About: Short interspersed nuclear element     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : owl:Thing, within Data Space : dbpedia.org associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.org/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FShort_interspersed_nuclear_element&graph=http%3A%2F%2Fdbpedia.org&graph=http%3A%2F%2Fdbpedia.org

Short interspersed nuclear elements (SINEs) are non-autonomous, non-coding transposable elements (TEs) that are about 100 to 700 base pairs in length. They are a class of retrotransposons, DNA elements that amplify themselves throughout eukaryotic genomes, often through RNA intermediates. SINEs compose about 13% of the mammalian genome.

AttributesValues
rdfs:label
  • SINE (ca)
  • Short Interspersed Nuclear Element (de)
  • Short interspersed nuclear element (it)
  • Élément nucléaire dispersé court (fr)
  • 短鎖散在反復配列 (ja)
  • Short interspersed nuclear element (nl)
  • Short interspersed nuclear element (en)
  • SINEs (ru)
  • 短散在核元件 (zh)
rdfs:comment
  • I short interspersed nuclear element, chiamati anche con l'acronimo di SINE, sono uno dei quattro tipi principali di trasposoni. Sono lunghi fino a circa 500 paia di basi. Sono trascritti ma non tradotti. Occupano circa il 15% del DNA. I SINE costituiscono circa il 13% del genoma dei mammiferi. (it)
  • Els elements nuclears intercalats curts (del anglès: Short interpersed nuclear elements, SINEs) són fragments d'ADN no codificants i transposables d'ADN. Són una classe de retrotransposons, elements d'ADN que s'amplifiquen autònomament per tot el genoma eucariota, sovint a través d'intermediaris d'ARN. L'anàlisi dels llinatges diferents, les mutacions i l'activitat dels SINEs és una eina molt útil en anàlisi filogenètica. (ca)
  • Unter short interspersed nuclear elements (SINE, engl. für ‚kurze, eingestreute Kernsequenzelemente‘) versteht man typischerweise 100–400 Basenpaare lange, häufig wiederholte und relativ frei verteilte DNA-Sequenzen im Genom. SINEs werden häufig zu den transponierbaren Elementen gerechnet, die eine RNA als Zwischenstufe benutzen (Retroelement) und keine long terminal repeats (Non-LTR Retrotransposons) besitzen. Transponierbare Elemente im engeren Sinn sind jedoch definiert als DNA-Sequenzen, die selbst eine Transposase kodieren und damit eine intrinsische Fähigkeit besitzen, ihre genomische Position zu ändern. Im Gegensatz zu den längeren LINEs sind SINEs somit nicht autonom, sondern benötigen eine externe Reverse Transkriptase (oft von LINEs codiert), da sie keine eigene (mehr) besitzen. (de)
  • Short interspersed nuclear elements (SINEs) are non-autonomous, non-coding transposable elements (TEs) that are about 100 to 700 base pairs in length. They are a class of retrotransposons, DNA elements that amplify themselves throughout eukaryotic genomes, often through RNA intermediates. SINEs compose about 13% of the mammalian genome. (en)
  • Les éléments nucléaires dispersés courts (SINE, short interspersed nuclear elements) font partie des séquences répétées dispersées au sein de l'ADN. Parmi les plus connues de ces séquences, on trouve les séquences Alu qui contiennent le site de restriction (AG/CT) de l'enzyme de restriction AluI, d'où leur nom. (fr)
  • 短鎖散在反復配列(たんささんざいはんぷくはいれつ、英: Short interspersed nuclear element, SINE)とは、長さ100から700塩基対の、非自律型・転移因子をいう。レトロトランスポゾンの一種であり、しばしばRNAを媒介として自己増殖する。真核生物のゲノム上に多く見られる。 SINEの内部領域はtRNAに起因し、保存性が高いことからSINEの構造および機能が正の淘汰圧により保存されていることがうかがえる。SINEは脊椎動物・無脊椎動物双方の多くの種に存在するが、系列特異的であるため、種間のマーカーとして有用であり、SINE配列中のコピー数多型および突然変異を種間で比較することにより系統学的な研究を行うことができる。また、ヒトその他の真核生物における一連の遺伝子疾患にも関連する。 (ja)
  • Een short interspersed nuclear element, afgekort tot SINE (Engels voor kort verspreid kernelement) is een DNA-sequentie in het genoom dat typisch zo'n 100–400 basenparen lang is, veel herhaald (repeat) wordt en relatief vrij verspreid voorkomt. Evolutionair gezien zijn SINE's afgeleid van het kleine cytoplasmatische 7SL RNA, een component van het signaalherkenningdeeltje. Het menselijk genoom heeft ongeveer 1,5 miljoen SINE-copiën, die ongeveer 14% van het genoom uitmaken. (nl)
  • SINEs (англ. Short interspersed nuclear element, Короткие Диспергированные Повторы) — короткие последовательности ДНК (менее 500 пар оснований) в геноме эукариот, появившиеся в результате обратной транскрипции коротких молекул РНК, транскрибируемых РНК-полимеразой III: 5S рРНК, тРНК и различные мяРНК. SINEs не кодируют белки, и их транспозиция в геноме зависит от других мобильных элементов. Выделяют 3 группы SINE в зависимости от того, какая РНК стала их предшественником.: (ru)
  • 短散在核元件(Short interspersed nuclear elements,簡稱SINE)是真核生物基因組中長100至700bp的轉位子序列,屬於反轉錄轉座子,哺乳類基因組約有13%為SINE。SINE與LINE等轉位子皆是「寄生」於生物基因組中的DNA元件,某些情況下可能對生物體有害,但有時細胞也將其用來調控自己的基因表現。 SINE一般不具有长末端重复序列(LTR),其序列從5端至3端可大致分為頭端、中端與尾端三部分,其中頭端大多來自tRNA等由RNA聚合酶III轉錄的RNA,例如Alu元件的5端序列即來自7SL RNA;中端序列常與長散在核元件(LINE)相似,因此可利用後者編碼的內切酶;尾端則是由一些重複序列組成。 Alu元件是靈長類演化過程中相當重要的SINE,約長300bp,人類基因組中有超過百萬個Alu元件,占基因組大小超過10%,許多其他動物基因組中也有大量的SINE。SINE插入重要的基因序列可影響基因表現而造成人類的遺傳疾病,例如有些乳癌、大腸癌、白血病、血友病、囊腫性纖維化、神經纖維瘤病與為Alu元件插入造成。 (zh)
foaf:depiction
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/LINE1s_and_SINEs.png
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
sameAs
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3330 as of Mar 19 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (62 GB total memory, 60 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software