino acid sequences. A motivation for this classification is to determine the evolutionary relationship between proteins. Proteins with the same shapes but having little sequence or functional similarity are placed in different superfamilies, and are assumed to have only a very distant common ancestor. Proteins having the same shape and some similarity of sequence and/or function are placed in "families", and are assumed to have a closer common ancestor. (en)
- SCOP, de l'anglais Structural Classification of Proteins, est une base de données bio-informatique de classification structurelle des domaines protéiques à partir de similitudes entre leur séquence en acides aminés et leur structure tridimensionnelle. Elle a été créée en 1994 au (en) (CPE) puis a été maintenue à partir de 2010 par le Laboratoire de biologie moléculaire (LMB), tous deux situés à Cambridge, au Royaume-Uni. Le travail sur SCOP, essentiellement manuel, a été interrompu fin 2013 devant l'accélération exponentielle des publications de nouvelles structures protéiques, et la dernière version disponible est la 1.75, publiée en juin 2009, qui organisait quelque 38 000 entrées PDB de manière strictement hiérarchique. (fr)
- タンパク質立体構造分類データベース(タンパクしつりったいこうぞうデータベース、英: Structural Classification of Proteins (SCOP) database)は、タンパク質の構造ドメインを、その構造とアミノ酸配列の類似性に基づいて、主に手作業で分類したものである。この分類の動機は、タンパク質間の進化的関係を決定することである。同じ形状をしていても、配列や機能の類似性がほとんどないタンパク質は、異なるスーパーファミリーに分類され、非常に遠い共通の祖先を持っていると想定される。同じ形状で、配列や機能がある程度類似しているタンパク質は「ファミリー」に分類され、より近い共通の祖先を持っていると見なされる。 CATHデータベースやPfamデータベースと同様に、SCOPはタンパク質の個々の構造ドメインを分類するものであり、かなりの数の異なるドメインを含む可能性のあるタンパク質全体を分類するものではない。 SCOPデータベースは、インターネット上で自由にアクセスできる。SCOPは、1994年にイギリスのケンブリッジにあるとMRC分子生物学研究所で作成された。これは、2010年に閉鎖されるまではタンパク質工学センターのAlexey G. Murzin氏と彼の同僚によって維持され、その後は分子生物学研究所に引き継がれた。 (ja)
- Baza danych SCOP (Structural Classification of Protein Database) zawiera przestrzenne struktury białkowe uporządkowane na podstawie zależności ewolucyjnych i strukturalnych białek. Opiera się w dużej mierze na ręcznej klasyfikacja strukturalnych domen białkowych w oparciu o podobieństwa ich struktur i sekwencji aminokwasowych. Jest dostępna w internecie do darmowego użytku. Prototyp nowej bazy danych: jest dostępny publicznie od 2014 roku z ostatnią wersją z grudnia 2016 roku. SCOP2 klasyfikuje białka inaczej niż SCOP zachowując jednak najlepsze cechy poprzedniej wersji. (pl)
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